<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU019601.8	1	AAGCTTGCTTAATTGGTTTGTTCTAGTTTTTCCAATAACATTGCTGACAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	15963	AAGCTTGCTTAATTGGTTTGTTCTAGTTTTTCCAATAACATTGCTGACAA	16012

CU019601.8	51	ATGCATGCATTTTCATGGAATCTGTTGTTTGAATGGCACAGGGGTGATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16013	ATGCATGCATTTTCATGGAATCTGTTGTTTGAATGGCACAGGGGTGATAA	16062

CU019601.8	101	CGATGAGAGGGAATATCTGGTGAAGTGGAAAGAGCTTCCATATGATGAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16063	CGATGAGAGGGAATATCTGGTGAAGTGGAAAGAGCTTCCATATGATGAAT	16112

CU019601.8	151	GTTATTGGGAATCTGAGTCTGATATTTCTGCATTTCAGCCGGAAATAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16113	GTTATTGGGAATCTGAGTCTGATATTTCTGCATTTCAGCCGGAAATAGAA	16162

CU019601.8	201	AGATTTAATAGATTTCGTTCTAGATCGAGCAAACTTGCTTCCATCAAGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16163	AGATTTAATAGATTTCGTTCTAGATCGAGCAAACTTGCTTCCATCAAGCA	16212

CU019601.8	251	ACAAAGCCGTGTTAATGATGACAATGAATTGAAGAAACAGCAGAAAGAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16213	ACAAAGCCGTGTTAATGATGACAATGAATTGAAGAAACAGCAGAAAGAAT	16262

CU019601.8	301	TTCATCAGTATGAACATAGCCCTGAGTTTCTTTCAGGTGGTATTTTTTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16263	TTCATCAGTATGAACATAGCCCTGAGTTTCTTTCAGGTGGTATTTTTTGT	16312

CU019601.8	351	AACTGCCCTATTCTTCGGGCAGCATTATGCTTTATGCTTTTATTTTTTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16313	AACTGCCCTATTCTTCGGGCAGCATTATGCTTTATGCTTTTATTTTTTAA	16362

CU019601.8	401	GATCCGGATGATCTCAATTGGCTGATATAAAATTTCATGTTGGTGAAGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16363	GATCCGGATGATCTCAATTGGCTGATATAAAATTTCATGTTGGTGAAGGT	16412

CU019601.8	451	TCTCTACACCCATATCAGCTTGAAGGCTTGAACTTCTTACGATTCTCTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16413	TCTCTACACCCATATCAGCTTGAAGGCTTGAACTTCTTACGATTCTCTTG	16462

CU019601.8	501	GTCCAAGCAAACACATGTTATACTTGCTGATGAAATGGGACTTGGTACTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16463	GTCCAAGCAAACACATGTTATACTTGCTGATGAAATGGGACTTGGTACTT	16512

CU019601.8	551	TCTCTCTCTTATTCTCTACCCATATATTCATGTTTTTGGGAAGATAAAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16513	TCTCTCTCTTATTCTCTACCCATATATTCATGTTTTTGGGAAGATAAAAG	16562

CU019601.8	601	TTTAACGGGGATGGTAGGATACTCTATTCCCAAGGAAAGGGCATATCACA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16563	TTTAACGGGGATGGTAGGATACTCTATTCCCAAGGAAAGGGCATATCACA	16612

CU019601.8	651	ATCACATGCAACAATGTGGGCTTCTATTGTTTCTTAATAACTATTCAATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16613	ATCACATGCAACAATGTGGGCTTCTATTGTTTCTTAATAACTATTCAATC	16662

CU019601.8	701	AAAGTATCGTTGCAAGCAGAACCAACTGCATTGAGTTAATGCTTTATACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16663	AAAGTATCGTTGCAAGCAGAACCAACTGCATTGAGTTAATGCTTTATACC	16712

CU019601.8	751	AAATTTGTCATAATTGGACCGAAGGTTGAACCGGTGAGACCTCCGGGTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16713	AAATTTGTCATAATTGGACCGAAGGTTGAACCGGTGAGACCTCCGGGTCA	16762

CU019601.8	801	TGGTTCAATCGGTTCAACCAGTTGAACCAGATTTGTAATAAATAAAAATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16763	TGGTTCAATCGGTTCAACCAGTTGAACCAGATTTGTAATAAATAAAAATA	16812

CU019601.8	851	CACAAAAAAGCAAAAACAAACACTTGTTGAATCAACCGCAATTGAACCGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16813	CACAAAAAAGCAAAAACAAACACTTGTTGAATCAACCGCAATTGAACCGT	16862

CU019601.8	901	GATTCAGTGTTCAACCCAGTTCCACCCGGTTCTAGGGACTAAGAACCAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16863	GATTCAGTGTTCAACCCAGTTCCACCCGGTTCTAGGGACTAAGAACCAGT	16912

CU019601.8	951	TACTAATTTGTAGTTTCTAGAGAATTACAGTATTCCACCATGATGAATTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16913	TACTAATTTGTAGTTTCTAGAGAATTACAGTATTCCACCATGATGAATTA	16962

CU019601.8	1001	GCTTTCCACCTGCAGGAAAAACTATACAAAGTATTGCTTTCTTAGCATCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	16963	GCTTTCCACCTGCAGGAAAAACTATACAAAGTATTGCTTTCTTAGCATCC	17012

CU019601.8	1051	CTTTTTGAAGAGGGTGTCTCTGCACATCCACATCTGGTGGTTGCTCCACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17013	CTTTTTGAAGAGGGTGTCTCTGCACATCCACATCTGGTGGTTGCTCCACT	17062

CU019601.8	1101	TTCAACACTGCGAAACTGGGAACGTGAATTTGCAACATGGGCCCCTCAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17063	TTCAACACTGCGAAACTGGGAACGTGAATTTGCAACATGGGCCCCTCAAA	17112

CU019601.8	1151	TGAATGTTGTATGTATATGGGGATTGTCAGTAATATTTCATTTTGATATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17113	TGAATGTTGTATGTATATGGGGATTGTCAGTAATATTTCATTTTGATATA	17162

CU019601.8	1201	TACTCTTTTAATTGTATGTTTGTTATTGCAGATTATGTATGTTGGATCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17163	TACTCTTTTAATTGTATGTTTGTTATTGCAGATTATGTATGTTGGATCTG	17212

CU019601.8	1251	CCCAAGCTCGTAGTGTTATCAGAGAATATGAATTTTACTTTCCCAAGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17213	CCCAAGCTCGTAGTGTTATCAGAGAATATGAATTTTACTTTCCCAAGAAA	17262

CU019601.8	1301	CTGAAGAAGAACAAGAAAAAGAAATCTTTAGTTAGTGAAAGTAAGCATGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17263	CTGAAGAAGAACAAGAAAAAGAAATCTTTAGTTAGTGAAAGTAAGCATGA	17312

CU019601.8	1351	CAGGATTAAGTTTGATGTCCTTTTGACATCATATGAGATGATCAACTTAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17313	CAGGATTAAGTTTGATGTCCTTTTGACATCATATGAGATGATCAACTTAG	17362

CU019601.8	1401	ACACAACATCATTAAAACCTATAAAATGGGAGTGCATGGTAAGATATGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17363	ACACAACATCATTAAAACCTATAAAATGGGAGTGCATGGTAAGATATGCT	17412

CU019601.8	1451	TACTGTTACATTACGAGACAAGAAATATTATTTTTCCAGTTACCTCTATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17413	TACTGTTACATTACGAGACAAGAAATATTATTTTTCCAGTTACCTCTATA	17462

CU019601.8	1501	ACTTCTATTCACATTTTTGGTTTCTCCATTATGCTGATAGTCTACCTACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17463	ACTTCTATTCACATTTTTGGTTTCTCCATTATGCTGATAGTCTACCTACA	17512

CU019601.8	1551	TGTATATGTAGATAGTTGATGAAGGTCACCGCCTCAAAAATAAGGATTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17513	TGTATATGTAGATAGTTGATGAAGGTCACCGCCTCAAAAATAAGGATTCA	17562

CU019601.8	1601	AAATTATTTTCTTCATTGAAGCAATATTCTACCAGACATCGTGTGCTCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17563	AAATTATTTTCTTCATTGAAGCAATATTCTACCAGACATCGTGTGCTCTT	17612

CU019601.8	1651	GACTGGAACTCCTCTTCAGGTCCAATTTCAATCATGTCATACTGGTTTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17613	GACTGGAACTCCTCTTCAGGTCCAATTTCAATCATGTCATACTGGTTTAG	17662

CU019601.8	1701	TGTGAACTTATGTCCTAATTTTCTATTATTGGTTAATTGAACTGTGTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17663	TGTGAACTTATGTCCTAATTTTCTATTATTGGTTAATTGAACTGTGTTTT	17712

CU019601.8	1751	TGTTTTGTTACTTTTGCTTGCTGGCTGGCTGTTGTCTCTTGACAGATTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17713	TGTTTTGTTACTTTTGCTTGCTGGCTGGCTGTTGTCTCTTGACAGATTGT	17762

CU019601.8	1801	GTTGTGCACACTAACTAATACTAAGAGTTCCATTTTCTAAATTTGGGTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17763	GTTGTGCACACTAACTAATACTAAGAGTTCCATTTTCTAAATTTGGGTCA	17812

CU019601.8	1851	TACAATTTTTATTGCATTTCTGATTTTTGAATTGGCCATAAATTCCTTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17813	TACAATTTTTATTGCATTTCTGATTTTTGAATTGGCCATAAATTCCTTAA	17862

CU019601.8	1901	TAAAACATAAAGGAAGTTGCTCTTCCCCACCCCCTTGGGAGTAAAAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17863	TAAAACATAAAGGAAGTTGCTCTTCCCCACCCCCTTGGGAGTAAAAAAAA	17912

CU019601.8	1951	CACGTTTGGGGGGTGGGGTGAGTCGCGTCCAAACATAAAAGCATATATTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062662.5	17913	CACGTTTGGGGGGTGGGGTGAGTCGCGTCCAAACATAAAAGCATATATTT	17962

Overview

Query
CU019601.8 - 95742 bps
Hit
CU062662.5 - 17962 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001943200012000115963179621
Short-link