<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU019603.9	1	AAGCTTATGATAGTCTTGAATGACATTTTATTCAAAATACTCTTAATTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10238	AAGCTTATGATAGTCTTGAATGACATTTTATTCAAAATACTCTTAATTTT	10287

CU019603.9	51	ATGGGCTTCCCCCCTAAACTCATTAACACTATCATGCAATGCATCAATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10288	ATGGGCTTCCCCCCTAAACTCATTAACACTATCATGCAATGCATCAATTC	10337

CU019603.9	101	TGTTACTTTTTCTATACTTATCAATGGACATCCAACTGATCCTTTTCAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10338	TGTTACTTTTTCTATACTTATCAATGGACATCCAACTGATCCTTTTCAAC	10387

CU019603.9	151	CTCAGAGAGGCATAAGATAAGGGGACCCTCTGTCACCCTACATTTTCATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10388	CTCAGAGAGGCATAAGATAAGGGGACCCTCTGTCACCCTACATTTTCATT	10437

CU019603.9	201	ATTTGTGCTGAAATCCTATCTGGTTTGATTGAAAAGGATCAGAAAAATGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10438	ATTTGTGCTGAAATCCTATCTGGTTTGATTGAAAAGGATCAGAAAAATGG	10487

CU019603.9	251	TCTCATCACTGGCGTGTCTATTGCTACTAATGCTCCAACTATTTCCCATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10488	TCTCATCACTGGCGTGTCTATTGCTACTAATGCTCCAACTATTTCCCATT	10537

CU019603.9	301	TATTGTATGTTGATGATAGTATTCTTTTTTGTAAAGCTAAACTTGAGGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10538	TATTGTATGTTGATGATAGTATTCTTTTTTGTAAAGCTAAACTTGAGGAA	10587

CU019603.9	351	GCCAATGCTATCATGAGGACTCTACAGGTCTACCAAGCAGCCTCTGGCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10588	GCCAATGCTATCATGAGGACTCTACAGGTCTACCAAGCAGCCTCTGGCCA	10637

CU019603.9	401	AAAGGTCAACATGGACAAATCTGAGATTATATTTAGTCCTAATATCTCTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10638	AAAGGTCAACATGGACAAATCTGAGATTATATTTAGTCCTAATATCTCTA	10687

CU019603.9	451	TGGATTCCAAAAAGGAATTTCAAGCTAATCTCCCTATCAAAATTAGCAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10688	TGGATTCCAAAAAGGAATTTCAAGCTAATCTCCCTATCAAAATTAGCAAT	10737

CU019603.9	501	AACATTCAGAAGTATTTGGGGATGCCAACCCACCTTGGCATGTCTAAAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10738	AACATTCAGAAGTATTTGGGGATGCCAACCCACCTTGGCATGTCTAAAGA	10787

CU019603.9	551	GCAAGATTTTCAATTTCTAATGGATAGAGTTTGGAACAAGTTGAAGGGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10788	GCAAGATTTTCAATTTCTAATGGATAGAGTTTGGAACAAGTTGAAGGGTT	10837

CU019603.9	601	GGAAGGAAAAAAGCCTCTCTTTTGAAGGCAGAGGAATCCTTATAAGAGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10838	GGAAGGAAAAAAGCCTCTCTTTTGAAGGCAGAGGAATCCTTATAAGAGCA	10887

CU019603.9	651	GTGGCACAAGCAATATCTACCTATATCATGAGTTGTTTTCTCCTTCCTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10888	GTGGCACAAGCAATATCTACCTATATCATGAGTTGTTTTCTCCTTCCTAA	10937

CU019603.9	701	GGGTCTTTGTGACAAGATTGAGAAGGCTGTTTGTGCCTTCTGGTGGGGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10938	GGGTCTTTGTGACAAGATTGAGAAGGCTGTTTGTGCCTTCTGGTGGGGAA	10987

CU019603.9	751	GCACTGACAATAAGAGGAAGATTCACTGGACCAAAAAAGAAAACCTATTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	10988	GCACTGACAATAAGAGGAAGATTCACTGGACCAAAAAAGAAAACCTATTT	11037

CU019603.9	801	AAATCAAAATTAGAAGGGGGAATGGGATTCAATATATTGAGAGACTTCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11038	AAATCAAAATTAGAAGGGGGAATGGGATTCAATATATTGAGAGACTTCAA	11087

CU019603.9	851	CTTAGCTATGTTGGCTAAACAAGACTGGAGGTTTCATACTGAACCTAATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11088	CTTAGCTATGTTGGCTAAACAAGACTGGAGGTTTCATACTGAACCTAATT	11137

CU019603.9	901	CTCTCATTTCTAGATGCTATAAAGCCAAGTACTACCCCCATTGCAATGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11138	CTCTCATTTCTAGATGCTATAAAGCCAAGTACTACCCCCATTGCAATGTT	11187

CU019603.9	951	CTTCAGGCTACTATTGGCAATAACCCAAGCTATGCTTGGAGGAGCATTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11188	CTTCAGGCTACTATTGGCAATAACCCAAGCTATGCTTGGAGGAGCATTTT	11237

CU019603.9	1001	TAATGCATTATGGATCATCAAAAAAGGATCTTGTTGGAGGATTGGCAATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11238	TAATGCATTATGGATCATCAAAAAAGGATCTTGTTGGAGGATTGGCAATG	11287

CU019603.9	1051	GTCAAGAGGTAAATATTTGGGAGGACAATTAGATTCCCTCCAATATTGGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11288	GTCAAGAGGTAAATATTTGGGAGGACAATTAGATTCCCTCCAATATTGGT	11337

CU019603.9	1101	TTCAAACCTATTTCTTCAAATAGTGGCTCTACTTCAGTTAGATTGGTCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11338	TTCAAACCTATTTCTTCAAATAGTGGCTCTACTTCAGTTAGATTGGTCAA	11387

CU019603.9	1151	GGACCTGATCATGGTTAATAGCTCAACCTGGAACTCTGAGCTTCTTAATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11388	GGACCTGATCATGGTTAATAGCTCAACCTGGAACTCTGAGCTTCTTAATA	11437

CU019603.9	1201	ACCAATTCCTTGGAATTGACACTGAAGCCATTGAACAGATTCCCATTATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11438	ACCAATTCCTTGGAATTGACACTGAAGCCATTGAACAGATTCCCATTATT	11487

CU019603.9	1251	GACATTTTCCATAGGGACACTCTTATGTGGATGTTTGAGAAAACTGGCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11488	GACATTTTCCATAGGGACACTCTTATGTGGATGTTTGAGAAAACTGGCAG	11537

CU019603.9	1301	CTACACGGTCAAGAGTGGTTACACAGCTATTCAGATTTGGAAAAATGGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11538	CTACACGGTCAAGAGTGGTTACACAGCTATTCAGATTTGGAAAAATGGTT	11587

CU019603.9	1351	CTCAGAACTCTCCAAGTTCAAGCTCTGAAAACACTAAATTATGGAAGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11588	CTCAGAACTCTCCAAGTTCAAGCTCTGAAAACACTAAATTATGGAAGAAA	11637

CU019603.9	1401	ATCTGGAATCTACACACTATTCCTAGACATAAAACTATTTTATGGAGAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11638	ATCTGGAATCTACACACTATTCCTAGACATAAAACTATTTTATGGAGAAT	11687

CU019603.9	1451	TCTGAATAACTCCATTCCTCTCAGAAGTGAACTAGGTAAAAGAGGAGTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11688	TCTGAATAACTCCATTCCTCTCAGAAGTGAACTAGGTAAAAGAGGAGTGT	11737

CU019603.9	1501	TGTGCTCCCCACTGTGCCCTAGATGTGAAACTAAGATTGAGACAACAGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11738	TGTGCTCCCCACTGTGCCCTAGATGTGAAACTAAGATTGAGACAACAGAC	11787

CU019603.9	1551	CATATTTTTATGCACTGCCCTAATATCTCCAAAATTTGGTTTAGGTCTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11788	CATATTTTTATGCACTGCCCTAATATCTCCAAAATTTGGTTTAGGTCTAA	11837

CU019603.9	1601	TCTTAACCTTAAAACTTTGGATCTACCCATACCAAGTTTCAGAGACTGGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11838	TCTTAACCTTAAAACTTTGGATCTACCCATACCAAGTTTCAGAGACTGGC	11887

CU019603.9	1651	TTATGCATTCCATTCTCACGCTCAAAGAAGATACGATAATACAGATAGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11888	TTATGCATTCCATTCTCACGCTCAAAGAAGATACGATAATACAGATAGCC	11937

CU019603.9	1701	TCTATAACTTATAACATTTGGCAAGCTCGTAATCAGAGCATATATGAACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11938	TCTATAACTTATAACATTTGGCAAGCTCGTAATCAGAGCATATATGAACA	11987

CU019603.9	1751	CATGTATAAACCTGAAGCAGACATAATACAGAGATCAGATCGTTGCGTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	11988	CATGTATAAACCTGAAGCAGACATAATACAGAGATCAGATCGTTGCGTTT	12037

CU019603.9	1801	CTGACTTTCTCCAAGCTCAGCTCAGCGACACGGTGGATAATCTGAATCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	12038	CTGACTTTCTCCAAGCTCAGCTCAGCGACACGGTGGATAATCTGAATCAT	12087

CU019603.9	1851	GACATCAGCTATTCCAATGCTCCTCACCAAAGCGTTGCTCGTCGTCAATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	12088	GACATCAGCTATTCCAATGCTCCTCACCAAAGCGTTGCTCGTCGTCAATG	12137

CU019603.9	1901	GCAACCACCTCCGCTGGGAATTTTTAAAGGCAACAGCGATGCTAACCTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	12138	GCAACCACCTCCGCTGGGAATTTTTAAAGGCAACAGCGATGCTAACCTTC	12187

CU019603.9	1951	AACAAACTGGCTGGTGGGGCTTAGGTGCTATCATCATAAATGATTTGGGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU041384.7	12188	AACAAACTGGCTGGTGGGGCTTAGGTGCTATCATCATAAATGATTTGGGT	12237

Overview

Query
CU019603.9 - 107844 bps
Hit
CU041384.7 - 12237 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001962200012000110238122371
Short-link