<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU024876.6	1	AAGCTTCACTGAAATGTCCCAGCGGCAAAAAGATTGTTGCTGTCGAGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	1995	AAGCTTCACTGAAATGTCCCAGCGGCAAAAAGATTGTTGCTGTCGAGTTT	2044

CU024876.6	51	GCAAGCTTTGGTAATCCTAGTGGTTACTGTGGAGATTTTGCTCTTGGAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2045	GCAAGCTTTGGTAATCCTAGTGGTTACTGTGGAGATTTTGCTCTTGGAAA	2094

CU024876.6	101	TTGTAACGGTGGTGCTGCTAAGGGTGTTGTTGAGAAGGCATGCTTGGGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2095	TTGTAACGGTGGTGCTGCTAAGGGTGTTGTTGAGAAGGCATGCTTGGGGA	2144

CU024876.6	151	AAGAAGAATGTTTGGTTGAAGTGAACCGTGCAAACTTCAACGGTCAGGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2145	AAGAAGAATGTTTGGTTGAAGTGAACCGTGCAAACTTCAACGGTCAGGGC	2194

CU024876.6	201	TGCGCAGGTTCAGTGAATACACTTGCTATCCAAGCTAAGTGTTCCTACTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2195	TGCGCAGGTTCAGTGAATACACTTGCTATCCAAGCTAAGTGTTCCTACTA	2244

CU024876.6	251	GAGTGAGTGAGTTAGGTGGATTGATTTGGCCAACTATAGCCCAGAAGCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2245	GAGTGAGTGAGTTAGGTGGATTGATTTGGCCAACTATAGCCCAGAAGCTC	2294

CU024876.6	301	AAAAATGTCATTGCAACAATTCAATGCTTGTATTATCTGTTTATCTACAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2295	AAAAATGTCATTGCAACAATTCAATGCTTGTATTATCTGTTTATCTACAT	2344

CU024876.6	351	CCAATTACATATATATCAAAAGATTGCAGTGATCCAATTCAAAATGATCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2345	CCAATTACATATATATCAAAAGATTGCAGTGATCCAATTCAAAATGATCT	2394

CU024876.6	401	TGACAACTACATCATCTCAGTACATAGTATATATCAATAGTTCCATTCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2395	TGACAACTACATCATCTCAGTACATAGTATATATCAATAGTTCCATTCAT	2444

CU024876.6	451	AATTAGAAGGAAAAAGCGAAAATAAGGAGCATTAGCAGTTCCCACGACAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2445	AATTAGAAGGAAAAAGCGAAAATAAGGAGCATTAGCAGTTCCCACGACAT	2494

CU024876.6	501	TAAAATATTATCATTTAAGAAGCAAATGCATTTTATTGAAAACAAATGAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2495	TAAAATATTATCATTTAAGAAGCAAATGCATTTTATTGAAAACAAATGAC	2544

CU024876.6	551	TAATATAAACTAAAGCATGAGTTGTGCTAAAGAAAGATTAGAAGAATAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2545	TAATATAAACTAAAGCATGAGTTGTGCTAAAGAAAGATTAGAAGAATAAT	2594

CU024876.6	601	ACAATAGAAATGTGGTGTAGAAAATCATAATGGACCGTGCTTGAATATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2595	ACAATAGAAATGTGGTGTAGAAAATCATAATGGACCGTGCTTGAATATTT	2644

CU024876.6	651	AGGCAGACAAATGATTTAATTAAACACCTTATGCAAGCAAGATTTAGGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2645	AGGCAGACAAATGATTTAATTAAACACCTTATGCAAGCAAGATTTAGGAG	2694

CU024876.6	701	TGGAGTGTAGTAGTACACAATTTGGCATATTATTCTGAAATGAAAGAAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2695	TGGAGTGTAGTAGTACACAATTTGGCATATTATTCTGAAATGAAAGAAAA	2744

CU024876.6	751	TCAAGTGCATAAGAAGAAAAAAACTGGATTCGAATCACAATGTAAACACG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2745	TCAAGTGCATAAGAAGAAAAAAACTGGATTCGAATCACAATGTAAACACG	2794

CU024876.6	801	GCAATCATAGATTGTCCCAGTTGTAACCTTTTTGTACTTAAAAAAAATAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2795	GCAATCATAGATTGTCCCAGTTGTAACCTTTTTGTACTTAAAAAAAATAC	2844

CU024876.6	851	TATCCAAAATTCTGAATATTTGTTTGTAAGGACCATTAACTCATAAAATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2845	TATCCAAAATTCTGAATATTTGTTTGTAAGGACCATTAACTCATAAAATG	2894

CU024876.6	901	GGATTATGTGAGTCACAAAACTGGTATATTGACTATTGTAATTGGCAACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2895	GGATTATGTGAGTCACAAAACTGGTATATTGACTATTGTAATTGGCAACA	2944

CU024876.6	951	GGTTGGTAGTTAACAGACAATCTGTCATAATTAGAATTAGAAATTAGGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2945	GGTTGGTAGTTAACAGACAATCTGTCATAATTAGAATTAGAAATTAGGAA	2994

CU024876.6	1001	ACAAAAGGAAAAGGTAGTAAGTATAACTGTGAGACAGGTTGATATAGATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	2995	ACAAAAGGAAAAGGTAGTAAGTATAACTGTGAGACAGGTTGATATAGATC	3044

CU024876.6	1051	TGTACGTATCTAAAGTTGGTGTTTGTCAATGACAAAACAATAATGTTACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3045	TGTACGTATCTAAAGTTGGTGTTTGTCAATGACAAAACAATAATGTTACC	3094

CU024876.6	1101	AAACTCCATCAAATGATAGCCTTCATTATTCATCAACTTTTAACCAAATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3095	AAACTCCATCAAATGATAGCCTTCATTATTCATCAACTTTTAACCAAATA	3144

CU024876.6	1151	TTTTGGAAACGGTTCAGGACAAACCAAACTCGACCTCTATTGATTTTGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3145	TTTTGGAAACGGTTCAGGACAAACCAAACTCGACCTCTATTGATTTTGAT	3194

CU024876.6	1201	TTTGATTTCGATATCATTTCAAAACATTTAAAATTGATCATCTGAAACTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3195	TTTGATTTCGATATCATTTCAAAACATTTAAAATTGATCATCTGAAACTA	3244

CU024876.6	1251	GACCAGGGAAAGGAATAAATAGACTGAGTTAGTATTTACAAAGTTCAAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3245	GACCAGGGAAAGGAATAAATAGACTGAGTTAGTATTTACAAAGTTCAAGT	3294

CU024876.6	1301	CTAGCTTGTTCAAAATATCAAGATCTAAGCATGAACACCTGCTACGTATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3295	CTAGCTTGTTCAAAATATCAAGATCTAAGCATGAACACCTGCTACGTATG	3344

CU024876.6	1351	ATAATTAAACTTATAAATAGACTAACTAACTAATTTCTAAATAGTGAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3345	ATAATTAAACTTATAAATAGACTAACTAACTAATTTCTAAATAGTGAAAT	3394

CU024876.6	1401	GATAGGTGCTATTTTTACTACATCTAACACAATAACATTAGAAGGGTGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3395	GATAGGTGCTATTTTTACTACATCTAACACAATAACATTAGAAGGGTGTA	3444

CU024876.6	1451	AAAGCTTTAAGTGTAGCATGATTTGCTCCAAGAATGAGAAAGGTACCACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3445	AAAGCTTTAAGTGTAGCATGATTTGCTCCAAGAATGAGAAAGGTACCACT	3494

CU024876.6	1501	ACCAGCCACATAAGTCTAACCTGCCTCACCAACTCACATCTAGAAGCAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3495	ACCAGCCACATAAGTCTAACCTGCCTCACCAACTCACATCTAGAAGCAAT	3544

CU024876.6	1551	GAGATTTGATTGTCACTTCCTTAATTCTCTCACTTCCTTTGGATCACAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3545	GAGATTTGATTGTCACTTCCTTAATTCTCTCACTTCCTTTGGATCACAAC	3594

CU024876.6	1601	TCAAATTAATCCTATGAAAAAATTCACAGCAGATAGAATAAATATTGCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3595	TCAAATTAATCCTATGAAAAAATTCACAGCAGATAGAATAAATATTGCTA	3644

CU024876.6	1651	TATAGTATTATTATGCTGCTGCACTAGAATATTAGCATCTATAGAGTCGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3645	TATAGTATTATTATGCTGCTGCACTAGAATATTAGCATCTATAGAGTCGT	3694

CU024876.6	1701	TATTAATTACGAACCAACCAACACCAATACCATATATAAATACAATACAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3695	TATTAATTACGAACCAACCAACACCAATACCATATATAAATACAATACAT	3744

CU024876.6	1751	ACATCAATCGATGTTTTTTATATTCATTCACTCTGAATCAATGAAGCAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3745	ACATCAATCGATGTTTTTTATATTCATTCACTCTGAATCAATGAAGCAAA	3794

CU024876.6	1801	GAAGTGAGTGATCATCAAATATAGATAGAATTGATCGATATGGGAAGGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3795	GAAGTGAGTGATCATCAAATATAGATAGAATTGATCGATATGGGAAGGTC	3844

CU024876.6	1851	CCCTTGCTGTGAGAAAGGTCACATAAACAAAGGAGCATGGAGCAAAGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3845	CCCTTGCTGTGAGAAAGGTCACATAAACAAAGGAGCATGGAGCAAAGAAG	3894

CU024876.6	1901	AAGATGAGCGGCTGCTCACGGTGAGGGATGCTGGCGCTCTCTCCCAAAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3895	AAGATGAGCGGCTGCTCACGGTGAGGGATGCTGGCGCTCTCTCCCAAAAG	3944

CU024876.6	1951	CCGCTGGTCTTCTCCGTTGCGGTAAGAGTTGCCGTCTCCGGTGGATCAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179753.5	3945	CCGCTGGTCTTCTCCGTTGCGGTAAGAGTTGCCGTCTCCGGTGGATCAAC	3994

Overview

Query
CU024876.6 - 137872 bps
Hit
CU179753.5 - 3994 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link