<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210926.7	1	CTCTGTGGGCACTTCACTCACATCTACTTGTAAGTGGTGATGCATGCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199437	CTCTGTGGGCACTTCACTCACATCTACTTGTAAGTGGTGATGCATGCCTT	199486

CU210926.7	51	TAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199487	TAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGC	199536

CU210926.7	101	CAGCCTGATCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199537	CAGCCTGATCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAA	199586

CU210926.7	151	ACCCTGTCTCAAAAAACCCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199587	ACCCTGTCTCAAAAAACCCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATAAAA	199636

CU210926.7	201	TAATAGCAATAAAAAATAAAATTATGAGTCTATTACTTTTAGGCATTTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199637	TAATAGCAATAAAAAATAAAATTATGAGTCTATTACTTTTAGGCATTTGT	199686

CU210926.7	251	CATAAATTAACATGGGTTTTGTTATTTGTTGACCAATTTGGTTTATTTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199687	CATAAATTAACATGGGTTTTGTTATTTGTTGACCAATTTGGTTTATTTTA	199736

CU210926.7	301	TTAAAGATTTCTGTTTTTATTGCAGTTCTCATTACTTTCAGAATATCTGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199737	TTAAAGATTTCTGTTTTTATTGCAGTTCTCATTACTTTCAGAATATCTGC	199786

CU210926.7	351	TAGGTAAATGTCTCATAAGGATTTTATGCCATCATTGACACAGAATCTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199787	TAGGTAAATGTCTCATAAGGATTTTATGCCATCATTGACACAGAATCTTT	199836

CU210926.7	401	CTTGTTTGTTTGTTTCCCATTGCTGGAGATAAAAACTAGAGCTTCTAGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199837	CTTGTTTGTTTGTTTCCCATTGCTGGAGATAAAAACTAGAGCTTCTAGGA	199886

CU210926.7	451	AAATGGTCTACCACTTAGCAACATCCTTAACCTCTTATTTTGTTCTACTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199887	AAATGGTCTACCACTTAGCAACATCCTTAACCTCTTATTTTGTTCTACTG	199936

CU210926.7	501	AGACACAGTCTTGTTATCTGAATCAGGCTTACCTAGAACCTGTGATTGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199937	AGACACAGTCTTGTTATCTGAATCAGGCTTACCTAGAACCTGTGATTGCC	199986

CU210926.7	551	TGCTTTAACTTTCCAATTACCACAATTACAGGTGTGTGATACTATGCCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	199987	TGCTTTAACTTTCCAATTACCACAATTACAGGTGTGTGATACTATGCCAA	200036

CU210926.7	601	CAGTCACTAAATTTTACTTCTATAACTATTTTCTTATATCCTATTGCCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200037	CAGTCACTAAATTTTACTTCTATAACTATTTTCTTATATCCTATTGCCAG	200086

CU210926.7	651	AATAAATTAATTAACCTATAATTTCCATGTGCTATGAAAAATTCACCAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200087	AATAAATTAATTAACCTATAATTTCCATGTGCTATGAAAAATTCACCAAC	200136

CU210926.7	701	CTATTTTTTTTCTATTTTTGTAAGTCTTCACAGTGGCACGGAAGGTTGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200137	CTATTTTTTTTCTATTTTTGTAAGTCTTCACAGTGGCACGGAAGGTTGTA	200186

CU210926.7	751	TTTATCTATTTGTGGTACTGGGAATGCTAGACAAGTGCTGTGCCACTGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200187	TTTATCTATTTGTGGTACTGGGAATGCTAGACAAGTGCTGTGCCACTGAA	200236

CU210926.7	801	TCAGCCCCTAAGAGTTCTTATTTGAAAATGGTTAATATGTAGGAATTGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200237	TCAGCCCCTAAGAGTTCTTATTTGAAAATGGTTAATATGTAGGAATTGGT	200286

CU210926.7	851	ACACTCCTATAATCCCAGCTCTCAGGAGGTAGAGGCAGGACAATTACAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200287	ACACTCCTATAATCCCAGCTCTCAGGAGGTAGAGGCAGGACAATTACAAA	200336

CU210926.7	901	TTCAAGGCTACAGCATAAGCCCTTATCTTTAAAAACAAAACAAAATAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200337	TTCAAGGCTACAGCATAAGCCCTTATCTTTAAAAACAAAACAAAATAAAA	200386

CU210926.7	951	CACAAACCAAAGAAGGAAAAACAACGAGATTAAAAAAAAAAGATAGGTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200387	CACAAACCAAAGAAGGAAAAACAACGAGATTAAAAAAAAAAGATAGGTTG	200436

CU210926.7	1001	CTGAGAAGTAAAGTCAGAGAAGACTGAACAATAAGAATGTTTTCTCAAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200437	CTGAGAAGTAAAGTCAGAGAAGACTGAACAATAAGAATGTTTTCTCAAAC	200486

CU210926.7	1051	AATAGCTATAGTTGGAGTTAATTTAGAACAAGGGTCAACAAACTCTTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200487	AATAGCTATAGTTGGAGTTAATTTAGAACAAGGGTCAACAAACTCTTATA	200536

CU210926.7	1101	AATTGATCAACTCTGGCCTGATGTCTGTTTTAATACAGCAAATGAATCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200537	AATTGATCAACTCTGGCCTGATGTCTGTTTTAATACAGCAAATGAATCAA	200586

CU210926.7	1151	AAGTCTTTATACTTTTAAAGTTTTTACATTTTCCAATGGTTAAAATAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200587	AAGTCTTTATACTTTTAAAGTTTTTACATTTTCCAATGGTTAAAATAAAA	200636

CU210926.7	1201	ACCAAAAGAAGACTAATATTTTGCCTGACATGGTGGCACACAGCTTAGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200637	ACCAAAAGAAGACTAATATTTTGCCTGACATGGTGGCACACAGCTTAGTT	200686

CU210926.7	1251	TGAGGCTATCCTGGTCTACAGAATGAGTTCCAGGACAGTTGGGGATACAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200687	TGAGGCTATCCTGGTCTACAGAATGAGTTCCAGGACAGTTGGGGATACAT	200736

CU210926.7	1301	AGAGAAACCCTGTTTTGAAAAAAAAACAAACAAAAAAACGAACAAGCCCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200737	AGAGAAACCCTGTTTTGAAAAAAAAACAAACAAAAAAACGAACAAGCCCC	200786

CU210926.7	1351	AAACCAAAACCAAAGCCAAACCAAAACAACAACAAACAAAATCAAAACAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200787	AAACCAAAACCAAAGCCAAACCAAAACAACAACAAACAAAATCAAAACAA	200836

CU210926.7	1401	ATAAACAAAATACTTGTATTTTATATCATATAAAACTGTAAGATTCAAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200837	ATAAACAAAATACTTGTATTTTATATCATATAAAACTGTAAGATTCAAAT	200886

CU210926.7	1451	TTCTGTGTCCATACATCAGTTTTTTTTTTTTTTCTAAACTGCTGCTCTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200887	TTCTGTGTCCATACATCAGTTTTTTTTTTTTTTCTAAACTGCTGCTCTAT	200936

CU210926.7	1501	TTGTTTAAGTAATGTTCTGGTAATTGGAAAGTTAAAGCAGGCAATCACAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200937	TTGTTTAAGTAATGTTCTGGTAATTGGAAAGTTAAAGCAGGCAATCACAA	200986

CU210926.7	1551	GTTCTAGGTAAGCCTGAACCAGATAACAAGACCATGACTCAATAGAACAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	200987	GTTCTAGGTAAGCCTGAACCAGATAACAAGACCATGACTCAATAGAACAA	201036

CU210926.7	1601	ATATCTGAATATTTGCAGTATCTGAATCAAATATTTGTGAAATGATAATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201037	ATATCTGAATATTTGCAGTATCTGAATCAAATATTTGTGAAATGATAATG	201086

CU210926.7	1651	TGTTTTTCAAAACTTACTATTGAAAGACCCTCGAGGGGAGACCCTCACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201087	TGTTTTTCAAAACTTACTATTGAAAGACCCTCGAGGGGAGACCCTCACTC	201136

CU210926.7	1701	AGACACTTAAGTCCCGGGACAGCCGCGTACCCAAGAAGACACTGAGACCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201137	AGACACTTAAGTCCCGGGACAGCCGCGTACCCAAGAAGACACTGAGACCA	201186

CU210926.7	1751	TACATAAAATGTAGAAGGCAAGATTTAATAAAGCAGCGACATGAAAGCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201187	TACATAAAATGTAGAAGGCAAGATTTAATAAAGCAGCGACATGAAAGCAC	201236

CU210926.7	1801	ACAGACCAGAGCTCTGGGGTCGAAATAAAGCAGCAACATGAAAGCACAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201237	ACAGACCAGAGCTCTGGGGTCGAAATAAAGCAGCAACATGAAAGCACAGA	201286

CU210926.7	1851	GCTCTGGGGTCGAAACTCATACACCTAGTGGCACCTAGTGGTGTAGAGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201287	GCTCTGGGGTCGAAACTCATACACCTAGTGGCACCTAGTGGTGTAGAGGA	201336

CU210926.7	1901	GAATCGACGACCAGCCAAAATTTTTCACAGGCTTATATAGTAAAACTCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201337	GAATCGACGACCAGCCAAAATTTTTCACAGGCTTATATAGTAAAACTCAA	201386

CU210926.7	1951	AGGGGGAGAACTGGGCAGGGAAAGTACAAGTTTACATCACTAGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207319.10	201387	AGGGGGAGAACTGGGCAGGGAAAGTACAAGTTTACATCACTAGGGAATTC	201436

Overview

Query
CU210926.7 - 87584 bps
Hit
CU207319.10 - 201436 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link