<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU234133.8	1	GTGTATGCCTGTGTGTAGCTATGTTCACCTGCACGTGCTGAATGGCTGTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	119750	GTGTATGCCTGTGTGTAGCTATGTTCACCTGCACGTGCTGAATGGCTGTC	119799

CU234133.8	51	CTGCTCTGTCACTCTTGGCCTTACATGCCTGAGAGGTCTCTAATAGCATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	119800	CTGCTCTGTCACTCTTGGCCTTACATGCCTGAGAGGTCTCTAATAGCATG	119849

CU234133.8	101	GAGTTATGTCAGTACTCCTCTCTGCCCCCCAGATTTGGGACCAAAGATGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	119850	GAGTTATGTCAGTACTCCTCTCTGCCCCCCAGATTTGGGACCAAAGATGT	119899

CU234133.8	151	GTGTGTGGTCATGTGTGTGTGTTCACATTTGAGCTTGTTATGAAACTTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	119900	GTGTGTGGTCATGTGTGTGTGTTCACATTTGAGCTTGTTATGAAACTTCT	119949

CU234133.8	201	GGGGATTTGGACTCACTTCGAATTCATGCATTTGTACCAAGTATTCAACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	119950	GGGGATTTGGACTCACTTCGAATTCATGCATTTGTACCAAGTATTCAACT	119999

CU234133.8	251	GCTGAACCCAAATTTTCACTAAAGCCACAGACCCCCTCCTCCTCCACTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120000	GCTGAACCCAAATTTTCACTAAAGCCACAGACCCCCTCCTCCTCCACTCC	120049

CU234133.8	301	AGATAATGCTAAAAATTATTTTGATGATTTCATGTATATAATATATTCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120050	AGATAATGCTAAAAATTATTTTGATGATTTCATGTATATAATATATTCTG	120099

CU234133.8	351	ATCACAACCATCTTCCCCGCTCTTCTTTCCCCAACCTCTGCCAACCCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120100	ATCACAACCATCTTCCCCGCTCTTCTTTCCCCAACCTCTGCCAACCCCTC	120149

CU234133.8	401	CCTCTTTCCAGCAAGCGCCCCACCACCCCCATTCATGCTTTTGTTTTTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120150	CCTCTTTCCAGCAAGCGCCCCACCACCCCCATTCATGCTTTTGTTTTTGT	120199

CU234133.8	451	GAATGTCTATTTAGAACGTGTAAATGTCTACTTGGAACGGCCATGCTGTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120200	GAATGTCTATTTAGAACGTGTAAATGTCTACTTGGAACGGCCATGCTGTC	120249

CU234133.8	501	ATTCTCTGACTGCAGAGTGCCAGGGTACTTCAGTGTGGCCTTCTCAGGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120250	ATTCTCTGACTGCAGAGTGCCAGGGTACTTCAGTGTGGCCTTCTCAGGTT	120299

CU234133.8	551	TCGCAGAGAGGTCTCAAGAGTCTGTAGCAGAGTGATGCGGAGTGTGAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120300	TCGCAGAGAGGTCTCAAGAGTCTGTAGCAGAGTGATGCGGAGTGTGAGCT	120349

CU234133.8	601	CGGAGCCAAGGCAAATCCCACCGGCTCTGCCTCCTCACAGGTAAAATGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120350	CGGAGCCAAGGCAAATCCCACCGGCTCTGCCTCCTCACAGGTAAAATGGG	120399

CU234133.8	651	ATCACACCTGATTTTAACTAAGAGGCCAAGAAGCAGAGGAAATGGGACTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120400	ATCACACCTGATTTTAACTAAGAGGCCAAGAAGCAGAGGAAATGGGACTT	120449

CU234133.8	701	CCGGCTGGAGAGATGTCTGGTGGCTGCTGCTTTTGCAGAGGTCATTCTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120450	CCGGCTGGAGAGATGTCTGGTGGCTGCTGCTTTTGCAGAGGTCATTCTCT	120499

CU234133.8	751	GTAGAGACAGAGGACAGTTTACACCTTCCTGTGTAAATACTGTTTTGACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120500	GTAGAGACAGAGGACAGTTTACACCTTCCTGTGTAAATACTGTTTTGACT	120549

CU234133.8	801	TGCCTGTAGTAAGTGTTGTCTGGGAGGCTTACAGCTTTCTATCTGCTAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120550	TGCCTGTAGTAAGTGTTGTCTGGGAGGCTTACAGCTTTCTATCTGCTAAC	120599

CU234133.8	851	CTAAGCCTAGTCCTGGAAGCTTGTAACCTCTGTACAATCTAATCCAGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120600	CTAAGCCTAGTCCTGGAAGCTTGTAACCTCTGTACAATCTAATCCAGGCC	120649

CU234133.8	901	CAGAATATCTCCAGCCTCTGAGGCTTGCTGCTGAAGAAGCAACTCACCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120650	CAGAATATCTCCAGCCTCTGAGGCTTGCTGCTGAAGAAGCAACTCACCCT	120699

CU234133.8	951	AGTTCTTTCTCATCTTTCTCATCAGCTGCTCTGGCTCCGACTGATTCAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120700	AGTTCTTTCTCATCTTTCTCATCAGCTGCTCTGGCTCCGACTGATTCAAT	120749

CU234133.8	1001	CTGGCTTCTCTTGGCTTCTGATTGATTTGCTCTGCTTGGCCTCAAACTAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120750	CTGGCTTCTCTTGGCTTCTGATTGATTTGCTCTGCTTGGCCTCAAACTAC	120799

CU234133.8	1051	TTCAGTCCGTTCTAATCTTCTGACTCCATCTCCTTCTCTGACTCATTCAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120800	TTCAGTCCGTTCTAATCTTCTGACTCCATCTCCTTCTCTGACTCATTCAC	120849

CU234133.8	1101	CTGGGTTTAGCTTGTTTTCTCTTGCAACCTATTTCTCTAAACTGACCTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120850	CTGGGTTTAGCTTGTTTTCTCTTGCAACCTATTTCTCTAAACTGACCTGG	120899

CU234133.8	1151	TATAACTGTCTCCTCGGCCGGGCAGTGGTGGCACATACTTTTAATCCTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120900	TATAACTGTCTCCTCGGCCGGGCAGTGGTGGCACATACTTTTAATCCTAG	120949

CU234133.8	1201	TACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCGAATTTCTGAGTTCGAGACCAACCTGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	120950	TACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCGAATTTCTGAGTTCGAGACCAACCTGGT	120999

CU234133.8	1251	CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121000	CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCT	121049

CU234133.8	1301	CAAAAAAACCGAAAAAAAAAAAAAAACAACCAACCAAACAACCAACCACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121050	CAAAAAAACCGAAAAAAAAAAAAAAACAACCAACCAAACAACCAACCACC	121099

CU234133.8	1351	CCCCCCCCCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAACCAAAAAACCCAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121100	CCCCCCCCCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAACCAAAAAACCCAAA	121149

CU234133.8	1401	AAACCTGTCTCCTCCTTCTCTTTTTCTGTCTCTGTGCTGCTCTCTCTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121150	AAACCTGTCTCCTCCTTCTCTTTTTCTGTCTCTGTGCTGCTCTCTCTTTT	121199

CU234133.8	1451	AAAGATTTATTTATTATTATATGTAAGTACACTGGCTGACTTCAGACACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121200	AAAGATTTATTTATTATTATATGTAAGTACACTGGCTGACTTCAGACACA	121249

CU234133.8	1501	CCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTATGGGTGGTTGTTAGCCACCTTGTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121250	CCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTATGGGTGGTTGTTAGCCACCTTGTG	121299

CU234133.8	1551	GTTGCTGTGATTTGAACTCTGGACCTTCAGAAGAGAAGTCAGTGCTCTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121300	GTTGCTGTGATTTGAACTCTGGACCTTCAGAAGAGAAGTCAGTGCTCTTA	121349

CU234133.8	1601	ACCACTGAGCCATCTCTTCAGTCCCTTTGTGTTGCTCTCTTAAGTAGCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121350	ACCACTGAGCCATCTCTTCAGTCCCTTTGTGTTGCTCTCTTAAGTAGCTT	121399

CU234133.8	1651	CTCTTTCCTCATGAGAGTTGGGCACATCCTATGTCTCACTCATTCTGTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121400	CTCTTTCCTCATGAGAGTTGGGCACATCCTATGTCTCACTCATTCTGTTG	121449

CU234133.8	1701	AGTCTTTCTTTGATTTGTCACTTTGTCCGCCACTCAACGATCAATTTCAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121450	AGTCTTTCTTTGATTTGTCACTTTGTCCGCCACTCAACGATCAATTTCAA	121499

CU234133.8	1751	ACATGAGTTCTTTCTTCTATGCATTGTTTGGGATTAAAGGTGTGTGCTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121500	ACATGAGTTCTTTCTTCTATGCATTGTTTGGGATTAAAGGTGTGTGCTAA	121549

CU234133.8	1801	GGGTTGAGCCACACCACAACTAAAAACAGGTTTTTTTTTTCAGTATATAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121550	GGGTTGAGCCACACCACAACTAAAAACAGGTTTTTTTTTTCAGTATATAA	121599

CU234133.8	1851	CACAATTTTAGGGTTTACAGTGTGATCAGATATCCTGCAACATTCCTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121600	CACAATTTTAGGGTTTACAGTGTGATCAGATATCCTGCAACATTCCTGTT	121649

CU234133.8	1901	AACTCCAGCTCCAAGCGTTCCATGATCTCTTCTGACCTCCCTAGGCACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121650	AACTCCAGCTCCAAGCGTTCCATGATCTCTTCTGACCTCCCTAGGCACTG	121699

CU234133.8	1951	CAGGCACATGGTACATATATACATATATACTCTGAGGTACAGGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207362.5	121700	CAGGCACATGGTACATATATACATATATACTCTGAGGTACAGGTGAATTC	121749

Overview

Query
CU234133.8 - 121780 bps
Hit
CU207362.5 - 121749 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link