<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU062662.5	1	AACCAAATTGAGGTTCAAATAACATTGCTTTAGTTTTGGTATCTCTGTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	105845	AACCAAATTGAGGTTCAAATAACATTGCTTTAGTTTTGGTATCTCTGTGT	105894

CU062662.5	51	TACGAGCAACTACAAACAATAGCTCTTAAATATATCGTAATTTTAAAATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	105895	TACGAGCAACTACAAACAATAGCTCTTAAATATATCGTAATTTTAAAATA	105944

CU062662.5	101	GTTCGAATGTGCAGTAGTATGTTATTTAAAATAGACTTCTAAGTTAAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	105945	GTTCGAATGTGCAGTAGTATGTTATTTAAAATAGACTTCTAAGTTAAAAT	105994

CU062662.5	151	GTTTTTTTAATATTGTCACACTAGATCTTTAATATACATACTTATTATGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	105995	GTTTTTTTAATATTGTCACACTAGATCTTTAATATACATACTTATTATGA	106044

CU062662.5	201	TATCGGTTCTAAGAACTTAGTGTGACATCAACCCATATATAAAAAGAATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106045	TATCGGTTCTAAGAACTTAGTGTGACATCAACCCATATATAAAAAGAATT	106094

CU062662.5	251	AATGTTAACATTGACTAACTATCAACGTCAGAGACTATTTTGGTTAATCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106095	AATGTTAACATTGACTAACTATCAACGTCAGAGACTATTTTGGTTAATCA	106144

CU062662.5	301	AGTATATAATCAATGAATATTTTAGAATCTCGATACATTGAAAAATTATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106145	AGTATATAATCAATGAATATTTTAGAATCTCGATACATTGAAAAATTATT	106194

CU062662.5	351	ATGACTGCTCGTTATACATTTAAGAATAAAAAGACTATTATTGAAACAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106195	ATGACTGCTCGTTATACATTTAAGAATAAAAAGACTATTATTGAAACAAA	106244

CU062662.5	401	AACTAACTCAAAATTTAATCATGAAGAACTTAAAAAAAATAGGTTTGATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106245	AACTAACTCAAAATTTAATCATGAAGAACTTAAAAAAAATAGGTTTGATC	106294

CU062662.5	451	AATTTTTGTCTTAATTATTACCCTAAATCCTACCTTCGATGTAGCAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106295	AATTTTTGTCTTAATTATTACCCTAAATCCTACCTTCGATGTAGCAAAAA	106344

CU062662.5	501	AAAGTCCTACCTTTGAAATTATAAACGAAAGATTAAAACCAATATAATTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106345	AAAGTCCTACCTTTGAAATTATAAACGAAAGATTAAAACCAATATAATTT	106394

CU062662.5	551	TATTCTTCGGCAAATAATTGAAGTAGGTAGTATGAAATCAAGCACAGTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106395	TATTCTTCGGCAAATAATTGAAGTAGGTAGTATGAAATCAAGCACAGTGC	106444

CU062662.5	601	ATGCATCTCAATCCAGAATTCAACTTGCCTAAAATAATTGAAAATTAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106445	ATGCATCTCAATCCAGAATTCAACTTGCCTAAAATAATTGAAAATTAAAA	106494

CU062662.5	651	AAATAAAAATAAAATAAAAAATATCATAAATAATTAAATTTAATAAAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106495	AAATAAAAATAAAATAAAAAATATCATAAATAATTAAATTTAATAAAAAA	106544

CU062662.5	701	GAAGGTCGGCGATAAATTGTTTGGGACACATGTTAACGATTGTTTTAGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106545	GAAGGTCGGCGATAAATTGTTTGGGACACATGTTAACGATTGTTTTAGGC	106594

CU062662.5	751	ATACCAAAAATTATCACACCCCAGGCCCAATTGTAAACGACGTCAATTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106595	ATACCAAAAATTATCACACCCCAGGCCCAATTGTAAACGACGTCAATTTT	106644

CU062662.5	801	AATCAAAACGACCCCACGTTCTCACCGAGTACAAATCCAGACTCAACCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106645	AATCAAAACGACCCCACGTTCTCACCGAGTACAAATCCAGACTCAACCCT	106694

CU062662.5	851	CGTACCCCAACCTTCGTTCTTCTCTCTCTCTTCCATTTCCCAATCCCTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106695	CGTACCCCAACCTTCGTTCTTCTCTCTCTCTTCCATTTCCCAATCCCTCT	106744

CU062662.5	901	GCTTCGTTGACTCCAAAATCGATCTTCGTCGAAGATCGGTGATACTTCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106745	GCTTCGTTGACTCCAAAATCGATCTTCGTCGAAGATCGGTGATACTTCAA	106794

CU062662.5	951	CCTTCGTTTTCTTCACTACAAGGTTCGATTCTACCGTTTTCTTCACTCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106795	CCTTCGTTTTCTTCACTACAAGGTTCGATTCTACCGTTTTCTTCACTCTA	106844

CU062662.5	1001	TTAACTACTACTTCGTTTTCCAGGGTTTCTCACTTCAAACCTCTAACCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106845	TTAACTACTACTTCGTTTTCCAGGGTTTCTCACTTCAAACCTCTAACCCT	106894

CU062662.5	1051	AGTTCACTTCAATTCGATTTGATTTAATTTAGTTGATTCGTTATTTGACG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106895	AGTTCACTTCAATTCGATTTGATTTAATTTAGTTGATTCGTTATTTGACG	106944

CU062662.5	1101	CTTCTTCTATACTTGTTTTTGTTTCAGATCTAGTTCAATTTCCACCTCAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106945	CTTCTTCTATACTTGTTTTTGTTTCAGATCTAGTTCAATTTCCACCTCAT	106994

CU062662.5	1151	ACGTTTGATTCAAAGCTCAACTCACTGAATTTGAAGATTCTTCAGGTTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	106995	ACGTTTGATTCAAAGCTCAACTCACTGAATTTGAAGATTCTTCAGGTTTT	107044

CU062662.5	1201	TTTACCTTTTTACTACTCGATTTAGTTCATGTTGATTTTGTTGCTGTAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107045	TTTACCTTTTTACTACTCGATTTAGTTCATGTTGATTTTGTTGCTGTAGA	107094

CU062662.5	1251	TTTGCTAGGTTCCGAGATTTGAACGGTTTTTTTGTGTGATTTGATTACAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107095	TTTGCTAGGTTCCGAGATTTGAACGGTTTTTTTGTGTGATTTGATTACAG	107144

CU062662.5	1301	ATCTGAGTGGTTTTGATTTGGATTTGTTGTTTGTGAAATGACGGATTTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107145	ATCTGAGTGGTTTTGATTTGGATTTGTTGTTTGTGAAATGACGGATTTAC	107194

CU062662.5	1351	CGAAGGATTTACAGAAAGGTGATTCGATTCAAATCAGAGAGGTATGGAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107195	CGAAGGATTTACAGAAAGGTGATTCGATTCAAATCAGAGAGGTATGGAAC	107244

CU062662.5	1401	GATAATCTGGAAGAGGAGTTTGTGTTGATTCGTGAAATTGTTGATAAGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107245	GATAATCTGGAAGAGGAGTTTGTGTTGATTCGTGAAATTGTTGATAAGTA	107294

CU062662.5	1451	TAACTATGTTGCGATGGATACGGAGTTTCCTGGTGTTGTTCTTCGGCCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107295	TAACTATGTTGCGATGGATACGGAGTTTCCTGGTGTTGTTCTTCGGCCTG	107344

CU062662.5	1501	TTGGGAATTTTAAGCATATTAATGATTTTAACTATCAGACTTTGAAGGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107345	TTGGGAATTTTAAGCATATTAATGATTTTAACTATCAGACTTTGAAGGAT	107394

CU062662.5	1551	AACGTTGATATGTTGAAGCTGATTCAGTTAGGTTTAACTTTTTCTGATGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107395	AACGTTGATATGTTGAAGCTGATTCAGTTAGGTTTAACTTTTTCTGATGA	107444

CU062662.5	1601	GAATGGAAATTTACCTACTTGTGGCACTGATAGTCCTTGCATCTGGCAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107445	GAATGGAAATTTACCTACTTGTGGCACTGATAGTCCTTGCATCTGGCAAT	107494

CU062662.5	1651	TCAATTTTCGCGAGTTTAATGTTAGCGAAGATATTTTCGCTGCTGATTCG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107495	TCAATTTTCGCGAGTTTAATGTTAGCGAAGATATTTTCGCTGCTGATTCG	107544

CU062662.5	1701	ATTGAGCTTTTGCGTCAATGCGGAATTGATTTTAAGAAGAACAGCGAGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107545	ATTGAGCTTTTGCGTCAATGCGGAATTGATTTTAAGAAGAACAGCGAGCA	107594

CU062662.5	1751	AGGAATTGATGTGAACCGATTTGGGGAACTTTTGATGTCATCGGGGATTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107595	AGGAATTGATGTGAACCGATTTGGGGAACTTTTGATGTCATCGGGGATTG	107644

CU062662.5	1801	TGTTGAATGATAATGTTCATTGGGTTACTTTTCACAGTGGTTATGATTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107645	TGTTGAATGATAATGTTCATTGGGTTACTTTTCACAGTGGTTATGATTTT	107694

CU062662.5	1851	GGTTATCTTTTGAAGCTTTTGACGTGCAGGGCTTTGCCGGATACACAAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107695	GGTTATCTTTTGAAGCTTTTGACGTGCAGGGCTTTGCCGGATACACAAGC	107744

CU062662.5	1901	TGGATTCTTCGATTTGATCGGGATTTATTTCCCGATTGTGTATGATATCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107745	TGGATTCTTCGATTTGATCGGGATTTATTTCCCGATTGTGTATGATATCA	107794

CU062662.5	1951	AGCATTTGATGAAGTTCTGCAACAGTCTTCATGGTGGTTTGAACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU019603.9	107795	AGCATTTGATGAAGTTCTGCAACAGTCTTCATGGTGGTTTGAACAAGCTT	107844

Overview

Query
CU062662.5 - 17962 bps
Hit
CU019603.9 - 107844 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100191220001200011058451078441
Short-link