<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU326379.2	1	CTAAAAATGATTAGAATGTCTAAAATAAGTTATAAAACCTAAATTATGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87293	CTAAAAATGATTAGAATGTCTAAAATAAGTTATAAAACCTAAATTATGAG	87342

CU326379.2	51	ATATTATGAAGAGAATCTCATATTGAGATTAAAGGAAAAGGAGTGACAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87343	ATATTATGAAGAGAATCTCATATTGAGATTAAAGGAAAAGGAGTGACAAA	87392

CU326379.2	101	GAAATTTATATATAAAAGGTATTCTATTTTCTTCAATTTCAACTTAGATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87393	GAAATTTATATATAAAAGGTATTCTATTTTCTTCAATTTCAACTTAGATT	87442

CU326379.2	151	TTGCATTGATTATTGAAATTATTAAAACTATCCTGACTTTCCCCGTCGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87443	TTGCATTGATTATTGAAATTATTAAAACTATCCTGACTTTCCCCGTCGAT	87492

CU326379.2	201	TTTGCTCAAAGCACCCTAAATCGGTTGACCAAATTGGACACAGATCCCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87493	TTTGCTCAAAGCACCCTAAATCGGTTGACCAAATTGGACACAGATCCCAC	87542

CU326379.2	251	ACCCACACTCATGTCGTGTTGACATGGGTGCGGCACCATAAGTGAAGAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87543	ACCCACACTCATGTCGTGTTGACATGGGTGCGGCACCATAAGTGAAGAGT	87592

CU326379.2	301	CCAAGCAACTTAGTTAGGAGTGTAATTGGAGTTAATTAATGACCACTAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87593	CCAAGCAACTTAGTTAGGAGTGTAATTGGAGTTAATTAATGACCACTAAA	87642

CU326379.2	351	TATAGTTATATAGCATTGTTTACCACTAAATATGGTTAAATGAAGTATTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87643	TATAGTTATATAGCATTGTTTACCACTAAATATGGTTAAATGAAGTATTT	87692

CU326379.2	401	CACATCTAATTAGTCAATTGATCATTCCATTTAGGACAAATACACTTAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87693	CACATCTAATTAGTCAATTGATCATTCCATTTAGGACAAATACACTTAGT	87742

CU326379.2	451	TATCGCGATGATTGCTTATGCTTGCTATTGGTGAAGGGTGAACTTTTCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87743	TATCGCGATGATTGCTTATGCTTGCTATTGGTGAAGGGTGAACTTTTCAT	87792

CU326379.2	501	TGCTGAAAACTCAATTTTGTATGATATGTGGGGAATCTGTATTATTCCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87793	TGCTGAAAACTCAATTTTGTATGATATGTGGGGAATCTGTATTATTCCTT	87842

CU326379.2	551	GATATTGGTAGTGTGTCTTTTTTTGCGTTTAGAGACTTTAAGTTTTGATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87843	GATATTGGTAGTGTGTCTTTTTTTGCGTTTAGAGACTTTAAGTTTTGATT	87892

CU326379.2	601	GACTTTCTAAAAGAAAAAAAAAAGTTGGATTGAGTACAGTGAATTAGAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87893	GACTTTCTAAAAGAAAAAAAAAAGTTGGATTGAGTACAGTGAATTAGAAC	87942

CU326379.2	651	ATGCAATGGAATAAAGCAGATTCAAAAATTGTTTGGTATCTGATGATGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87943	ATGCAATGGAATAAAGCAGATTCAAAAATTGTTTGGTATCTGATGATGTG	87992

CU326379.2	701	CTGGATTAATGTGGGAGGTAATGTTAGACAGAAGAAGTGGAAACCCCAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	87993	CTGGATTAATGTGGGAGGTAATGTTAGACAGAAGAAGTGGAAACCCCAGC	88042

CU326379.2	751	ATGCAATGCAAGGTGTTTCGAAGATTGAAGCAGTCCCACCCAGAGAATGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88043	ATGCAATGCAAGGTGTTTCGAAGATTGAAGCAGTCCCACCCAGAGAATGA	88092

CU326379.2	801	AAATGAATTGAATTTTGTTACTTTTAACTTTAACGTGAAGAAAATCATGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88093	AAATGAATTGAATTTTGTTACTTTTAACTTTAACGTGAAGAAAATCATGG	88142

CU326379.2	851	AGAGGAAGCTAAAGCTCTTATTAGAATTATTAGGATCCTTGTAAGAGAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88143	AGAGGAAGCTAAAGCTCTTATTAGAATTATTAGGATCCTTGTAAGAGAAC	88192

CU326379.2	901	AAGGTCACTCTTCTACTTTCGTTTGTAATTGTAAATATGACTGCAACGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88193	AAGGTCACTCTTCTACTTTCGTTTGTAATTGTAAATATGACTGCAACGCA	88242

CU326379.2	951	GCTTTTGTGCTGATGATTAGTGTACTGTTATCTTTCTCAAAAAAGAAATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88243	GCTTTTGTGCTGATGATTAGTGTACTGTTATCTTTCTCAAAAAAGAAATT	88292

CU326379.2	1001	GTTTGGTGTGGTAGCAGAATCTTCTTTGACTATTTAATATGCAACTTGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88293	GTTTGGTGTGGTAGCAGAATCTTCTTTGACTATTTAATATGCAACTTGTC	88342

CU326379.2	1051	CAAGGATATTCTCATACTCTGCCTCGAGCCAAACTATCTGCAGCCCCCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88343	CAAGGATATTCTCATACTCTGCCTCGAGCCAAACTATCTGCAGCCCCCCC	88392

CU326379.2	1101	AGTCAATGCTCCGACATGTGGTTGTCACTATAATCACCATGAAGGTTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88393	AGTCAATGCTCCGACATGTGGTTGTCACTATAATCACCATGAAGGTTTCA	88442

CU326379.2	1151	CGAATTTCATGCATCCTAATGAGGAGGTATAGTGCATGCTTCCCTGCAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88443	CGAATTTCATGCATCCTAATGAGGAGGTATAGTGCATGCTTCCCTGCAAG	88492

CU326379.2	1201	TTGTTGACACTGTAATTTTTCAGTTAATTGCTCAAGTAAACATGTTTTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88493	TTGTTGACACTGTAATTTTTCAGTTAATTGCTCAAGTAAACATGTTTTAT	88542

CU326379.2	1251	CTATTTCACAAGGAAAAAGAGTTTCAAGTATGTTATTACACTAGTTGTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88543	CTATTTCACAAGGAAAAAGAGTTTCAAGTATGTTATTACACTAGTTGTTG	88592

CU326379.2	1301	TGGTATGTATGTATATGTGAACTTAGAAAGGCAGGAGTAGGTACTTCTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88593	TGGTATGTATGTATATGTGAACTTAGAAAGGCAGGAGTAGGTACTTCTAA	88642

CU326379.2	1351	TGATTATGACACTATGTTGTGAAGAAAAGTGACCTTTATTTCCCACAGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88643	TGATTATGACACTATGTTGTGAAGAAAAGTGACCTTTATTTCCCACAGTA	88692

CU326379.2	1401	CTTTAATGGAAAATATGTGGATTGTTTTAACCCTTTTGATGTTTTGACTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88693	CTTTAATGGAAAATATGTGGATTGTTTTAACCCTTTTGATGTTTTGACTC	88742

CU326379.2	1451	GATGCTGCACTATCTCATGTCAAGGCTTGGTCTTATGCAGAGAATTAAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88743	GATGCTGCACTATCTCATGTCAAGGCTTGGTCTTATGCAGAGAATTAAAC	88792

CU326379.2	1501	AGTTGCTCCTTGTCTTGATAGCGAAGCATGACAAGGTGATGCACTCGTTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88793	AGTTGCTCCTTGTCTTGATAGCGAAGCATGACAAGGTGATGCACTCGTTA	88842

CU326379.2	1551	CTTCTATTAATCATGTTGAGAATCTTGAATTTTTGGTGTGAAGGGGATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88843	CTTCTATTAATCATGTTGAGAATCTTGAATTTTTGGTGTGAAGGGGATTT	88892

CU326379.2	1601	TCATAAATCAGGTGTGAGTTGTGACCAACCAATTTGAACTTCATCTAGTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88893	TCATAAATCAGGTGTGAGTTGTGACCAACCAATTTGAACTTCATCTAGTC	88942

CU326379.2	1651	TACTGTTGAATATAGATATTGCCCACTCCTCCTAGTGCTGTTTTTCTCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88943	TACTGTTGAATATAGATATTGCCCACTCCTCCTAGTGCTGTTTTTCTCAT	88992

CU326379.2	1701	CGTTTTGTTGACAGTGGAGCATGAAGGTGACAATTCATTTATTTATTCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	88993	CGTTTTGTTGACAGTGGAGCATGAAGGTGACAATTCATTTATTTATTCTT	89042

CU326379.2	1751	CACCCTGGAAATCACGAGCCTCTGTTATCAAGTTGGATTCATAATTTGGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	89043	CACCCTGGAAATCACGAGCCTCTGTTATCAAGTTGGATTCATAATTTGGA	89092

CU326379.2	1801	TTTTGGCCGAATATTCTTGGACCTCTTCTAGTTCACTTAAAAATATTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	89093	TTTTGGCCGAATATTCTTGGACCTCTTCTAGTTCACTTAAAAATATTTTT	89142

CU326379.2	1851	TTTTATCGTTCACTTTGATTGCACACCCAATCGAGCTCCAGCTGTAGTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	89143	TTTTATCGTTCACTTTGATTGCACACCCAATCGAGCTCCAGCTGTAGTAA	89192

CU326379.2	1901	ACTTAAGTTATTGATTCTTTCGGCACGTGCCTGGCTAGGATGGCACTAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	89193	ACTTAAGTTATTGATTCTTTCGGCACGTGCCTGGCTAGGATGGCACTAGT	89242

CU326379.2	1951	GATAACTCCGTTAATGTGAAGAGCTTGAATGATGAATGATCAACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062498.5	89243	GATAACTCCGTTAATGTGAAGAGCTTGAATGATGAATGATCAACAAGCTT	89292

Overview

Query
CU326379.2 - 51696 bps
Hit
CU062498.5 - 89292 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001932200012000187293892921
Short-link