<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210866.8	1	GAATTCAGTTGAGAAATGAGCCTGCTGGAAGAATGACACTGTTTAACACG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32138	GAATTCAGTTGAGAAATGAGCCTGCTGGAAGAATGACACTGTTTAACACG	32187

CU210866.8	51	GTAGGGCCCTTTGGAGGCTGAAGAGGTGGCTCAGCAGTTAAGAACACTGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32188	GTAGGGCCCTTTGGAGGCTGAAGAGGTGGCTCAGCAGTTAAGAACACTGG	32237

CU210866.8	101	GCTGCACTTTCAGGGGACCGGGCTTCAGTTCCCAGCACCAACTATACGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32238	GCTGCACTTTCAGGGGACCGGGCTTCAGTTCCCAGCACCAACTATACGTG	32287

CU210866.8	151	ACTCCAGTTCCAGGGGAAATGATAACCTCTCCTGGCCTCCACAGTCATTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32288	ACTCCAGTTCCAGGGGAAATGATAACCTCTCCTGGCCTCCACAGTCATTG	32337

CU210866.8	201	TATGTACAAGGTACATACACTCACAAGGCAGACAAACCACCAACACAAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32338	TATGTACAAGGTACATACACTCACAAGGCAGACAAACCACCAACACAAAT	32387

CU210866.8	251	AAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAGCAAAACAAAACAAAACAAAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32388	AAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAGCAAAACAAAACAAAACAAAAT	32437

CU210866.8	301	ACAGAGGCCCCGCCAGTTGTGTGTCTCCCCAGATGTTTCTCTCATTGGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32438	ACAGAGGCCCCGCCAGTTGTGTGTCTCCCCAGATGTTTCTCTCATTGGAA	32487

CU210866.8	351	CAAACAACAATGAACCCTGGAGTCACCAAGAGCTCATCGGTGACCGTCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32488	CAAACAACAATGAACCCTGGAGTCACCAAGAGCTCATCGGTGACCGTCCA	32537

CU210866.8	401	TTCCAGGTAGGCAGACAGGAAGTAAGGTTGCTGCAGGAGCCAGGTAGTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32538	TTCCAGGTAGGCAGACAGGAAGTAAGGTTGCTGCAGGAGCCAGGTAGTGG	32587

CU210866.8	451	GCACTTAACGCACCAAGAGCAATGTGGAACACCACCATCAGCAAAGTCAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32588	GCACTTAACGCACCAAGAGCAATGTGGAACACCACCATCAGCAAAGTCAG	32637

CU210866.8	501	AAAGCCAGCCAAAGGCTTTTTTCTTTACCCACGGAAATCTATGGGAATCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32638	AAAGCCAGCCAAAGGCTTTTTTCTTTACCCACGGAAATCTATGGGAATCT	32687

CU210866.8	551	AGAAATCCTAAACTGAGAGCAATGGGCACTGTTGGCCAAATAGACCAAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32688	AGAAATCCTAAACTGAGAGCAATGGGCACTGTTGGCCAAATAGACCAAGA	32737

CU210866.8	601	GTGTGTGACCACACTCTGATTTTGAGGATGGCGTCGAACTCGTGCTCCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32738	GTGTGTGACCACACTCTGATTTTGAGGATGGCGTCGAACTCGTGCTCCTC	32787

CU210866.8	651	CTACCTAATCGCTAGAGTGCTGGGGCTACAGGCAGGCATGCACCATCATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32788	CTACCTAATCGCTAGAGTGCTGGGGCTACAGGCAGGCATGCACCATCATA	32837

CU210866.8	701	GCCAGTTTTATGCAGTACTTGGGTTCAAACCCAGGGCTATGCGTTAGATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32838	GCCAGTTTTATGCAGTACTTGGGTTCAAACCCAGGGCTATGCGTTAGATC	32887

CU210866.8	751	TCCACCTACTTGGAACAGATGGCGGTGCGCATGCTCAGTCTTTCCTCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32888	TCCACCTACTTGGAACAGATGGCGGTGCGCATGCTCAGTCTTTCCTCAGG	32937

CU210866.8	801	GGCCGGAGCGCATGCGCTGTTTTACCTCAGGGTTCTGATGCATTACACGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32938	GGCCGGAGCGCATGCGCTGTTTTACCTCAGGGTTCTGATGCATTACACGA	32987

CU210866.8	851	ACTGTCATTCTGGTTCACTGTGACGACGATCACGTGTTCATCTAGCCTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	32988	ACTGTCATTCTGGTTCACTGTGACGACGATCACGTGTTCATCTAGCCTGA	33037

CU210866.8	901	CGAAGGGGAAGCAGCAAGAGTTATGGAGGTCCTGTAAGACAAAGGCAGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33038	CGAAGGGGAAGCAGCAAGAGTTATGGAGGTCCTGTAAGACAAAGGCAGGT	33087

CU210866.8	951	GTTGTGTGAATTTTCCTGGGTAGTCGGGAACAAAGGTCCATTTACCCTTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33088	GTTGTGTGAATTTTCCTGGGTAGTCGGGAACAAAGGTCCATTTACCCTTA	33137

CU210866.8	1001	GATATGGTACCGAGGGCAGAATAAGTCCACTTTGGTGTGGCTTGGTGAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33138	GATATGGTACCGAGGGCAGAATAAGTCCACTTTGGTGTGGCTTGGTGAAC	33187

CU210866.8	1051	CATTGAGTTTATTTATTTGGTTGGTTTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33188	CATTGAGTTTATTTATTTGGTTGGTTTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	33237

CU210866.8	1101	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33238	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTG	33287

CU210866.8	1151	TCTGTTGCACACATATGTATGCTCTCGCCCATCCATGCATGCACAGGGTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33288	TCTGTTGCACACATATGTATGCTCTCGCCCATCCATGCATGCACAGGGTC	33337

CU210866.8	1201	AGAAGAAGATACCGGGTATCCTGTTTTATCAACATCCCTTCTCCTCTCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33338	AGAAGAAGATACCGGGTATCCTGTTTTATCAACATCCCTTCTCCTCTCTT	33387

CU210866.8	1251	GAGACAGAGTCTCTCACTGAACCTGGAGCTAGGTTGACAACCAGCAAGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33388	GAGACAGAGTCTCTCACTGAACCTGGAGCTAGGTTGACAACCAGCAAGCT	33437

CU210866.8	1301	CTGGTGACCTTGTCTCCATGTCCCACAAGGCTGGGATTATGGGCATGTGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33438	CTGGTGACCTTGTCTCCATGTCCCACAAGGCTGGGATTATGGGCATGTGC	33487

CU210866.8	1351	ACAGCCACTGTTAGCTTCCCACACGAGTGCTGCAGATCTGAGCTCAGGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33488	ACAGCCACTGTTAGCTTCCCACACGAGTGCTGCAGATCTGAGCTCAGGTC	33537

CU210866.8	1401	TGCCTGCCTGTGCACCAGGCAATCTTCCCCTCTAGCCCCAGTGGGCCCAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33538	TGCCTGCCTGTGCACCAGGCAATCTTCCCCTCTAGCCCCAGTGGGCCCAA	33587

CU210866.8	1451	CCTTCTGCCTCTTTAGGGTAATGTTGGTTGCTCTGATTCCAAAATGGCAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33588	CCTTCTGCCTCTTTAGGGTAATGTTGGTTGCTCTGATTCCAAAATGGCAA	33637

CU210866.8	1501	ATGCTGTGTCATACTAGGAGGGAATGAGAGGACAAGAGACAAAAGATTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33638	ATGCTGTGTCATACTAGGAGGGAATGAGAGGACAAGAGACAAAAGATTCA	33687

CU210866.8	1551	GGGCTCTGACCCAATTCCTAGGGATAACGTGATTCAGGACAGGTAGTAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33688	GGGCTCTGACCCAATTCCTAGGGATAACGTGATTCAGGACAGGTAGTAAC	33737

CU210866.8	1601	AGCCTTTCCAAGGACACAGACAGACTATCATATTGTGGTAAATATTATTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33738	AGCCTTTCCAAGGACACAGACAGACTATCATATTGTGGTAAATATTATTT	33787

CU210866.8	1651	TGGCGGTTTACCCCCACTTAAACCATATAGCTCCCAAATAAAAGATACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33788	TGGCGGTTTACCCCCACTTAAACCATATAGCTCCCAAATAAAAGATACAG	33837

CU210866.8	1701	AAGCCTTTATATTTAGAGTGAGCCTTAAAGCATTAGAGCTGCCCTGAGAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33838	AAGCCTTTATATTTAGAGTGAGCCTTAAAGCATTAGAGCTGCCCTGAGAT	33887

CU210866.8	1751	ATCACATCCCATGATCTACCTGGGCTGCTCCTACTCCACCTGGCTGGCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33888	ATCACATCCCATGATCTACCTGGGCTGCTCCTACTCCACCTGGCTGGCCC	33937

CU210866.8	1801	TCATGGCTAACACTCATGATTTAACTACGTACACCATGGAGACTTCTCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33938	TCATGGCTAACACTCATGATTTAACTACGTACACCATGGAGACTTCTCCT	33987

CU210866.8	1851	TTTTCCTCTCTCTCTCTCTCCTGGTCCCTGCCTAAGCCCCCAAGCCTGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	33988	TTTTCCTCTCTCTCTCTCTCCTGGTCCCTGCCTAAGCCCCCAAGCCTGAG	34037

CU210866.8	1901	AAACTTCACTCTGCCTCCTCTCCTGCTCAGCCCAGGCAGTAGGCATCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	34038	AAACTTCACTCTGCCTCCTCTCCTGCTCAGCCCAGGCAGTAGGCATCTTT	34087

CU210866.8	1951	ATTAACCAATCAAGGATGACTTGGAGAGCTAAGTTTACATAACGAAAGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207361.21	34088	ATTAACCAATCAAGGATGACTTGGAGAGCTAAGTTTACATAACGAAAGCT	34137

Overview

Query
CU210866.8 - 203649 bps
Hit
CU207361.21 - 34137 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link