<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207341.13	1	GAATTCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGTTGATGGTTTTTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166633	GAATTCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGTTGATGGTTTTTG	166682

CU207341.13	51	TCAAATGGTTTCTCCACATCTAAAGAGATGATCATGTGGTATTTGTCTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166683	TCAAATGGTTTCTCCACATCTAAAGAGATGATCATGTGGTATTTGTCTTT	166732

CU207341.13	101	GAGTTTGTTTATATACTGGATTATGTTGATAGATTTCTGTATATTGAACC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166733	GAGTTTGTTTATATACTGGATTATGTTGATAGATTTCTGTATATTGAACC	166782

CU207341.13	151	ATCCCTGCATTCCTGGAATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGATTGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166783	ATCCCTGCATTCCTGGAATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGATTGTT	166832

CU207341.13	201	TTGATGTGTTCTTGGATTCAGTAAGCGATAACTTTATTGAGGATTTTTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166833	TTGATGTGTTCTTGGATTCAGTAAGCGATAACTTTATTGAGGATTTTTGC	166882

CU207341.13	251	ATCGATATTCATAAGGGAAATTGGTCTGAAGTTCTCTGTGTGCGGGAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166883	ATCGATATTCATAAGGGAAATTGGTCTGAAGTTCTCTGTGTGCGGGAGAC	166932

CU207341.13	301	ATCCTGGTTCCCGGACTCCACCAAAACTAGTCTGCACAGATGAGAGTGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166933	ATCCTGGTTCCCGGACTCCACCAAAACTAGTCTGCACAGATGAGAGTGTG	166982

CU207341.13	351	GACTACAGAAGCGAACAGCTTCTGGGAGAGGCAGGAGCAATCAAAACAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	166983	GACTACAGAAGCGAACAGCTTCTGGGAGAGGCAGGAGCAATCAAAACAAA	167032

CU207341.13	401	AGGAGATCAATGGGATACAAATTGGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCACTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167033	AGGAGATCAATGGGATACAAATTGGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCACTT	167082

CU207341.13	451	TTTGCAGATGATATGATAGTATACTTACATAAACCCAAAATTGCACCAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167083	TTTGCAGATGATATGATAGTATACTTACATAAACCCAAAATTGCACCAGA	167132

CU207341.13	501	GAATTTTTAAACCTGATAAACAACTTCAGAAAATTAGCTGGAAATAAAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167133	GAATTTTTAAACCTGATAAACAACTTCAGAAAATTAGCTGGAAATAAAAT	167182

CU207341.13	551	TAACTCAAACAAATCAGTGTTCTTCCTCACACAAAGGATAAACAGGCTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167183	TAACTCAAACAAATCAGTGTTCTTCCTCACACAAAGGATAAACAGGCTGA	167232

CU207341.13	601	GAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCACAATAATCACAAATACTATAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167233	GAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCACAATAATCACAAATACTATAA	167282

CU207341.13	651	AATACCTTGTTGTGACTCTAACTAAGCAAGTGAAAGATCTGTATGATAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167283	AATACCTTGTTGTGACTCTAACTAAGCAAGTGAAAGATCTGTATGATAAA	167332

CU207341.13	701	AATTCAAGTCTCTGAAGAAAGTAATCCAAGAAGATCTCATAAGATGGAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167333	AATTCAAGTCTCTGAAGAAAGTAATCCAAGAAGATCTCATAAGATGGAAC	167382

CU207341.13	751	AATCTCCCATGCTCATAGATTGGTAGGATTCATTTTTTTAAAAGGATTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167383	AATCTCCCATGCTCATAGATTGGTAGGATTCATTTTTTTAAAAGGATTAT	167432

CU207341.13	801	CTTGCGGAAAGCATTCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167433	CTTGCGGAAAGCATTCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAA	167482

CU207341.13	851	CTGAATCCTTCACAGAGTTATAAAGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167483	CTGAATCCTTCACAGAGTTATAAAGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAAT	167532

CU207341.13	901	AACAAAAAACAGCATAGTGAAAACTATTCTCAACAATAAAAGAACTTTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167533	AACAAAAAACAGCATAGTGAAAACTATTCTCAACAATAAAAGAACTTTTG	167582

CU207341.13	951	GTGGAATCACCATTCATGACCTCAAGTAGTAGTACTACAGAGCGATTTTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167583	GTGGAATCACCATTCATGACCTCAAGTAGTAGTACTACAGAGCGATTTTA	167632

CU207341.13	1001	ATGAAAACTGTTCCAATTATTATGCCTCAGGAGGAATTTCTTTTCTGGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167633	ATGAAAACTGTTCCAATTATTATGCCTCAGGAGGAATTTCTTTTCTGGTC	167682

CU207341.13	1051	CAGTCTCTTTGGAGTTCTGTAGGCTTCTTGTATGTTCATGGGCATCTCTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167683	CAGTCTCTTTGGAGTTCTGTAGGCTTCTTGTATGTTCATGGGCATCTCTT	167732

CU207341.13	1101	TCTTTAGGTTAGGGAAGTTTTCTTCTATAATTTTGTTGAAGATATTTACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167733	TCTTTAGGTTAGGGAAGTTTTCTTCTATAATTTTGTTGAAGATATTTACT	167782

CU207341.13	1151	GGCCCTTTAAGTTGGGAGTCTTCACTCTCTTCTATACCTATTATCCTTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167783	GGCCCTTTAAGTTGGGAGTCTTCACTCTCTTCTATACCTATTATCCTTAG	167832

CU207341.13	1201	GTTTTGTCTTCTCACTGTGTTCTGGATTTCCTGGATGTTTTGAGTTAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167833	GTTTTGTCTTCTCACTGTGTTCTGGATTTCCTGGATGTTTTGAGTTAGGA	167882

CU207341.13	1251	TCTTTTTGCATTTTGCATTTTCTTTGATTGTTGTGTCAATGTTTTCTATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167883	TCTTTTTGCATTTTGCATTTTCTTTGATTGTTGTGTCAATGTTTTCTATG	167932

CU207341.13	1301	GAATCATCTGTATCTGAGATTCTCTCTTCTATCTCTTGTATTGTGTTGGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167933	GAATCATCTGTATCTGAGATTCTCTCTTCTATCTCTTGTATTGTGTTGGT	167982

CU207341.13	1351	GATGCTTACATCTATGGCTCCTGATTTCTTTCCCAGGATTTCTAACTCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	167983	GATGCTTACATCTATGGCTCCTGATTTCTTTCCCAGGATTTCTAACTCTA	168032

CU207341.13	1401	GTGTTGTCTACCTGTGTGATTTCTATATTATTTCTACTTCCACTTTTAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168033	GTGTTGTCTACCTGTGTGATTTCTATATTATTTCTACTTCCACTTTTAGA	168082

CU207341.13	1451	TCCTGGGTGGTTTTGTTCAATTCCTTCATCTGTTTGGATGTGTTTTCCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168083	TCCTGGGTGGTTTTGTTCAATTCCTTCATCTGTTTGGATGTGTTTTCCTT	168132

CU207341.13	1501	AATCTTTAAAGGATCTTGTGTTGTCTCTTTAAGGGCTTGTACCTGTTTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168133	AATCTTTAAAGGATCTTGTGTTGTCTCTTTAAGGGCTTGTACCTGTTTAC	168182

CU207341.13	1551	CTGTGCTCTTCTGTAATTCTTTAAGTGATTTTTGTGATTCCTCTTTAATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168183	CTGTGCTCTTCTGTAATTCTTTAAGTGATTTTTGTGATTCCTCTTTAATG	168232

CU207341.13	1601	GCTTCTAACTTTTTACCTGTGTTCTCCTGTATTTCTTTAAGGGAGTTATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168233	GCTTCTAACTTTTTACCTGTGTTCTCCTGTATTTCTTTAAGGGAGTTATT	168282

CU207341.13	1651	AATGTCCTTCTTAAAATCTTCTACCAGCATCATGAGATATGATTTTAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168283	AATGTCCTTCTTAAAATCTTCTACCAGCATCATGAGATATGATTTTAAAT	168332

CU207341.13	1701	CCATATCTTGTTTTCTGGTGTGTTAGGGTATCCAGGACTTGCTGTGGTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168333	CCATATCTTGTTTTCTGGTGTGTTAGGGTATCCAGGACTTGCTGTGGTGA	168382

CU207341.13	1751	GAGAACTGTGTTCTGATGATTCCAAGTAGTCTTCGTTGGTAAGATTCTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168383	GAGAACTGTGTTCTGATGATTCCAAGTAGTCTTCGTTGGTAAGATTCTTG	168432

CU207341.13	1801	TGTTTGCCTTTCACCATGTGGTTACCTCTGGTGTTAGATATTCTTGCTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168433	TGTTTGCCTTTCACCATGTGGTTACCTCTGGTGTTAGATATTCTTGCTGT	168482

CU207341.13	1851	CTTTAGATGGAGCTTGTTACTCCTGTGGGTCTGTAAGCCTGTGTCAGCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168483	CTTTAGATGGAGCTTGTTACTCCTGTGGGTCTGTAAGCCTGTGTCAGCAC	168532

CU207341.13	1901	TCCTGGGAGACCAGCTCTCTCCTGGCAGAACTTGTGTACAGAGGGCTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168533	TCCTGGGAGACCAGCTCTCTCCTGGCAGAACTTGTGTACAGAGGGCTCTG	168582

CU207341.13	1951	GAACAGCCCAAGCTTGGGGTGCAGATATAGACTGGAAGGATCCTGTCCCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207324.10	168583	GAACAGCCCAAGCTTGGGGTGCAGATATAGACTGGAAGGATCCTGTCCCA	168632

Overview

Query
CU207341.13 - 154996 bps
Hit
CU207324.10 - 168632 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link