<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210900.9	1	TCAGATACTGAGCCTGTTTGTCCTGAGGGGGATGGTTTTCTCTGAGCTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217686	TCAGATACTGAGCCTGTTTGTCCTGAGGGGGATGGTTTTCTCTGAGCTGG	217735

CU210900.9	51	TTGTCACTTCCGTGTTTTAGCACTAGATGGCGACCAGGTTCATTCAGCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217736	TTGTCACTTCCGTGTTTTAGCACTAGATGGCGACCAGGTTCATTCAGCTT	217785

CU210900.9	101	TGCCTGTTCTCACTGTTGCTGTTTTTAGACACGAATCAACGCCCAGATTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217786	TGCCTGTTCTCACTGTTGCTGTTTTTAGACACGAATCAACGCCCAGATTT	217835

CU210900.9	151	GTTTCAATACATTTCTTGGAGTGTTGTTTAAAAGGAAATTTGAGATCTTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217836	GTTTCAATACATTTCTTGGAGTGTTGTTTAAAAGGAAATTTGAGATCTTG	217885

CU210900.9	201	AAATGACCTGCCCCCAAGAAATGCTTGACTATTAGGGTTAGATGCCTCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217886	AAATGACCTGCCCCCAAGAAATGCTTGACTATTAGGGTTAGATGCCTCTT	217935

CU210900.9	251	CCATAGTCTGTGGTTAGAGTCTGCTGGATTCTACCCTCTTCTGGGCACAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217936	CCATAGTCTGTGGTTAGAGTCTGCTGGATTCTACCCTCTTCTGGGCACAG	217985

CU210900.9	301	CCACCATGGATAGATTCTCTTTCATTGTGTGGTCTTTTTGCTCTGATGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	217986	CCACCATGGATAGATTCTCTTTCATTGTGTGGTCTTTTTGCTCTGATGAT	218035

CU210900.9	351	GATTTTCTTTGTTGTACATAATGGTTTTTTAAATTAGTTTTGTATAATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218036	GATTTTCTTTGTTGTACATAATGGTTTTTTAAATTAGTTTTGTATAATTC	218085

CU210900.9	401	CATTTGTCAGTTTTTCCTGTCTTGCAGCTGTCAACATCTTGAGGGTTCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218086	CATTTGTCAGTTTTTCCTGTCTTGCAGCTGTCAACATCTTGAGGGTTCCT	218135

CU210900.9	451	CCATGGTTTCCCAGTGGTTTCAGAACTTCATGTCAACTTCATGCTCAATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218136	CCATGGTTTCCCAGTGGTTTCAGAACTTCATGTCAACTTCATGCTCAATG	218185

CU210900.9	501	ACTTTCATCCATGTGCTGTAGGATGAGCTGCTGGTCTCAGAGGACAAGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218186	ACTTTCATCCATGTGCTGTAGGATGAGCTGCTGGTCTCAGAGGACAAGCT	218235

CU210900.9	551	CCCCACTCCCCCCTGACAGTGCAAGGAGGTCTATGGGTTGACTCATAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218236	CCCCACTCCCCCCTGACAGTGCAAGGAGGTCTATGGGTTGACTCATAGCC	218285

CU210900.9	601	ACCCTGCTGAGCCCAGCGTGGGCCACAGTCGTTACCACTTTTAAAATCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218286	ACCCTGCTGAGCCCAGCGTGGGCCACAGTCGTTACCACTTTTAAAATCTG	218335

CU210900.9	651	TGACCTTGGGCATGTTCCTTCACCTCACGCTGTGCCTCAGTTTTCGTTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218336	TGACCTTGGGCATGTTCCTTCACCTCACGCTGTGCCTCAGTTTTCGTTTA	218385

CU210900.9	701	CATAATTTTTTGAGATTATAATGTAATATGTTACTCAATGGGGATTAAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218386	CATAATTTTTTGAGATTATAATGTAATATGTTACTCAATGGGGATTAAGC	218435

CU210900.9	751	CAATTGATGTTTATAGCAGATCATAGATATTTGTTGATTAAAAGCACAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218436	CAATTGATGTTTATAGCAGATCATAGATATTTGTTGATTAAAAGCACAAT	218485

CU210900.9	801	GTGAAAGCAAGGTGTTAGGCTGACGGTATTTCAATACTAGAAGGACTTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218486	GTGAAAGCAAGGTGTTAGGCTGACGGTATTTCAATACTAGAAGGACTTGT	218535

CU210900.9	851	TGGCCATGAGAAGCCAGCACACGGTCCTTAACATGCCACACTAAATTAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218536	TGGCCATGAGAAGCCAGCACACGGTCCTTAACATGCCACACTAAATTAAC	218585

CU210900.9	901	CTAATTTCACTTTAGAAGATCTAATTATGAGGTGGCTGGGGAAACAGAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218586	CTAATTTCACTTTAGAAGATCTAATTATGAGGTGGCTGGGGAAACAGAAT	218635

CU210900.9	951	AAAGTTAATGAATTCCAGCTTGAGTAAAACACTTAAAAGTGTCTCATGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218636	AAAGTTAATGAATTCCAGCTTGAGTAAAACACTTAAAAGTGTCTCATGAT	218685

CU210900.9	1001	GCCTGTATAAGCAGAGAGAGGAAAGTAAGTCGATAATTTGACAGCTAGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218686	GCCTGTATAAGCAGAGAGAGGAAAGTAAGTCGATAATTTGACAGCTAGGA	218735

CU210900.9	1051	AGCCATTAACTATCAGATGGTGAAGTGGCTGTGTAAGGAATGTTAACCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218736	AGCCATTAACTATCAGATGGTGAAGTGGCTGTGTAAGGAATGTTAACCTC	218785

CU210900.9	1101	TGGAAATGTATTGTTTTTTTAAAGTTTATTTTTAGTTATTATAGGAGAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218786	TGGAAATGTATTGTTTTTTTAAAGTTTATTTTTAGTTATTATAGGAGAGA	218835

CU210900.9	1151	ACTCGAATGCAGTTCCCTCCACTATCACAGACTATACTGTATAGTTGAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218836	ACTCGAATGCAGTTCCCTCCACTATCACAGACTATACTGTATAGTTGAGT	218885

CU210900.9	1201	TTACCACATTTGGGAAAAATCTTAGGCCAGCATATCCAAGTGCAGTGGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218886	TTACCACATTTGGGAAAAATCTTAGGCCAGCATATCCAAGTGCAGTGGCT	218935

CU210900.9	1251	AAGCTTCTTGCTGGGAAAACACCTCCTGATCACAGCATCTTCATCTCTCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218936	AAGCTTCTTGCTGGGAAAACACCTCCTGATCACAGCATCTTCATCTCTCC	218985

CU210900.9	1301	CTCTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	218986	CTCTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTTC	219035

CU210900.9	1351	CTCTGTGGGTGTGGGTATTTATAAATGTGTGGGAGGGAGGGAAGGAGAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219036	CTCTGTGGGTGTGGGTATTTATAAATGTGTGGGAGGGAGGGAAGGAGAGA	219085

CU210900.9	1401	GAGAAAGCACAAGCAGGCACACAGGAAACAGTGGAAACATTTAGAAAGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219086	GAGAAAGCACAAGCAGGCACACAGGAAACAGTGGAAACATTTAGAAAGTG	219135

CU210900.9	1451	GAGCCTTAAGTAAGAAATCCACCTGGTCCTTCCACCTTGCCATCATGTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219136	GAGCCTTAAGTAAGAAATCCACCTGGTCCTTCCACCTTGCCATCATGTAA	219185

CU210900.9	1501	GGATCCATCATAGGTCCAAGAGATCCTGGACTGAGGCCTCCAAAACCTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219186	GGATCCATCATAGGTCCAAGAGATCCTGGACTGAGGCCTCCAAAACCTAT	219235

CU210900.9	1551	AGGTCCCCTTACTTTCTCTGTTCATCTCAGGTACTTTGTCACAGGAGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219236	AGGTCCCCTTACTTTCTCTGTTCATCTCAGGTACTTTGTCACAGGAGTGA	219285

CU210900.9	1601	ACTGGTGACTAATAAAGTTTCCTTCCCATCATACTAGAGAGTTACAGTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219286	ACTGGTGACTAATAAAGTTTCCTTCCCATCATACTAGAGAGTTACAGTCA	219335

CU210900.9	1651	CTCCTAGTTTTTCTAGTAGATTTCTTCCTGCTAGTGGACTGGGTCACTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219336	CTCCTAGTTTTTCTAGTAGATTTCTTCCTGCTAGTGGACTGGGTCACTCA	219385

CU210900.9	1701	GGGACCACCAGAAGTAAGTGCTTTAAACCCTTTCAGCCTGCTTCAGTGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219386	GGGACCACCAGAAGTAAGTGCTTTAAACCCTTTCAGCCTGCTTCAGTGAC	219435

CU210900.9	1751	CCAATGAAGCAGAGGGTATCCCCTTGCAGAGGATACCTTGTTAACCGTCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219436	CCAATGAAGCAGAGGGTATCCCCTTGCAGAGGATACCTTGTTAACCGTCA	219485

CU210900.9	1801	ACACTGAGTATGTGACTCCAGTATTGAGTAAAAACCCCAACTTTCTCTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219486	ACACTGAGTATGTGACTCCAGTATTGAGTAAAAACCCCAACTTTCTCTTT	219535

CU210900.9	1851	AGATATATAAGAGATAACCCAAGGCTTCTTAAAAACAAACAAACCAGGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219536	AGATATATAAGAGATAACCCAAGGCTTCTTAAAAACAAACAAACCAGGGT	219585

CU210900.9	1901	GAGGACAGATGCTTGGCCTTATCAGTCATCATCTTCTGTAGAAGGAGCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219586	GAGGACAGATGCTTGGCCTTATCAGTCATCATCTTCTGTAGAAGGAGCTG	219635

CU210900.9	1951	ATGCAAATCGTGCATACTGATGTCTCCCCATTCTGGGGATGTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207318.9	219636	ATGCAAATCGTGCATACTGATGTCTCCCCATTCTGGGGATGTTGGAATTC	219685

Overview

Query
CU210900.9 - 186433 bps
Hit
CU207318.9 - 219685 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link