<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU467017.8	1	CATTAGACAGGTAAAACACATGCCCCCTGCTTTCAAGAAACTGACTCTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	197794	CATTAGACAGGTAAAACACATGCCCCCTGCTTTCAAGAAACTGACTCTGA	197843

CU467017.8	51	GTTTGGGAAAGAGATGTAGCCCCACTGTTAAATATGTTCCTGAAAAGAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	197844	GTTTGGGAAAGAGATGTAGCCCCACTGTTAAATATGTTCCTGAAAAGAAT	197893

CU467017.8	101	ATAGAACTGTAAAGCAAGAAGTGGGGAAAGGGGTTGTCTAGGCAGTAAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	197894	ATAGAACTGTAAAGCAAGAAGTGGGGAAAGGGGTTGTCTAGGCAGTAAGC	197943

CU467017.8	151	CTTTGAGGAAGCCAAGATGGCTATGTGAAGGGTATGGTTTGGGCCAGCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	197944	CTTTGAGGAAGCCAAGATGGCTATGTGAAGGGTATGGTTTGGGCCAGCTT	197993

CU467017.8	201	ACACCCAAGTCCTTGCATGTGAGCCTCATGGTAGAAGGGCCATCTTTGTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	197994	ACACCCAAGTCCTTGCATGTGAGCCTCATGGTAGAAGGGCCATCTTTGTA	198043

CU467017.8	251	GGCTGTGTCTGAGGCACACCATGTCAGCATATCCTCATTCCTTTCCCTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198044	GGCTGTGTCTGAGGCACACCATGTCAGCATATCCTCATTCCTTTCCCTTG	198093

CU467017.8	301	TCCAGGATACATACATCCTTCAACTACTTTCAACTTCCAAAAGCAGGTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198094	TCCAGGATACATACATCCTTCAACTACTTTCAACTTCCAAAAGCAGGTGT	198143

CU467017.8	351	CTCCATTCCCCCACTTCCTAAGTAAGTTGAGTTGTCTATTCTCAGACATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198144	CTCCATTCCCCCACTTCCTAAGTAAGTTGAGTTGTCTATTCTCAGACATT	198193

CU467017.8	401	CTAAACTCCTTTTATTAAGTAGACCTGACAGGATTAAGATTCATCTCAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198194	CTAAACTCCTTTTATTAAGTAGACCTGACAGGATTAAGATTCATCTCAAC	198243

CU467017.8	451	ATAACATAATTAAATAAACTTACTTCTAGCTGGGCAGTGGTGGTGCACCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198244	ATAACATAATTAAATAAACTTACTTCTAGCTGGGCAGTGGTGGTGCACCC	198293

CU467017.8	501	CTTTAATCCTAGCAGTTGAGAGGAGGCAGAAGCAGGTAAGGCCAGCCTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198294	CTTTAATCCTAGCAGTTGAGAGGAGGCAGAAGCAGGTAAGGCCAGCCTGG	198343

CU467017.8	551	TCCAAAGAGCAAGTTCCAGGACAGTCAAGGCTACACACAGAGAGACCCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198344	TCCAAAGAGCAAGTTCCAGGACAGTCAAGGCTACACACAGAGAGACCCTG	198393

CU467017.8	601	TCTTGAAAAACAACAAACAGGCCCAAAACCTACTTTTAAAAGAACCATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198394	TCTTGAAAAACAACAAACAGGCCCAAAACCTACTTTTAAAAGAACCATTT	198443

CU467017.8	651	GGGAATCAACAAGTGCAAGGCCAGCGTAAACAACTTAGTGGGACCATGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198444	GGGAATCAACAAGTGCAAGGCCAGCGTAAACAACTTAGTGGGACCATGTG	198493

CU467017.8	701	TCAAAATCCAAAAGTAAGAGAGGGGCTGAAGTGAGAGGTGTACCCCAGAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198494	TCAAAATCCAAAAGTAAGAGAGGGGCTGAAGTGAGAGGTGTACCCCAGAG	198543

CU467017.8	751	GTGGAACACTTACCAAGCAGTACTACAAAACAAAACCAAAGTAGAAAATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198544	GTGGAACACTTACCAAGCAGTACTACAAAACAAAACCAAAGTAGAAAATA	198593

CU467017.8	801	ACCCCTACTCTCTCTAAAGAAGTGTTAATTCTTTTAGAAAGTAATTTTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198594	ACCCCTACTCTCTCTAAAGAAGTGTTAATTCTTTTAGAAAGTAATTTTCC	198643

CU467017.8	851	CAGTTATTCACATTGTATATTTCTATGTGCATCAGGTATGTGTGTATATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198644	CAGTTATTCACATTGTATATTTCTATGTGCATCAGGTATGTGTGTATATA	198693

CU467017.8	901	TGTGTATGTGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGCATGGTATGTATATGTATAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198694	TGTGTATGTGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGCATGGTATGTATATGTATAC	198743

CU467017.8	951	ATGGTATATGTGTATGTATGGTATGTATGTTGCTTGTATGTGTATGGTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198744	ATGGTATATGTGTATGTATGGTATGTATGTTGCTTGTATGTGTATGGTAT	198793

CU467017.8	1001	GTGTATATGCATGCATGTTTTGTCTATATGTCTATGTCTATGTATGCATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198794	GTGTATATGCATGCATGTTTTGTCTATATGTCTATGTCTATGTATGCATG	198843

CU467017.8	1051	ATATTTGTGTGTATGTATGTATACACACACATATATATGTATACATGGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198844	ATATTTGTGTGTATGTATGTATACACACACATATATATGTATACATGGTG	198893

CU467017.8	1101	TGTGTGTATGGTATGTATGGTGCTTGTATGTGTATGGTGTGTATATGTAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198894	TGTGTGTATGGTATGTATGGTGCTTGTATGTGTATGGTGTGTATATGTAT	198943

CU467017.8	1151	TCATGGATTTGTATGTATGTGTATGTATGATGGTGTTTCTGTGTATATGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198944	TCATGGATTTGTATGTATGTGTATGTATGATGGTGTTTCTGTGTATATGT	198993

CU467017.8	1201	ATGTGTCTATGTGTATGTATGTATGGTGTTTGTGTGTGTGTATGTATGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	198994	ATGTGTCTATGTGTATGTATGTATGGTGTTTGTGTGTGTGTATGTATGGT	199043

CU467017.8	1251	ATGTGTGTGAGTATGTGTATGTGTGATGTATGGTTTTGTATGTGTATGGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199044	ATGTGTGTGAGTATGTGTATGTGTGATGTATGGTTTTGTATGTGTATGGT	199093

CU467017.8	1301	ATGTGTATATGTATGCATGGTTTTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTATAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199094	ATGTGTATATGTATGCATGGTTTTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTATAT	199143

CU467017.8	1351	GTATGTATGTTGTTTGTGTGTGTGTGTATGCATGGTGTGTGTGTGTGTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199144	GTATGTATGTTGTTTGTGTGTGTGTGTATGCATGGTGTGTGTGTGTGTGT	199193

CU467017.8	1401	GTGTGTGTGTGTGTGCATGGTGTGTGTGTATGTCTCAGCCCTGAACAGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199194	GTGTGTGTGTGTGTGCATGGTGTGTGTGTATGTCTCAGCCCTGAACAGGA	199243

CU467017.8	1451	ACAGGGAGGTCTATGCAGAGTGTTTGTTGACTTTGCATAGCTGAAAGCAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199244	ACAGGGAGGTCTATGCAGAGTGTTTGTTGACTTTGCATAGCTGAAAGCAA	199293

CU467017.8	1501	TCTTGATGCCTCTTTTCTCTTGTGAGAACACTGGAGGGGCGAGACAACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199294	TCTTGATGCCTCTTTTCTCTTGTGAGAACACTGGAGGGGCGAGACAACAT	199343

CU467017.8	1551	AGTTACTCAGTGACTGTCAGGTCTAGATACTTCTATAATTATTTTCTGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199344	AGTTACTCAGTGACTGTCAGGTCTAGATACTTCTATAATTATTTTCTGTG	199393

CU467017.8	1601	ATTTAAATTTAATTTGTAGGCAATGACACCCTGGTGGGTTGTTCTGGAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199394	ATTTAAATTTAATTTGTAGGCAATGACACCCTGGTGGGTTGTTCTGGAAG	199443

CU467017.8	1651	CTTCAGTATTGACCATCAGTCTCATGTTTGGCTATTTGTTTGATCTAGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199444	CTTCAGTATTGACCATCAGTCTCATGTTTGGCTATTTGTTTGATCTAGCC	199493

CU467017.8	1701	AGTTTCTGATTGCCTTGCTCACATTCCTGTGAGTCAGTCTACCCACAGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199494	AGTTTCTGATTGCCTTGCTCACATTCCTGTGAGTCAGTCTACCCACAGGT	199543

CU467017.8	1751	GGTCCAGATGGTTACAAGCAATAGGTTGGCTTGGGGGCTGCTCCAGGGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199544	GGTCCAGATGGTTACAAGCAATAGGTTGGCTTGGGGGCTGCTCCAGGGCC	199593

CU467017.8	1801	TGCCGTGGGCCAGAGCCAGTTACATGCAGAGCCAGAAGCAATCCAGCCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199594	TGCCGTGGGCCAGAGCCAGTTACATGCAGAGCCAGAAGCAATCCAGCCTG	199643

CU467017.8	1851	CACAGGCTGTTCAACTCTGGGGCATAGTACCCTAGCTTCCATCCAGAATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199644	CACAGGCTGTTCAACTCTGGGGCATAGTACCCTAGCTTCCATCCAGAATG	199693

CU467017.8	1901	TTCCCGATGAGCTGCCTAACCGTTTGTTCACAAACACAAATTCCTATGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199694	TTCCCGATGAGCTGCCTAACCGTTTGTTCACAAACACAAATTCCTATGGC	199743

CU467017.8	1951	AACCTAATAAAAATGAGAACTGAAGGAAGAGGGAAAGCTTAATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207335.14	199744	AACCTAATAAAAATGAGAACTGAAGGAAGAGGGAAAGCTTAATGGAATTC	199793

Overview

Query
CU467017.8 - 64036 bps
Hit
CU207335.14 - 199793 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link