<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU137640.12	1	ACAAGGGAAGGAAAAAAAAGGGGAAACATAAGACAGCAATGAAGAAAGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120513	ACAAGGGAAGGAAAAAAAAGGGGAAACATAAGACAGCAATGAAGAAAGTA	120562

CU137640.12	51	CCTTTGAGGTATCATTATTTGCAAGCAGATGAGTAAGTGTTTGGAGTACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120563	CCTTTGAGGTATCATTATTTGCAAGCAGATGAGTAAGTGTTTGGAGTACA	120612

CU137640.12	101	TTTAAAACTAATCTCTCCCCCTTTCCCTCGTCTAGATCACTGTTAAGTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120613	TTTAAAACTAATCTCTCCCCCTTTCCCTCGTCTAGATCACTGTTAAGTAA	120662

CU137640.12	151	TGATACAACATGCAAAAAGCATTCCCCATCACGAAATAGAGCCTGGTAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120663	TGATACAACATGCAAAAAGCATTCCCCATCACGAAATAGAGCCTGGTAGT	120712

CU137640.12	201	ACTGAAACATTAGAACATAAAAAAAACCACTCAGTAAAATTGTAAAATGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120713	ACTGAAACATTAGAACATAAAAAAAACCACTCAGTAAAATTGTAAAATGC	120762

CU137640.12	251	ATATTCATTTAAGCTAATAAAATTGAGAGATAAATCAACATCAGATGCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120763	ATATTCATTTAAGCTAATAAAATTGAGAGATAAATCAACATCAGATGCAT	120812

CU137640.12	301	ACTGCTTGATTAGCCAGAAGCATTTCTCTCATTCCAGCCAACATGTCAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120813	ACTGCTTGATTAGCCAGAAGCATTTCTCTCATTCCAGCCAACATGTCAAC	120862

CU137640.12	351	AGACAGATCAACAAAAAATTTCTCCCGTTCTTTTATTTGCGTAAACATTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120863	AGACAGATCAACAAAAAATTTCTCCCGTTCTTTTATTTGCGTAAACATTT	120912

CU137640.12	401	CCAAATACTTAGAGCATAACTGTAACTTTGCTTTTTTATCTTCCTCCGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120913	CCAAATACTTAGAGCATAACTGTAACTTTGCTTTTTTATCTTCCTCCGAA	120962

CU137640.12	451	ATTGGTATAATCTGAAAATTAACAATAATAAATATAGCAACATATATATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	120963	ATTGGTATAATCTGAAAATTAACAATAATAAATATAGCAACATATATATT	121012

CU137640.12	501	ATACTTGCAAGATGATTAAAACTTAGATTATGAATTCCAAAGTACGTTAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121013	ATACTTGCAAGATGATTAAAACTTAGATTATGAATTCCAAAGTACGTTAT	121062

CU137640.12	551	AGCTCAAGCCAAAATCAAGTAAAACTAAATTTTCACCTTCATGAGATCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121063	AGCTCAAGCCAAAATCAAGTAAAACTAAATTTTCACCTTCATGAGATCAA	121112

CU137640.12	601	GTATGTGCCTAAGTACATCATCTCTCAAACCTTCTATCCAAAATAAATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121113	GTATGTGCCTAAGTACATCATCTCTCAAACCTTCTATCCAAAATAAATCA	121162

CU137640.12	651	AACAAGCAATCAATGCTTGCAAAACTATGCAATATAAAACTCTTCGTATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121163	AACAAGCAATCAATGCTTGCAAAACTATGCAATATAAAACTCTTCGTATC	121212

CU137640.12	701	TTCAGCTGATGCAAAAAACTTGGTAAAGAACTCCATGCACATTTTCATGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121213	TTCAGCTGATGCAAAAAACTTGGTAAAGAACTCCATGCACATTTTCATGC	121262

CU137640.12	751	AACCAAACCAATTTTGCACGGTCTCAGGTGAATTGCAGTTTGGTTGATCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121263	AACCAAACCAATTTTGCACGGTCTCAGGTGAATTGCAGTTTGGTTGATCA	121312

CU137640.12	801	GGCACTGATTCCAAAACTTCCAAGCCGCTATTTACACTGGAGGGGTCCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121313	GGCACTGATTCCAAAACTTCCAAGCCGCTATTTACACTGGAGGGGTCCAT	121362

CU137640.12	851	ACTTCCAGATCTTTTGCACTCTTGTGCTTGAACACAAGCAACTTGTAGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121363	ACTTCCAGATCTTTTGCACTCTTGTGCTTGAACACAAGCAACTTGTAGAA	121412

CU137640.12	901	CCCGAGAGACTGCATTCAAGGTTTTACAGGAAGTAATAGTTTTCTCGGGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121413	CCCGAGAGACTGCATTCAAGGTTTTACAGGAAGTAATAGTTTTCTCGGGG	121462

CU137640.12	951	GAGAGCTGCAAAATACGAACTAAACTCCTCACAAGAAGACCAGCAATTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121463	GAGAGCTGCAAAATACGAACTAAACTCCTCACAAGAAGACCAGCAATTTC	121512

CU137640.12	1001	AGGATTACAAGCAGAATGTTCAAGTGCATCCAGCAAAGCGGACAATTCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121513	AGGATTACAAGCAGAATGTTCAAGTGCATCCAGCAAAGCGGACAATTCAG	121562

CU137640.12	1051	TCTATAATCAAAATAAGAAACAGATATTAGATACAAATGAGTAACACACG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121563	TCTATAATCAAAATAAGAAACAGATATTAGATACAAATGAGTAACACACG	121612

CU137640.12	1101	CATGCGAAATGATATGCACACGGTAAATATTACATTAGCAAAATAATAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121613	CATGCGAAATGATATGCACACGGTAAATATTACATTAGCAAAATAATAAG	121662

CU137640.12	1151	GCATAAAGCCAATTAACAAGACAGGTAGTACATAATTTAAAACAAATATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121663	GCATAAAGCCAATTAACAAGACAGGTAGTACATAATTTAAAACAAATATC	121712

CU137640.12	1201	CAACGCGTGAAGCTTAGGAAAAACTTTTGACAAGTCACAGCACTTCTGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121713	CAACGCGTGAAGCTTAGGAAAAACTTTTGACAAGTCACAGCACTTCTGTT	121762

CU137640.12	1251	CTGTAAAATGATTTTGTGATCTATTATCTATTAAGAACAAAATTCTACAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121763	CTGTAAAATGATTTTGTGATCTATTATCTATTAAGAACAAAATTCTACAT	121812

CU137640.12	1301	ACTTAAAAAATATTTTTTGCAAATCACTGCTCTCCACTGCATAGCTTCAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121813	ACTTAAAAAATATTTTTTGCAAATCACTGCTCTCCACTGCATAGCTTCAC	121862

CU137640.12	1351	ATACATTTTTCACCATATAGCTGTATTTTATCTCTCTTACAACAGATATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121863	ATACATTTTTCACCATATAGCTGTATTTTATCTCTCTTACAACAGATATG	121912

CU137640.12	1401	AAATCTGTGTTTTAAGTCTCAATTTCACAAAATAAAAGAAATTTTAGAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121913	AAATCTGTGTTTTAAGTCTCAATTTCACAAAATAAAAGAAATTTTAGAAA	121962

CU137640.12	1451	GATGCATCCTGGGGGGGGGACCCACCATGTTGTGTGTATTTCCATTAGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	121963	GATGCATCCTGGGGGGGGGACCCACCATGTTGTGTGTATTTCCATTAGAA	122012

CU137640.12	1501	GTTGCAGCAAATTCCACAAATGACATTATTTCCATCTGCAGACTTCTAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122013	GTTGCAGCAAATTCCACAAATGACATTATTTCCATCTGCAGACTTCTAAC	122062

CU137640.12	1551	CCCATTGACTTCTGGTTTGTCGACTGTGCTACTTGAAGCAGACAATAATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122063	CCCATTGACTTCTGGTTTGTCGACTGTGCTACTTGAAGCAGACAATAATT	122112

CU137640.12	1601	CAGACTTCTCGTTGTATGCAAATACCTGTCGACCAATTTCTTCTAAACCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122113	CAGACTTCTCGTTGTATGCAAATACCTGTCGACCAATTTCTTCTAAACCT	122162

CU137640.12	1651	GATTCGAAGTAAAAGAAATTTTCTGAAAAGATAAGATCCCATATTCCCTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122163	GATTCGAAGTAAAAGAAATTTTCTGAAAAGATAAGATCCCATATTCCCTC	122212

CU137640.12	1701	TTCACGAAAATTTTCAAGTGACATGGGAGAAGTAGAAAGAAGATTTTTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122213	TTCACGAAAATTTTCAAGTGACATGGGAGAAGTAGAAAGAAGATTTTTAA	122262

CU137640.12	1751	ATGCATTGAGAACTGTGTTCTGTAAAATGGTGACAAAGACCCTGCAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122263	ATGCATTGAGAACTGTGTTCTGTAAAATGGTGACAAAGACCCTGCAGAAA	122312

CU137640.12	1801	ATGGGAAGAAAAGCAACAGCAAAAATTAGTTCAGCATATGAAGTTTTTAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122313	ATGGGAAGAAAAGCAACAGCAAAAATTAGTTCAGCATATGAAGTTTTTAC	122362

CU137640.12	1851	TTCATAACCATAGAAAGAGAGTAATTTGCAATAACTGTTTTTTATAGTTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122363	TTCATAACCATAGAAAGAGAGTAATTTGCAATAACTGTTTTTTATAGTTA	122412

CU137640.12	1901	ATTAAGATTTTTAAGCAAACAGCACAAGTAAAGACAATGGAAACCATTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122413	ATTAAGATTTTTAAGCAAACAGCACAAGTAAAGACAATGGAAACCATTTA	122462

CU137640.12	1951	TATTATTCACCTTAAATAGCTTGGCAAATCATTCTGATTTGAGCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU075908.9	122463	TATTATTCACCTTAAATAGCTTGGCAAATCATTCTGATTTGAGCAAGCTT	122512

Overview

Query
CU137640.12 - 81033 bps
Hit
CU075908.9 - 122512 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100191620001200011205131225121
Short-link