<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207236.5	1	TTCAAATATATGAAATGAGACTAAAATGGTTCTTCCATTAAGCTTTCTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	12751	TTCAAATATATGAAATGAGACTAAAATGGTTCTTCCATTAAGCTTTCTGT	12800

CU207236.5	51	GAGATCAACTTTGACCATTTTTTATGTTACTTCAAATCTTTGGATTCGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	12801	GAGATCAACTTTGACCATTTTTTATGTTACTTCAAATCTTTGGATTCGGA	12850

CU207236.5	101	AGACTGATTTGATGTTACAAATTTTTGAAGCACCAAATTGAGGTCTAAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	12851	AGACTGATTTGATGTTACAAATTTTTGAAGCACCAAATTGAGGTCTAAAG	12900

CU207236.5	151	TATAGGATCAAAATGATAACTTAGGGCTTATTTGGGTTGACTTATTTGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	12901	TATAGGATCAAAATGATAACTTAGGGCTTATTTGGGTTGACTTATTTGAG	12950

CU207236.5	201	TTTATTTTACTTGTGAGATTGTTTGAGAGAGTTTATGGAAACAACTTATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	12951	TTTATTTTACTTGTGAGATTGTTTGAGAGAGTTTATGGAAACAACTTATT	13000

CU207236.5	251	ACATGCCCATTAAGTTGTTTTCAGTTAATTTCCATAGGCTCTCTATAGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13001	ACATGCCCATTAAGTTGTTTTCAGTTAATTTCCATAGGCTCTCTATAGGA	13050

CU207236.5	301	TAGCTTATGAAAAACAAGATCTAGTTTATATGAAAATAGTTTGACTTTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13051	TAGCTTATGAAAAACAAGATCTAGTTTATATGAAAATAGTTTGACTTTAT	13100

CU207236.5	351	TTATCTTTTGTTATTGAATTAGCTTATACGTAAGCACATATATGAGAAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13101	TTATCTTTTGTTATTGAATTAGCTTATACGTAAGCACATATATGAGAAGC	13150

CU207236.5	401	TCTTAATTAAGTTTGTGTGTGTCTAAACACCAAAAGAGAAGAGTTTGCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13151	TCTTAATTAAGTTTGTGTGTGTCTAAACACCAAAAGAGAAGAGTTTGCTG	13200

CU207236.5	451	ATGACATTGTTTCACATTGCACCTGCAGGCTGTTCTGTGAATTTTGAGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13201	ATGACATTGTTTCACATTGCACCTGCAGGCTGTTCTGTGAATTTTGAGTT	13250

CU207236.5	501	TCTAAACTACACAATAATCACAAGCAAATGTAAAGGACCTAAGTACCCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13251	TCTAAACTACACAATAATCACAAGCAAATGTAAAGGACCTAAGTACCCTC	13300

CU207236.5	551	CCAAGGAATGTTGTGGATCATTTAAAGAGTTTGCTTGCCCTTATGCTGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13301	CCAAGGAATGTTGTGGATCATTTAAAGAGTTTGCTTGCCCTTATGCTGAC	13350

CU207236.5	601	GTGATAAATGATTTAACAAACGATTGTGCCTCAACCATGTTTAGCTACAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13351	GTGATAAATGATTTAACAAACGATTGTGCCTCAACCATGTTTAGCTACAT	13400

CU207236.5	651	TAATCTTTATGGAAGATACCCTCCTGGCCTCTTTGCGAGCGAGTGTCGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13401	TAATCTTTATGGAAGATACCCTCCTGGCCTCTTTGCGAGCGAGTGTCGTG	13450

CU207236.5	701	AAGGGAAGGAAGGCCTAGCATGTGATGCATTGCCACCATCAGTGTCCGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13451	AAGGGAAGGAAGGCCTAGCATGTGATGCATTGCCACCATCAGTGTCCGCC	13500

CU207236.5	751	GATGATACTGCAAATCAAATCGTACATACTCCATCTCTAGTGCTGGTTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13501	GATGATACTGCAAATCAAATCGTACATACTCCATCTCTAGTGCTGGTTCT	13550

CU207236.5	801	CACAGCCTGCATCTTCCTAATCTTGTTATTCTAATATCTCAATATCTCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13551	CACAGCCTGCATCTTCCTAATCTTGTTATTCTAATATCTCAATATCTCAA	13600

CU207236.5	851	CTTCAATTCATTTGTTGCAGTGCTTTGCATTGTTGTATTATCAGTGAACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13601	CTTCAATTCATTTGTTGCAGTGCTTTGCATTGTTGTATTATCAGTGAACA	13650

CU207236.5	901	TATTTATTTATATAACATGTTCGTTATTGTTGATGCGGGTTGATTATGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13651	TATTTATTTATATAACATGTTCGTTATTGTTGATGCGGGTTGATTATGCT	13700

CU207236.5	951	AGAGCTGAAACTCGAGCTTGTACTTATATATAGTTACCATATAGTTACCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13701	AGAGCTGAAACTCGAGCTTGTACTTATATATAGTTACCATATAGTTACCT	13750

CU207236.5	1001	ATGTTGTATTTGAGTGTTGTTTAGAGATTGCAAGTTTTGTTGGATCTTGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13751	ATGTTGTATTTGAGTGTTGTTTAGAGATTGCAAGTTTTGTTGGATCTTGT	13800

CU207236.5	1051	GTTCTCTGCAAATGAAGAGTAATATTTTATGTAGAATAGGTTTGTGTGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13801	GTTCTCTGCAAATGAAGAGTAATATTTTATGTAGAATAGGTTTGTGTGAA	13850

CU207236.5	1101	TTAATTTTTTAGAATCTGGATTTAAACTACTGCGATCAATTGATTTAAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13851	TTAATTTTTTAGAATCTGGATTTAAACTACTGCGATCAATTGATTTAAGC	13900

CU207236.5	1151	CCTTGGATAGAGATCAGTTGACTCACATCGTGACCTCGACAAATTGAGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13901	CCTTGGATAGAGATCAGTTGACTCACATCGTGACCTCGACAAATTGAGTG	13950

CU207236.5	1201	TTTTTTTTCTTCTTTTTCGGATAGAAAAATGTAAGTTTTGGGAAGCAGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	13951	TTTTTTTTCTTCTTTTTCGGATAGAAAAATGTAAGTTTTGGGAAGCAGAT	14000

CU207236.5	1251	TTTCTGCTGTAACAGCAGGGTGCTGTAAAGCATCCGAGCTGTCCGGTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14001	TTTCTGCTGTAACAGCAGGGTGCTGTAAAGCATCCGAGCTGTCCGGTCAG	14050

CU207236.5	1301	AATTGTACGGCCATGATCCGGGTCTGCTCACCAATTGTTCTGATGTCGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14051	AATTGTACGGCCATGATCCGGGTCTGCTCACCAATTGTTCTGATGTCGAT	14100

CU207236.5	1351	GTTCGTTCTTCATCAACAATTGGCAATTTGGCATCATTGACAGATTGAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14101	GTTCGTTCTTCATCAACAATTGGCAATTTGGCATCATTGACAGATTGAAT	14150

CU207236.5	1401	CAAATCTATTTCCAAAATTTAAGTGTGTACTTGTGATTTAAAGAGATATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14151	CAAATCTATTTCCAAAATTTAAGTGTGTACTTGTGATTTAAAGAGATATC	14200

CU207236.5	1451	AACCTATTATTCACTTAAATTATGTGTGCCAAATGAGCCTTGAGCAAATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14201	AACCTATTATTCACTTAAATTATGTGTGCCAAATGAGCCTTGAGCAAATG	14250

CU207236.5	1501	AAATTACTCAAATTAGTTTCTCATGCTTTGTTATTCAGGTAAAGAAAATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14251	AAATTACTCAAATTAGTTTCTCATGCTTTGTTATTCAGGTAAAGAAAATG	14300

CU207236.5	1551	CTTCATACATAACCCGTGTAGAATGTGGATATCATAGCAAGGACTCTACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14301	CTTCATACATAACCCGTGTAGAATGTGGATATCATAGCAAGGACTCTACA	14350

CU207236.5	1601	TAACAAGGATTTGTACCTACGCAAACTAGGAACGTGAAGGAAACATATAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14351	TAACAAGGATTTGTACCTACGCAAACTAGGAACGTGAAGGAAACATATAA	14400

CU207236.5	1651	AATTATAGGAATTAGGTGGATTTCATATCTAAACGAGGTTGACAACAAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14401	AATTATAGGAATTAGGTGGATTTCATATCTAAACGAGGTTGACAACAAGT	14450

CU207236.5	1701	TCTTTTAAAGTTGACCATTTCTTCCTCTGTTAGAGGTGTTCCAGAAATGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14451	TCTTTTAAAGTTGACCATTTCTTCCTCTGTTAGAGGTGTTCCAGAAATGT	14500

CU207236.5	1751	CTTTGATAAACAAGTAAATGACTCTGAAAGAATGAATGTATTATTCAAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14501	CTTTGATAAACAAGTAAATGACTCTGAAAGAATGAATGTATTATTCAAAC	14550

CU207236.5	1801	ATTTGTAAATATTTTAACAACCTTAATTAGCTTTCATAAAATTTTGTTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14551	ATTTGTAAATATTTTAACAACCTTAATTAGCTTTCATAAAATTTTGTTGA	14600

CU207236.5	1851	AGTAATTTGGAAAAGTTGCAAAAATTCACTAGTTAAAAGGATCCACTTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14601	AGTAATTTGGAAAAGTTGCAAAAATTCACTAGTTAAAAGGATCCACTTAA	14650

CU207236.5	1901	CATTTCTTTTGAAAAAAATAAAATGAAACTGCATATTACGTCAATAGTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14651	CATTTCTTTTGAAAAAAATAAAATGAAACTGCATATTACGTCAATAGTAT	14700

CU207236.5	1951	TCTGTCACATCTTGATGTCTGCAGATGAGGAGAAGAGAATATGGAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT967313.3	14701	TCTGTCACATCTTGATGTCTGCAGATGAGGAGAAGAGAATATGGAAGCTT	14750

Overview

Query
CU207236.5 - 81964 bps
Hit
CT967313.3 - 14750 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001919200012000112751147501
Short-link