<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 6444 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

  AC125389.33	136572	AAGCTTGATAAACTTGCAATTTGATTAAATGATTGCTAACATTTCTTTCA	136621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	134090	AAGCTTGATAAACTTGCAATTTGATTAAATGATTGCTAACATTTCTTTCA	134041

  AC125389.33	136622	CTATGTAGGGAAATGTGGAGTAGTTTTTGCCTCTATTCCACCTGCAATTG	136671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	134040	CTATGTAGGGAAATGTGGAGTAGTTTTTGCCTCTATTCCACCTGCAATTG	133991

  AC125389.33	136672	TTGATGTCATATACATCGTCAATATAAAGACTTATAAGACTGTCAATTAA	136721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133990	TTGATGTCATATACATCGTCAATATAAAGACTTATAAGACTGTCAATTAA	133941

  AC125389.33	136722	TCATACTTACACTAATTGTTTTTTTGTGATAGTAGTTCAATGATATAATC	136771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133940	TCATACTTACACTAATTGTTTTTTTGTGATAGTAGTTCAATGATATAATC	133891

  AC125389.33	136772	AACGTGCCATTTCAATCAAAATCATTTGTTGCGGATGTTGCAGCATATTT	136821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133890	AACGTGCCATTTCAATCAAAATCATTTGTTGCGGATGTTGCAGCATATTT	133841

  AC125389.33	136822	CCTCGACAACACTTAAATAAGAAGGATTCATCTATTAAAAATGACAAAGA	136871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133840	CCTCGACAACACTTAAATAAGAAGGATTCATCTATTAAAAATGACAAAGA	133791

  AC125389.33	136872	CAAACATTCATGGGACAATTACATGTCTTTCAAGGGTAACATAATAAGTG	136921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133790	CAAACATTCATGGGACAATTACATGTCTTTCAAGGGTAACATAATAAGTG	133741

  AC125389.33	136922	AGAAGTTCTATTCAGTACCTTTCAATCTAAACAAATAGTTTCCCTCAGTT	136971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133740	AGAAGTTCTATTCAGTACCTTTCAATCTAAACAAATAGTTTCCCTCAGTT	133691

  AC125389.33	136972	TAATTGTGTAGCACATGAAGAGCGATAAGATAAAGTGTTTCATCTTCATC	137021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133690	TAATTGTGTAGCACATGAAGAGCGATAAGATAAAGTGTTTCATCTTCATC	133641

  AC125389.33	137022	AAAGTTTAGTTATGATATAAGGTCGAACTATTTTTTAAAAGGATAAGATT	137071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133640	AAAGTTTAGTTATGATATAAGGTCGAACTATTTTTTAAAAGGATAAGATT	133591

  AC125389.33	137072	GTAATATATTTACTTATTTTCTTGTCGATGTTTGCTGCAAATTCTGATCA	137121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133590	GTAATATATTTACTTATTTTCTTGTCGATGTTTGCTGCAAATTCTGATCA	133541

  AC125389.33	137122	ACATAGTGGATTGACTGCTTAATTTCCTTCATTTGATTTTTGTCATATTC	137171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133540	ACATAGTGGATTGACTGCTTAATTTCCTTCATTTGATTTTTGTCATATTC	133491

  AC125389.33	137172	ACTTCAAATTCCACATGCACGCACGCACGAGCGTACGCACACAATTTTTA	137221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133490	ACTTCAAATTCCACATGCACGCACGCACGAGCGTACGCACACAATTTTTA	133441

  AC125389.33	137222	AATAGGTCGTTTTCTTTTTATTTAAAAAAAACAACATATTAATTCAGTTT	137271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133440	AATAGGTCGTTTTCTTTTTATTTAAAAAAAACAACATATTAATTCAGTTT	133391

  AC125389.33	137272	TTATTAAGGGCTTGTATTTTTTTTTGCGAAAAAAAAATTGTCTAGTCTTT	137321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133390	TTATTAAGGGCTTGTATTTTTTTTTGCGAAAAAAAAATTGTCTAGTCTTT	133341

  AC125389.33	137322	GGAGCACACAACATAATAATTCAGCTTTTATCGTGGCACATGATGGCGAA	137371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133340	GGAGCACACAACATAATAATTCAGCTTTTATCGTGGCACATGATGGCGAA	133291

  AC125389.33	137372	AGAAACTACTGAGTTGCCGTGCACGGTTCAACCAGCAGAACTGATGATCG	137421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133290	AGAAACTACTGAGTTGCCGTGCACGGTTCAACCAGCAGAACTGATGATCG	133241

  AC125389.33	137422	AAATCCTTTTGAGGGTGGAGTCAGACAATCCTCTACAATTAAGGTGTGTT	137471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133240	AAATCCTTTTGAGGGTGGAGTCAGACAATCCTCTACAATTAAGGTGTGTT	133191

  AC125389.33	137472	TGCAAGTTGTGGAAGTCGCTCCTTGTTGATCCTCAATTCATGGAGAATCA	137521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133190	TGCAAGTTGTGGAAGTCGCTCCTTGTTGATCCTCAATTCATGGAGAATCA	133141

  AC125389.33	137522	CATTCTTAGACCGACCACTAACATATGTGATCTACTGAACAAGACTCTTG	137571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133140	CATTCTTAGACCGACCACTAACATATGTGATCTACTGAACAAGACTCTTG	133091

  AC125389.33	137572	AACACTACCATACTTTCAAATTGTAGTATATTACAAATAACCTGGTTCGC	137621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133090	AACACTACCATACTTTCAAATTGTAGTATATTACAAATAACCTGGTTCGC	133041

  AC125389.33	137622	GTCAAGAAGATGGAGTAGTTTTTGCCTCTATTCCACCTGCAATTGTTTTT	137671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	133040	GTCAAGAAGATGGAGTAGTTTTTGCCTCTATTCCACCTGCAATTGTTTTT	132991

  AC125389.33	137672	TTGAACAAGTTCCACCTGCAATTGTTGATGTCATGTACCTCTTATTCTTT	137721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132990	TTGAACAAGTTCCACCTGCAATTGTTGATGTCATGTACCTCTTATTCTTT	132941

  AC125389.33	137722	TCTTATGTTGACATGTTTGATTTTAATTCTAGATAAGATAAACTTGAACA	137771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132940	TCTTATGTTGACATGTTTGATTTTAATTCTAGATAAGATAAACTTGAACA	132891

  AC125389.33	137772	TGTATATATACCTTTATTTATTATGATACTTAAAAGGAAAAACCATATAA	137821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132890	TGTATATATACCTTTATTTATTATGATACTTAAAAGGAAAAACCATATAA	132841

  AC125389.33	137822	TGTTATTATTTTCATTCATCACTAGTTACAAACCCGTGCTTCGCACGAGT	137871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132840	TGTTATTATTTTCATTCATCACTAGTTACAAACCCGTGCTTCGCACGAGT	132791

  AC125389.33	137872	TGAATAACGTATTCTGTAAAAAAAACTTTAAAGAAAATACAGTTTTGAGA	137921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132790	TGAATAACGTATTCTGTAAAAAAAACTTTAAAGAAAATACAGTTTTGAGA	132741

  AC125389.33	137922	CAATATCAAAAATACTCATGATTAAAAAGATAATCTTTAGCCACCTACCT	137971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132740	CAATATCAAAAATACTCATGATTAAAAAGATAATCTTTAGCCACCTACCT	132691

  AC125389.33	137972	CTAGCAAAACCAAATTGTTTTCACTATTTTTAATAAAAGACCAAGTAGGT	138021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132690	CTAGCAAAACCAAATTGTTTTCACTATTTTTAATAAAAGACCAAGTAGGT	132641

  AC125389.33	138022	ATAGAGCTATATTTGACAACTTTCCAAAAAGAAAAAAGAGAAGTGCTATT	138071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132640	ATAGAGCTATATTTGACAACTTTCCAAAAAGAAAAAAGAGAAGTGCTATT	132591

  AC125389.33	138072	GCACATAACATTTTCTCTAACATAAGAAGTTAATGAGAAAAATCACCATA	138121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132590	GCACATAACATTTTCTCTAACATAAGAAGTTAATGAGAAAAATCACCATA	132541

  AC125389.33	138122	GTATCATCACTGGCAAAATATCCATTGACTAAAGGACTGATAAAAGGAAG	138171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132540	GTATCATCACTGGCAAAATATCCATTGACTAAAGGACTGATAAAAGGAAG	132491

  AC125389.33	138172	ACCACACAAAAGATTCAAATTTCATTAGCAATCCTATTGTCATTAGCAGA	138221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132490	ACCACACAAAAGATTCAAATTTCATTAGCAATCCTATTGTCATTAGCAGA	132441

  AC125389.33	138222	CACAGCTTGTGCACACATAACCAAAAGGGTCCTCAAATCCACAACATCCC	138271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132440	CACAGCTTGTGCACACATAACCAAAAGGGTCCTCAAATCCACAACATCCC	132391

  AC125389.33	138272	TCTTCCTCCCTTGTTTCTTCGAACGCGCCTTCCCTCCATCAAGTTCACCA	138321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132390	TCTTCCTCCCTTGTTTCTTCGAACGCGCCTTCCCTCCATCAAGTTCACCA	132341

  AC125389.33	138322	ACCTGTGTTCTACTCTCCACCACTGATCCATCCTTTTGTTCAGCACACAA	138371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132340	ACCTGTGTTCTACTCTCCACCACTGATCCATCCTTTTGTTCAGCACACAA	132291

  AC125389.33	138372	CGATACATTTTCTTTTTGTAAGTTGCATGACCAATGAATTCAAATTTCTG	138421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132290	CGATACATTTTCTTTTTGTAAGTTGCATGACCAATGAATTCAAATTTCTG	132241

  AC125389.33	138422	TACATACCAGATGCACCATGTAGAACTTGTAGCAAAAAACATTTTACGCT	138471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132240	TACATACCAGATGCACCATGTAGAACTTGTAGCAAAAAACATTTTACGCT	132191

  AC125389.33	138472	AAAGTTTCAATTCCACAACAAAAAGTTGAAAGTTGAAAATGAGCTATAAA	138521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132190	AAAGTTTCAATTCCACAACAAAAAGTTGAAAGTTGAAAATGAGCTATAAA	132141

  AC125389.33	138522	GTGTTTTATCTTCATCAAAGTTTAGTTATGATTTAAGATCGAACTGTTTT	138571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132140	GTGTTTTATCTTCATCAAAGTTTAGTTATGATTTAAGATCGAACTGTTTT	132091

  AC125389.33	138572	TTTTTTAAAGGATAAGATTGTAATATATATATTTATTTTCTTGTCGATGT	138621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132090	TTTTTTAAAGGATAAGATTGTAATATATATATTTATTTTCTTGTCGATGT	132041

  AC125389.33	138622	TTGCTACAAATTTTGATCAACAGAGTGGATTGACTACTTAATTTCCTTCA	138671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	132040	TTGCTACAAATTTTGATCAACAGAGTGGATTGACTACTTAATTTCCTTCA	131991

  AC125389.33	138672	TTTGATTTTTGTCATATTCACTTCAAATTCCGCATGCACGCACGCACGCA	138721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131990	TTTGATTTTTGTCATATTCACTTCAAATTCCGCATGCACGCACGCACGCA	131941

  AC125389.33	138722	CTTGCGTACGCACACAATTTTAAAAAAACAACATAATAATTCAGTTTTTA	138771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131940	CTTGCGTACGCACACAATTTTAAAAAAACAACATAATAATTCAGTTTTTA	131891

  AC125389.33	138772	TTAAGGTTGAAAATTTAAAAAATGTTATTTTCAATACAACAATTTTTTTA	138821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131890	TTAAGGTTGAAAATTTAAAAAATGTTATTTTCAATACAACAATTTTTTTA	131841

  AC125389.33	138822	TTTCCTAATTAACAAGTGTTTTAAGAGCACATGGTATCCTATTGGAGGTG	138871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131840	TTTCCTAATTAACAAGTGTTTTAAGAGCACATGGTATCCTATTGGAGGTG	131791

  AC125389.33	138872	ATTGCGTTTGCAAATTCATTAGAGTGGTAACAATAAATGGAAACTCCAAA	138921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131790	ATTGCGTTTGCAAATTCATTAGAGTGGTAACAATAAATGGAAACTCCAAA	131741

  AC125389.33	138922	TCATAGCCCATATAATTTTGTCAAAAATAAACCAATCTATTACAATGATA	138971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131740	TCATAGCCCATATAATTTTGTCAAAAATAAACCAATCTATTACAATGATA	131691

  AC125389.33	138972	AGCAATTTAGTTATGGTAGTGCATATATACATCACATATTTTTGCATCAA	139021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131690	AGCAATTTAGTTATGGTAGTGCATATATACATCACATATTTTTGCATCAA	131641

  AC125389.33	139022	AATCAAAAAGCCTCCAAAGCTCCACCTAATGCAAATATATCACAATCTTC	139071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131640	AATCAAAAAGCCTCCAAAGCTCCACCTAATGCAAATATATCACAATCTTC	131591

  AC125389.33	139072	AGTGTTGCACCAAGCTCGATGATCATGACCATTTTTACATCCACACTTGT	139121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131590	AGTGTTGCACCAAGCTCGATGATCATGACCATTTTTACATCCACACTTGT	131541

  AC125389.33	139122	TCCAATTATTCAATCTCCTCTTATTTTGCTTCTCCATCTCCGCAACCGAA	139171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131540	TCCAATTATTCAATCTCCTCTTATTTTGCTTCTCCATCTCCGCAACCGAA	131491

  AC125389.33	139172	GCTACTTTTATTTTAATCTCCACTTCCACCTACGGCGTTATGAATATACC	139221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131490	GCTACTTTTATTTTAATCTCCACTTCCACCTACGGCGTTATGAATATACC	131441

  AC125389.33	139222	CTCTTTGCAATCACTTCCACTCAACAAATCCATCTTCAACCATTTTTTTA	139271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131440	CTCTTTGCAATCACTTCCACTCAACAAATCCATCTTCAACCATTTTTTTA	131391

  AC125389.33	139272	ACTCCATGTTTTGTGATTCAAGAATCACTTTCCATGGAATCTCACCTTTT	139321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131390	ACTCCATGTTTTGTGATTCAAGAATCACTTTCCATGGAATCTCACCTTTT	131341

  AC125389.33	139322	CCAATAAGTTGTGACCCCCACATCTTCCTTTGCCTTAGCTCCAACACTAG	139371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131340	CCAATAAGTTGTGACCCCCACATCTTCCTTTGCCTTAGCTCCAACACTAG	131291

  AC125389.33	139372	GCTTTGTTGGTTAACCAAGAATTCTTGGGCACAAGAACAATCAAGATTAA	139421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131290	GCTTTGTTGGTTAACCAAGAATTCTTGGGCACAAGAACAATCAAGATTAA	131241

  AC125389.33	139422	AAGATTCATCCCAAAAGGGCACTGATTTGGTAGAAACATTTTAGCCGTTG	139471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131240	AAGATTCATCCCAAAAGGGCACTGATTTGGTAGAAACATTTTAGCCGTTG	131191

  AC125389.33	139472	AGTTGAATTCTTTTATTGTTTCCTGTTGGAAGATACAACCTTGCAAACAA	139521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131190	AGTTGAATTCTTTTATTGTTTCCTGTTGGAAGATACAACCTTGCAAACAA	131141

  AC125389.33	139522	GTTTTTCGTGGACTTGATGAATTCGATGTTTCGAGCTTGTATTAATCTCA	139571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131140	GTTTTTCGTGGACTTGATGAATTCGATGTTTCGAGCTTGTATTAATCTCA	131091

  AC125389.33	139572	ATTCACAACTGAAGTTAACATAAGAAGACATATAAGATGGATCCATCGTG	139621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131090	ATTCACAACTGAAGTTAACATAAGAAGACATATAAGATGGATCCATCGTG	131041

  AC125389.33	139622	AATTGAGAATAGCTATGAACGTTTCTTGTTATATGTTGTTGCTAGAAAAA	139671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	131040	AATTGAGAATAGCTATGAACGTTTCTTGTTATATGTTGTTGCTAGAAAAA	130991

  AC125389.33	139672	ACAGAGGAAATTAGATCTAAAGAATATATTGAAGGAGTTTGTTGTTTGAG	139721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130990	ACAGAGGAAATTAGATCTAAAGAATATATTGAAGGAGTTTGTTGTTTGAG	130941

  AC125389.33	139722	TTATAGTTGTTGTGTGTGATGTATTATATAGTGTTTAAAAAGTAATTAAT	139771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130940	TTATAGTTGTTGTGTGTGATGTATTATATAGTGTTTAAAAAGTAATTAAT	130891

  AC125389.33	139772	TAAAGGAAGATGGAAATGCTTTCCAAGAAGCTGCTCTAATCCTTGTGCTT	139821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130890	TAAAGGAAGATGGAAATGCTTTCCAAGAAGCTGCTCTAATCCTTGTGCTT	130841

  AC125389.33	139822	TTTGTGAATATTTTAATACCAAATTAATCTTAAACATGCACATCAGATTG	139871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130840	TTTGTGAATATTTTAATACCAAATTAATCTTAAACATGCACATCAGATTG	130791

  AC125389.33	139872	TTCTAAAGATTTTAATCATATTAAAGAAAACCTTGGAATCTAGAAAGGGT	139921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130790	TTCTAAAGATTTTAATCATATTAAAGAAAACCTTGGAATCTAGAAAGGGT	130741

  AC125389.33	139922	GGATTTTCCAATTCGGATCTTGTCTTGTAACTACAACTCCAAGTTGTAAT	139971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130740	GGATTTTCCAATTCGGATCTTGTCTTGTAACTACAACTCCAAGTTGTAAT	130691

  AC125389.33	139972	GTGGTATTGGGTTTTGATTCAAGAGAGTATCTTAATGCAATCGATTCAAG	140021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130690	GTGGTATTGGGTTTTGATTCAAGAGAGTATCTTAATGCAATCGATTCAAG	130641

  AC125389.33	140022	AGAGTATCTTAATGCAATCTGTAGCTGGGGACCCCAAATTATAGAAGATT	140071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130640	AGAGTATCTTAATGCAATCTGTAGCTGGGGACCCCAAATTATAGAAGATT	130591

  AC125389.33	140072	AGAATAATTACAAGGTTTTTAGTGTGCTAAACTAAAAGCAATCGAAAACA	140121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130590	AGAATAATTACAAGGTTTTTAGTGTGCTAAACTAAAAGCAATCGAAAACA	130541

  AC125389.33	140122	CTCTCAAAAAAAATAAAAGGTTAATAGTGTTTTTCAACCCTATAAAATTT	140171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130540	CTCTCAAAAAAAATAAAAGGTTAATAGTGTTTTTCAACCCTATAAAATTT	130491

  AC125389.33	140172	TCGGTTTGGTTTTCGTCCTCGTAATTTTTTTTTTTGTCCGGAAAACCCCC	140221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130490	TCGGTTTGGTTTTCGTCCTCGTAATTTTTTTTTTTGTCCGGAAAACCCCC	130441

  AC125389.33	140222	CTCCCCCATCTAACTCAGCAGATTTGCTTATGTGGCGCTGAGTTGACATC	140271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130440	CTCCCCCATCTAACTCAGCAGATTTGCTTATGTGGCGCTGAGTTGACATC	130391

  AC125389.33	140272	TTTTTTTCGTTTTTTATTTTTTTTAATTTACCACATGGAAAAAAACATTT	140321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130390	TTTTTTTCGTTTTTTATTTTTTTTAATTTACCACATGGAAAAAAACATTT	130341

  AC125389.33	140322	CCACATCAGATTTTATTTAAAAAAATCCAAAAAATAAAAAATCAGAAAAA	140371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130340	CCACATCAGATTTTATTTAAAAAAATCCAAAAAATAAAAAATCAGAAAAA	130291

  AC125389.33	140372	TATTCAGATTTTTTTCAAAAAAATAAGAATATTTTCTAAAATAAAAAAAA	140421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130290	TATTCAGATTTTTTTCAAAAAAATAAGAATATTTTCTAAAATAAAAAAAA	130241

  AC125389.33	140422	TAAGAAATTATGAATAAGAATAATTTCAAAAAAAGATGTTTTTTTGAAAT	140471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130240	TAAGAAATTATGAATAAGAATAATTTCAAAAAAAGATGTTTTTTTGAAAT	130191

  AC125389.33	140472	TTAAAAAATTAGTTTTTTTAAGAAATTATGAAGATTTTTTAAATTTGTGG	140521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130190	TTAAAAAATTAGTTTTTTTAAGAAATTATGAAGATTTTTTAAATTTGTGG	130141

  AC125389.33	140522	AATTTAATAGGTTTTTTTTTCTGATAAAACAATTATTACCAATTTTTTTT	140571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130140	AATTTAATAGGTTTTTTTTTCTGATAAAACAATTATTACCAATTTTTTTT	130091

  AC125389.33	140572	TGTATTTATATTTTTTTTTCTAAAATTTTAAAAATCAGAAAAAACTATAA	140621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130090	TGTATTTATATTTTTTTTTCTAAAATTTTAAAAATCAGAAAAAACTATAA	130041

  AC125389.33	140622	TTTTTTTTTCCAAATTAAAAAAATTAGAAAAAAAATCTGAAAATATATTT	140671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	130040	TTTTTTTTTCCAAATTAAAAAAATTAGAAAAAAAATCTGAAAATATATTT	129991

  AC125389.33	140672	AGATTTTTTTCGAAATTAAAATATTCTGGAGTTTAATTTTCAAAATTTAA	140721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129990	AGATTTTTTTCGAAATTAAAATATTCTGGAGTTTAATTTTCAAAATTTAA	129941

  AC125389.33	140722	AAATATAATCGGATTTTTTTCTACACAAAAAAAATTTGGATACAAATTTA	140771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129940	AAATATAATCGGATTTTTTTCTACACAAAAAAAATTTGGATACAAATTTA	129891

  AC125389.33	140772	GAAAAATATTCAATTTTTTTTCGAAAATTTTATAAAATATTTTTCCTGAA	140821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129890	GAAAAATATTCAATTTTTTTTCGAAAATTTTATAAAATATTTTTCCTGAA	129841

  AC125389.33	140822	TTTTTTTTCTAGTTTTTACAATTTTTTTATTTTCAAAAATTAAAATTTTA	140871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129840	TTTTTTTTCTAGTTTTTACAATTTTTTTATTTTCAAAAATTAAAATTTTA	129791

  AC125389.33	140872	ATATAAATAAATTAATATTATTTTTTTGATTTTTAAAAATTAAATTTAAG	140921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129790	ATATAAATAAATTAATATTATTTTTTTGATTTTTAAAAATTAAATTTAAG	129741

  AC125389.33	140922	AATCCAAAAATTGAAGACGATAATCAGTTTTGGATTGAACTTTAAATCCG	140971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129740	AATCCAAAAATTGAAGACGATAATCAGTTTTGGATTGAACTTTAAATCCG	129691

  AC125389.33	140972	TTTCGAAAAATGAAGGTGAAATGAAGAGGAAACATTCTAGTGATGCCATG	141021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129690	TTTCGAAAAATGAAGGTGAAATGAAGAGGAAACATTCTAGTGATGCCATG	129641

  AC125389.33	141022	TGTCATTCTTCTTTTATCGAAGTAGAATGGCATCACATACTTCGGTAGAT	141071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129640	TGTCATTCTTCTTTTATCGAAGTAGAATGGCATCACATACTTCGGTAGAT	129591

  AC125389.33	141072	GAAGACACTTCAAGAGATGATGCCAGATTTCAGCACACCTTTATCAAAGT	141121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129590	GAAGACACTTCAAGAGATGATGCCAGATTTCAGCACACCTTTATCAAAGT	129541

  AC125389.33	141122	AGAATGAAATCTTGCACGTCTCGGTAGATGAAAACGCTTGCTTCAATAGA	141171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129540	AGAATGAAATCTTGCACGTCTCGGTAGATGAAAACGCTTGCTTCAATAGA	129491

  AC125389.33	141172	GCGATTCCACATGTCATCACTTTTTTATCGTAGTAGAATGACATCTTGGA	141221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129490	GCGATTCCACATGTCATCACTTTTTTATCGTAGTAGAATGACATCTTGGA	129441

  AC125389.33	141222	CTTTGGTAGATGAAGACTCTCCAACTGTTCGATGACAGTGTCATGACTTC	141271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129440	CTTTGGTAGATGAAGACTCTCCAACTGTTCGATGACAGTGTCATGACTTC	129391

  AC125389.33	141272	TTTTATTGAAGTAGAATGACATCTTTGGTTTTCATCGATGAAGTCGCCTC	141321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129390	TTTTATTGAAGTAGAATGACATCTTTGGTTTTCATCGATGAAGTCGCCTC	129341

  AC125389.33	141322	ACTAAATTGATGTTGTGCCGTCACTTCTTTTATCAAAGTAGAATGACAAC	141371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129340	ACTAAATTGATGTTGTGCCGTCACTTCTTTTATCAAAGTAGAATGACAAC	129291

  AC125389.33	141372	TTCTACGCCAATAGTTGAAGACACGTGGTTCTATAAAAATAATCTTCAAC	141421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129290	TTCTACGCCAATAGTTGAAGACACGTGGTTCTATAAAAATAATCTTCAAC	129241

  AC125389.33	141422	ACTTAGCACAATTATCAAGTAGGATACCTGTCTCTATAACATTGCCGACT	141471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129240	ACTTAGCACAATTATCAAGTAGGATACCTGTCTCTATAACATTGCCGACT	129191

  AC125389.33	141472	TGGGGGCATCTGTTTTGGACAAGGCCAATGAACAATGCAGATTTCTCCTT	141521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129190	TGGGGGCATCTGTTTTGGACAAGGCCAATGAACAATGCAGATTTCTCCTT	129141

  AC125389.33	141522	CATGAATCCCTATTCCTTCGGTCCACCCTAAGCTAAAGGGTTGCCTTCAA	141571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129140	CATGAATCCCTATTCCTTCGGTCCACCCTAAGCTAAAGGGTTGCCTTCAA	129091

  AC125389.33	141572	AAATATTGTACAACATGTATATATAGAGATCAACCTCTAAGAGAAATGTA	141621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129090	AAATATTGTACAACATGTATATATAGAGATCAACCTCTAAGAGAAATGTA	129041

  AC125389.33	141622	TGCACAGCTAATTCTAGCTATCACTCTCTCAAAATTTTACTGACTTGAGT	141671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	129040	TGCACAGCTAATTCTAGCTATCACTCTCTCAAAATTTTACTGACTTGAGT	128991

  AC125389.33	141672	GTTGCAGGTACTCCCTCGGCTTCACTGGAGATCGTCTGCAGCATCTCTGA	141721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128990	GTTGCAGGTACTCCCTCGGCTTCACTGGAGATCGTCTGCAGCATCTCTGA	128941

  AC125389.33	141722	ACTATTTCTAGATCAAAATTTAAGGTAATAACTTTTTACGTTTCCAAGAT	141771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128940	ACTATTTCTAGATCAAAATTTAAGGTAATAACTTTTTACGTTTCCAAGAT	128891

  AC125389.33	141772	CAATATTGCTTTAGAAGAGGAAAAAAATAGTAATTTAAAATTTAAAAATG	141821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128890	CAATATTGCTTTAGAAGAGGAAAAAAATAGTAATTTAAAATTTAAAAATG	128841

  AC125389.33	141822	ATAATAATTTTATTATGATGGAATAACATGTCGCAGAGACACAGACTATG	141871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128840	ATAATAATTTTATTATGATGGAATAACATGTCGCAGAGACACAGACTATG	128791

  AC125389.33	141872	ATTTTGTAAGCTTGTAGGAAAATTTTGCAATGTTTTCTAATAATAATTAA	141921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128790	ATTTTGTAAGCTTGTAGGAAAATTTTGCAATGTTTTCTAATAATAATTAA	128741

  AC125389.33	141922	TGTACATTATCACAACTAGTGAGTTTAATTAGATAAGAATGCCAACTGAG	141971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128740	TGTACATTATCACAACTAGTGAGTTTAATTAGATAAGAATGCCAACTGAG	128691

  AC125389.33	141972	GGTTCTAGTTTTATTGATGGTGTAGTGGAAGCCAGCATTCAAGGGTTTTA	142021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128690	GGTTCTAGTTTTATTGATGGTGTAGTGGAAGCCAGCATTCAAGGGTTTTA	128641

  AC125389.33	142022	GTTAGTACAAAAACCTTGGTTATTCTAATATTACTTTTGGTGTCCCAGTT	142071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128640	GTTAGTACAAAAACCTTGGTTATTCTAATATTACTTTTGGTGTCCCAGTT	128591

  AC125389.33	142072	ATGGATTGCATTAAGATACTGTGGATTCATAACCCAATACCAAATCAGAC	142121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128590	ATGGATTGCATTAAGATACTGTGGATTCATAACCCAATACCAAATCAGAC	128541

  AC125389.33	142122	TAACAATAGGAAAATTGGAAAATCTAGCCTTTCAAGATTCTAAACTCTAA	142171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128540	TAACAATAGGAAAATTGGAAAATCTAGCCTTTCAAGATTCTAAACTCTAA	128491

  AC125389.33	142172	AGGTTTTCTACAATAAGATATAATATTCAACACAATCTCATGTGCATGAT	142221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128490	AGGTTTTCTACAATAAGATATAATATTCAACACAATCTCATGTGCATGAT	128441

  AC125389.33	142222	ATAAGATTAAGTTGGTAGTAATATATTCGCAAAATGAACAACTGAGATAC	142271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128440	ATAAGATTAAGTTGGTAGTAATATATTCGCAAAATGAACAACTGAGATAC	128391

  AC125389.33	142272	TGGACAAATTTTATATTAGTGTTCAAGGATAAGAGCAGCTTCCTGTAAAG	142321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128390	TGGACAAATTTTATATTAGTGTTCAAGGATAAGAGCAGCTTCCTGTAAAG	128341

  AC125389.33	142322	CATTTCCAATTTACTTTTTCAACACTATATAATACATCACCTACAACAAT	142371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128340	CATTTCCAATTTACTTTTTCAACACTATATAATACATCACCTACAACAAT	128291

  AC125389.33	142372	TCAAACTCAAACCAACCTTTTTCATATTCTTACCTTCAATTTCCTCTCTT	142421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128290	TCAAACTCAAACCAACCTTTTTCATATTCTTACCTTCAATTTCCTCTCTT	128241

  AC125389.33	142422	TTTTCTAGCTAAAACACATAACTAGACAAATTCCTAACTAGCTATACTCT	142471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128240	TTTTCTAGCTAAAACACATAACTAGACAAATTCCTAACTAGCTATACTCT	128191

  AC125389.33	142472	CAATAACTCAATGGATCCATCTCATATAACTGCTTATGTAAATTTCAGCT	142521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128190	CAATAACTCAATGGATCCATCTCATATAACTGCTTATGTAAATTTCAGCT	128141

  AC125389.33	142522	GCGAACTGAGAATAATACAAGCTCGTAACATCGAATTCATCAAGTCCACG	142571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128140	GCGAACTGAGAATAATACAAGCTCGTAACATCGAATTCATCAAGTCCACG	128091

  AC125389.33	142572	AAGAACTTATTTGCAAGGTTGTATCTTCCAACAGGAAACGACAAAAGAAT	142621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128090	AAGAACTTATTTGCAAGGTTGTATCTTCCAACAGGAAACGACAAAAGAAT	128041

  AC125389.33	142622	TCAACTAAACAGCAAAAGTGTTTCCACCAAATCAGTGCCCTTTTGGGACG	142671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	128040	TCAACTAAACAGCAAAAGTGTTTCCACCAAATCAGTGCCCTTTTGGGACG	127991

  AC125389.33	142672	AGTCTTTTAATTTAGACTGCTCATGCCCTCAAGAATTCTTGGAAAACCTT	142721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127990	AGTCTTTTAATTTAGACTGCTCATGCCCTCAAGAATTCTTGGAAAACCTT	127941

  AC125389.33	142722	AATCAACAAAGCCTAGTGTTGGAGCTAAGACAAAGAAAGATATGGGGGTC	142771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127940	AATCAACAAAGCCTAGTGTTGGAGCTAAGACAAAGAAAGATATGGGGGTC	127891

  AC125389.33	142772	ACAACTTATTGGCAAAGGTGACATTCCATGGAAGGTGATTCTTGAAGCAC	142821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127890	ACAACTTATTGGCAAAGGTGACATTCCATGGAAGGTGATTCTTGAAGCAC	127841

  AC125389.33	142822	AAAACATGGAGTTAAAAAAATGGTTGAAAATGGATTTGGTGAGTGGAAGT	142871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127840	AAAACATGGAGTTAAAAAAATGGTTGAAAATGGATTTGGTGAGTGGAAGT	127791

  AC125389.33	142872	GAGTGCAAAGAGGGTATGTTCAGTACACCAGAAGTGGAAGTGGAGATTAA	142921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127790	GAGTGCAAAGAGGGTATGTTCAGTACACCAGAAGTGGAAGTGGAGATTAA	127741

  AC125389.33	142922	AATAAGAGTAGCTTCAGTTGTTGAGATGGAGAAGCAAAATAAGAGGAGAT	142971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127740	AATAAGAGTAGCTTCAGTTGTTGAGATGGAGAAGCAAAATAAGAGGAGAT	127691

  AC125389.33	142972	TGAATAATTGGAATGAGTGTGGATGCAAAAATGGTCATGATCAT	143015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CT967306.8	127690	TGAATAATTGGAATGAGTGTGGATGCAAAAATGGTCATGATCAT	127647

Overview

Query
AC125389.33 - 143015 bps
Hit
CT967306.8 - 134090 bps
Total alignments
36
Best alignment
alignment #1 (HSP: 6444 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100611064441365721430151127647134090-1
294.48821459609096234186768821-1
3828420096542967411884790521
488.3241668512875812944211220401227211
586.7247786612875912962411275161283801
688.0247081012876412957311247051255221
786.434248101287641295731130896131697-1
883.84438102712877412980011173441183471
989.59304812981612986311183731184191
1086.25448012981712989611257481258271
1180.9308912998713007511232561233521
1284.47477103713230713334311274341284511
1387.9551588813233313322011246341255231
1493.1655374513233413307811219831227181
1586.434528551323661332201130895131730-1
1687.3640269613241313310811173441180331
1787.66438113326113334111181871182661
1885.046612713344813357411257481258741
1983.3336841334541335371130553130639-1
2010035371366371366731132994133030-1
2191.031472231370011372231131916132145-1
2210035371376321376681133989134025-1
2391.311452301385171387461133439133661-1
2487.4939368813893213961911220151227041
2583.8639686113895613981611246961255671
2685.2640680713896013976611275161283301
2783.4334677913898813976611173581181351
2884.735813113981413994411228961230271
2982.56328614002414010911257551258371
3081.211162981410341413311123865124156-1
3183.3339841415871416701123524123607-1
3284.4351011821418341430151122169123325-1
3385.357211771418391430151117460118643-1
3476.97331521419471420981125748125908-1
3585.6734868414233214301511308961315721
3688.364126791423371430151124830125518-1
Short-link