<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU458742.8	1	CTAAAGAAAATCAACAAGACTTGGAAATAGAACACAGAAACAAACCTCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229327	CTAAAGAAAATCAACAAGACTTGGAAATAGAACACAGAAACAAACCTCTT	229376

CU458742.8	51	CCTGTCTTTGGAGTGTGGGATGGACTTGAATAAAATAGCTCCTCTACCAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229377	CCTGTCTTTGGAGTGTGGGATGGACTTGAATAAAATAGCTCCTCTACCAT	229426

CU458742.8	101	GAAGCCTAGTGATGTACATCAAGTCTCTATAAACTCTAAGTCAACTGTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229427	GAAGCCTAGTGATGTACATCAAGTCTCTATAAACTCTAAGTCAACTGTGA	229476

CU458742.8	151	ACAAACTAGTACACAGGAGATGCCCATGTGACCAGTCTAACTACAGAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229477	ACAAACTAGTACACAGGAGATGCCCATGTGACCAGTCTAACTACAGAAAC	229526

CU458742.8	201	TCACTTTTTAAGACTGTCTAGTTACTTTCTAAATATTCCCTTATTTTAAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229527	TCACTTTTTAAGACTGTCTAGTTACTTTCTAAATATTCCCTTATTTTAAC	229576

CU458742.8	251	CACAACATTCTCCCTAAAGAATAGCTCCACAAAAACTTTCTGCCAAAATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229577	CACAACATTCTCCCTAAAGAATAGCTCCACAAAAACTTTCTGCCAAAATG	229626

CU458742.8	301	TTATTCTTCAAATACAACAAAATTTAATCTAAAAACAAATCCTTAAAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229627	TTATTCTTCAAATACAACAAAATTTAATCTAAAAACAAATCCTTAAAACT	229676

CU458742.8	351	GCTTCTAAAATAGAAAACCCAAAACTTTATTCCATCGTTCTTAGTCTTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229677	GCTTCTAAAATAGAAAACCCAAAACTTTATTCCATCGTTCTTAGTCTTTA	229726

CU458742.8	401	TCATTTCAGTGGAAAATTTTTTCCACATTTCTTGAACCCTACATGTAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229727	TCATTTCAGTGGAAAATTTTTTCCACATTTCTTGAACCCTACATGTAAAA	229776

CU458742.8	451	TGTACTCTAGACGGAACAAAAAATTTCAATATGAAAAGAAATCAAAATAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229777	TGTACTCTAGACGGAACAAAAAATTTCAATATGAAAAGAAATCAAAATAC	229826

CU458742.8	501	CAGGCATAGTGAAGTATACCTGTCATCCCAGCACCTGCAAGACAGACTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229827	CAGGCATAGTGAAGTATACCTGTCATCCCAGCACCTGCAAGACAGACTTA	229876

CU458742.8	551	GGAAACTGAGAGTTCAACCCCAAGCTGGAGTACACAGAGAGACCATTTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229877	GGAAACTGAGAGTTCAACCCCAAGCTGGAGTACACAGAGAGACCATTTCA	229926

CU458742.8	601	ACCCCCGCATCCCACAGAGGGGCCAGGGGGAGAAAAGAGAAAAAAAATCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229927	ACCCCCGCATCCCACAGAGGGGCCAGGGGGAGAAAAGAGAAAAAAAATCC	229976

CU458742.8	651	AAGTAATATTAGGTCCCTGGATAAGAAGTACTCTCCATTCAAGAGAAAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	229977	AAGTAATATTAGGTCCCTGGATAAGAAGTACTCTCCATTCAAGAGAAAAC	230026

CU458742.8	701	ATTTGCCAAATAAGCATTATCTTATTTTATTTCTATGTTAGGATAATAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230027	ATTTGCCAAATAAGCATTATCTTATTTTATTTCTATGTTAGGATAATAAA	230076

CU458742.8	751	AAGACTGGAGAATCACATTAGATGATTAACATGAAACAAGAGTTATGGTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230077	AAGACTGGAGAATCACATTAGATGATTAACATGAAACAAGAGTTATGGTA	230126

CU458742.8	801	GCATGTATACCCCTAATGATGCCATCAGGAAATGAAGATCAATGACGAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230127	GCATGTATACCCCTAATGATGCCATCAGGAAATGAAGATCAATGACGAAC	230176

CU458742.8	851	ACCATCTGGAGCACCAAGCAGAGCACAGACTCACGTCTGTCCAGTTGTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230177	ACCATCTGGAGCACCAAGCAGAGCACAGACTCACGTCTGTCCAGTTGTAC	230226

CU458742.8	901	TCACCTGTCTTGTCTTTGCTGAGGTCTCAATGAACGGAATCCCGTAACTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230227	TCACCTGTCTTGTCTTTGCTGAGGTCTCAATGAACGGAATCCCGTAACTC	230276

CU458742.8	951	CTTGCTAACTCCTGAGCCTGTTTCGTGTCTACTGTTCTAGAAGGCAAATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230277	CTTGCTAACTCCTGAGCCTGTTTCGTGTCTACTGTTCTAGAAGGCAAATC	230326

CU458742.8	1001	ACACTTATTCCCTACCAGGACCATAGGCACATCTTCAGAGTCCTTTACTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230327	ACACTTATTCCCTACCAGGACCATAGGCACATCTTCAGAGTCCTTTACTC	230376

CU458742.8	1051	TTTTAATTTGTTCTCTGGGGAAGAAACAAAGTGAAGCAGAAGCATAAGTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230377	TTTTAATTTGTTCTCTGGGGAAGAAACAAAGTGAAGCAGAAGCATAAGTA	230426

CU458742.8	1101	ACACAAAAATACTTCAAACCTTGCCCTCAACTTCATCTCACAAAGCTTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230427	ACACAAAAATACTTCAAACCTTGCCCTCAACTTCATCTCACAAAGCTTGA	230476

CU458742.8	1151	CTGAGTGGTTTCTTCATATGAATCCTAGTTTCTACCCTACCAAATTGTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230477	CTGAGTGGTTTCTTCATATGAATCCTAGTTTCTACCCTACCAAATTGTCT	230526

CU458742.8	1201	TCACTTCTCTTATTTTCCCTCTAAGACAAAAAAAAAAAAATCTTACATAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230527	TCACTTCTCTTATTTTCCCTCTAAGACAAAAAAAAAAAAATCTTACATAT	230576

CU458742.8	1251	CTGTTCACTTACATATATAAAAATAAGAAATATACAAAAGTTTCAAACAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230577	CTGTTCACTTACATATATAAAAATAAGAAATATACAAAAGTTTCAAACAT	230626

CU458742.8	1301	TTTGGTTTAAAATTATCTTAGAAATATGATACATATATGTAAATGTGTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230627	TTTGGTTTAAAATTATCTTAGAAATATGATACATATATGTAAATGTGTAT	230676

CU458742.8	1351	GTATACAATTGAAAATATTTTTATCCAACAGATATGGTGACTCATGCCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230677	GTATACAATTGAAAATATTTTTATCCAACAGATATGGTGACTCATGCCTT	230726

CU458742.8	1401	CAATCTCAGCATTAAGGAAGCAGAGGCAGTAGGACCTCTGTGAATTCAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230727	CAATCTCAGCATTAAGGAAGCAGAGGCAGTAGGACCTCTGTGAATTCAGG	230776

CU458742.8	1451	ACAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGCAAGCCAAAGCCACATAGTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230777	ACAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGCAAGCCAAAGCCACATAGTAA	230826

CU458742.8	1501	AACCCTATCTCAAGAAAAAATGTGTGTGTTTTTACCAAACATGAGTTAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230827	AACCCTATCTCAAGAAAAAATGTGTGTGTTTTTACCAAACATGAGTTAAC	230876

CU458742.8	1551	AGCATCAACATAACTGACATTTCAGGACTCTCCCTGCCATCTGTGGGTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230877	AGCATCAACATAACTGACATTTCAGGACTCTCCCTGCCATCTGTGGGTAA	230926

CU458742.8	1601	ACATTCTGAGAATCTTGCATGAGTGCCTGAAACTAGGGATGGTACCAAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230927	ACATTCTGAGAATCTTGCATGAGTGCCTGAAACTAGGGATGGTACCAAAC	230976

CU458742.8	1651	TCTTCATATACTATCTTCTCCTCCAGTACATGTCAATAATTCAGCTTAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	230977	TCTTCATATACTATCTTCTCCTCCAGTACATGTCAATAATTCAGCTTAAT	231026

CU458742.8	1701	TAACAATATAGTAGGAAAATAAAACAAAAAAACATAACAATATATAGTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	231027	TAACAATATAGTAGGAAAATAAAACAAAAAAACATAACAATATATAGTAA	231076

CU458742.8	1751	AAACTATTCAAAACTTAGAAATCCTTCATTTTTTGAAATTCCCATTTCGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	231077	AAACTATTCAAAACTTAGAAATCCTTCATTTTTTGAAATTCCCATTTCGT	231126

CU458742.8	1801	ATTTTCATACTTAGGTGAGGTGCACATGAGTGAAACATCAGACAACAAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	231127	ATTTTCATACTTAGGTGAGGTGCACATGAGTGAAACATCAGACAACAAAG	231176

CU458742.8	1851	CTATGGGTAAGGGCTCCTGCATTACTCAGACACAAAGACAATCATGAAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	231177	CTATGGGTAAGGGCTCCTGCATTACTCAGACACAAAGACAATCATGAAAG	231226

CU458742.8	1901	ACTGATTTCAGTTTCCATGTTTAACCACGCATATGTGTGTCTGTGTATAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	231227	ACTGATTTCAGTTTCCATGTTTAACCACGCATATGTGTGTCTGTGTATAG	231276

CU458742.8	1951	GTACATGCATGTGAATTCAGGTGCCAGTGCAGGCCAAAAGTATTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU207316.8	231277	GTACATGCATGTGAATTCAGGTGCCAGTGCAGGCCAAAAGTATTGAATTC	231326

Overview

Query
CU458742.8 - 38786 bps
Hit
CU207316.8 - 231326 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link