<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU075908.9	1	CAATGCTTTGGTTGTGATTTTTTCTATGACTCTTGTTCTATAGATATGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49065	CAATGCTTTGGTTGTGATTTTTTCTATGACTCTTGTTCTATAGATATGAT	49114

CU075908.9	51	CAAAGTTGGGAAAGAACACAATTTTATAAACGAGTAGGTTCCTACGTTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49115	CAAAGTTGGGAAAGAACACAATTTTATAAACGAGTAGGTTCCTACGTTGT	49164

CU075908.9	101	TCAGTAGTACGACAGATTTAGATGAGTTACTGTAGGTAAAAATATAATTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49165	TCAGTAGTACGACAGATTTAGATGAGTTACTGTAGGTAAAAATATAATTG	49214

CU075908.9	151	TAGGTACCATTTGAACTATGAAAGATGACAAGATAACCACTTTATTAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49215	TAGGTACCATTTGAACTATGAAAGATGACAAGATAACCACTTTATTAAAT	49264

CU075908.9	201	AGGTGGAAAAGCAACAAGTTACCAGTGAAAATTCTGCTAATGATTTCAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49265	AGGTGGAAAAGCAACAAGTTACCAGTGAAAATTCTGCTAATGATTTCAGA	49314

CU075908.9	251	TAGTTCTGTTGTTTAAGACGTGTCATATATCTAATTACTACTTTATACAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49315	TAGTTCTGTTGTTTAAGACGTGTCATATATCTAATTACTACTTTATACAT	49364

CU075908.9	301	GCTGACATGATTGTATATTTTCTCTGCTACTCACTGTTTTTTCTACCTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49365	GCTGACATGATTGTATATTTTCTCTGCTACTCACTGTTTTTTCTACCTTT	49414

CU075908.9	351	TTTTGGGATTTATCAACATTTTATGCAGTGTTTCCGTTTCTCTGTCTTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49415	TTTTGGGATTTATCAACATTTTATGCAGTGTTTCCGTTTCTCTGTCTTAT	49464

CU075908.9	401	TTATCGTACATTGATTTACTTCAACTAGGCAACTAGCTTTCAACCTCAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49465	TTATCGTACATTGATTTACTTCAACTAGGCAACTAGCTTTCAACCTCAAA	49514

CU075908.9	451	TATTTCAAGATGTCTATGTTGGGAGATGGAGAAAGGTTCGCATGCTACGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49515	TATTTCAAGATGTCTATGTTGGGAGATGGAGAAAGGTTCGCATGCTACGT	49564

CU075908.9	501	TCGGCTAGTGGTACTACTCCACCTATAAAGACATATTCAGATTTGCCAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49565	TCGGCTAGTGGTACTACTCCACCTATAAAGACATATTCAGATTTGCCAAT	49614

CU075908.9	551	ACATTTCCAGAAAGGCGAGGTGTCATTTGGGGTGGGTTATGAACCAGCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49615	ACATTTCCAGAAAGGCGAGGTGTCATTTGGGGTGGGTTATGAACCAGCTT	49664

CU075908.9	601	TTGCTGATGTTAGTTACGCTTTCACCGTAGCACTTCGGAGGGCTAATCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49665	TTGCTGATGTTAGTTACGCTTTCACCGTAGCACTTCGGAGGGCTAATCTA	49714

CU075908.9	651	AGTATTAGGAATCCTGGTCCACTTATTCATCCACCAAAGAAGGAGCGGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49715	AGTATTAGGAATCCTGGTCCACTTATTCATCCACCAAAGAAGGAGCGGAG	49764

CU075908.9	701	TTTACCATGGTGGGACGACATGAGAAATTACATCCATGGAAAAGTTTCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49765	TTTACCATGGTGGGACGACATGAGAAATTACATCCATGGAAAAGTTTCCT	49814

CU075908.9	751	TACTGTTCTCTGAATCAAGATGGAATATTTTGGCAACTACAGATCCATAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49815	TACTGTTCTCTGAATCAAGATGGAATATTTTGGCAACTACAGATCCATAT	49864

CU075908.9	801	GAAAAGGTTGACAAACTTCAAATTGTAAGCAGCTGTATGGAACTTCACCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49865	GAAAAGGTTGACAAACTTCAAATTGTAAGCAGCTGTATGGAACTTCACCA	49914

CU075908.9	851	GTCTGACGGCTGTGTTTCTGTTTTTGCCGAAGATTTTAAGTTTTTGTTAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49915	GTCTGACGGCTGTGTTTCTGTTTTTGCCGAAGATTTTAAGTTTTTGTTAA	49964

CU075908.9	901	GTAGTTTGGAAAGTTTGGCAAACAGATGTGGTTTCAAAATTCCAACAGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	49965	GTAGTTTGGAAAGTTTGGCAAACAGATGTGGTTTCAAAATTCCAACAGGA	50014

CU075908.9	951	GTCTCTGGGGCATTTTTGGAAGCCCCTATCTTTACTCTCGAAGTTACAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50015	GTCTCTGGGGCATTTTTGGAAGCCCCTATCTTTACTCTCGAAGTTACAAT	50064

CU075908.9	1001	GGACTGGGAATGTGGATCTGGAGATCCCATGGATCATTATTTATTTGCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50065	GGACTGGGAATGTGGATCTGGAGATCCCATGGATCATTATTTATTTGCAC	50114

CU075908.9	1051	TACCAGTTGAGGGAAAACCTCGCGACAAAGTATTTGATCCCTTTAGATCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50115	TACCAGTTGAGGGAAAACCTCGCGACAAAGTATTTGATCCCTTTAGATCG	50164

CU075908.9	1101	ACTTCTCTTTCTCTCCGATGGAACTTCTCTCTTAGACCCCTTCCTCTTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50165	ACTTCTCTTTCTCTCCGATGGAACTTCTCTCTTAGACCCCTTCCTCTTTC	50214

CU075908.9	1151	ATTAAAAAAACATTCCTCACTGTCCATTGCTAGGGATTATACTGAACAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50215	ATTAAAAAAACATTCCTCACTGTCCATTGCTAGGGATTATACTGAACAAG	50264

CU075908.9	1201	GATCTACTGTATTTGATCCTCCTCATGTATCTCAAAATTTTTCACGCGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50265	GATCTACTGTATTTGATCCTCCTCATGTATCTCAAAATTTTTCACGCGTG	50314

CU075908.9	1251	TCCCCTACATTTAACTTTGGAGCTCATGATCTAGCGTGGATATTAAGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50315	TCCCCTACATTTAACTTTGGAGCTCATGATCTAGCGTGGATATTAAGATT	50364

CU075908.9	1301	CTGGAGCTTGAACTACAATCCTCCACATAAGCTGCGGAGCTTCTCCCGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50365	CTGGAGCTTGAACTACAATCCTCCACATAAGCTGCGGAGCTTCTCCCGTT	50414

CU075908.9	1351	GGCCGCGTTTTGGAGTTTCGAGAGCTGCCAGGTCAGGCAATCTTTCACTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50415	GGCCGCGTTTTGGAGTTTCGAGAGCTGCCAGGTCAGGCAATCTTTCACTA	50464

CU075908.9	1401	GATAAAGTGATGACTGAATTCATGCTTCGTCTAGATGCCACCCCAGCCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50465	GATAAAGTGATGACTGAATTCATGCTTCGTCTAGATGCCACCCCAGCCTG	50514

CU075908.9	1451	TATAAAGAACATGCCTTTAGATGATGATGATCCAGCCAAAGGACTGACTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50515	TATAAAGAACATGCCTTTAGATGATGATGATCCAGCCAAAGGACTGACTT	50564

CU075908.9	1501	TCACAATGAGAAAACTAAAGTATGAACTGTGTTATAGTAGGGGCAAGCAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50565	TCACAATGAGAAAACTAAAGTATGAACTGTGTTATAGTAGGGGCAAGCAA	50614

CU075908.9	1551	AAATATACTTTTGAAAGCAAGCGTGATATTCTTGATCTTGTTTACCAGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50615	AAATATACTTTTGAAAGCAAGCGTGATATTCTTGATCTTGTTTACCAGGG	50664

CU075908.9	1601	ACTTGACCTTCATATGCTCAAAGCTTTCCTAAATAAGGAAGCTTGTGCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50665	ACTTGACCTTCATATGCTCAAAGCTTTCCTAAATAAGGAAGCTTGTGCTA	50714

CU075908.9	1651	GTGTTGCTAAAGCAGTTAACATGATAATGAAAAGTTCACAATCTGTATCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50715	GTGTTGCTAAAGCAGTTAACATGATAATGAAAAGTTCACAATCTGTATCC	50764

CU075908.9	1701	ACAGACAAAATCTCAACCGACAAAGGTTACATGACAGAGAAAAATCGTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50765	ACAGACAAAATCTCAACCGACAAAGGTTACATGACAGAGAAAAATCGTGA	50814

CU075908.9	1751	TGATGGATTTTTATTGTCCTCCGATTACTTCACTATCAGAAGGCAATCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50815	TGATGGATTTTTATTGTCCTCCGATTACTTCACTATCAGAAGGCAATCCT	50864

CU075908.9	1801	CAAAGGCTGATCCTGCTAGGTTACTAGCATGGCAAGAAGCAGGAAGAAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50865	CAAAGGCTGATCCTGCTAGGTTACTAGCATGGCAAGAAGCAGGAAGAAGA	50914

CU075908.9	1851	AGAAAAGTTGAGATGACATATGTACGGTCTGAGTTTGACAATGGGAGTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50915	AGAAAAGTTGAGATGACATATGTACGGTCTGAGTTTGACAATGGGAGTGA	50964

CU075908.9	1901	AACTGATGAACATATGCGGTCTGACCCAAGTGATGATGATGGTTACAATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	50965	AACTGATGAACATATGCGGTCTGACCCAAGTGATGATGATGGTTACAATG	51014

CU075908.9	1951	TGGTAATAGCTGACGGTTGTCAACGTGTGTTTGTCTATGGTCTTAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062660.8	51015	TGGTAATAGCTGACGGTTGTCAACGTGTGTTTGTCTATGGTCTTAAGCTT	51064

Overview

Query
CU075908.9 - 122512 bps
Hit
CU062660.8 - 51064 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001962200012000149065510641
Short-link