<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207395.25	1	TGCCCTCCCAACTTTTCTCTTCCAGCTTCAGGGGCTCTGTTTTAAAACTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219433	TGCCCTCCCAACTTTTCTCTTCCAGCTTCAGGGGCTCTGTTTTAAAACTC	219482

CU207395.25	51	ACCAACTATACTAGCGCCCCTGTACACGCACAGCCATATGGGACCATGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219483	ACCAACTATACTAGCGCCCCTGTACACGCACAGCCATATGGGACCATGTG	219532

CU207395.25	101	CTGGATGGTGCTCCAGGGACCACTTCCCTGAAGGAAGCCTATTCTCTCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219533	CTGGATGGTGCTCCAGGGACCACTTCCCTGAAGGAAGCCTATTCTCTCTC	219582

CU207395.25	151	TTCTAGCAGGCTTCAATTGCCAATAGCTCCCTGGCTGAAAGTGGAACTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219583	TTCTAGCAGGCTTCAATTGCCAATAGCTCCCTGGCTGAAAGTGGAACTTC	219632

CU207395.25	201	CCCATCCATGCTGGTGTTTTGGCTGCTGTGTTCTTATGTAGGGCTTATGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219633	CCCATCCATGCTGGTGTTTTGGCTGCTGTGTTCTTATGTAGGGCTTATGC	219682

CU207395.25	251	ATGCAATCTATTAGCTCATGTGTCAAAAAGCCCTGTGGTGTTCAGCAAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219683	ATGCAATCTATTAGCTCATGTGTCAAAAAGCCCTGTGGTGTTCAGCAAAT	219732

CU207395.25	301	GAGGTTTCACTGTGGCTCTCCACTACTCCTGATCGAATTCTTTTGGCCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219733	GAGGTTTCACTGTGGCTCTCCACTACTCCTGATCGAATTCTTTTGGCCCC	219782

CU207395.25	351	TCTGGTGCCATGAGCCCTGAGCCCTGGGAGGTGGGGGGAGTGCGAGGGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219783	TCTGGTGCCATGAGCCCTGAGCCCTGGGAGGTGGGGGGAGTGCGAGGGTG	219832

CU207395.25	401	GTGGTGGAGGAGGGTGATAGAGATGTCTCATTTTGAGATTAGTACTCCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219833	GTGGTGGAGGAGGGTGATAGAGATGTCTCATTTTGAGATTAGTACTCCAC	219882

CU207395.25	451	AGCCTATTAATTAATCTCTGTACACTGACCAGATGTGACTCTCTGGATTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219883	AGCCTATTAATTAATCTCTGTACACTGACCAGATGTGACTCTCTGGATTG	219932

CU207395.25	501	ATTCACATCTAACTGTAGAGGAAGGTTCTTTGATAAGGTTGAACAGAACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219933	ATTCACATCTAACTGTAGAGGAAGGTTCTTTGATAAGGTTGAACAGAACA	219982

CU207395.25	551	CTAATCTACTGATATAAACATGAGGACTAGGAGGTCAGTTTAATGCTTTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	219983	CTAATCTACTGATATAAACATGAGGACTAGGAGGTCAGTTTAATGCTTTG	220032

CU207395.25	601	TTCGTTTAGCAGAATGAGAGCATAAAGTTCTCCCCTTGGGCTTATGATCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220033	TTCGTTTAGCAGAATGAGAGCATAAAGTTCTCCCCTTGGGCTTATGATCC	220082

CU207395.25	651	ATTTAACCAATAGGAAAGTAGCTGGTTACCCCCATAATATTTACATCACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220083	ATTTAACCAATAGGAAAGTAGCTGGTTACCCCCATAATATTTACATCACT	220132

CU207395.25	701	ACTCCACCAAATGGGTGTATCTTACCAGGGCAGTCATTATTGTAGCATGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220133	ACTCCACCAAATGGGTGTATCTTACCAGGGCAGTCATTATTGTAGCATGT	220182

CU207395.25	751	AGGATTCACAGATGGTTAACTTTTTATAAAGCCATCATTACCCTGACACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220183	AGGATTCACAGATGGTTAACTTTTTATAAAGCCATCATTACCCTGACACC	220232

CU207395.25	801	AAAACCAGGTAAAGGCCCAACCAAAATAGAAGACTATAGACTGATCTTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220233	AAAACCAGGTAAAGGCCCAACCAAAATAGAAGACTATAGACTGATCTTCC	220282

CU207395.25	851	TGGTGGAGACAGATGCAAAATTTCTCAATGTATTTGCAAACGAAATTCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220283	TGGTGGAGACAGATGCAAAATTTCTCAATGTATTTGCAAACGAAATTCAA	220332

CU207395.25	901	GAATATATCCAAAATGTCACCCACCCAACACAATCAAGTTGGCTTTTCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220333	GAATATATCCAAAATGTCACCCACCCAACACAATCAAGTTGGCTTTTCCC	220382

CU207395.25	951	AGAGATACAGGGATGGTTCAATGTATGTAAATTGGTAAATGCAGTCTACC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220383	AGAGATACAGGGATGGTTCAATGTATGTAAATTGGTAAATGCAGTCTACC	220432

CU207395.25	1001	ATAAAAATAGACTCAAGGACAGAAATCATTTGATCATCTGATTAGATGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220433	ATAAAAATAGACTCAAGGACAGAAATCATTTGATCATCTGATTAGATGTT	220482

CU207395.25	1051	AAAAACAAAACAAAAACAAAAACAAAACCCTTTGGTGAAATACAACATCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220483	AAAAACAAAACAAAAACAAAAACAAAACCCTTTGGTGAAATACAACATCT	220532

CU207395.25	1101	CTTAGTTACAAGTCCTGAGGAACGTGGTGACATGGGGAACATTATTTCGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220533	CTTAGTTACAAGTCCTGAGGAACGTGGTGACATGGGGAACATTATTTCGA	220582

CU207395.25	1151	CATAGTTAAGGCAATACAACAAACCCATGGTCAACATCATGTAAAGTGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220583	CATAGTTAAGGCAATACAACAAACCCATGGTCAACATCATGTAAAGTGTG	220632

CU207395.25	1201	ACCAGGTGCCGAGCATTTTCCACTAATGTCACCAAGCATTTCCCACTAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220633	ACCAGGTGCCGAGCATTTTCCACTAATGTCACCAAGCATTTCCCACTAAT	220682

CU207395.25	1251	GTCAAGGACAAAAGCAATGTCCACTCTTTGCTCTCCTGTTCAATATTGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220683	GTCAAGGACAAAAGCAATGTCCACTCTTTGCTCTCCTGTTCAATATTGTG	220732

CU207395.25	1301	CTTCCAGTCTTGGCTTGAACAAAAAGGTGGGAGGAGAGAGAGGATGAACG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220733	CTTCCAGTCTTGGCTTGAACAAAAAGGTGGGAGGAGAGAGAGGATGAACG	220782

CU207395.25	1351	TAGACAGGAAGAAGTAACCGCATCCATGTCTGCAGATGATACGATTCCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220783	TAGACAGGAAGAAGTAACCGCATCCATGTCTGCAGATGATACGATTCCAT	220832

CU207395.25	1401	CTCTTAAAAACCTGCAAGACTCCAGACAACCCCCACGGCTGACAGACAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220833	CTCTTAAAAACCTGCAAGACTCCAGACAACCCCCACGGCTGACAGACAGA	220882

CU207395.25	1451	GCAGCGGGAGACAAAACTCACACATAAGTCAGCAGCCTCCCTACATTCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220883	GCAGCGGGAGACAAAACTCACACATAAGTCAGCAGCCTCCCTACATTCCA	220932

CU207395.25	1501	ATGACAAACCGACACAGAAATAAATCTTGGAATCAACCTGAACGGCGAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220933	ATGACAAACCGACACAGAAATAAATCTTGGAATCAACCTGAACGGCGAAG	220982

CU207395.25	1551	CAAAGGGCACGTACAATGAAACCTTTAGGACCCGGAGACAGAAGTTAGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	220983	CAAAGGGCACGTACAATGAAACCTTTAGGACCCGGAGACAGAAGTTAGAG	221032

CU207395.25	1601	ACCTACCATGCTCATGGATTGGCAAGATGAACACCAAAAGCAATCTACAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221033	ACCTACCATGCTCATGGATTGGCAAGATGAACACCAAAAGCAATCTACAG	221082

CU207395.25	1651	AGTCGATGCAGTCCCTATCAAAACTCAGATGTGTTCTTCATAGAGATCGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221083	AGTCGATGCAGTCCCTATCAAAACTCAGATGTGTTCTTCATAGAGATCGA	221132

CU207395.25	1701	AAAACTAATCTCCAAATCCAATATGGAAACACAAAAGACTTAGGATATCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221133	AAAACTAATCTCCAAATCCAATATGGAAACACAAAAGACTTAGGATATCC	221182

CU207395.25	1751	AAAATAATCCTGAAGACTAGGAGCCTTGCTGAATGCATCACCATCCCAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221183	AAAATAATCCTGAAGACTAGGAGCCTTGCTGAATGCATCACCATCCCAGA	221232

CU207395.25	1801	TTTCAAGTTAAACAACAGAAACATCGGCATAAAAGAACAGAGGATCGATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221233	TTTCAAGTTAAACAACAGAAACATCGGCATAAAAGAACAGAGGATCGATA	221282

CU207395.25	1851	TCAAAATAGGTACACTGATCAGTGGAGTAAAACTGAGAGCCAGATATACG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221283	TCAAAATAGGTACACTGATCAGTGGAGTAAAACTGAGAGCCAGATATACG	221332

CU207395.25	1901	TCCCTGAGTTTTGACAAAGAAGCCAAAAATTCACATGAATGAAAAGACAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221333	TCCCTGAGTTTTGACAAAGAAGCCAAAAATTCACATGAATGAAAAGACAG	221382

CU207395.25	1951	CATCTTCAATGCTTTAAATTTTAAATATTTTTCATTTTTCCACAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207391.12	221383	CATCTTCAATGCTTTAAATTTTAAATATTTTTCATTTTTCCACAGAATTC	221432

Overview

Query
CU207395.25 - 130014 bps
Hit
CU207391.12 - 221432 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link