<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU137640.12 1 ACAAGGGAAGGAAAAAAAAGGGGAAACATAAGACAGCAATGAAGAAAGTA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120513 ACAAGGGAAGGAAAAAAAAGGGGAAACATAAGACAGCAATGAAGAAAGTA 120562 CU137640.12 51 CCTTTGAGGTATCATTATTTGCAAGCAGATGAGTAAGTGTTTGGAGTACA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120563 CCTTTGAGGTATCATTATTTGCAAGCAGATGAGTAAGTGTTTGGAGTACA 120612 CU137640.12 101 TTTAAAACTAATCTCTCCCCCTTTCCCTCGTCTAGATCACTGTTAAGTAA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120613 TTTAAAACTAATCTCTCCCCCTTTCCCTCGTCTAGATCACTGTTAAGTAA 120662 CU137640.12 151 TGATACAACATGCAAAAAGCATTCCCCATCACGAAATAGAGCCTGGTAGT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120663 TGATACAACATGCAAAAAGCATTCCCCATCACGAAATAGAGCCTGGTAGT 120712 CU137640.12 201 ACTGAAACATTAGAACATAAAAAAAACCACTCAGTAAAATTGTAAAATGC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120713 ACTGAAACATTAGAACATAAAAAAAACCACTCAGTAAAATTGTAAAATGC 120762 CU137640.12 251 ATATTCATTTAAGCTAATAAAATTGAGAGATAAATCAACATCAGATGCAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120763 ATATTCATTTAAGCTAATAAAATTGAGAGATAAATCAACATCAGATGCAT 120812 CU137640.12 301 ACTGCTTGATTAGCCAGAAGCATTTCTCTCATTCCAGCCAACATGTCAAC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120813 ACTGCTTGATTAGCCAGAAGCATTTCTCTCATTCCAGCCAACATGTCAAC 120862 CU137640.12 351 AGACAGATCAACAAAAAATTTCTCCCGTTCTTTTATTTGCGTAAACATTT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120863 AGACAGATCAACAAAAAATTTCTCCCGTTCTTTTATTTGCGTAAACATTT 120912 CU137640.12 401 CCAAATACTTAGAGCATAACTGTAACTTTGCTTTTTTATCTTCCTCCGAA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120913 CCAAATACTTAGAGCATAACTGTAACTTTGCTTTTTTATCTTCCTCCGAA 120962 CU137640.12 451 ATTGGTATAATCTGAAAATTAACAATAATAAATATAGCAACATATATATT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 120963 ATTGGTATAATCTGAAAATTAACAATAATAAATATAGCAACATATATATT 121012 CU137640.12 501 ATACTTGCAAGATGATTAAAACTTAGATTATGAATTCCAAAGTACGTTAT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121013 ATACTTGCAAGATGATTAAAACTTAGATTATGAATTCCAAAGTACGTTAT 121062 CU137640.12 551 AGCTCAAGCCAAAATCAAGTAAAACTAAATTTTCACCTTCATGAGATCAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121063 AGCTCAAGCCAAAATCAAGTAAAACTAAATTTTCACCTTCATGAGATCAA 121112 CU137640.12 601 GTATGTGCCTAAGTACATCATCTCTCAAACCTTCTATCCAAAATAAATCA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121113 GTATGTGCCTAAGTACATCATCTCTCAAACCTTCTATCCAAAATAAATCA 121162 CU137640.12 651 AACAAGCAATCAATGCTTGCAAAACTATGCAATATAAAACTCTTCGTATC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121163 AACAAGCAATCAATGCTTGCAAAACTATGCAATATAAAACTCTTCGTATC 121212 CU137640.12 701 TTCAGCTGATGCAAAAAACTTGGTAAAGAACTCCATGCACATTTTCATGC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121213 TTCAGCTGATGCAAAAAACTTGGTAAAGAACTCCATGCACATTTTCATGC 121262 CU137640.12 751 AACCAAACCAATTTTGCACGGTCTCAGGTGAATTGCAGTTTGGTTGATCA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121263 AACCAAACCAATTTTGCACGGTCTCAGGTGAATTGCAGTTTGGTTGATCA 121312 CU137640.12 801 GGCACTGATTCCAAAACTTCCAAGCCGCTATTTACACTGGAGGGGTCCAT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121313 GGCACTGATTCCAAAACTTCCAAGCCGCTATTTACACTGGAGGGGTCCAT 121362 CU137640.12 851 ACTTCCAGATCTTTTGCACTCTTGTGCTTGAACACAAGCAACTTGTAGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121363 ACTTCCAGATCTTTTGCACTCTTGTGCTTGAACACAAGCAACTTGTAGAA 121412 CU137640.12 901 CCCGAGAGACTGCATTCAAGGTTTTACAGGAAGTAATAGTTTTCTCGGGG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121413 CCCGAGAGACTGCATTCAAGGTTTTACAGGAAGTAATAGTTTTCTCGGGG 121462 CU137640.12 951 GAGAGCTGCAAAATACGAACTAAACTCCTCACAAGAAGACCAGCAATTTC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121463 GAGAGCTGCAAAATACGAACTAAACTCCTCACAAGAAGACCAGCAATTTC 121512 CU137640.12 1001 AGGATTACAAGCAGAATGTTCAAGTGCATCCAGCAAAGCGGACAATTCAG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121513 AGGATTACAAGCAGAATGTTCAAGTGCATCCAGCAAAGCGGACAATTCAG 121562 CU137640.12 1051 TCTATAATCAAAATAAGAAACAGATATTAGATACAAATGAGTAACACACG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121563 TCTATAATCAAAATAAGAAACAGATATTAGATACAAATGAGTAACACACG 121612 CU137640.12 1101 CATGCGAAATGATATGCACACGGTAAATATTACATTAGCAAAATAATAAG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121613 CATGCGAAATGATATGCACACGGTAAATATTACATTAGCAAAATAATAAG 121662 CU137640.12 1151 GCATAAAGCCAATTAACAAGACAGGTAGTACATAATTTAAAACAAATATC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121663 GCATAAAGCCAATTAACAAGACAGGTAGTACATAATTTAAAACAAATATC 121712 CU137640.12 1201 CAACGCGTGAAGCTTAGGAAAAACTTTTGACAAGTCACAGCACTTCTGTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121713 CAACGCGTGAAGCTTAGGAAAAACTTTTGACAAGTCACAGCACTTCTGTT 121762 CU137640.12 1251 CTGTAAAATGATTTTGTGATCTATTATCTATTAAGAACAAAATTCTACAT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121763 CTGTAAAATGATTTTGTGATCTATTATCTATTAAGAACAAAATTCTACAT 121812 CU137640.12 1301 ACTTAAAAAATATTTTTTGCAAATCACTGCTCTCCACTGCATAGCTTCAC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121813 ACTTAAAAAATATTTTTTGCAAATCACTGCTCTCCACTGCATAGCTTCAC 121862 CU137640.12 1351 ATACATTTTTCACCATATAGCTGTATTTTATCTCTCTTACAACAGATATG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121863 ATACATTTTTCACCATATAGCTGTATTTTATCTCTCTTACAACAGATATG 121912 CU137640.12 1401 AAATCTGTGTTTTAAGTCTCAATTTCACAAAATAAAAGAAATTTTAGAAA 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121913 AAATCTGTGTTTTAAGTCTCAATTTCACAAAATAAAAGAAATTTTAGAAA 121962 CU137640.12 1451 GATGCATCCTGGGGGGGGGACCCACCATGTTGTGTGTATTTCCATTAGAA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 121963 GATGCATCCTGGGGGGGGGACCCACCATGTTGTGTGTATTTCCATTAGAA 122012 CU137640.12 1501 GTTGCAGCAAATTCCACAAATGACATTATTTCCATCTGCAGACTTCTAAC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122013 GTTGCAGCAAATTCCACAAATGACATTATTTCCATCTGCAGACTTCTAAC 122062 CU137640.12 1551 CCCATTGACTTCTGGTTTGTCGACTGTGCTACTTGAAGCAGACAATAATT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122063 CCCATTGACTTCTGGTTTGTCGACTGTGCTACTTGAAGCAGACAATAATT 122112 CU137640.12 1601 CAGACTTCTCGTTGTATGCAAATACCTGTCGACCAATTTCTTCTAAACCT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122113 CAGACTTCTCGTTGTATGCAAATACCTGTCGACCAATTTCTTCTAAACCT 122162 CU137640.12 1651 GATTCGAAGTAAAAGAAATTTTCTGAAAAGATAAGATCCCATATTCCCTC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122163 GATTCGAAGTAAAAGAAATTTTCTGAAAAGATAAGATCCCATATTCCCTC 122212 CU137640.12 1701 TTCACGAAAATTTTCAAGTGACATGGGAGAAGTAGAAAGAAGATTTTTAA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122213 TTCACGAAAATTTTCAAGTGACATGGGAGAAGTAGAAAGAAGATTTTTAA 122262 CU137640.12 1751 ATGCATTGAGAACTGTGTTCTGTAAAATGGTGACAAAGACCCTGCAGAAA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122263 ATGCATTGAGAACTGTGTTCTGTAAAATGGTGACAAAGACCCTGCAGAAA 122312 CU137640.12 1801 ATGGGAAGAAAAGCAACAGCAAAAATTAGTTCAGCATATGAAGTTTTTAC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122313 ATGGGAAGAAAAGCAACAGCAAAAATTAGTTCAGCATATGAAGTTTTTAC 122362 CU137640.12 1851 TTCATAACCATAGAAAGAGAGTAATTTGCAATAACTGTTTTTTATAGTTA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122363 TTCATAACCATAGAAAGAGAGTAATTTGCAATAACTGTTTTTTATAGTTA 122412 CU137640.12 1901 ATTAAGATTTTTAAGCAAACAGCACAAGTAAAGACAATGGAAACCATTTA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122413 ATTAAGATTTTTAAGCAAACAGCACAAGTAAAGACAATGGAAACCATTTA 122462 CU137640.12 1951 TATTATTCACCTTAAATAGCTTGGCAAATCATTCTGATTTGAGCAAGCTT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU075908.9 122463 TATTATTCACCTTAAATAGCTTGGCAAATCATTCTGATTTGAGCAAGCTT 122512
