<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210846.9	1	GGAGCCTGGCTTGGGTTTTGACCTCTGATTTTCTGCTGGCTAGCTGAGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138603	GGAGCCTGGCTTGGGTTTTGACCTCTGATTTTCTGCTGGCTAGCTGAGTG	138652

CU210846.9	51	CTTTCCGGAGGAGGGAGGGACATTGTGTTGCTTCTCTGGGTCTGTTTTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138653	CTTTCCGGAGGAGGGAGGGACATTGTGTTGCTTCTCTGGGTCTGTTTTCT	138702

CU210846.9	101	CACATTTTTAGGGGGGAGGGGAATAAGATATGGCGGTTAAAGCCGGCTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138703	CACATTTTTAGGGGGGAGGGGAATAAGATATGGCGGTTAAAGCCGGCTTT	138752

CU210846.9	151	ATAATCCTAGCTACACAGGAGACTGAGGCAGGAGAATTGGATGTTCAGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138753	ATAATCCTAGCTACACAGGAGACTGAGGCAGGAGAATTGGATGTTCAGTC	138802

CU210846.9	201	TAGTCAGACCAACTTAGCAAGACCCTGTAACATTTTTAAAAAGGACAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138803	TAGTCAGACCAACTTAGCAAGACCCTGTAACATTTTTAAAAAGGACAGAG	138852

CU210846.9	251	GGAACCTGGATCAGGGAGAAAGGCTCTGTGCATATTCTTTAGTGCTGGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138853	GGAACCTGGATCAGGGAGAAAGGCTCTGTGCATATTCTTTAGTGCTGGAA	138902

CU210846.9	301	CACTTGTCTGGCTTATGCCAAAGCCCTGGAAGGTAATTGATTAATTAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138903	CACTTGTCTGGCTTATGCCAAAGCCCTGGAAGGTAATTGATTAATTAAAA	138952

CU210846.9	351	GAGGCTGCAAGTCACTTTGGGGCCTCCAGCTCCCCACGTCCCTGGGCCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	138953	GAGGCTGCAAGTCACTTTGGGGCCTCCAGCTCCCCACGTCCCTGGGCCTG	139002

CU210846.9	401	GCCTCGCTATATTCGCAGTGCAGATAATATGTTCCAATGTCAGGGACCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139003	GCCTCGCTATATTCGCAGTGCAGATAATATGTTCCAATGTCAGGGACCAT	139052

CU210846.9	451	CTACTCCCTTAGAAAAACAGCTTCCCCCTTCCCAGCCCAGACAGCGACAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139053	CTACTCCCTTAGAAAAACAGCTTCCCCCTTCCCAGCCCAGACAGCGACAG	139102

CU210846.9	501	CAGATGAGCCTCACCTGGCGGCCCCAGAGCTTGCGGAAGATCTGGAAATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139103	CAGATGAGCCTCACCTGGCGGCCCCAGAGCTTGCGGAAGATCTGGAAATA	139152

CU210846.9	551	GGCCATAGCCATGAGGCCCAGTGGGGCCAGGTAGGTGACAATGAAAAAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139153	GGCCATAGCCATGAGGCCCAGTGGGGCCAGGTAGGTGACAATGAAAAAGC	139202

CU210846.9	601	AGCTGTGATAGATCTTGGGGTAGAGTTCATCTGTAGGTCGCAAGACACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139203	AGCTGTGATAGATCTTGGGGTAGAGTTCATCTGTAGGTCGCAAGACACAA	139252

CU210846.9	651	GGGTCAAGTTCACCCTGGAGGTCCCCGTCTGCCTCAGCAATGCCACCCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139253	GGGTCAAGTTCACCCTGGAGGTCCCCGTCTGCCTCAGCAATGCCACCCTG	139302

CU210846.9	701	TCCCAACATGAACCAAAGCAAGACCTGGGGACAACTGAATTCACATAAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139303	TCCCAACATGAACCAAAGCAAGACCTGGGGACAACTGAATTCACATAAGC	139352

CU210846.9	751	ACCTTGGGTAGAGAGAGAGCCTAGAATTGCCCAGTCTAGTGGTGCCAGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139353	ACCTTGGGTAGAGAGAGAGCCTAGAATTGCCCAGTCTAGTGGTGCCAGCC	139402

CU210846.9	801	TGGAGGGATCCCCAGCTGATGCTCACACTAGAGGAGATACCTACCCTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139403	TGGAGGGATCCCCAGCTGATGCTCACACTAGAGGAGATACCTACCCTGGG	139452

CU210846.9	851	GGTACCCACCCTGAAAATCCCCTGCCCTGGGGGTATACACCTCCAGAAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139453	GGTACCCACCCTGAAAATCCCCTGCCCTGGGGGTATACACCTCCAGAAGT	139502

CU210846.9	901	GCCCATTACCTGCCCAGTGCTCATCACAGACAGAGAAGAGCCGGGTGCGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139503	GCCCATTACCTGCCCAGTGCTCATCACAGACAGAGAAGAGCCGGGTGCGA	139552

CU210846.9	951	TTGGCTAGCTCAGGCAGCACGCTGCTGCACTCCATGACAGCAGCCTGGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139553	TTGGCTAGCTCAGGCAGCACGCTGCTGCACTCCATGACAGCAGCCTGGGG	139602

CU210846.9	1001	CACCATGACAGCCAGCGACACAGCCCAGATGCCCAGGATGGAGCCACGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139603	CACCATGACAGCCAGCGACACAGCCCAGATGCCCAGGATGGAGCCACGGG	139652

CU210846.9	1051	CACGGCGAGCTGTGCTCTTGAACAACAGTGGGTGGCAGATGGCATACCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139653	CACGGCGAGCTGTGCTCTTGAACAACAGTGGGTGGCAGATGGCATACCAG	139702

CU210846.9	1101	CGGTCCAGGGCGATGAAGCTGAGAGTCAGCACTGCCACTGACACCGACAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139703	CGGTCCAGGGCGATGAAGCTGAGAGTCAGCACTGCCACTGACACCGACAC	139752

CU210846.9	1151	AGCCTGCCCCACAGGGACACAACATCAGAGGTAGGGCGGGGCAGGGGGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139753	AGCCTGCCCCACAGGGACACAACATCAGAGGTAGGGCGGGGCAGGGGGAG	139802

CU210846.9	1201	GGGAAACAGTTCACAGCCCAGAGCTACCAGTGCAGCAAATCGTGACTCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139803	GGGAAACAGTTCACAGCCCAGAGCTACCAGTGCAGCAAATCGTGACTCCA	139852

CU210846.9	1251	CCCCTTTGTGCTGTGTGAATTTGGGCAAGTCACTCACCCTCTCTGAGCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139853	CCCCTTTGTGCTGTGTGAATTTGGGCAAGTCACTCACCCTCTCTGAGCCT	139902

CU210846.9	1301	CATCTGCAGAATGGGAATATAGCATCTATCTGGCAGGATGCTGGTGAGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139903	CATCTGCAGAATGGGAATATAGCATCTATCTGGCAGGATGCTGGTGAGAA	139952

CU210846.9	1351	TAAATGAAATCGTGTATGGAAAATGTCCAATTGGAGACCTGACACACACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	139953	TAAATGAAATCGTGTATGGAAAATGTCCAATTGGAGACCTGACACACACA	140002

CU210846.9	1401	ATGAGACTTTGTGTGGCAAACAGACCTCTCCCTATTTTTTTCTAAATAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140003	ATGAGACTTTGTGTGGCAAACAGACCTCTCCCTATTTTTTTCTAAATAAT	140052

CU210846.9	1451	TTTTTTTATGTACATTGATGTTTTGCTTGCATGTATGTCAGTATGAGGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140053	TTTTTTTATGTACATTGATGTTTTGCTTGCATGTATGTCAGTATGAGGGT	140102

CU210846.9	1501	GTTGGATCCCCTGGAACAGGAGTTACAGACAGTTGTGAGATGACATCTAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140103	GTTGGATCCCCTGGAACAGGAGTTACAGACAGTTGTGAGATGACATCTAG	140152

CU210846.9	1551	GTGCTGGGAATTGAACCGGGGGCCTCTGGAAGAGCCAGTGCTCTTAACCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140153	GTGCTGGGAATTGAACCGGGGGCCTCTGGAAGAGCCAGTGCTCTTAACCC	140202

CU210846.9	1601	CTGAGCCATCTCTCCTACCCCTCCTTTCTCTACTTTTAAAACCTATGAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140203	CTGAGCCATCTCTCCTACCCCTCCTTTCTCTACTTTTAAAACCTATGAAG	140252

CU210846.9	1651	TAGGTGTCCTGGTACAGTGAAGAGATGAGACACATGATCTCCATCCACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140253	TAGGTGTCCTGGTACAGTGAAGAGATGAGACACATGATCTCCATCCACAG	140302

CU210846.9	1701	AGGGGACCAGTTGGGCAGAAAACCTTAAAGCAGTGTGAAGTCCCTGAGGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140303	AGGGGACCAGTTGGGCAGAAAACCTTAAAGCAGTGTGAAGTCCCTGAGGC	140352

CU210846.9	1751	ATCACTGTCAGCCCGGGAGGTCACCCCTATGCTGTTGGGAAATCTCTCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140353	ATCACTGTCAGCCCGGGAGGTCACCCCTATGCTGTTGGGAAATCTCTCTT	140402

CU210846.9	1801	GGTCTGAGCGGCACAGATGAATTGACTGGTAGTATAGGTAGGCATTGCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140403	GGTCTGAGCGGCACAGATGAATTGACTGGTAGTATAGGTAGGCATTGCCT	140452

CU210846.9	1851	CCAGGGTGCCCTGTTTCCCAGGATACAGGAAGAGGACCAAGGGCTACTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140453	CCAGGGTGCCCTGTTTCCCAGGATACAGGAAGAGGACCAAGGGCTACTAA	140502

CU210846.9	1901	GAGGCCGTGGTGGTCTCTGGCTAGTCCTCTTCCTATTCCACTGATATCAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140503	GAGGCCGTGGTGGTCTCTGGCTAGTCCTCTTCCTATTCCACTGATATCAT	140552

CU210846.9	1951	CTGGGTGTCCTGGTGTCCAGCGTTGGGGAAGGAGACTAGAGAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207372.6	140553	CTGGGTGTCCTGGTGTCCAGCGTTGGGGAAGGAGACTAGAGAGAGAATTC	140602

Overview

Query
CU210846.9 - 134910 bps
Hit
CU207372.6 - 140602 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link