<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU019605.7	1	AACCATAATTATTGGTCACTTACCAGCAGAGATTCCAACATGTGAACCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128503	AACCATAATTATTGGTCACTTACCAGCAGAGATTCCAACATGTGAACCCC	128552

CU019605.7	51	CAACAATGCAGTCAGTTATCAGAAGCAGACAGTTGACAAGTGCCAACCAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128553	CAACAATGCAGTCAGTTATCAGAAGCAGACAGTTGACAAGTGCCAACCAT	128602

CU019605.7	101	GAAGACAAAAATGGAATAAATTTTTACTATAAAAAGTAACAGTAACATCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128603	GAAGACAAAAATGGAATAAATTTTTACTATAAAAAGTAACAGTAACATCT	128652

CU019605.7	151	ATTATAAAAAATTTGGAACATAATGTAGATCCCTCTTCCAAAATAAGAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128653	ATTATAAAAAATTTGGAACATAATGTAGATCCCTCTTCCAAAATAAGAGT	128702

CU019605.7	201	TGTCCTCCTCTCTCCCTCTCAAACAATTCCTTAACACAAAAGGCAGAGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128703	TGTCCTCCTCTCTCCCTCTCAAACAATTCCTTAACACAAAAGGCAGAGAT	128752

CU019605.7	251	ATGTCAACATGATCTATAAATAATTGGGAATTCCCTCAAGGTATAAAAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128753	ATGTCAACATGATCTATAAATAATTGGGAATTCCCTCAAGGTATAAAAGA	128802

CU019605.7	301	AAATGAATCAGCTCGCCTAAAGGGCGCATGATTTTCCTATGCACTTCACC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128803	AAATGAATCAGCTCGCCTAAAGGGCGCATGATTTTCCTATGCACTTCACC	128852

CU019605.7	351	AAAAGTTTAATCACTTCCTTTCTTGTAAGCCTATTTTTATACCTTCTCAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128853	AAAAGTTTAATCACTTCCTTTCTTGTAAGCCTATTTTTATACCTTCTCAA	128902

CU019605.7	401	CTGATTCAGAGGACACAGGCACCGCAGCATAATCTTGTGTTTTACTGGTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128903	CTGATTCAGAGGACACAGGCACCGCAGCATAATCTTGTGTTTTACTGGTA	128952

CU019605.7	451	GGAAGGGAAAAGCTACGGCGCTCCTTACCCCCTGGCTTAGAAGAAGCATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	128953	GGAAGGGAAAAGCTACGGCGCTCCTTACCCCCTGGCTTAGAAGAAGCATT	129002

CU019605.7	501	GCCATACCAAATCATTCCCGCAATTGCGATTGCCATGCCTAGAACAACAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129003	GCCATACCAAATCATTCCCGCAATTGCGATTGCCATGCCTAGAACAACAT	129052

CU019605.7	551	GTAGATTGAGGCCCTCTTTTCCAAAGAAAATGAACCCCATGAATAGGACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129053	GTAGATTGAGGCCCTCTTTTCCAAAGAAAATGAACCCCATGAATAGGACC	129102

CU019605.7	601	AGAATAGTCTTCATATGGCCAAGGACTTGGAATGATACGGCCGTAAACCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129103	AGAATAGTCTTCATATGGCCAAGGACTTGGAATGATACGGCCGTAAACCT	129152

CU019605.7	651	ACCAATGCAGATGAACTGGCTGAGATTTGTTCCTACTGCGATAGTGCAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129153	ACCAATGCAGATGAACTGGCTGAGATTTGTTCCTACTGCGATAGTGCAAG	129202

CU019605.7	701	ACAGAATGATGAACAACTGCAGACACCAGGAGCAGATCAGCTTAATAATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129203	ACAGAATGATGAACAACTGCAGACACCAGGAGCAGATCAGCTTAATAATA	129252

CU019605.7	751	GTTTTCCAATAGTCAAAACAGTAATCATGGTTGTTTTTATGAGTGAAGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129253	GTTTTCCAATAGTCAAAACAGTAATCATGGTTGTTTTTATGAGTGAAGGT	129302

CU019605.7	801	ACAATGCACAGTTTTAAAGTTGACATAAATGGGTATGCGTATTTGGATCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129303	ACAATGCACAGTTTTAAAGTTGACATAAATGGGTATGCGTATTTGGATCC	129352

CU019605.7	851	CCCCTTTTTTCTAAGGTGAATGTCAGTGTCATTTTCAGAGAGAGAGAAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129353	CCCCTTTTTTCTAAGGTGAATGTCAGTGTCATTTTCAGAGAGAGAGAAAC	129402

CU019605.7	901	AGGAAAAAACGTGCAGACTGCAGAGTATAAGTCCATGCACAGTAAACAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129403	AGGAAAAAACGTGCAGACTGCAGAGTATAAGTCCATGCACAGTAAACAGT	129452

CU019605.7	951	TTCTCTCCACAGAATAAATTGTGTTTCTATAAAATGAGTGTTTGTCCTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129453	TTCTCTCCACAGAATAAATTGTGTTTCTATAAAATGAGTGTTTGTCCTAT	129502

CU019605.7	1001	GGCCAAGGGATAAGACCCAAGTTGAAAAATACAGAGAATTATTGCTAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129503	GGCCAAGGGATAAGACCCAAGTTGAAAAATACAGAGAATTATTGCTAGAA	129552

CU019605.7	1051	CTTTACCAGATATGGTTCTAAGGTATGCCAGGGATGGACCCACACAAATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129553	CTTTACCAGATATGGTTCTAAGGTATGCCAGGGATGGACCCACACAAATT	129602

CU019605.7	1101	TAGTATGTACTGTGAGTAACTAGTTATTCATTAGTACAAAGTGTCAAGTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129603	TAGTATGTACTGTGAGTAACTAGTTATTCATTAGTACAAAGTGTCAAGTA	129652

CU019605.7	1151	TACAGAGCTTTTGTGAACTAAAGGAAGAGCTTTTGTAGATTTATAACAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129653	TACAGAGCTTTTGTGAACTAAAGGAAGAGCTTTTGTAGATTTATAACAAT	129702

CU019605.7	1201	GTTGGTGTATATGTATACTACTAAATATATCTGGCATGACTCAAGCAACG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129703	GTTGGTGTATATGTATACTACTAAATATATCTGGCATGACTCAAGCAACG	129752

CU019605.7	1251	TCATAACCCCAGGAAATCATTGTAGAAGCAGAATTGGCAAATCAGGGTAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129753	TCATAACCCCAGGAAATCATTGTAGAAGCAGAATTGGCAAATCAGGGTAG	129802

CU019605.7	1301	ATAAAACACGAACCTTCCAGAAATTATATATGGGGGGAGCACAGGATACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129803	ATAAAACACGAACCTTCCAGAAATTATATATGGGGGGAGCACAGGATACA	129852

CU019605.7	1351	TAAAATGAAACAAGTATATGAAACTAAGTAAAATCTTCATCGCAGGAAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129853	TAAAATGAAACAAGTATATGAAACTAAGTAAAATCTTCATCGCAGGAAGC	129902

CU019605.7	1401	TCGCAAAAAAGTAATTTAAGAAAGATTGTTTGTCCTCTAGATTTAAGCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129903	TCGCAAAAAAGTAATTTAAGAAAGATTGTTTGTCCTCTAGATTTAAGCAT	129952

CU019605.7	1451	GATAACCAGGCCTCATAGATCTTACGTTCTTAGTAGAATATTGCTAATAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	129953	GATAACCAGGCCTCATAGATCTTACGTTCTTAGTAGAATATTGCTAATAA	130002

CU019605.7	1501	AATGCAAGTGTTTTCAGACTAGATTGGTCATATAAGAATATGAAGTACTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130003	AATGCAAGTGTTTTCAGACTAGATTGGTCATATAAGAATATGAAGTACTT	130052

CU019605.7	1551	AATTCACACTACTTCACTTAGATTGGGTATCTAAGTGAATTTAATGATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130053	AATTCACACTACTTCACTTAGATTGGGTATCTAAGTGAATTTAATGATTT	130102

CU019605.7	1601	GGCTAATGTCCCAAGCAGTACAAATTTATACAAAATACATAAATAATTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130103	GGCTAATGTCCCAAGCAGTACAAATTTATACAAAATACATAAATAATTAT	130152

CU019605.7	1651	GTCCACTTTTCAGGATTACTTTCTTTACTCTAACATTATGGAAGAAGAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130153	GTCCACTTTTCAGGATTACTTTCTTTACTCTAACATTATGGAAGAAGAAG	130202

CU019605.7	1701	ATACTGTTAGCCATAGAGAATTCTCTACATTTGTGAAGAATGAACCTCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130203	ATACTGTTAGCCATAGAGAATTCTCTACATTTGTGAAGAATGAACCTCCA	130252

CU019605.7	1751	CCTCTTCAAAGAGACTTGAAAGGAAGTTTTACATTTCAAATTAAAAAAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130253	CCTCTTCAAAGAGACTTGAAAGGAAGTTTTACATTTCAAATTAAAAAAAT	130302

CU019605.7	1801	TGATGGGCATGAATGGAAGTTAACTGGATTTGTTACAACACCTACTTCAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130303	TGATGGGCATGAATGGAAGTTAACTGGATTTGTTACAACACCTACTTCAA	130352

CU019605.7	1851	ATGCTACTTACAGTCTTCTCCTAGACAACCAGCAAATTTGGATTTTTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130353	ATGCTACTTACAGTCTTCTCCTAGACAACCAGCAAATTTGGATTTTTGAA	130402

CU019605.7	1901	TTTGATATACTATTTATAAATTTAGGCTGCAAGCAATGCATGCACGACTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130403	TTTGATATACTATTTATAAATTTAGGCTGCAAGCAATGCATGCACGACTT	130452

CU019605.7	1951	ACAAATTTAAAACCGAGTCGGTTGTGAAGTAGTGTGAATTAGTTAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU062496.5	130453	ACAAATTTAAAACCGAGTCGGTTGTGAAGTAGTGTGAATTAGTTAAGCTT	130502

Overview

Query
CU019605.7 - 54018 bps
Hit
CU062496.5 - 130502 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193920001200011285031305021
Short-link