<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU469450.4	1	ACCCAGAACCATACTGGCTATGTTCCAAGGAATTGAAGAAAACTATTTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225403	ACCCAGAACCATACTGGCTATGTTCCAAGGAATTGAAGAAAACTATTTTT	225452

CU469450.4	51	GAGAGAGTTGTCACTGTGGGTACAATGCAGATAGTAAATGCAGCATATGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225453	GAGAGAGTTGTCACTGTGGGTACAATGCAGATAGTAAATGCAGCATATGC	225502

CU469450.4	101	AGATAGTGGTTACTATACAGATAGTTTCTGTAGCTGCTGAAGAAGAATGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225503	AGATAGTGGTTACTATACAGATAGTTTCTGTAGCTGCTGAAGAAGAATGT	225552

CU469450.4	151	CAGTAAATGCCACAAAGTAAATGACATTATGAACAGAACCAGACAGAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225553	CAGTAAATGCCACAAAGTAAATGACATTATGAACAGAACCAGACAGAAAC	225602

CU469450.4	201	TGTACATGAATCACAAATAAGAAACATACAACAGAATTAAAAACTTGCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225603	TGTACATGAATCACAAATAAGAAACATACAACAGAATTAAAAACTTGCAC	225652

CU469450.4	251	ATATAAAATAAACATGATGGACACCTTTCAAGTGAGAATAGACAACCGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225653	ATATAAAATAAACATGATGGACACCTTTCAAGTGAGAATAGACAACCGGA	225702

CU469450.4	301	TACCTCTGTCCATATTCCCAACACCAGAGAAATGAAGACACGTGGATGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225703	TACCTCTGTCCATATTCCCAACACCAGAGAAATGAAGACACGTGGATGAA	225752

CU469450.4	351	TACTTCAAGGACAGACAGGGTAAGATTAACCCTTAAAACAAAAATATCAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225753	TACTTCAAGGACAGACAGGGTAAGATTAACCCTTAAAACAAAAATATCAA	225802

CU469450.4	401	CAAAATAATAAAGATTACATGTATTTTTAAATTATATTAAAACAACTTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225803	CAAAATAATAAAGATTACATGTATTTTTAAATTATATTAAAACAACTTAA	225852

CU469450.4	451	CATATAAATACCTAGGAAAGTTATTAAAGGATACACAGAATTATGAGGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225853	CATATAAATACCTAGGAAAGTTATTAAAGGATACACAGAATTATGAGGTG	225902

CU469450.4	501	ATTTCCTAAAATTTGTATTTGTAAAAAGAAATAGACCTTCAGCAAAACAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225903	ATTTCCTAAAATTTGTATTTGTAAAAAGAAATAGACCTTCAGCAAAACAG	225952

CU469450.4	551	CTAAAAACAAGGTGTTAATGCAAAAGGGCTATTTTGAGGATCAAGGACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	225953	CTAAAAACAAGGTGTTAATGCAAAAGGGCTATTTTGAGGATCAAGGACAA	226002

CU469450.4	601	ATGTGGATAAGTACTGGAAAATAGAGGATAGGAGAAAATAAAGGATGGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226003	ATGTGGATAAGTACTGGAAAATAGAGGATAGGAGAAAATAAAGGATGGGC	226052

CU469450.4	651	TAAAAATACTTAAGGCTGTATAGAAGGTCCTATGGAAACCCAAGAGTTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226053	TAAAAATACTTAAGGCTGTATAGAAGGTCCTATGGAAACCCAAGAGTTAA	226102

CU469450.4	701	AAAGCTTATAGTTGACCAGCACAAAACACATTCCATGTGTTCTTAATGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226103	AAAGCTTATAGTTGACCAGCACAAAACACATTCCATGTGTTCTTAATGAT	226152

CU469450.4	751	TGGAGTTTTACATTTTGTTTTGTTTAGTTTGGGTTTTCTTTAATGTTGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226153	TGGAGTTTTACATTTTGTTTTGTTTAGTTTGGGTTTTCTTTAATGTTGTT	226202

CU469450.4	801	TGTCTGTGTGTTTCTTTGTTTTTTGGGGGGGCAATTTTTTCTTATTAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226203	TGTCTGTGTGTTTCTTTGTTTTTTGGGGGGGCAATTTTTTCTTATTAGAA	226252

CU469450.4	851	TTTTCTTTACTTGATTGATTGATTTTATTTTATTTTTTATTCTTTTTATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226253	TTTTCTTTACTTGATTGATTGATTTTATTTTATTTTTTATTCTTTTTATC	226302

CU469450.4	901	TTTATTTTATTTTTTTGTTTTTGTTATTTTTCCTCTAGGGAGAGGGAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226303	TTTATTTTATTTTTTTGTTTTTGTTATTTTTCCTCTAGGGAGAGGGAGAA	226352

CU469450.4	951	ATAACATGAAGTTGAATTGGTAGGAAGGTAGGAATGTACAAGGAGTATTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226353	ATAACATGAAGTTGAATTGGTAGGAAGGTAGGAATGTACAAGGAGTATTT	226402

CU469450.4	1001	TGAGGAAACAGTACAGGATCAAAATATATTCTATTAAAATGTAATTAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226403	TGAGGAAACAGTACAGGATCAAAATATATTCTATTAAAATGTAATTAAAA	226452

CU469450.4	1051	ATAAAATTTTAACAAGTAGCTGAAAGAGTAGGATGCAGATACTTACACCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226453	ATAAAATTTTAACAAGTAGCTGAAAGAGTAGGATGCAGATACTTACACCC	226502

CU469450.4	1101	AACCAATGAATAGATGCCAAGGACCTCTGTGGTGGAATTAGGGAAAAGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226503	AACCAATGAATAGATGCCAAGGACCTCTGTGGTGGAATTAGGGAAAAGCT	226552

CU469450.4	1151	GGAAGAAGGTGAGGCCAACCACCTAACTAACCTTTATTCCTGAGATCACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226553	GGAAGAAGGTGAGGCCAACCACCTAACTAACCTTTATTCCTGAGATCACT	226602

CU469450.4	1201	CAGTCACTGAGACACCAATCATTCAGCATACACGAGCTGATATGAGGCCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226603	CAGTCACTGAGACACCAATCATTCAGCATACACGAGCTGATATGAGGCCC	226652

CU469450.4	1251	CCTATGAAAATACAGCAGAAGACTGCCTGGTCTGACCTCAGTGAGGGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226653	CCTATGAAAATACAGCAGAAGACTGCCTGGTCTGACCTCAGTGAGGGAAA	226702

CU469450.4	1301	ATGTACCTAAGCCTACAAAGATAAGAGGACCCAGGTAGTGAGGAGGTCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226703	ATGTACCTAAGCCTACAAAGATAAGAGGACCCAGGTAGTGAGGAGGTCTG	226752

CU469450.4	1351	ATGCTATTAGTGGTGTGTGTGGACATCCTCTTGGAGACTGAGGGAGTAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226753	ATGCTATTAGTGGTGTGTGTGGACATCCTCTTGGAGACTGAGGGAGTAAG	226802

CU469450.4	1401	TGTGGGATGAGGAGCAGCCAAATGGCAGATCAGGAGGGACATAAAGACTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226803	TGTGGGATGAGGAGCAGCCAAATGGCAGATCAGGAGGGACATAAAGACTG	226852

CU469450.4	1451	AACTGTAAAAAATGTCTAAAGAATCATAAATAAATAAAGATTAGAGAATC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226853	AACTGTAAAAAATGTCTAAAGAATCATAAATAAATAAAGATTAGAGAATC	226902

CU469450.4	1501	ATAAATAAATAAATAAATAAATGATTTAAATTCAAAGAAGAGTTACAATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226903	ATAAATAAATAAATAAATAAATGATTTAAATTCAAAGAAGAGTTACAATT	226952

CU469450.4	1551	CCAGAAGATATGTTTTTAAAAGAAAACCAATTGTAACACACAGGATTTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	226953	CCAGAAGATATGTTTTTAAAAGAAAACCAATTGTAACACACAGGATTTCT	227002

CU469450.4	1601	CCAAAGATATGACTTACAGTTCAGGGATACAATAGGCATCTCCCACATAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227003	CCAAAGATATGACTTACAGTTCAGGGATACAATAGGCATCTCCCACATAG	227052

CU469450.4	1651	CAAAGCCTATTGTTATTGTCTTTGGTTACTTCACATAACTATATGGTATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227053	CAAAGCCTATTGTTATTGTCTTTGGTTACTTCACATAACTATATGGTATG	227102

CU469450.4	1701	GCCCTATTGCTGAATATTTTCCGCACATTAACATCAAAACATAGATGAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227103	GCCCTATTGCTGAATATTTTCCGCACATTAACATCAAAACATAGATGAAT	227152

CU469450.4	1751	TAACCTCAAGCCAATAAGGAAATGTCTTCACCAGAGATGGCTTTCTAAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227153	TAACCTCAAGCCAATAAGGAAATGTCTTCACCAGAGATGGCTTTCTAAGT	227202

CU469450.4	1801	GTTATTAGGTGCTTTGCATTTTGCAGGAAAGGAAATTTATGAATAATCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227203	GTTATTAGGTGCTTTGCATTTTGCAGGAAAGGAAATTTATGAATAATCCT	227252

CU469450.4	1851	ATTGTGTACTGGACACTGCATCCTGAAATGCTGACCTGCTGCAGAACAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227253	ATTGTGTACTGGACACTGCATCCTGAAATGCTGACCTGCTGCAGAACAGG	227302

CU469450.4	1901	CAGATGTGCCCAGTGTTACTATTGTTATAGGATAAATAGATTCTTTCTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227303	CAGATGTGCCCAGTGTTACTATTGTTATAGGATAAATAGATTCTTTCTTA	227352

CU469450.4	1951	TTGGAGCTCTGCACTTTACCACAGGGAGAACATGTTTGGTGTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207332.5	227353	TTGGAGCTCTGCACTTTACCACAGGGAGAACATGTTTGGTGTTGGAATTC	227402

Overview

Query
CU469450.4 - 52091 bps
Hit
CU207332.5 - 227402 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link