<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CT010464.7	117153	AAGCTTATAGAAGATAGATATAAACTCATATGAGCAAAATATACATGTTT	117104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	62884	AAGCTTATAGAAGATAGATATAAACTCATATGAGCAAAATATACATGTTT	62933

C  CT010464.7	117103	GATTATATATATTTTTCATAGGCTTACATCGTTGTTTCATAAGTTTATAG	117054
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	62934	GATTATATATATTTTTCATAGGCTTACATCGTTGTTTCATAAGTTTATAG	62983

C  CT010464.7	117053	CGTTTTTCGACAAATTAATTCATGTAGCGTTTTAACTTATAACTTCTCAT	117004
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	62984	CGTTTTTCGACAAATTAATTCATGTAGCGTTTTAACTTATAACTTCTCAT	63033

C  CT010464.7	117003	TTTTTCGTTAATCCAATATTACCTTATCAGTTTTACTCATGTAATAGCTT	116954
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63034	TTTTTCGTTAATCCAATATTACCTTATCAGTTTTACTCATGTAATAGCTT	63083

C  CT010464.7	116953	ATTTTTATAATTTTGAATACTAGCGTATTATAGTTGGTAAAAAAATAAAC	116904
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63084	ATTTTTATAATTTTGAATACTAGCGTATTATAGTTGGTAAAAAAATAAAC	63133

C  CT010464.7	116903	ACTTGTGTATTATTGTTTTATACAAAATTAATATTTTTTAATTATACACA	116854
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63134	ACTTGTGTATTATTGTTTTATACAAAATTAATATTTTTTAATTATACACA	63183

C  CT010464.7	116853	AAATGTCAAAATCATCTTATAAATAAATCATATTGTTTTAAATGCTTAAA	116804
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63184	AAATGTCAAAATCATCTTATAAATAAATCATATTGTTTTAAATGCTTAAA	63233

C  CT010464.7	116803	TTAACTTTTATAATGTTTTTCAATTTTATTTTAAATATTATGTTTATAGT	116754
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63234	TTAACTTTTATAATGTTTTTCAATTTTATTTTAAATATTATGTTTATAGT	63283

C  CT010464.7	116753	TTTAATTTTACAAAATATTAATATTTCATGAAACTGTAAATTAATTTTTT	116704
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63284	TTTAATTTTACAAAATATTAATATTTCATGAAACTGTAAATTAATTTTTT	63333

C  CT010464.7	116703	TTAATTTCTTAATGTTACATAAAATCATAAAAAAATAAATTAATATTACA	116654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63334	TTAATTTCTTAATGTTACATAAAATCATAAAAAAATAAATTAATATTACA	63383

C  CT010464.7	116653	TATAATTACATAATGTATAACAAGTTTGTACCAAAAAATAATAAAATAAT	116604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63384	TATAATTACATAATGTATAACAAGTTTGTACCAAAAAATAATAAAATAAT	63433

C  CT010464.7	116603	CTATAGAAAATGCAATAGGACTAGTTTTAGGAGTATAAATAAAAGGGAAA	116554
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63434	CTATAGAAAATGCAATAGGACTAGTTTTAGGAGTATAAATAAAAGGGAAA	63483

C  CT010464.7	116553	TGTTAACAAGTGTCCCCGGGGCACTTGCTAAGGGAATATAAAAGGAAATA	116504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63484	TGTTAACAAGTGTCCCCGGGGCACTTGCTAAGGGAATATAAAAGGAAATA	63533

C  CT010464.7	116503	TTCTTTTGAAAATTGTGCATTATAGTTTTTGAAAGTTGAGAAAGTGTTCT	116454
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63534	TTCTTTTGAAAATTGTGCATTATAGTTTTTGAAAGTTGAGAAAGTGTTCT	63583

C  CT010464.7	116453	TTTTAATACAAAATTTTACTTTTCTTTCTGTTTTTAGTTTGTTAACTAGT	116404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63584	TTTTAATACAAAATTTTACTTTTCTTTCTGTTTTTAGTTTGTTAACTAGT	63633

C  CT010464.7	116403	GTCCCGGAGACACCGGTTAACAAGACCCTAGATAAAATATGACTAGCTCT	116354
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63634	GTCCCGGAGACACCGGTTAACAAGACCCTAGATAAAATATGACTAGCTCT	63683

C  CT010464.7	116353	ATTCCGGCATATTTTGTGTTTGGTAGAACTTTGTGTTTCTGTTAATATAA	116304
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63684	ATTCCGGCATATTTTGTGTTTGGTAGAACTTTGTGTTTCTGTTAATATAA	63733

C  CT010464.7	116303	TCTCATTTCTTTGGTTACATACATAATTTTATTTTGGCATGTTAAAAAGC	116254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63734	TCTCATTTCTTTGGTTACATACATAATTTTATTTTGGCATGTTAAAAAGC	63783

C  CT010464.7	116253	ACCACTGTATTTCTTAAAAAATCAATCATCAGATTAAGAATTGACTATTC	116204
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63784	ACCACTGTATTTCTTAAAAAATCAATCATCAGATTAAGAATTGACTATTC	63833

C  CT010464.7	116203	ACAACCGACCAATATTTTTAACTAAGAAAACTTCAACCAAAAGACCATTT	116154
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63834	ACAACCGACCAATATTTTTAACTAAGAAAACTTCAACCAAAAGACCATTT	63883

C  CT010464.7	116153	TATTTTAAGGTAGGAAGGAAATCTAATTATAGACATAAATTAATCCTTAT	116104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63884	TATTTTAAGGTAGGAAGGAAATCTAATTATAGACATAAATTAATCCTTAT	63933

C  CT010464.7	116103	TCGATTGTATGGATATTATCCATAATATACGAATAAACTAAAAATAGAAA	116054
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63934	TCGATTGTATGGATATTATCCATAATATACGAATAAACTAAAAATAGAAA	63983

C  CT010464.7	116053	ACCCAAGGATGAAATTGTGCCTAGAAAAACTTGTACATTGACCATAGATT	116004
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	63984	ACCCAAGGATGAAATTGTGCCTAGAAAAACTTGTACATTGACCATAGATT	64033

C  CT010464.7	116003	GATATATCAAATCCTAGGATTTGAAAATTTCTTATTGCATGGTAAGAAAA	115954
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64034	GATATATCAAATCCTAGGATTTGAAAATTTCTTATTGCATGGTAAGAAAA	64083

C  CT010464.7	115953	TATGTCTAATGCTATGTTTGGGACATTTCTTATTGCATGCTTAGCATTGT	115904
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64084	TATGTCTAATGCTATGTTTGGGACATTTCTTATTGCATGCTTAGCATTGT	64133

C  CT010464.7	115903	TGTACACTTGTTCATCAGCAACAACTGTTGAATATGATTCAAGTGCAATT	115854
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64134	TGTACACTTGTTCATCAGCAACAACTGTTGAATATGATTCAAGTGCAATT	64183

C  CT010464.7	115853	ATTCTTAATGGAGAACGAAAACTAATAATTTCTGGTGCAATTCACTACCC	115804
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64184	ATTCTTAATGGAGAACGAAAACTAATAATTTCTGGTGCAATTCACTACCC	64233

C  CT010464.7	115803	ACGCAGCACTTCACAAATGTGGCCAGATCTTATAATGAAAGCAAAAGATG	115754
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64234	ACGCAGCACTTCACAAATGTGGCCAGATCTTATAATGAAAGCAAAAGATG	64283

C  CT010464.7	115753	GTGATCTTGATGCCATTGAAACCTATATATTTTGGGACCTTCACGAACCT	115704
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64284	GTGATCTTGATGCCATTGAAACCTATATATTTTGGGACCTTCACGAACCT	64333

C  CT010464.7	115703	GTTCGTCGCAAATATGATTTTTCTGGAAATCTAGATTTCATCAAGTTTCT	115654
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64334	GTTCGTCGCAAATATGATTTTTCTGGAAATCTAGATTTCATCAAGTTTCT	64383

C  CT010464.7	115653	AAAAATTGCTCAAGAACAAGGGCTTTATGTAGTGCTTAGAATTGGTCCTT	115604
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64384	AAAAATTGCTCAAGAACAAGGGCTTTATGTAGTGCTTAGAATTGGTCCTT	64433

C  CT010464.7	115603	ATGTTTGTGCTGAATGGAACTATGGAGGTTTCCCAATGTGGTTACATAAC	115554
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64434	ATGTTTGTGCTGAATGGAACTATGGAGGTTTCCCAATGTGGTTACATAAC	64483

C  CT010464.7	115553	ATGCCAGGGATTCAACTAAGGACCGACAATGCAGTTTTTAAGGAGGAAAT	115504
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64484	ATGCCAGGGATTCAACTAAGGACCGACAATGCAGTTTTTAAGGAGGAAAT	64533

C  CT010464.7	115503	GAAAATATTTACAACAAAGATTGTAACCATGTGCAAGGAAGCTGGATTGT	115454
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64534	GAAAATATTTACAACAAAGATTGTAACCATGTGCAAGGAAGCTGGATTGT	64583

C  CT010464.7	115453	TTGCACCACAAGGAGGACCAATTATTTTGGCTCAAATTGAGAATGAATAT	115404
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64584	TTGCACCACAAGGAGGACCAATTATTTTGGCTCAAATTGAGAATGAATAT	64633

C  CT010464.7	115403	GGAGATGTCATAAGTCATTATGGAGAAGCTGGGAATTCATACATTAAATG	115354
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64634	GGAGATGTCATAAGTCATTATGGAGAAGCTGGGAATTCATACATTAAATG	64683

C  CT010464.7	115353	GTGTGCCGAAATGGCTTTAGCTCAAAATATTGGTGTCCCATGGATCATGT	115304
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64684	GTGTGCCGAAATGGCTTTAGCTCAAAATATTGGTGTCCCATGGATCATGT	64733

C  CT010464.7	115303	GCAAGCAAAAAAATGCTCCAGCCACTATTATCGATACATGCAATGGCTAT	115254
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64734	GCAAGCAAAAAAATGCTCCAGCCACTATTATCGATACATGCAATGGCTAT	64783

C  CT010464.7	115253	TATTGTGACACTTTCAAGCCAAACAATCCTAAAAGCCCTAAAATATTTAC	115204
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64784	TATTGTGACACTTTCAAGCCAAACAATCCTAAAAGCCCTAAAATATTTAC	64833

C  CT010464.7	115203	AGAGAATTGGGTTGGCTGGTTCCAAAAATGGGGTGAAAGGAGGCCACATA	115154
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT868737.2	64834	AGAGAATTGGGTTGGCTGGTTCCAAAAATGGGGTGAAAGGAGGCCACATA	64883

Overview

Query
CT010464.7 - 117153 bps
Hit
CT868737.2 - 64883 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110018682000115154117153-162884648831
Short-link