<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CT990489.3 1 AAGCTTGTGGGGAGTAGGGGTTCAAAAAATCGATACTTTGATTTTGACAA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83243 AAGCTTGTGGGGAGTAGGGGTTCAAAAAATCGATACTTTGATTTTGACAA 83292 CT990489.3 51 ATTGGCAGAGGTTTGTTTTGTTCTAAATACCAACTTTCTTGAACATGTTT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83293 ATTGGCAGAGGTTTGTTTTGTTCTAAATACCAACTTTCTTGAACATGTTT 83342 CT990489.3 101 CTCTTGACATTATTCTTAATTTTGCTCTGTTTGCCATGTGAGACAGGTCA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83343 CTCTTGACATTATTCTTAATTTTGCTCTGTTTGCCATGTGAGACAGGTCA 83392 CT990489.3 151 CTGCATTAGTCACTTCTAACCTGAACAAAATTATTGACGTCAATTACTAC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83393 CTGCATTAGTCACTTCTAACCTGAACAAAATTATTGACGTCAATTACTAC 83442 CT990489.3 201 CCTGTTGAAACTGCAAAAAGGTCTAACTTACGACATAGGCCTATTGGACT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83443 CCTGTTGAAACTGCAAAAAGGTCTAACTTACGACATAGGCCTATTGGACT 83492 CT990489.3 251 TGGAGTCCAGGGACTTGCAGACACATTCATTTTGCTTGGCATGGCATTTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83493 TGGAGTCCAGGGACTTGCAGACACATTCATTTTGCTTGGCATGGCATTTG 83542 CT990489.3 301 ATTCCCAGGAGGTAAGTTTTGTCTATCATCTTTTCTAGCTGTACATTTGT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83543 ATTCCCAGGAGGTAAGTTTTGTCTATCATCTTTTCTAGCTGTACATTTGT 83592 CT990489.3 351 GCAGATTGTTCTGATCTTATACTTTGTCTATGTATAGGCTCAGCAGCTAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83593 GCAGATTGTTCTGATCTTATACTTTGTCTATGTATAGGCTCAGCAGCTAA 83642 CT990489.3 401 ACAAGGACATATTTGAGACAATATACTACCATGCATTAAAAGCTTCTTCT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83643 ACAAGGACATATTTGAGACAATATACTACCATGCATTAAAAGCTTCTTCT 83692 CT990489.3 451 GAATTAGCTGCCAAGGAAGGCCCATACGAGACATATGCAGGAAGTCCTGT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83693 GAATTAGCTGCCAAGGAAGGCCCATACGAGACATATGCAGGAAGTCCTGT 83742 CT990489.3 501 AAGCAAGGTATAAATCCTTTCATTCCTAGATTTTACAAATGGGTAATATG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83743 AAGCAAGGTATAAATCCTTTCATTCCTAGATTTTACAAATGGGTAATATG 83792 CT990489.3 551 TTAATGGGATGTTTGATTTTCCAGTGCATATTGACGATCATCCATGATTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83793 TTAATGGGATGTTTGATTTTCCAGTGCATATTGACGATCATCCATGATTT 83842 CT990489.3 601 AGTCGAAATGGTTGTTATACTTCTAAGTGTCTAACATAAATAAAATAGCA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83843 AGTCGAAATGGTTGTTATACTTCTAAGTGTCTAACATAAATAAAATAGCA 83892 CT990489.3 651 TCTTCTTACTGGTTTGACTTTGAAGATATGATTGCAAGTTTAAAGAGAAT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83893 TCTTCTTACTGGTTTGACTTTGAAGATATGATTGCAAGTTTAAAGAGAAT 83942 CT990489.3 701 TTGAAAATGTTGAGACACAAATTATACACACTACAGTAGAACATGAAATG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83943 TTGAAAATGTTGAGACACAAATTATACACACTACAGTAGAACATGAAATG 83992 CT990489.3 751 ACTGTCAGATTTTATTTTGATTCACATTGTATTTCCACTAAATACATATT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 83993 ACTGTCAGATTTTATTTTGATTCACATTGTATTTCCACTAAATACATATT 84042 CT990489.3 801 ATGCTGCCCAGGGTATTCTCCAGCCAGACATGTGGGGAATTACACCATCT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84043 ATGCTGCCCAGGGTATTCTCCAGCCAGACATGTGGGGAATTACACCATCT 84092 CT990489.3 851 GATAAATGGGATTGGCATGCTCTTCGTGAAATGATTGCAAATAATGGTGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84093 GATAAATGGGATTGGCATGCTCTTCGTGAAATGATTGCAAATAATGGTGT 84142 CT990489.3 901 AAGAAATTCACTTCTTGTAGCTCCAATGCCAACTGCTTCAACCAGCCAAA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84143 AAGAAATTCACTTCTTGTAGCTCCAATGCCAACTGCTTCAACCAGCCAAA 84192 CT990489.3 951 TTCTTGGAAATAATGAATGCTTTGAGCCATATACATCTAATATCTACAGC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84193 TTCTTGGAAATAATGAATGCTTTGAGCCATATACATCTAATATCTACAGC 84242 CT990489.3 1001 AGAAGGGTTCTGAGGTAACACCTGCTAGCAGATCCTGCAGCTGCTGCTTT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84243 AGAAGGGTTCTGAGGTAACACCTGCTAGCAGATCCTGCAGCTGCTGCTTT 84292 CT990489.3 1051 TTTTTTTTTTTTTATTATTATCATACTTGCTGCATATGATTTATACATGG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84293 TTTTTTTTTTTTTATTATTATCATACTTGCTGCATATGATTTATACATGG 84342 CT990489.3 1101 TTTATTTTTTATCTCCAGTGGTGAATTTGTTGTGGTGAACAAACATCTTC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84343 TTTATTTTTTATCTCCAGTGGTGAATTTGTTGTGGTGAACAAACATCTTC 84392 CT990489.3 1151 TGCATGACCTAACCGAGACAGGGCTCTGGTCACCTGCTGTTAAGAATAGG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84393 TGCATGACCTAACCGAGACAGGGCTCTGGTCACCTGCTGTTAAGAATAGG 84442 CT990489.3 1201 ATAATACATGATGATGGTTCTGTGCAGAAAATCCCTGAAATTCCAGATGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84443 ATAATACATGATGATGGTTCTGTGCAGAAAATCCCTGAAATTCCAGATGA 84492 CT990489.3 1251 TCTTAAAGTTATTTATAAGTATGAACTTTCACTAATTACTTGTTCAGTTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84493 TCTTAAAGTTATTTATAAGTATGAACTTTCACTAATTACTTGTTCAGTTT 84542 CT990489.3 1301 TTATATACACTTCATTTCCACTTACATTCTAATACTGTTCACTGACTTCA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84543 TTATATACACTTCATTTCCACTTACATTCTAATACTGTTCACTGACTTCA 84592 CT990489.3 1351 GGACTGTCTGGGAGATCAAGCAACGGACCCTGGTTGACATGGCTGTAGAC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84593 GGACTGTCTGGGAGATCAAGCAACGGACCCTGGTTGACATGGCTGTAGAC 84642 CT990489.3 1401 CGTGGTTGCTACATAGATCAGAGTCAAAGCCTCAACATCCATATGGATCA 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84643 CGTGGTTGCTACATAGATCAGAGTCAAAGCCTCAACATCCATATGGATCA 84692 CT990489.3 1451 ACCCAACTTTGGAAAGCTCACTTCCCTTCATTTTCATGCTTGGTCCAGGG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84693 ACCCAACTTTGGAAAGCTCACTTCCCTTCATTTTCATGCTTGGTCCAGGG 84742 CT990489.3 1501 TACACTTCAATTTTCACATTATAAGTTTTGTTGATCTTTTGAAGAGTGCA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84743 TACACTTCAATTTTCACATTATAAGTTTTGTTGATCTTTTGAAGAGTGCA 84792 CT990489.3 1551 TAAGCACTAAGAAATGGTCTGGTATATTGTTACTCAATAGTTTAGTACAA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84793 TAAGCACTAAGAAATGGTCTGGTATATTGTTACTCAATAGTTTAGTACAA 84842 CT990489.3 1601 ACATCCATTTAAAGAGATCTTTTAGCGACTAGTGAATGTAGTTGTCAGAC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84843 ACATCCATTTAAAGAGATCTTTTAGCGACTAGTGAATGTAGTTGTCAGAC 84892 CT990489.3 1651 TACAACAGCATGAACAGATCTTTGTAGGTTCCATCTTCACAGGTCAATTT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84893 TACAACAGCATGAACAGATCTTTGTAGGTTCCATCTTCACAGGTCAATTT 84942 CT990489.3 1701 TGAGTCTGAGTTTCATCTTTCTTGTTATTGTAGGGTTTGAAAACTGGAAT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84943 TGAGTCTGAGTTTCATCTTTCTTGTTATTGTAGGGTTTGAAAACTGGAAT 84992 CT990489.3 1751 GTACTATCTACGATCACGTGCTGCAGCTGATGCAATCAAGTTCACAGTTG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 84993 GTACTATCTACGATCACGTGCTGCAGCTGATGCAATCAAGTTCACAGTTG 85042 CT990489.3 1801 ACACTTCCATGCTGAAGGTAGTAAGTAGTAACGTTATAATGCTGAGTAAC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 85043 ACACTTCCATGCTGAAGGTAGTAAGTAGTAACGTTATAATGCTGAGTAAC 85092 CT990489.3 1851 TTATCGTCAATATTATTTTGTTCTTACAAACTGCGCACTGGTATCAATTT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 85093 TTATCGTCAATATTATTTTGTTCTTACAAACTGCGCACTGGTATCAATTT 85142 CT990489.3 1901 GCAGGAAAAACCAAAGACTGCTGTTGACGAAGAAACTAAATTGGCTCAGA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 85143 GCAGGAAAAACCAAAGACTGCTGTTGACGAAGAAACTAAATTGGCTCAGA 85192 CT990489.3 1951 TGGTGTGCTCTTTTACAAACCGCGAGGACTGTTTATCCTGTGGAAGTTAG 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU019619.10 85193 TGGTGTGCTCTTTTACAAACCGCGAGGACTGTTTATCCTGTGGAAGTTAG 85242
