<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU459017.18	1	CACAGGCTTCCTGCCTAGAACCCTGGAGGTCCTCTACAGTCATCACCATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189038	CACAGGCTTCCTGCCTAGAACCCTGGAGGTCCTCTACAGTCATCACCATG	189087

CU459017.18	51	CTTAGTCGTCCCAGTCTCAGTTTCTTCATCTCCACAGTGGGTTGCTGGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189088	CTTAGTCGTCCCAGTCTCAGTTTCTTCATCTCCACAGTGGGTTGCTGGTA	189137

CU459017.18	101	TAACAATGGGGAGGGGGCAAGGGAGCCGCAGACAGCTGTTTAAGATGAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189138	TAACAATGGGGAGGGGGCAAGGGAGCCGCAGACAGCTGTTTAAGATGAGG	189187

CU459017.18	151	AGCCCTTCTCCAGCACCAGCCTGGGTTCTGCGCTTTGCCTTGTTTTAATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189188	AGCCCTTCTCCAGCACCAGCCTGGGTTCTGCGCTTTGCCTTGTTTTAATA	189237

CU459017.18	201	AGAGAGATGGGGGGGGGGGGGGGCTCTGACCTGCTAGCTTTGAAATTCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189238	AGAGAGATGGGGGGGGGGGGGGGCTCTGACCTGCTAGCTTTGAAATTCTT	189287

CU459017.18	251	GTTGGTTGGCCTGGAACTCACCAGGCTGGCTGGCCTGAAATTCAGGGTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189288	GTTGGTTGGCCTGGAACTCACCAGGCTGGCTGGCCTGAAATTCAGGGTGA	189337

CU459017.18	301	TCCTCCGGTCTCAACTTCCCAAATGCTGGGTCTCACATGTACCCCTCGAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189338	TCCTCCGGTCTCAACTTCCCAAATGCTGGGTCTCACATGTACCCCTCGAC	189387

CU459017.18	351	GCTGGGCTTCTGCTCTGAGTCCTCACTTCATTCCCTCAGTGAGGGCTGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189388	GCTGGGCTTCTGCTCTGAGTCCTCACTTCATTCCCTCAGTGAGGGCTGGA	189437

CU459017.18	401	GTTGGGCAGCTCAGGGAAAGAGGACAGAGAGAATCTTTTGAGGTGACAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189438	GTTGGGCAGCTCAGGGAAAGAGGACAGAGAGAATCTTTTGAGGTGACAGG	189487

CU459017.18	451	TTGGGGACCTCCTAGGGGTGGCTCTCACTTTCTGACTGATTTTTGGGGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189488	TTGGGGACCTCCTAGGGGTGGCTCTCACTTTCTGACTGATTTTTGGGGTT	189537

CU459017.18	501	AGCCTCAGTCACTTGGCTCCGATCCTCATTCCTCTGAGTTCCCCAGCTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189538	AGCCTCAGTCACTTGGCTCCGATCCTCATTCCTCTGAGTTCCCCAGCTCC	189587

CU459017.18	551	AGTCCTCTCTGGGACCCTCCTGAGCCTGGCCAGGGGCATCCTTGAGTGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189588	AGTCCTCTCTGGGACCCTCCTGAGCCTGGCCAGGGGCATCCTTGAGTGGA	189637

CU459017.18	601	GTGTGCTGGTGAGCCCTCACCCTGGGGTCTCTTTGTCTACATGGTGGGGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189638	GTGTGCTGGTGAGCCCTCACCCTGGGGTCTCTTTGTCTACATGGTGGGGA	189687

CU459017.18	651	TGAGGACCCACAAGTGTCAGGAAGCCACTCACAGGGACTGTGGGATGGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189688	TGAGGACCCACAAGTGTCAGGAAGCCACTCACAGGGACTGTGGGATGGAC	189737

CU459017.18	701	GACAGATCTGCCAACAGTGGCCCATGGGGCTTCTGATGTCACAAACTCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189738	GACAGATCTGCCAACAGTGGCCCATGGGGCTTCTGATGTCACAAACTCAG	189787

CU459017.18	751	GGATGGGCCTGTCCCATAAAGTCCCTACAAAAGCTATGCAGAAGTGCCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189788	GGATGGGCCTGTCCCATAAAGTCCCTACAAAAGCTATGCAGAAGTGCCAT	189837

CU459017.18	801	CTTGGGGATCCCTGGTGTGGATTAGCTGTGTTCCCCCACCTCCAAATGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189838	CTTGGGGATCCCTGGTGTGGATTAGCTGTGTTCCCCCACCTCCAAATGCA	189887

CU459017.18	851	ATCTAAGTGCTGACCTCTGCTCTCTGAATGTGTCTTTCCTTACCAGACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189888	ATCTAAGTGCTGACCTCTGCTCTCTGAATGTGTCTTTCCTTACCAGACAG	189937

CU459017.18	901	TTTCTGCTGGTGGGATCTGGTTTAGATGATGTCATTGCAGGCTCTGGTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189938	TTTCTGCTGGTGGGATCTGGTTTAGATGATGTCATTGCAGGCTCTGGTAG	189987

CU459017.18	951	GTAGGTCCAGTGCCTGCTGCTCTTTAAGGGGGACATTTGGACACACAGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	189988	GTAGGTCCAGTGCCTGCTGCTCTTTAAGGGGGACATTTGGACACACAGGG	190037

CU459017.18	1001	AATGGCAGAGGCAGCGGTTAGAATTTGCTGCTACAGGCTGGTGAGAGCCG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190038	AATGGCAGAGGCAGCGGTTAGAATTTGCTGCTACAGGCTGGTGAGAGCCG	190087

CU459017.18	1051	GGAGTCATGCGTGGGTCTCAGTCTCCCTGGGAACCCCAAGGAGGATGCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190088	GGAGTCATGCGTGGGTCTCAGTCTCCCTGGGAACCCCAAGGAGGATGCAG	190137

CU459017.18	1101	CCCTGCTCTGCCCTTGGCCTTTGGGCTCAGCCTCCAGGACTAGGAGAGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190138	CCCTGCTCTGCCCTTGGCCTTTGGGCTCAGCCTCCAGGACTAGGAGAGAA	190187

CU459017.18	1151	CAGATGCTGTTGTTCGAAGTTTCCGTGCTGGTGGTCCTGACCCCAGCAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190188	CAGATGCTGTTGTTCGAAGTTTCCGTGCTGGTGGTCCTGACCCCAGCAGT	190237

CU459017.18	1201	CCCGGGCAAATGCATAAACATGCCAGAGATGAAGAAACTGAAGCACAGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190238	CCCGGGCAAATGCATAAACATGCCAGAGATGAAGAAACTGAAGCACAGAG	190287

CU459017.18	1251	AGGCGAAACCCTCAGCCCAAAACACACAGCAAGCTGGTACTGTAGTCAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190288	AGGCGAAACCCTCAGCCCAAAACACACAGCAAGCTGGTACTGTAGTCAGA	190337

CU459017.18	1301	CAGACTCTGGGGCTGTTTGGCAGCCAAGCTCATTCCCCTGGCCAGGGGCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190338	CAGACTCTGGGGCTGTTTGGCAGCCAAGCTCATTCCCCTGGCCAGGGGCT	190387

CU459017.18	1351	GGTGGACTGGCCACCTTGTTTTGTGGTCATTTGTACCCAGGCTCCACACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190388	GGTGGACTGGCCACCTTGTTTTGTGGTCATTTGTACCCAGGCTCCACACC	190437

CU459017.18	1401	ATGGTCTGTCTGTCCCCAAGGACAACTGCCAAAGTGCACACTTGAGATAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190438	ATGGTCTGTCTGTCCCCAAGGACAACTGCCAAAGTGCACACTTGAGATAG	190487

CU459017.18	1451	ACACATGGGGCCAGCAGGAGACCCCATGACACGCTTCTCAGAACACAAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190488	ACACATGGGGCCAGCAGGAGACCCCATGACACGCTTCTCAGAACACAAGC	190537

CU459017.18	1501	AGGAGAAAGGAGTGCAACATTCATGTCTGAGGTCACCAGACCCTGAGGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190538	AGGAGAAAGGAGTGCAACATTCATGTCTGAGGTCACCAGACCCTGAGGGT	190587

CU459017.18	1551	CCACAGTGTCCCCATGACAGTGTCCCCATGACACCATAAGACAGAATACG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190588	CCACAGTGTCCCCATGACAGTGTCCCCATGACACCATAAGACAGAATACG	190637

CU459017.18	1601	TTTGGTACCTAGAGCTCTGGACAAGGTTTCCTGAAGTTTCAGTCTCAACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190638	TTTGGTACCTAGAGCTCTGGACAAGGTTTCCTGAAGTTTCAGTCTCAACC	190687

CU459017.18	1651	ATCACCGGCTTTGGAACTTGAGAAACTTCCTTAGTTTCCCCATCTGAAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190688	ATCACCGGCTTTGGAACTTGAGAAACTTCCTTAGTTTCCCCATCTGAAGA	190737

CU459017.18	1701	ATGGGTATAGGCTCCCAGGGCCCAGGATGTAGGGAGGGAACATCTTGGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190738	ATGGGTATAGGCTCCCAGGGCCCAGGATGTAGGGAGGGAACATCTTGGTG	190787

CU459017.18	1751	CACTGCAGAGACAAAGGACCCTTGTCTCTGCAACTTTCTCACCCACACAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190788	CACTGCAGAGACAAAGGACCCTTGTCTCTGCAACTTTCTCACCCACACAG	190837

CU459017.18	1801	GCTTCGGGGTGACGCAGGGGAGGTGATCTGGGGACAGATTTCACCGTGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190838	GCTTCGGGGTGACGCAGGGGAGGTGATCTGGGGACAGATTTCACCGTGGC	190887

CU459017.18	1851	TAAGGGGAGGGGAGAGAGGCAAGCAACTTCACCCTAGCCTTTCATTCCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190888	TAAGGGGAGGGGAGAGAGGCAAGCAACTTCACCCTAGCCTTTCATTCCCT	190937

CU459017.18	1901	CGGGAAACAGGAAGTCCACTCTGCCCAGGCGCTGCCCTGACTCCAGGAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190938	CGGGAAACAGGAAGTCCACTCTGCCCAGGCGCTGCCCTGACTCCAGGAAG	190987

CU459017.18	1951	CCAGATGACCCCTTCCTCTCCTGTCTCCCTCCCAGCTGGGGAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207375.12	190988	CCAGATGACCCCTTCCTCTCCTGTCTCCCTCCCAGCTGGGGAAGGAATTC	191037

Overview

Query
CU459017.18 - 74103 bps
Hit
CU207375.12 - 191037 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link