<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CT009521.5 1 AAGCTTATGGTCATTAAAGACCACAAAACTCATGGACAGTGTTAGGTCAA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 95861 AAGCTTATGGTCATTAAAGACCACAAAACTCATGGACAGTGTTAGGTCAA 95910 CT009521.5 51 AGATCCACTGATTTTCTTAGAAACTTCCTGTTAGACTGTGGTTCTAGAAG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 95911 AGATCCACTGATTTTCTTAGAAACTTCCTGTTAGACTGTGGTTCTAGAAG 95960 CT009521.5 101 TCTGAGTCACCTTTATGTAACCTTAGATAGAATACTATGATGTCACTAAG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 95961 TCTGAGTCACCTTTATGTAACCTTAGATAGAATACTATGATGTCACTAAG 96010 CT009521.5 151 TTCAACCACTAAAGTCAGTTACAAATTAAGTGAAGGACTACTGATATGGG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96011 TTCAACCACTAAAGTCAGTTACAAATTAAGTGAAGGACTACTGATATGGG 96060 CT009521.5 201 GAATGGATTGTCTCCAGTCCAATTTCCTCCTGTTTTCTCAGCAATCTGAG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96061 GAATGGATTGTCTCCAGTCCAATTTCCTCCTGTTTTCTCAGCAATCTGAG 96110 CT009521.5 251 CCCTCCATTAACAAAAACACACATTTATATGCATTAGTTGATCTCGACCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96111 CCCTCCATTAACAAAAACACACATTTATATGCATTAGTTGATCTCGACCA 96160 CT009521.5 301 TTGCTTTGACATTAGTCAATTACACCTTCAACAAATCATCTTTAAATAAT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96161 TTGCTTTGACATTAGTCAATTACACCTTCAACAAATCATCTTTAAATAAT 96210 CT009521.5 351 CTACGCCATTGATTTAAGATCAGACAACTATGAATAATAAATGCATCACA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96211 CTACGCCATTGATTTAAGATCAGACAACTATGAATAATAAATGCATCACA 96260 CT009521.5 401 CAATTGATGCGTGACATCCAAATCCTTATAGTCCTAGGTTCTAAGTGCTA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96261 CAATTGATGCGTGACATCCAAATCCTTATAGTCCTAGGTTCTAAGTGCTA 96310 CT009521.5 451 ACCCATAGTCTCATGCCACTTCGATCTCTAACATAGACCTAAATATATTG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96311 ACCCATAGTCTCATGCCACTTCGATCTCTAACATAGACCTAAATATATTG 96360 CT009521.5 501 TGAAAATTGAGTCGTCCCACTCACATGTTTTGTGATTTAGTACTTTTTTT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96361 TGAAAATTGAGTCGTCCCACTCACATGTTTTGTGATTTAGTACTTTTTTT 96410 CT009521.5 551 TTATTATCAAATGTGATTGAGTACTTGATGGATATAAATGTGGAAAATGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96411 TTATTATCAAATGTGATTGAGTACTTGATGGATATAAATGTGGAAAATGA 96460 CT009521.5 601 ATATTTTGACCATTTACTTATGACTCCCATTTAAGACGGCAATGACTTGT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96461 ATATTTTGACCATTTACTTATGACTCCCATTTAAGACGGCAATGACTTGT 96510 CT009521.5 651 GACTCAGAAATTCCACCAAGAAAAAGACAATTGACTTAATTTTCATATGA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96511 GACTCAGAAATTCCACCAAGAAAAAGACAATTGACTTAATTTTCATATGA 96560 CT009521.5 701 TAATATGGACCTCACTTCCCATTCTCTCCTACTAAAAACCACCATCACCT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96561 TAATATGGACCTCACTTCCCATTCTCTCCTACTAAAAACCACCATCACCT 96610 CT009521.5 751 TTCTTCTCTTTTCACTAGTCTCTAAAACCATGAGCTACTCAACCTTCCAA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96611 TTCTTCTCTTTTCACTAGTCTCTAAAACCATGAGCTACTCAACCTTCCAA 96660 CT009521.5 801 ACACACACTCCTGAAAATACTGATGAAGGAAGCAAAGAATTCAGTTTCTG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96661 ACACACACTCCTGAAAATACTGATGAAGGAAGCAAAGAATTCAGTTTCTG 96710 CT009521.5 851 GACTTCACCAAATACCATCATAAAATCTTTAGAAAAATGTGATGGTCATG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96711 GACTTCACCAAATACCATCATAAAATCTTTAGAAAAATGTGATGGTCATG 96760 CT009521.5 901 ATATTCAACTTCGAAGCAATGAAACACAAGAGCTCAATAACCATCATCAA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96761 ATATTCAACTTCGAAGCAATGAAACACAAGAGCTCAATAACCATCATCAA 96810 CT009521.5 951 TGTTCAATAGTTTCAGAACCTTCAAGAAGCAAAGATATTTTAGAAGGAAA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96811 TGTTCAATAGTTTCAGAACCTTCAAGAAGCAAAGATATTTTAGAAGGAAA 96860 CT009521.5 1001 GAAAGAACTTATGGAAATGATTCAAGACATGCCCGAGTCTAGCTATGAAC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96861 GAAAGAACTTATGGAAATGATTCAAGACATGCCCGAGTCTAGCTATGAAC 96910 CT009521.5 1051 TCTCTTTTCAAGACATGGTTGTTGAGCAGCATCAAGTTCCAGAAACAGAA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96911 TCTCTTTTCAAGACATGGTTGTTGAGCAGCATCAAGTTCCAGAAACAGAA 96960 CT009521.5 1101 ACAGAACCAGTGTATAGTAAATTTCAACAACCTCAACAGAAAAAGCTGAA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 96961 ACAGAACCAGTGTATAGTAAATTTCAACAACCTCAACAGAAAAAGCTGAA 97010 CT009521.5 1151 TAAGAATAAGAAGAAGAATAAGAAGGAAAACAAAAGCAATAGACATGGTA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97011 TAAGAATAAGAAGAAGAATAAGAAGGAAAACAAAAGCAATAGACATGGTA 97060 CT009521.5 1201 AAATGTTAAGAGTTGAAAGCATGGACAGTGAAACCTTCCTATTGAAGATG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97061 AAATGTTAAGAGTTGAAAGCATGGACAGTGAAACCTTCCTATTGAAGATG 97110 CT009521.5 1251 TTCTTTCCAATTTCTTTTGATTGGATGAAGAAGACTACTAAAGTACAAAA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97111 TTCTTTCCAATTTCTTTTGATTGGATGAAGAAGACTACTAAAGTACAAAA 97160 CT009521.5 1301 TGGCTCTGAGGTAGAACAAAAAGATAAAGAATGGAGAATCAAAAGATTTT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97161 TGGCTCTGAGGTAGAACAAAAAGATAAAGAATGGAGAATCAAAAGATTTT 97210 CT009521.5 1351 TCAGTGAAGATAGACAAAATACTAGTAGTAGTAGCACTAGCAGAAGCAAC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97211 TCAGTGAAGATAGACAAAATACTAGTAGTAGTAGCACTAGCAGAAGCAAC 97260 CT009521.5 1401 AGCAATGATAAAAGCAGGTACATATGATTATTTTTTTCCAGAAAATCTTT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97261 AGCAATGATAAAAGCAGGTACATATGATTATTTTTTTCCAGAAAATCTTT 97310 CT009521.5 1451 ATTAGATAACGATGATGGCTACTAAGTTACGAAGTAATGATATAGACACA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97311 ATTAGATAACGATGATGGCTACTAAGTTACGAAGTAATGATATAGACACA 97360 CT009521.5 1501 ACAATGACACGTTGACATTGATAATAATTTAAAACAATTAAATAATTTAA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97361 ACAATGACACGTTGACATTGATAATAATTTAAAACAATTAAATAATTTAA 97410 CT009521.5 1551 TGTAATATCATATGCCGGTGTTACACAATGGACAAACATTCAATGTGAAG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97411 TGTAATATCATATGCCGGTGTTACACAATGGACAAACATTCAATGTGAAG 97460 CT009521.5 1601 CGTCGGTGGCATAATTTTTTTTTTATTGGAGTTGTTCAACTTAAGAAAAA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97461 CGTCGGTGGCATAATTTTTTTTTTATTGGAGTTGTTCAACTTAAGAAAAA 97510 CT009521.5 1651 CATCAAATAACTTGGAAATGAACATAATCTAAATGAAATTGTTTTCCAGC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97511 CATCAAATAACTTGGAAATGAACATAATCTAAATGAAATTGTTTTCCAGC 97560 CT009521.5 1701 TATATACAAAATATACACTAATGATTTTGTATTTTATTCTTGTTTTTAGT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97561 TATATACAAAATATACACTAATGATTTTGTATTTTATTCTTGTTTTTAGT 97610 CT009521.5 1751 AGGTATGTTGATCGCAGCTTCTCACTTTCAGAAGGTTGCTTCCCATTCTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97611 AGGTATGTTGATCGCAGCTTCTCACTTTCAGAAGGTTGCTTCCCATTCTT 97660 CT009521.5 1801 ATATGATATAAAAAGCAAAGTAAAGAAACTAGGAGGAGGATGGATTGCTT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97661 ATATGATATAAAAAGCAAAGTAAAGAAACTAGGAGGAGGATGGATTGCTT 97710 CT009521.5 1851 AAATTATGAATACTCTTGTTCTTTTGCCTGATGGAAATTCAGAATATGTA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97711 AAATTATGAATACTCTTGTTCTTTTGCCTGATGGAAATTCAGAATATGTA 97760 CT009521.5 1901 AAATAGAGGATTCAAGGCGTGAAGAATTGCAAAGGACACTTGAGTTATTC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97761 AAATAGAGGATTCAAGGCGTGAAGAATTGCAAAGGACACTTGAGTTATTC 97810 CT009521.5 1951 TTGAATTCTTGGGTTTTGATTATAGTAGTGACATTCATTTTACATATTTG 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU012051.7 97811 TTGAATTCTTGGGTTTTGATTATAGTAGTGACATTCATTTTACATATTTG 97860
