<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT010459.8	1	AAGCTTTTGATGTTAGTGAAGGAGATATCTAGATACCGCAATTGCACCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98367	AAGCTTTTGATGTTAGTGAAGGAGATATCTAGATACCGCAATTGCACCAA	98416

CT010459.8	51	ATTGCCAATTGAATCTGGTAATTTAGTGATGTTTGTATACCTCGATAGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98417	ATTGCCAATTGAATCTGGTAATTTAGTGATGTTTGTATACCTCGATAGTG	98466

CT010459.8	101	ATAACACACGCAGCCTTTTTTGTGATGGGAGCAGATCATCAACCACCTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98467	ATAACACACGCAGCCTTTTTTGTGATGGGAGCAGATCATCAACCACCTTG	98516

CT010459.8	151	AAGGATAAGTAGTTTTCATTGAATGAATGGGAGGAAGTGGATAGAAAGCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98517	AAGGATAAGTAGTTTTCATTGAATGAATGGGAGGAAGTGGATAGAAAGCT	98566

CT010459.8	201	TCGCAAGCATTTGAAATTGTATAATTTCTCAAACTTCATGAAAATGTCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98567	TCGCAAGCATTTGAAATTGTATAATTTCTCAAACTTCATGAAAATGTCAT	98616

CT010459.8	251	AGAATTTTTGGTTATATGAGAAGTGACGAACATTTTCAGGGATGTCATCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98617	AGAATTTTTGGTTATATGAGAAGTGACGAACATTTTCAGGGATGTCATCG	98666

CT010459.8	301	CATTCAAGCCTGTAACAACTTTTTCCTGATACGAATGTAGATAAATCATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98667	CATTCAAGCCTGTAACAACTTTTTCCTGATACGAATGTAGATAAATCATT	98716

CT010459.8	351	GACAAGGTCATGCATGACAAACTTTTTTCCACAAGCATCATCGCTTAATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98717	GACAAGGTCATGCATGACAAACTTTTTTCCACAAGCATCATCGCTTAATT	98766

CT010459.8	401	GTTGAATTAATGATCTCAATAACAATTCAGCAAAACAATCATTGCCTAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98767	GTTGAATTAATGATCTCAATAACAATTCAGCAAAACAATCATTGCCTAAT	98816

CT010459.8	451	TCCTCCAAATCTTTTCCCCCTTGAGAACAATCAAGAAAGCCTTCTGCCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98817	TCCTCCAAATCTTTTCCCCCTTGAGAACAATCAAGAAAGCCTTCTGCCAT	98866

CT010459.8	501	CCACAACAAAACCAATTGCTTCCTATCAAGTGGGCAATCCTTGGGAAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98867	CCACAACAAAACCAATTGCTTCCTATCAAGTGGGCAATCCTTGGGAAAAA	98916

CT010459.8	551	TTGAACAATATGCAAAACATCTTTTCAAATGAGAGGGAAGATATTGATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98917	TTGAACAATATGCAAAACATCTTTTCAAATGAGAGGGAAGATATTGATAA	98966

CT010459.8	601	CTCAAATGCAAAGCAGGAAGAATGTAATCATTAGGTAAGTTCCATACATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	98967	CTCAAATGCAAAGCAGGAAGAATGTAATCATTAGGTAAGTTCCATACATT	99016

CT010459.8	651	GCTGTTCAAAATGGATGTCCACTCTGTTACATCTACCTTTGAACGTAGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99017	GCTGTTCAAAATGGATGTCCACTCTGTTACATCTACCTTTGAACGTAGAA	99066

CT010459.8	701	GTCCTCCTATTGTTTTAGCAGCTATTGGCAATCCTCCACACTTTCTTGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99067	GTCCTCCTATTGTTTTAGCAGCTATTGGCAATCCTCCACACTTTCTTGCA	99116

CT010459.8	751	ATCTTCCTGCCTATTTCTTCAAGGGTTGTGTTTGAACTATGGTGAAACTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99117	ATCTTCCTGCCTATTTCTTCAAGGGTTGTGTTTGAACTATGGTGAAACTC	99166

CT010459.8	801	ATCACTACCCAATGCATGCTTTGAGAGTAAAGACCAACAGTCTTCATTCG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99167	ATCACTACCCAATGCATGCTTTGAGAGTAAAGACCAACAGTCTTCATTCG	99216

CT010459.8	851	ATAGAAGTTTTAGTTCATGTATAGGAAATGTGCATGCTACCTTAGCAACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99217	ATAGAAGTTTTAGTTCATGTATAGGAAATGTGCATGCTACCTTAGCAACT	99266

CT010459.8	901	TTTCGTTGGCGCGTTGTTATAATCACCATGCTTCCGGGTTTTCCATCAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99267	TTTCGTTGGCGCGTTGTTATAATCACCATGCTTCCGGGTTTTCCATCAAT	99316

CT010459.8	951	GAAGGGACTTACTAGTTCACCCCAATCATAATAATTGTCATTCCACAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99317	GAAGGGACTTACTAGTTCACCCCAATCATAATAATTGTCATTCCACAAAT	99366

CT010459.8	1001	CATCCAACACAAACAAAAATCTTTTCTCCCTTGATTTTTTCTTTAACGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99367	CATCCAACACAAACAAAAATCTTTTCTCCCTTGATTTTTTCTTTAACGCA	99416

CT010459.8	1051	ACTCGAAGGACATCAAGATTATTGCTATCCCATGTTCTTGAAGTGACCGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99417	ACTCGAAGGACATCAAGATTATTGCTATCCCATGTTCTTGAAGTGACCGA	99466

CT010459.8	1101	TTCAAGGAGAGACTTGGTTACTCTCAAAATATCAAAATCCTCAGACACAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99467	TTCAAGGAGAGACTTGGTTACTCTCAAAATATCAAAATCCTCAGACACAC	99516

CT010459.8	1151	AAGCCCATGCCTTCAAATCAAAATGTTGTTGAACTTTTTCATCATTGTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99517	AAGCCCATGCCTTCAAATCAAAATGTTGTTGAACTTTTTCATCATTGTAA	99566

CT010459.8	1201	ACAAGTTGTGCAAGGGTAGTTTTTCCTAAACCTCCCATGCCCAAAATTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99567	ACAAGTTGTGCAAGGGTAGTTTTTCCTAAACCTCCCATGCCCAAAATTGC	99616

CT010459.8	1251	AACAACACCTATATTATTATGCGATGTGTCTGTCTCTGATAGCAACATGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99617	AACAACACCTATATTATTATGCGATGTGTCTGTCTCTGATAGCAACATGT	99666

CT010459.8	1301	TCATTATAGTGTCTTTATCATCCTTCCTACCCACCATGACAGATTCATTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99667	TCATTATAGTGTCTTTATCATCCTTCCTACCCACCATGACAGATTCATTT	99716

CT010459.8	1351	ACCACTGAACTTGAAGGTGTTCTACGAGAAACTCTACCACTTTTAGTTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99717	ACCACTGAACTTGAAGGTGTTCTACGAGAAACTCTACCACTTTTAGTTTG	99766

CT010459.8	1401	CAGACCAAGTATATCTTTATACTGTGCAAAGAATTGCAGGCTATCACACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99767	CAGACCAAGTATATCTTTATACTGTGCAAAGAATTGCAGGCTATCACACA	99816

CT010459.8	1451	TGACCTTCATTTGAGAATTGATCTCTCTGTAGAAGGTGTTAAAAGGAGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99817	TGACCTTCATTTGAGAATTGATCTCTCTGTAGAAGGTGTTAAAAGGAGAA	99866

CT010459.8	1501	GAAAGGAAGTTCAACACCTGATTAGTTTTGTTTTGAGCTTTTGCATTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99867	GAAAGGAAGTTCAACACCTGATTAGTTTTGTTTTGAGCTTTTGCATTCTC	99916

CT010459.8	1551	CACCTTGCATCGCAGGGAATCATAACTGATTTCATTGAGCAAGTCCTCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99917	CACCTTGCATCGCAGGGAATCATAACTGATTTCATTGAGCAAGTCCTCAG	99966

CT010459.8	1601	CATCAAAGATAGCATCTTTCAAGTCATCAAGCCATTGCTTGACAGAAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	99967	CATCAAAGATAGCATCTTTCAAGTCATCAAGCCATTGCTTGACAGAAGGA	100016

CT010459.8	1651	TTGATGATCTGCTTCTCCTCTGCATCATCCAGCACAACTTGAAGAGTGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100017	TTGATGATCTGCTTCTCCTCTGCATCATCCAGCACAACTTGAAGAGTGAG	100066

CT010459.8	1701	CAGTGTTGTTTTTAACTGCCTCAAGAGTGAGACATTGAGTTTGGTGTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100067	CAGTGTTGTTTTTAACTGCCTCAAGAGTGAGACATTGAGTTTGGTGTTTT	100116

CT010459.8	1751	TGATGTAATCAAGAAACTCTGTTGAAGCAAGTTTCTCAACTAAGGTCTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100117	TGATGTAATCAAGAAACTCTGTTGAAGCAAGTTTCTCAACTAAGGTCTGA	100166

CT010459.8	1801	ACAGTTGCAGAGAGAAAAGCACCTCCTATCATAGTTGCAGCCATCTTCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100167	ACAGTTGCAGAGAGAAAAGCACCTCCTATCATAGTTGCAGCCATCTTCTG	100216

CT010459.8	1851	TTGATCTTGTAAAAGCAAATCAGCAACTAAGGTATGGAAGTTGTAGATAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100217	TTGATCTTGTAAAAGCAAATCAGCAACTAAGGTATGGAAGTTGTAGATAA	100266

CT010459.8	1901	TAGTATGGAATTTTGATGGAAATTAAGAGCTATGAAAGATTTAGGGATAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100267	TAGTATGGAATTTTGATGGAAATTAAGAGCTATGAAAGATTTAGGGATAG	100316

CT010459.8	1951	CAGTAAGGAGCAAAGACTCAAAGAAGACTCGCTTGTGAGTGAATGGATAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT963130.10	100317	CAGTAAGGAGCAAAGACTCAAAGAAGACTCGCTTGTGAGTGAATGGATAA	100366

Overview

Query
CT010459.8 - 128491 bps
Hit
CT963130.10 - 100366 bps
Total alignments
18
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019542000120001983671003661
288.451725283912839186320891391
397.78394524542498188818888621
491.7210415732743430189168893241
597.56324134403480189320893601
692.0712116441624325191003911661
797.359811344884600191171912831
895.45556668466911149067491331
995.4555663549935564149067491331
1091.2335575584555901184057841121
1197.2251725594156012184160842311
1289.83271340605610760166184233882871
1393.012142865611056395196346966311
1490.012537375256415601661965821003351
1510036376612666162189103891391
1689.788913710809010822617306873199-1
1780.211038290212559012849118492787793-1
1881.914435912561312597119946599817-1
Short-link