<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU151875.4	1	GGTCCCTACCTACACCACCGTTAGAATAATCTAACAATAATCTAAAATTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90244	GGTCCCTACCTACACCACCGTTAGAATAATCTAACAATAATCTAAAATTG	90293

CU151875.4	51	CACAATCTGGTCCATAATAATAAAAAAAGGATATAATGGATACATGTAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90294	CACAATCTGGTCCATAATAATAAAAAAAGGATATAATGGATACATGTAAA	90343

CU151875.4	101	ATATAATCAAACAGTGGATAACACAGAGATATTTCGGTCATATGTCCATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90344	ATATAATCAAACAGTGGATAACACAGAGATATTTCGGTCATATGTCCATT	90393

CU151875.4	151	ATAAACCTTAAAACTTTAGAGAATATATAAGATAAACAAAAAACAAAGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90394	ATAAACCTTAAAACTTTAGAGAATATATAAGATAAACAAAAAACAAAGAC	90443

CU151875.4	201	CGAGTTCATAAGTCATATTCATCAAGAGTCACATAATCTGAGCAGGGATA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90444	CGAGTTCATAAGTCATATTCATCAAGAGTCACATAATCTGAGCAGGGATA	90493

CU151875.4	251	ATGAAATTATAGAAACCATGACAAGCTTTTCCAGGCTAATCAAAGTATAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90494	ATGAAATTATAGAAACCATGACAAGCTTTTCCAGGCTAATCAAAGTATAC	90543

CU151875.4	301	GAAAATAAAAGGGAAACAGAAGGAACAAAATTTAAACATGAGACATTAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90544	GAAAATAAAAGGGAAACAGAAGGAACAAAATTTAAACATGAGACATTAAC	90593

CU151875.4	351	AAGTTGTAAGCATGGTGCCTAGTTAGCAGACTATTCAACTAGAGAATAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90594	AAGTTGTAAGCATGGTGCCTAGTTAGCAGACTATTCAACTAGAGAATAAT	90643

CU151875.4	401	CAACTTCATCATGTAGATGACGAAAACACCAATCGAGCCAATGAAATTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90644	CAACTTCATCATGTAGATGACGAAAACACCAATCGAGCCAATGAAATTTT	90693

CU151875.4	451	GATCTCGGATGAAGACAAGGTCTACCAGTAGGCACAATGCATTTTATCAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90694	GATCTCGGATGAAGACAAGGTCTACCAGTAGGCACAATGCATTTTATCAG	90743

CU151875.4	501	TTCGTTATTACTCGCTGAATACACTTCACATTCCCCAGAGAAACTATTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90744	TTCGTTATTACTCGCTGAATACACTTCACATTCCCCAGAGAAACTATTAA	90793

CU151875.4	551	TATAATACACATGGTTGCTTTCATATCCCAACTTGTCCGGGTTCTCAATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90794	TATAATACACATGGTTGCTTTCATATCCCAACTTGTCCGGGTTCTCAATG	90843

CU151875.4	601	CATAGCATTTGTGATGTGAATAAAACAATGCAAGGTCACCCAAAGTTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90844	CATAGCATTTGTGATGTGAATAAAACAATGCAAGGTCACCCAAAGTTTCT	90893

CU151875.4	651	AGCTTGGCATAACTCATCGTTAACAAGTCTATTCTATAGAAATCCAATAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90894	AGCTTGGCATAACTCATCGTTAACAAGTCTATTCTATAGAAATCCAATAA	90943

CU151875.4	701	TTTCTTCGGTGTAAAGTAAACAATAAGAAGCTTCCCATCACAACTAAGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90944	TTTCTTCGGTGTAAAGTAAACAATAAGAAGCTTCCCATCACAACTAAGCA	90993

CU151875.4	751	ACTTAGGGCACAAGTAACGTATATTGGGCGTGTTTTTCAGTTCTAAAAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	90994	ACTTAGGGCACAAGTAACGTATATTGGGCGTGTTTTTCAGTTCTAAAAGT	91043

CU151875.4	801	TTCAGAATTTGGGGAGTTCAGGCTCAGTACACATATCTCCGCCTTGCAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91044	TTCAGAATTTGGGGAGTTCAGGCTCAGTACACATATCTCCGCCTTGCAAG	91093

CU151875.4	851	TGAGTGCATAAATAGTATTATGCAAAACAACAAAGTCCACAACCTTGCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91094	TGAGTGCATAAATAGTATTATGCAAAACAACAAAGTCCACAACCTTGCAT	91143

CU151875.4	901	GAATTTCCCTTTTTGGAATAAGTGATCCAATTAGAATATCGAGACTGATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91144	GAATTTCCCTTTTTGGAATAAGTGATCCAATTAGAATATCGAGACTGATA	91193

CU151875.4	951	AACATGCAAACCAAAAAAATGTCTGCATGAAGCCACTATGACAAATTCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91194	AACATGCAAACCAAAAAAATGTCTGCATGAAGCCACTATGACAAATTCAT	91243

CU151875.4	1001	TAGAACCTTTGGCAAAAGCAAGTAAGACACGACAAGTGAAATGAATGAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91244	TAGAACCTTTGGCAAAAGCAAGTAAGACACGACAAGTGAAATGAATGAAA	91293

CU151875.4	1051	TCATCTCCAACTGTTGAGGTATCAATGATGATATGTTTTCTTGTAAATGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91294	TCATCTCCAACTGTTGAGGTATCAATGATGATATGTTTTCTTGTAAATGG	91343

CU151875.4	1101	ATTCATTAGATGTAGTCTTTTATTTGCACCTGGCATGATCAAATATCCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91344	ATTCATTAGATGTAGTCTTTTATTTGCACCTGGCATGATCAAATATCCAC	91393

CU151875.4	1151	TAGACGAACCACCATAGGAGCCAAAATAAACACTCCTCTTAGAACGGTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91394	TAGACGAACCACCATAGGAGCCAAAATAAACACTCCTCTTAGAACGGTAA	91443

CU151875.4	1201	ACTCGTTTTTCAGGTATGCTATAGAAAGAACAATATTTCGTATCATACGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91444	ACTCGTTTTTCAGGTATGCTATAGAAAGAACAATATTTCGTATCATACGG	91493

CU151875.4	1251	AGTTGTTTGAACAAGAAGTGGTGATTGGGATGCTAGGAACCTTCTCCAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91494	AGTTGTTTGAACAAGAAGTGGTGATTGGGATGCTAGGAACCTTCTCCAAT	91543

CU151875.4	1301	AAATTTTCTGAACACGCCTCCACTCCTTACAAACACCAGCAAATTGAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91544	AAATTTTCTGAACACGCCTCCACTCCTTACAAACACCAGCAAATTGAAAT	91593

CU151875.4	1351	TGATCGTCAAAATCTAGTTTTCGAGAAATGGTATCAAGCACATTATCAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91594	TGATCGTCAAAATCTAGTTTTCGAGAAATGGTATCAAGCACATTATCAGG	91643

CU151875.4	1401	AAGTTGGCTGAAGTCAACGACGTTTTCCGCTTCTTTCCCTTCTACAATGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91644	AAGTTGGCTGAAGTCAACGACGTTTTCCGCTTCTTTCCCTTCTACAATGA	91693

CU151875.4	1451	CAATGTTAGGTTACAATTTCAATAATATGAGTACATATATATTTTTTATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91694	CAATGTTAGGTTACAATTTCAATAATATGAGTACATATATATTTTTTATT	91743

CU151875.4	1501	CATCTATCTAATAATATCATAGAAAATCGTGAGATAAGGAAATATTTAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91744	CATCTATCTAATAATATCATAGAAAATCGTGAGATAAGGAAATATTTAAA	91793

CU151875.4	1551	GACAATATACAATAATCATAAGAAAGATCTTTTATTAAAAAGAAGGCAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91794	GACAATATACAATAATCATAAGAAAGATCTTTTATTAAAAAGAAGGCAAC	91843

CU151875.4	1601	AAGTCAACCACTAAACCAAAATGAAACACAATTCTGGTATTTCTGAACCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91844	AAGTCAACCACTAAACCAAAATGAAACACAATTCTGGTATTTCTGAACCA	91893

CU151875.4	1651	TCTCATTGAGTGTCAAGGATTCGTGATGATTTCTAATTTATCATTCTATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91894	TCTCATTGAGTGTCAAGGATTCGTGATGATTTCTAATTTATCATTCTATC	91943

CU151875.4	1701	ATATTATTGGTAAATACGAAGTAAAATCACGTTTTTCTCATAACATGCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91944	ATATTATTGGTAAATACGAAGTAAAATCACGTTTTTCTCATAACATGCTT	91993

CU151875.4	1751	TGACATGAATGGTAATATAGCTCATATAGGAGTAAAATAATCCTTCAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	91994	TGACATGAATGGTAATATAGCTCATATAGGAGTAAAATAATCCTTCAAAA	92043

CU151875.4	1801	TAAAACTACAATAATTACAAACAACTTGTAGTAAACTTGGGATATTTTGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	92044	TAAAACTACAATAATTACAAACAACTTGTAGTAAACTTGGGATATTTTGC	92093

CU151875.4	1851	AGGGCAAATTCTATGGTACACCCAATAAATTTGGGTGTATCAGTACACCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	92094	AGGGCAAATTCTATGGTACACCCAATAAATTTGGGTGTATCAGTACACCA	92143

CU151875.4	1901	AGTCGTAAAATTAATAATAAATGAGTTGTTTTTTTGAAGAAAAATAATTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	92144	AGTCGTAAAATTAATAATAAATGAGTTGTTTTTTTGAAGAAAAATAATTA	92193

CU151875.4	1951	TTTTTTATCATTGACAACTAAGATAATTAAATTTTATTTACCAAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967319.2	92194	TTTTTTATCATTGACAACTAAGATAATTAAATTTTATTTACCAAAAGCTT	92243

Overview

Query
CU151875.4 - 44766 bps
Hit
CT967319.2 - 92243 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001902200012000190244922431
286.42676129550216315178200794801
392.41437574597533180612806901
Short-link