<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207417.13	1	GGAAATCTGGAGAGGAGAGAAGAGGAGACCATTAAGACTTGCCATGGGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111284	GGAAATCTGGAGAGGAGAGAAGAGGAGACCATTAAGACTTGCCATGGGGA	111333

CU207417.13	51	GGACCGCTCGGAACTGCAGAGCACTTGTCCCTCCTCCCTAGGACCCCACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111334	GGACCGCTCGGAACTGCAGAGCACTTGTCCCTCCTCCCTAGGACCCCACC	111383

CU207417.13	101	CTGGGAAGAGTGAGTGGCAAGACAAGCAGGCAGGGTCTCACCTCTTGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111384	CTGGGAAGAGTGAGTGGCAAGACAAGCAGGCAGGGTCTCACCTCTTGCCA	111433

CU207417.13	151	TTTGGCATCATTCCACTGTTGGAATGTCACAGGTGGAGGCTCAAAAGAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111434	TTTGGCATCATTCCACTGTTGGAATGTCACAGGTGGAGGCTCAAAAGAGG	111483

CU207417.13	201	CCAAGACAATGTAGTCCGCAGAGGCCAGCTGTACCCGGAGTTGATAGGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111484	CCAAGACAATGTAGTCCGCAGAGGCCAGCTGTACCCGGAGTTGATAGGTG	111533

CU207417.13	251	CAGCCACAGTCTGCTCTGGGGGCAACCCTAGGGAGGATAGAGAAGGCTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111534	CAGCCACAGTCTGCTCTGGGGGCAACCCTAGGGAGGATAGAGAAGGCTGT	111583

CU207417.13	301	GAGCTTGAAAAACCACAGTGGCTTCTTACAGAGACACTGTCCAAGCCTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111584	GAGCTTGAAAAACCACAGTGGCTTCTTACAGAGACACTGTCCAAGCCTGT	111633

CU207417.13	351	CACCATATGGTACATTGGATGAGGACTGTGTGCTTAGCCCAGTCCCGGTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111634	CACCATATGGTACATTGGATGAGGACTGTGTGCTTAGCCCAGTCCCGGTC	111683

CU207417.13	401	CTGGGCTTCATCCTTAGCACTACAGAGATAAATTCAAGCGGTATGGGGTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111684	CTGGGCTTCATCCTTAGCACTACAGAGATAAATTCAAGCGGTATGGGGTA	111733

CU207417.13	451	ATCAGAGGGAAGGGGTGGGAGGTGCTACATAAGGCATGAGTTCCTGCCCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111734	ATCAGAGGGAAGGGGTGGGAGGTGCTACATAAGGCATGAGTTCCTGCCCA	111783

CU207417.13	501	GGGCAGCTAGCTCATTGGGAGGCCTCACTGTCCATCTGAGTCGACTGTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111784	GGGCAGCTAGCTCATTGGGAGGCCTCACTGTCCATCTGAGTCGACTGTTG	111833

CU207417.13	551	GGGGGAAAAAGGCTGATAGGGGAACGAGGCAGAGTGGGGTGGGGTTGACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111834	GGGGGAAAAAGGCTGATAGGGGAACGAGGCAGAGTGGGGTGGGGTTGACC	111883

CU207417.13	601	TGTGGCTCTTAGGGTGTCCCTTGCCACACTGTGGGGGAGACCACTTACCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111884	TGTGGCTCTTAGGGTGTCCCTTGCCACACTGTGGGGGAGACCACTTACCA	111933

CU207417.13	651	GTCCTTAACCACAATGTCAGGCCGAAAGGTGTCCATCAGCTCCTCGCAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111934	GTCCTTAACCACAATGTCAGGCCGAAAGGTGTCCATCAGCTCCTCGCAGT	111983

CU207417.13	701	AGCCCTCGGCTTTGAGGTCCACCATCTGGGATTTGAGGCACATCCTGGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	111984	AGCCCTCGGCTTTGAGGTCCACCATCTGGGATTTGAGGCACATCCTGGGG	112033

CU207417.13	751	GCAGAGGTCAGGCTTGTATTGCCAGCATGCTAAACAGAGCCCTTCCTTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112034	GCAGAGGTCAGGCTTGTATTGCCAGCATGCTAAACAGAGCCCTTCCTTGC	112083

CU207417.13	801	CAGGTAGGTGGCTCAAGGGACCCAGGTGACTTCCAGGACATACCCAGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112084	CAGGTAGGTGGCTCAAGGGACCCAGGTGACTTCCAGGACATACCCAGCCT	112133

CU207417.13	851	GGAGCTCCTTGGGTCTGTCTGAGGGAAATGGGGAGTTAGATTTGCTCTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112134	GGAGCTCCTTGGGTCTGTCTGAGGGAAATGGGGAGTTAGATTTGCTCTTC	112183

CU207417.13	901	CCTAGGGAGTATTTGGCCCCATGGGATATTATGAAGTGTTGCTGATTCTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112184	CCTAGGGAGTATTTGGCCCCATGGGATATTATGAAGTGTTGCTGATTCTT	112233

CU207417.13	951	GCTCCTGACGTGACGTTCAGTGACCTCCTGTCACCTGAAACCCAAGTTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112234	GCTCCTGACGTGACGTTCAGTGACCTCCTGTCACCTGAAACCCAAGTTGA	112283

CU207417.13	1001	CTGCTCCTGGACACTCCTTGAGCTCCCAGAGGCCCCCTCCCACGTATCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112284	CTGCTCCTGGACACTCCTTGAGCTCCCAGAGGCCCCCTCCCACGTATCCT	112333

CU207417.13	1051	ACCAGTTGGTAGAGTCTCCCAGACTCTCTGCCCTCAGCACAGGCTGCCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112334	ACCAGTTGGTAGAGTCTCCCAGACTCTCTGCCCTCAGCACAGGCTGCCCC	112383

CU207417.13	1101	GTCCGCAATCATCACTTACTCAAAAGAGGTGACAAAATACTTCTTGACCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112384	GTCCGCAATCATCACTTACTCAAAAGAGGTGACAAAATACTTCTTGACCT	112433

CU207417.13	1151	TGTTGTCAGGAAAGCTTGTGCCACAGCTCCCAGGGAGCGTCTCCACCTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112434	TGTTGTCAGGAAAGCTTGTGCCACAGCTCCCAGGGAGCGTCTCCACCTTC	112483

CU207417.13	1201	CAGCGATCCCCTCCGTTAGAGTCTATCCGCCATGAGCTCAGGTTCTCTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112484	CAGCGATCCCCTCCGTTAGAGTCTATCCGCCATGAGCTCAGGTTCTCTGG	112533

CU207417.13	1251	GGGAAAGCGGAAGCACGGGTGAGATCCCCTTGCATTCTGCCAGCAACTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112534	GGGAAAGCGGAAGCACGGGTGAGATCCCCTTGCATTCTGCCAGCAACTGC	112583

CU207417.13	1301	ATCCCTGAAGTATACACTTGAAATTTTGAGGCCTTTACTGGTCCTGGAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112584	ATCCCTGAAGTATACACTTGAAATTTTGAGGCCTTTACTGGTCCTGGAAG	112633

CU207417.13	1351	ACTTCAGGAGTGGTGAGATGGTTTTGGCTAGGGCTTAATTGGGCTCAGAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112634	ACTTCAGGAGTGGTGAGATGGTTTTGGCTAGGGCTTAATTGGGCTCAGAT	112683

CU207417.13	1401	TTTCAGATTGGGATACCAAAGGATTAATCAGTTTGCTTCTGTAGTATATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112684	TTTCAGATTGGGATACCAAAGGATTAATCAGTTTGCTTCTGTAGTATATT	112733

CU207417.13	1451	AGGGAGCCAAGTTTAGCACCCAACCAGTCCAAGAGCATGACTTCATATTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112734	AGGGAGCCAAGTTTAGCACCCAACCAGTCCAAGAGCATGACTTCATATTG	112783

CU207417.13	1501	CCGTGGGGCCCCTACAAAGACCATGTTTCAATCCTTAGAGAGTATGATCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112784	CCGTGGGGCCCCTACAAAGACCATGTTTCAATCCTTAGAGAGTATGATCA	112833

CU207417.13	1551	TAAAGGCCTGTGATGGAGTAGACCTTATGGCTGATGGGAGTTCTTCCCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112834	TAAAGGCCTGTGATGGAGTAGACCTTATGGCTGATGGGAGTTCTTCCCAA	112883

CU207417.13	1601	CGTGGCCACTTTCCTGGCCACCAGCTTTTCCAGGCTTAGGGGAGGAGAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112884	CGTGGCCACTTTCCTGGCCACCAGCTTTTCCAGGCTTAGGGGAGGAGAGG	112933

CU207417.13	1651	CCCTGGTTAACTGTGACCCAGATTCTATGGGCCAAAGGAACCCACTGTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112934	CCCTGGTTAACTGTGACCCAGATTCTATGGGCCAAAGGAACCCACTGTTC	112983

CU207417.13	1701	CCACAAGATCAGATGCCCTTTTCCTGGGCAAATGCCAAGAGGGCACATTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	112984	CCACAAGATCAGATGCCCTTTTCCTGGGCAAATGCCAAGAGGGCACATTG	113033

CU207417.13	1751	GTGTCCCCTGGGCTGGTGGCTGCAGGAGTCCTGTGGTATGGGGCCTACAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	113034	GTGTCCCCTGGGCTGGTGGCTGCAGGAGTCCTGTGGTATGGGGCCTACAG	113083

CU207417.13	1801	GAACAGGGTTAGATCTAGGGGTTCCCCCCTTCAGATCAAGTATGGCAGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	113084	GAACAGGGTTAGATCTAGGGGTTCCCCCCTTCAGATCAAGTATGGCAGAC	113133

CU207417.13	1851	CCAGGAAAACACGAGTGTTAATTGATGGTGGCCCAGAACCATCACCAGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	113134	CCAGGAAAACACGAGTGTTAATTGATGGTGGCCCAGAACCATCACCAGAA	113183

CU207417.13	1901	CTCTGCCAGTCCACTCTGTATCCCTCCCTCTAAGAGCCCACACGGTTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	113184	CTCTGCCAGTCCACTCTGTATCCCTCCCTCTAAGAGCCCACACGGTTTTC	113233

CU207417.13	1951	ATGCGTTCTGGGAAGCTTCCCAGTAGAGAACCAAAGGAAGACAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207376.7	113234	ATGCGTTCTGGGAAGCTTCCCAGTAGAGAACCAAAGGAAGACAAGAATTC	113283

Overview

Query
CU207417.13 - 157035 bps
Hit
CU207376.7 - 113283 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link