<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 524 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU914523.1	21466	TTCAGGGAGAGTTAATGCTTGTTGGGTATTTTGGTTTGACACTGCTTCAC	21515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	130953	TTCAGGGAGAGTTAATGCTTGTTGGGTATTTTGGTTTGACACTGCTTCAC	131002

CU914523.1	21516	ACCCCCAAAAAAAAGAAGGGAGCTACGTCTGAGTTAAACTTGGAGATGGA	21565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131003	ACCCCCAAAAAAAAGAAGGGAGCTACGTCTGAGTTAAACTTGGAGATGGA	131052

CU914523.1	21566	AGTCTTCTTTCCTTTCTCGACGGTGAAGTAAGACCAAGCTCATGAGCTTA	21615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131053	AGTCTTCTTTCCTTTCTCGACGGTGAAGTAAGACCAAGCTCATGAGCTTA	131102

CU914523.1	21616	TTATCCTAGGTCGGAACAAGTTGATAGGACCCCCTTTTTTACGTCCCTAT	21665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131103	TTATCCTAGGTCGGAACAAGTTGATAGGACCCCCTTTTTTACGTCCCTAT	131152

CU914523.1	21666	GTTCCCCCCGTGTGGCGACATGGGGGCGAAAAAAGGAAAGAGAGGGATGG	21715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131153	GTTCCCCCCGTGTGGCGACATGGGGGCGAAAAAAGGAAAGAGAGGGATGG	131202

CU914523.1	21716	GGTTTCTCTCGCTTTTGGCATAGCGGGCCCCCAGTGGGAGGCTCGCACGA	21765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131203	GGTTTCTCTCGCTTTTGGCATAGCGGGCCCCCAGTGGGAGGCTCGCACGA	131252

CU914523.1	21766	CAGGCTATTAGCTCAGTGGTAGAGCGCGCCCCTGATAATTGCGTCGTTGT	21815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131253	CAGGCTATTAGCTCAGTGGTAGAGCGCGCCCCTGATAATTGCGTCGTTGT	131302

CU914523.1	21816	GCCTGGGCTGTGAGGGCTCTCAGCCACATGGATAGTTCAATGTGCTCATC	21865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131303	GCCTGGGCTGTGAGGGCTCTCAGCCACATGGATAGTTCAATGTGCTCATC	131352

CU914523.1	21866	GGCGCCTGACCCTGAGATGTGGATCATCCAAGGCACATTAGCATGGCGTA	21915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131353	GGCGCCTGACCCTGAGATGTGGATCATCCAAGGCACATTAGCATGGCGTA	131402

CU914523.1	21916	CTCCTCCTGTTCGAATCGGGGTTTGAAACCAAACTCCTCCTTAGGAGGAT	21965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131403	CTCCTCCTGTTCGAATCGGGGTTTGAAACCAAACTCCTCCTTAGGAGGAT	131452

CU914523.1	21966	AGATGGGGCGATTCGGGTGAGATC	21989
			||||||||||||||||||||||||
CU179634.6	131453	AGATGGGGCGATTCGGGTGAGATC	131476

Overview

Query
CU914523.1 - 92869 bps
Hit
CU179634.6 - 131476 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 524 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100523524214662198911309531314761
210043514485168812136511251911296751
399.31245289230152330311290291293171
Short-link