<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU179677.2	1	GGAGGGAAGGAGGGACCCAGGAGGAAAAGTGGATGGGGGGGGAGTGGGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193669	GGAGGGAAGGAGGGACCCAGGAGGAAAAGTGGATGGGGGGGGAGTGGGAG	193718

CU179677.2	51	GGAGAGGGGAACCTGATCTGGTATTGGGTGAGGGAAAATGACTGAAGCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193719	GGAGAGGGGAACCTGATCTGGTATTGGGTGAGGGAAAATGACTGAAGCCC	193768

CU179677.2	101	CGAGGGCCAGCAGAAAGAATGGAAACAGGCAACCTCGGGAGGTAGGAGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193769	CGAGGGCCAGCAGAAAGAATGGAAACAGGCAACCTCGGGAGGTAGGAGAT	193818

CU179677.2	151	TGGGGGGCCCTCCAGAATGCACCAGAGACCTGGGAGGTGAGAGATTCTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193819	TGGGGGGCCCTCCAGAATGCACCAGAGACCTGGGAGGTGAGAGATTCTCA	193868

CU179677.2	201	GGACTCAAAGGACCTTAGATGAAATGCCAGGAGAGGGAACTTATAGAGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193869	GGACTCAAAGGACCTTAGATGAAATGCCAGGAGAGGGAACTTATAGAGCC	193918

CU179677.2	251	CACCTCCAGCAGGAAGACAGGGCATAAAATGAGGGAGGGGGCATCCCACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193919	CACCTCCAGCAGGAAGACAGGGCATAAAATGAGGGAGGGGGCATCCCACA	193968

CU179677.2	301	GTCACAACTCTGATCCATATTTGTTCCTGTCTGAAAGAATTACAGGAATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	193969	GTCACAACTCTGATCCATATTTGTTCCTGTCTGAAAGAATTACAGGAATG	194018

CU179677.2	351	GAAATGGAGAGGAGCTTGAGGAAAAGGAGGTCCAGTGACAGGCCCAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194019	GAAATGGAGAGGAGCTTGAGGAAAAGGAGGTCCAGTGACAGGCCCAAAAA	194068

CU179677.2	401	GGGATCCAGCTCAAGGGGAAGTCCCAAGGCTTGACACTATTACTGAGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194069	GGGATCCAGCTCAAGGGGAAGTCCCAAGGCTTGACACTATTACTGAGGCT	194118

CU179677.2	451	ATGGCGCCCTCACAAAAGGGACCTAGCATGACTGCCCTCCAGAAGACACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194119	ATGGCGCCCTCACAAAAGGGACCTAGCATGACTGCCCTCCAGAAGACACA	194168

CU179677.2	501	ACAAACAGCTGAAAGTGTCAGAGGCAGATAGTTGTACCCAACGAATGGAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194169	ACAAACAGCTGAAAGTGTCAGAGGCAGATAGTTGTACCCAACGAATGGAC	194218

CU179677.2	551	AGAAGCAACTGACCCCTGTTGTTGAATTAGAAGAAGCTGAGGAGGAAGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194219	AGAAGCAACTGACCCCTGTTGTTGAATTAGAAGAAGCTGAGGAGGAAGGC	194268

CU179677.2	601	GACCCTGTAGGAGGACCAGCAGTCTCAATTAATCTGGACCCACGAGATCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194269	GACCCTGTAGGAGGACCAGCAGTCTCAATTAATCTGGACCCACGAGATCT	194318

CU179677.2	651	CTCAAACACTGGACTACCAAACAGACAGCATACACCACCCACTGACACAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194319	CTCAAACACTGGACTACCAAACAGACAGCATACACCACCCACTGACACAC	194368

CU179677.2	701	ATGTACGTACACATAGAGGGCTGCCAGGTCTGTGTTCATTCAGAGATGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194369	ATGTACGTACACATAGAGGGCTGCCAGGTCTGTGTTCATTCAGAGATGAT	194418

CU179677.2	751	GCATCTAACCCTCAAGAGACTAAGGGCCCCAGGGAGTTTAGAGGTCAGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194419	GCATCTAACCCTCAAGAGACTAAGGGCCCCAGGGAGTTTAGAGGTCAGGT	194468

CU179677.2	801	GGGGTAGGGGGTGGGGACATCCACGTGGAGACAGGGAAATGGAGAGGAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194469	GGGGTAGGGGGTGGGGACATCCACGTGGAGACAGGGAAATGGAGAGGAGG	194518

CU179677.2	851	TATGGGATGTGGATCAGTAGGAGGGTGGAGGGGGGAAATAAAATATGGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194519	TATGGGATGTGGATCAGTAGGAGGGTGGAGGGGGGAAATAAAATATGGAG	194568

CU179677.2	901	TGTAAAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTTTTAAAAAAACAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194569	TGTAAAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTTTTAAAAAAACAG	194618

CU179677.2	951	AAAGAAGAAAATGAATGGCAAAGAAATGTGAGAGATGCAAACATGGAGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194619	AAAGAAGAAAATGAATGGCAAAGAAATGTGAGAGATGCAAACATGGAGCT	194668

CU179677.2	1001	GAGATGCAGCTCAGCAGCTGTTGCAGTGCACTTTCTGTTGCTGTGATAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194669	GAGATGCAGCTCAGCAGCTGTTGCAGTGCACTTTCTGTTGCTGTGATAAA	194718

CU179677.2	1051	TACCATGACCAAAAGCAACTTATGGGAGAGAGGGTTTATTTTGGCTCACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194719	TACCATGACCAAAAGCAACTTATGGGAGAGAGGGTTTATTTTGGCTCACC	194768

CU179677.2	1101	GTTCCAGAGGGATGAGAGTCCATCATCGCAGGAAGGCATAGCAACAAGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194769	GTTCCAGAGGGATGAGAGTCCATCATCGCAGGAAGGCATAGCAACAAGTG	194818

CU179677.2	1151	GAAGACATGGCGAGCTCACATCTTTAACCACGGACAGATCAGATCTTTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194819	GAAGACATGGCGAGCTCACATCTTTAACCACGGACAGATCAGATCTTTGA	194868

CU179677.2	1201	CTGTAAGCACAGCGAAAAGAGAGTAAGTTGGAAGCAGAGCAAGGCTATAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194869	CTGTAAGCACAGCGAAAAGAGAGTAAGTTGGAAGCAGAGCAAGGCTATAA	194918

CU179677.2	1251	ACCCTCAAAGCCTATCTGCACCCTCCAGCAAGGCTGCATCTTCTGAACTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194919	ACCCTCAAAGCCTATCTGCACCCTCCAGCAAGGCTGCATCTTCTGAACTT	194968

CU179677.2	1301	CCCCAATCAGCACCACCAACTGGGGACAAAGTGTTCAAATATCAGTGCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	194969	CCCCAATCAGCACCACCAACTGGGGACAAAGTGTTCAAATATCAGTGCCT	195018

CU179677.2	1351	ATAAAGGACACTTCTAATTGAAACTACTACAGCTAATCCAGCTAGCTAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195019	ATAAAGGACACTTCTAATTGAAACTACTACAGCTAATCCAGCTAGCTAGC	195068

CU179677.2	1401	CAGTGAGTCCCAGGGACAGCCCCACATCCATTTCTGCCTCTTCAGCACTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195069	CAGTGAGTCCCAGGGACAGCCCCACATCCATTTCTGCCTCTTCAGCACTG	195118

CU179677.2	1451	GGGTTATAAGCAGACACCAGCATGCCATGCTTTTTTTCTTTTTAATGTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195119	GGGTTATAAGCAGACACCAGCATGCCATGCTTTTTTTCTTTTTAATGTGG	195168

CU179677.2	1501	GTTATGGGGACTGAATTCAAGACTTCATGCTTTAAAAGCAAATACTACCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195169	GTTATGGGGACTGAATTCAAGACTTCATGCTTTAAAAGCAAATACTACCA	195218

CU179677.2	1551	ACTGGGCTTTCTCCCCAGCCCTAAACTGCTTACTCAAATACAACAGAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195219	ACTGGGCTTTCTCCCCAGCCCTAAACTGCTTACTCAAATACAACAGAAAT	195268

CU179677.2	1601	TTGTCTCTTGGGCTTCTGAAAGGTGAGAAGTTGAAGATCAATGTGTTTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195269	TTGTCTCTTGGGCTTCTGAAAGGTGAGAAGTTGAAGATCAATGTGTTTGA	195318

CU179677.2	1651	GAAAGACCTGTTCCTCTTAGATGGTACCTCCCTGCTGTACCCTAGCAAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195319	GAAAGACCTGTTCCTCTTAGATGGTACCTCCCTGCTGTACCCTAGCAAGG	195368

CU179677.2	1701	AGGGAAGAGTGGATCCATCCCTCACTCCTTCTATAAGAACATGGAGCCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195369	AGGGAAGAGTGGATCCATCCCTCACTCCTTCTATAAGAACATGGAGCCCA	195418

CU179677.2	1751	TTTGTCAGGACTCTGCCCTCCTAAATGAGTCACCTCCCCAAAGCCCATCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195419	TTTGTCAGGACTCTGCCCTCCTAAATGAGTCACCTCCCCAAAGCCCATCT	195468

CU179677.2	1801	TGATACCACTGTGTTTGTGTTCAGACACTTCAACCTCAGTGATACTGCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195469	TGATACCACTGTGTTTGTGTTCAGACACTTCAACCTCAGTGATACTGCTG	195518

CU179677.2	1851	TGTCTCTGAGAAAGGAATACACTCGCCAACAAATTAAAGCACGGCAGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195519	TGTCTCTGAGAAAGGAATACACTCGCCAACAAATTAAAGCACGGCAGAAG	195568

CU179677.2	1901	GCTACATCCATGTGACTCACAAATCTATGTCTCCATCACTCTGAAGCAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195569	GCTACATCCATGTGACTCACAAATCTATGTCTCCATCACTCTGAAGCAGC	195618

CU179677.2	1951	TGACTTGAAGATAAGGTACTGAGTGGCTAATAAGAGCTGACGCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU074422.1	195619	TGACTTGAAGATAAGGTACTGAGTGGCTAATAAGAGCTGACGCAGAATTC	195668

Overview

Query
CU179677.2 - 65984 bps
Hit
CU074422.1 - 195668 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link