<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT967323.1	1	GAATTCTGTGGCAGATGGTGGTAGCTCCCTGGAAGGGGGCCCTTCAGTAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	63985	GAATTCTGTGGCAGATGGTGGTAGCTCCCTGGAAGGGGGCCCTTCAGTAC	64034

CT967323.1	51	TTACTAGAACTGAATCTATCAGCATAAGGCAAGTGCCAACAGCCCTCCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64035	TTACTAGAACTGAATCTATCAGCATAAGGCAAGTGCCAACAGCCCTCCTG	64084

CT967323.1	101	CCTAGAAGTGCTTTTCATGTTTAGATGGGGCCTCAGGGGTATGTGTGGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64085	CCTAGAAGTGCTTTTCATGTTTAGATGGGGCCTCAGGGGTATGTGTGGCT	64134

CT967323.1	151	TTCTAGAGACCTGAGCAAGATCTTAGGCAGCTTTACCACAGGTCTCAACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64135	TTCTAGAGACCTGAGCAAGATCTTAGGCAGCTTTACCACAGGTCTCAACT	64184

CT967323.1	201	TCAGACTAAAGTAAGCACTATGTAAGACTAAAGTAAGTTCTGATACCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64185	TCAGACTAAAGTAAGCACTATGTAAGACTAAAGTAAGTTCTGATACCTCA	64234

CT967323.1	251	CTAGCACTGGCTTGGTGCTGGTGAGGGAATGACAGGGTGACATTTGCAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64235	CTAGCACTGGCTTGGTGCTGGTGAGGGAATGACAGGGTGACATTTGCAGA	64284

CT967323.1	301	GACAGCCTGGTCACCAGTTAACCCTCACACAACTTTGTTAAATTGTGAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64285	GACAGCCTGGTCACCAGTTAACCCTCACACAACTTTGTTAAATTGTGAAT	64334

CT967323.1	351	AACTGTGGCCCCATGGGGTGGTTCCTGGTGCCTTATTGGGCTGCTGGTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64335	AACTGTGGCCCCATGGGGTGGTTCCTGGTGCCTTATTGGGCTGCTGGTCT	64384

CT967323.1	401	CCCCTCTGAACACATCCTTCCCACTGTGTTCTTAAGAGACTGTCCTTGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64385	CCCCTCTGAACACATCCTTCCCACTGTGTTCTTAAGAGACTGTCCTTGGA	64434

CT967323.1	451	GCAGTCACAAAAGGGAGCTCACAAAAGGCTGTTTGAATGTGTCTGACATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64435	GCAGTCACAAAAGGGAGCTCACAAAAGGCTGTTTGAATGTGTCTGACATA	64484

CT967323.1	501	CATGCACACTGCACACACTTGCACACAACCCTCAGTATTCTCAGCCGGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64485	CATGCACACTGCACACACTTGCACACAACCCTCAGTATTCTCAGCCGGTT	64534

CT967323.1	551	ACCAGCTTGGCATCTTGGAAGAGGAGTGTGGGTGGGTGTGGCCTATGGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64535	ACCAGCTTGGCATCTTGGAAGAGGAGTGTGGGTGGGTGTGGCCTATGGGT	64584

CT967323.1	601	AAGGAGTGGCAGAATGACAGCATGCCTAGCTCCTTCTATTCTGCATATGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64585	AAGGAGTGGCAGAATGACAGCATGCCTAGCTCCTTCTATTCTGCATATGG	64634

CT967323.1	651	ACTGGCTCAGAAGGAAACTTTCTTCACAAATGACTGTCCAGCCTTCTCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64635	ACTGGCTCAGAAGGAAACTTTCTTCACAAATGACTGTCCAGCCTTCTCCC	64684

CT967323.1	701	ACAGAGCAGAGCACAGTGGGTTCTTGGTGCACCTAGTGAGATGACTTCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64685	ACAGAGCAGAGCACAGTGGGTTCTTGGTGCACCTAGTGAGATGACTTCAG	64734

CT967323.1	751	ATACAGTGTGCGTGGGAGGGAGGATAAGATGTCAGGGTCAAAGGATGCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64735	ATACAGTGTGCGTGGGAGGGAGGATAAGATGTCAGGGTCAAAGGATGCTG	64784

CT967323.1	801	GACAAGCCCAATCGTTTTTGTCCTACCGACTCTGGGGTCCCTTCATGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64785	GACAAGCCCAATCGTTTTTGTCCTACCGACTCTGGGGTCCCTTCATGGGA	64834

CT967323.1	851	GGGAATAGCAACACCACCCCAGTGTTTGGATAGAGAAGGCACTAGATGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64835	GGGAATAGCAACACCACCCCAGTGTTTGGATAGAGAAGGCACTAGATGCC	64884

CT967323.1	901	CCTTCCCAGGCTGGAGAGCAAGCTGATTGAGAGGACAGATCTTTATGTGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64885	CCTTCCCAGGCTGGAGAGCAAGCTGATTGAGAGGACAGATCTTTATGTGC	64934

CT967323.1	951	CCAGATGAGGAGAGGACACCCCAGCATCTGCCTGTAAGATGCAGGAGAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64935	CCAGATGAGGAGAGGACACCCCAGCATCTGCCTGTAAGATGCAGGAGAGA	64984

CT967323.1	1001	TGGAAGTACAGCCTTACTGCTGCCTGTTCCATCCACAAGGATAGACAATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	64985	TGGAAGTACAGCCTTACTGCTGCCTGTTCCATCCACAAGGATAGACAATA	65034

CT967323.1	1051	GTCACCAGTGGGGGGGGGAGGGGCTACAGAGAGATATCAGTGGTTCACAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65035	GTCACCAGTGGGGGGGGGAGGGGCTACAGAGAGATATCAGTGGTTCACAG	65084

CT967323.1	1101	TGGGAAGCTCCATTCCTCATACCCCCTCCCTCCTGCCTCCACCACCCAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65085	TGGGAAGCTCCATTCCTCATACCCCCTCCCTCCTGCCTCCACCACCCAGC	65134

CT967323.1	1151	TGTTTAACATTGAGTGACTACTGCATGAAGAGAGCTTTGCCAGCAAATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65135	TGTTTAACATTGAGTGACTACTGCATGAAGAGAGCTTTGCCAGCAAATTC	65184

CT967323.1	1201	TCCCCCAGGCTATGTAGGCATAGATTCTTTGCAACCTACTTTTAATAAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65185	TCCCCCAGGCTATGTAGGCATAGATTCTTTGCAACCTACTTTTAATAAGA	65234

CT967323.1	1251	GTTCAACGTCTCCTCTAGTCTACCACCCAGAAGAGGTAGTGGAAGAGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65235	GTTCAACGTCTCCTCTAGTCTACCACCCAGAAGAGGTAGTGGAAGAGAAA	65284

CT967323.1	1301	AGTTATTAGGATGTGGGGGAAGTGGAGCTGCTCAGCAACAGTTCTCTGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65285	AGTTATTAGGATGTGGGGGAAGTGGAGCTGCTCAGCAACAGTTCTCTGGG	65334

CT967323.1	1351	GGTGAGCCTGATCTTCTTTGGCAGCCGTTCTGTCCTGTAGCCAACACCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65335	GGTGAGCCTGATCTTCTTTGGCAGCCGTTCTGTCCTGTAGCCAACACCAA	65384

CT967323.1	1401	ATATGACTCAGCAGCTGCAGACAAGTCCTCTAGGCAGGAAGATACCACAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65385	ATATGACTCAGCAGCTGCAGACAAGTCCTCTAGGCAGGAAGATACCACAC	65434

CT967323.1	1451	ACAAACCCATTAGCTTCAGTCCAGTCCTTTCGGCAGGCAGGCATCAGGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65435	ACAAACCCATTAGCTTCAGTCCAGTCCTTTCGGCAGGCAGGCATCAGGCA	65484

CT967323.1	1501	CGAACTAGCAGCTATAGTGCAATCCTGAAGGAACTGCAAGGCTCACCAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65485	CGAACTAGCAGCTATAGTGCAATCCTGAAGGAACTGCAAGGCTCACCAAC	65534

CT967323.1	1551	CAGCCCAAGGAGAGGCCATGAAGGCAGCAAGCTGTGGCAAGAACCCCATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65535	CAGCCCAAGGAGAGGCCATGAAGGCAGCAAGCTGTGGCAAGAACCCCATG	65584

CT967323.1	1601	AGCAATTCTTGGGCGAGTTTCTCTCAATGGCAGCGTTCTCACAAGTTGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65585	AGCAATTCTTGGGCGAGTTTCTCTCAATGGCAGCGTTCTCACAAGTTGAG	65634

CT967323.1	1651	TTCAATAATGCTATATAAGGCAAACCAATGCATGTGTGTCATTAGAGAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65635	TTCAATAATGCTATATAAGGCAAACCAATGCATGTGTGTCATTAGAGAAG	65684

CT967323.1	1701	AAGAGTGATGCGGAGCAAACCAAACCAGTGCTTCTCCTCCACTGTCTGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65685	AAGAGTGATGCGGAGCAAACCAAACCAGTGCTTCTCCTCCACTGTCTGTG	65734

CT967323.1	1751	GGGCCAAATACATACTCCTTCACCAAAGGTCTTTTCATGTGTTTGCTATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65735	GGGCCAAATACATACTCCTTCACCAAAGGTCTTTTCATGTGTTTGCTATA	65784

CT967323.1	1801	TCAAAAACATCCTTTCACCTGTGTGCCCCAGCAAAACATCATTTGACATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65785	TCAAAAACATCCTTTCACCTGTGTGCCCCAGCAAAACATCATTTGACATA	65834

CT967323.1	1851	ACTAACTTTCCAAAGACTAGAAATTTCCACATCAGAGCTAACTGAAGCGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65835	ACTAACTTTCCAAAGACTAGAAATTTCCACATCAGAGCTAACTGAAGCGA	65884

CT967323.1	1901	CTCTGTGGAGACACTTTGAGCCCTTAATTGAGTGTTCTAGTTTGATTTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65885	CTCTGTGGAGACACTTTGAGCCCTTAATTGAGTGTTCTAGTTTGATTTAT	65934

CT967323.1	1951	GTTTCTGTGATTTAACACTGACCAGAAGCAACTTAAGGGAGGAAAAAGGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179677.2	65935	GTTTCTGTGATTTAACACTGACCAGAAGCAACTTAAGGGAGGAAAAAGGT	65984

Overview

Query
CT967323.1 - 196130 bps
Hit
CU179677.2 - 65984 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link