<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207319.10	1	GAATTCCAAGATAGCCAAGGCTACACAGAAAAACCCTGTTTCCAAAACAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185082	GAATTCCAAGATAGCCAAGGCTACACAGAAAAACCCTGTTTCCAAAACAA	185131

CU207319.10	51	AACAAAACAAAACAAAAAACAAAAAAACAAAAAACCCAAAAACAATAGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185132	AACAAAACAAAACAAAAAACAAAAAAACAAAAAACCCAAAAACAATAGTA	185181

CU207319.10	101	ACAAAACCAAAACACAAATTAGGTGAAATAGGGACATGAATAGAGGCAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185182	ACAAAACCAAAACACAAATTAGGTGAAATAGGGACATGAATAGAGGCAAC	185231

CU207319.10	151	TAACTGAGTACACGTATACATTGTATCTTTCCAACTGGATTCATACCTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185232	TAACTGAGTACACGTATACATTGTATCTTTCCAACTGGATTCATACCTGG	185281

CU207319.10	201	CACCTTAAGAAGTGGGTTATTATCCATCAAGTACCTCAGATGGCTTCCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185282	CACCTTAAGAAGTGGGTTATTATCCATCAAGTACCTCAGATGGCTTCCTG	185331

CU207319.10	251	ATAACTTGGCTTGGATAGAGACCAGCCAATCAAAGTTTCTTTAGCAACTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185332	ATAACTTGGCTTGGATAGAGACCAGCCAATCAAAGTTTCTTTAGCAACTT	185381

CU207319.10	301	CTGGGTTTCAGACATGGCATGTATGGGTGATAACCAACAAAGCATAAGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185382	CTGGGTTTCAGACATGGCATGTATGGGTGATAACCAACAAAGCATAAGTT	185431

CU207319.10	351	GAGATATATATTTCAAGTTCATGTAGGACACCTGGGGCCAGAAGCAGTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185432	GAGATATATATTTCAAGTTCATGTAGGACACCTGGGGCCAGAAGCAGTTT	185481

CU207319.10	401	CTGGAAATTCAGTCATTTCTTAGAATCTAGTTTAGTACAAAATGGAGACG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185482	CTGGAAATTCAGTCATTTCTTAGAATCTAGTTTAGTACAAAATGGAGACG	185531

CU207319.10	451	ATATACAAGGTGGAGTCCCTGTAGCAAGGAGGCCCTCAGCAAGAGCACTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185532	ATATACAAGGTGGAGTCCCTGTAGCAAGGAGGCCCTCAGCAAGAGCACTC	185581

CU207319.10	501	CATACCAATACATAAACTTGGTAAGAATGCCACTGTGGAGAAGACTGGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185582	CATACCAATACATAAACTTGGTAAGAATGCCACTGTGGAGAAGACTGGGC	185631

CU207319.10	551	CTTCAAAAAGGATCATGAAGGGACCTGGCTCCCCTAGGTAAGACTGACTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185632	CTTCAAAAAGGATCATGAAGGGACCTGGCTCCCCTAGGTAAGACTGACTT	185681

CU207319.10	601	TCTTTCTCTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185682	TCTTTCTCTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	185731

CU207319.10	651	TTCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTGAAAGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185732	TTCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTGAAAGAC	185781

CU207319.10	701	TCTGAAAGGAGCCCCTCGCTCAGGCCTCAGGACAATAGCGGACACCCAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185782	TCTGAAAGGAGCCCCTCGCTCAGGCCTCAGGACAATAGCGGACACCCAAG	185831

CU207319.10	751	AACTCACGATAGACCAAGCTTGATGTAAACCACATGATGCTTTATTGGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185832	AACTCACGATAGACCAAGCTTGATGTAAACCACATGATGCTTTATTGGGG	185881

CU207319.10	801	AGGGGGGGTGAGCCAGAGCTCTGGGGACAACTCATATCCCACAAAGGGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185882	AGGGGGGGTGAGCCAGAGCTCTGGGGACAACTCATATCCCACAAAGGGGT	185931

CU207319.10	851	AGAGGAGTCGACCTCGAGGGGAAAGAGGTCCCAGTTTTTATAGGCCCTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185932	AGAGGAGTCGACCTCGAGGGGAAAGAGGTCCCAGTTTTTATAGGCCCTCA	185981

CU207319.10	901	GGGGGGAAAGGAGAAAGGGGAGAGTAGGGGATTTCCAGATCTAAACAATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	185982	GGGGGGAAAGGAGAAAGGGGAGAGTAGGGGATTTCCAGATCTAAACAATG	186031

CU207319.10	951	TCTATTCTCAAGAAATGGATATGGGAGGGGTACGAGGAAAGAGTCTGGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186032	TCTATTCTCAAGAAATGGATATGGGAGGGGTACGAGGAAAGAGTCTGGTG	186081

CU207319.10	1001	CAGGTGTAGCAACTCAGGATTGGCCGGGCTGTGGTTGCTGGGGAGATTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186082	CAGGTGTAGCAACTCAGGATTGGCCGGGCTGTGGTTGCTGGGGAGATTTT	186131

CU207319.10	1051	CTGACTCTTTCTCAGCAACCAATATCACAAACACCTGGCAATGGGCTTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186132	CTGACTCTTTCTCAGCAACCAATATCACAAACACCTGGCAATGGGCTTCA	186181

CU207319.10	1101	TCAGTGGGCACACACATGTGTTCAAGGAACAGTCAAAACATTGGCAGACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186182	TCAGTGGGCACACACATGTGTTCAAGGAACAGTCAAAACATTGGCAGACA	186231

CU207319.10	1151	CACGGGTTCAAGGAGTGGCCAGAGCACTGTGCACCTCTATTTTTCTAAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186232	CACGGGTTCAAGGAGTGGCCAGAGCACTGTGCACCTCTATTTTTCTAAAT	186281

CU207319.10	1201	CAGTGAAGCTAGTTCTGCTAACACTGACATCTATCTTGCCAATTTCAGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186282	CAGTGAAGCTAGTTCTGCTAACACTGACATCTATCTTGCCAATTTCAGGG	186331

CU207319.10	1251	CTTCTGTGACCTTTTACATTCTGTCAGGATCTTTCACTTCCTTCCTTCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186332	CTTCTGTGACCTTTTACATTCTGTCAGGATCTTTCACTTCCTTCCTTCCT	186381

CU207319.10	1301	TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTTTCTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186382	TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTTTCTTT	186431

CU207319.10	1351	CTTTCCTTTCTTTTTTTTTAAGTTTTATTTATTATGTATACAATGTTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186432	CTTTCCTTTCTTTTTTTTTAAGTTTTATTTATTATGTATACAATGTTCTG	186481

CU207319.10	1401	CCTTCACAGCCAGAAGAGAGCACCAGACCTCATTATAGATGGTTATGAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186482	CCTTCACAGCCAGAAGAGAGCACCAGACCTCATTATAGATGGTTATGAGC	186531

CU207319.10	1451	AACCATGTAGTTGCTGGAAATTGAACTCAGGACCTCTAGAAGAGCGGCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186532	AACCATGTAGTTGCTGGAAATTGAACTCAGGACCTCTAGAAGAGCGGCTA	186581

CU207319.10	1501	GTGCTCTTACCCGCTGAGCCATCTCTCTAGCCCCTTTCTTTCCTTTCAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186582	GTGCTCTTACCCGCTGAGCCATCTCTCTAGCCCCTTTCTTTCCTTTCAAG	186631

CU207319.10	1551	ACATGGTTTCTCTGTGCAGTCCTGGCTGTAAAAAAGTGAAACATAAAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186632	ACATGGTTTCTCTGTGCAGTCCTGGCTGTAAAAAAGTGAAACATAAAAAA	186681

CU207319.10	1601	CAAAAAATTCTAGGCCTTTAGGTCCAGGCTTGAGAATGTGACCTTTGTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186682	CAAAAAATTCTAGGCCTTTAGGTCCAGGCTTGAGAATGTGACCTTTGTGA	186731

CU207319.10	1651	CTCAATGCTACAAGGCATGCTAATCATAAAACAGATAGTGACATTCCTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186732	CTCAATGCTACAAGGCATGCTAATCATAAAACAGATAGTGACATTCCTCC	186781

CU207319.10	1701	ACCCACCTGCCTCCAGGGTTTAGGGAGTGTTCGTTCAAAAAAGTCACCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186782	ACCCACCTGCCTCCAGGGTTTAGGGAGTGTTCGTTCAAAAAAGTCACCCT	186831

CU207319.10	1751	GACCCACCCTGACCCACCCTGACTGTGCTATTGTTAGAGGCTCCTAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186832	GACCCACCCTGACCCACCCTGACTGTGCTATTGTTAGAGGCTCCTAGAAA	186881

CU207319.10	1801	ACTGTCTTGGCTTTCCCTTCCTCATGACTCTTAACTGGTATTTTTGGTAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186882	ACTGTCTTGGCTTTCCCTTCCTCATGACTCTTAACTGGTATTTTTGGTAT	186931

CU207319.10	1851	TTTCCAACAACGCCCTCCCCACCCTCTTGAGTTGTGGTTTTTTCCTTTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186932	TTTCCAACAACGCCCTCCCCACCCTCTTGAGTTGTGGTTTTTTCCTTTAA	186981

CU207319.10	1901	ATACCCCCTTACCCAGCTACTCAGGGTGCCACGGTCCTCTCCCCCTGCAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	186982	ATACCCCCTTACCCAGCTACTCAGGGTGCCACGGTCCTCTCCCCCTGCAT	187031

CU207319.10	1951	GGTGTATGACTGTGGGCTCGAGAGCGCTCTTGAAATAAAAGTCCTCTTGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207334.6	187032	GGTGTATGACTGTGGGCTCGAGAGCGCTCTTGAAATAAAAGTCCTCTTGC	187081

Overview

Query
CU207319.10 - 201436 bps
Hit
CU207334.6 - 187081 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link