<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CU074402.8	2000	GAATTCCACAACCAGCTTTTCTGTGTTAGTCCTGAAAGTACTGGCAGCAG	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1	GAATTCCACAACCAGCTTTTCTGTGTTAGTCCTGAAAGTACTGGCAGCAG	50

C  CU074402.8	1950	GACTGGCTCAGAGAAGGTGCCGATCCTAGCGCTGCGCAGGGGACAGCTCG	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	51	GACTGGCTCAGAGAAGGTGCCGATCCTAGCGCTGCGCAGGGGACAGCTCG	100

C  CU074402.8	1900	CCATCAGTGTGCAGCGGAAAAAGCTTGGGGGGTGAGGGGGGCGCCCGTTC	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	101	CCATCAGTGTGCAGCGGAAAAAGCTTGGGGGGTGAGGGGGGCGCCCGTTC	150

C  CU074402.8	1850	CTCACAGCGGATCCCATACTCCCCGCGCTTACCCCTGCCGGGGAACTCGA	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	151	CTCACAGCGGATCCCATACTCCCCGCGCTTACCCCTGCCGGGGAACTCGA	200

C  CU074402.8	1800	GCTGAGGGGCCCCTCTGGCAAGCTCATGACCCGCGAAGGCGTGGGGACCA	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	201	GCTGAGGGGCCCCTCTGGCAAGCTCATGACCCGCGAAGGCGTGGGGACCA	250

C  CU074402.8	1750	GAAGAAGCAGTACGAAGCGCGGGAGCGGGCAGCGCCCGGGAGGAGGAGCG	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	251	GAAGAAGCAGTACGAAGCGCGGGAGCGGGCAGCGCCCGGGAGGAGGAGCG	300

C  CU074402.8	1700	CGGGGCGGAGCGCATCGCCCAGCTTCCCCCGCGCCCCCGCCTCTCGCATC	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	301	CGGGGCGGAGCGCATCGCCCAGCTTCCCCCGCGCCCCCGCCTCTCGCATC	350

C  CU074402.8	1650	CGGCGGCGGCACAGGATGTTCTTTCGCTCGGGTCCCCCGCCCCCGCTCTC	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	351	CGGCGGCGGCACAGGATGTTCTTTCGCTCGGGTCCCCCGCCCCCGCTCTC	400

C  CU074402.8	1600	ACTTTCTTCCCCGCTCCCCTCCTCCACACGCGCCGTGCGCCGCGCCCCGA	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	401	ACTTTCTTCCCCGCTCCCCTCCTCCACACGCGCCGTGCGCCGCGCCCCGA	450

C  CU074402.8	1550	GCCAGCACCTTGCTTAACCCCTTCCCGCCCGCGCCTAGGGCGCGCAGCGA	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	451	GCCAGCACCTTGCTTAACCCCTTCCCGCCCGCGCCTAGGGCGCGCAGCGA	500

C  CU074402.8	1500	GTCTGGGGTGCCCGGGTAGGCGCAGGACTGCGCCCACCAGGACAACGTCG	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	501	GTCTGGGGTGCCCGGGTAGGCGCAGGACTGCGCCCACCAGGACAACGTCG	550

C  CU074402.8	1450	AGGGTGGAGAGTATGGTGGTCTTCCGAGGACCCAAGCCTGCAGTCTCCAG	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	551	AGGGTGGAGAGTATGGTGGTCTTCCGAGGACCCAAGCCTGCAGTCTCCAG	600

C  CU074402.8	1400	AAGCCCCCTAAATCGCCAGGGGCGGTTCCCGGGGACCCAGGCCCGCACTC	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	601	AAGCCCCCTAAATCGCCAGGGGCGGTTCCCGGGGACCCAGGCCCGCACTC	650

C  CU074402.8	1350	TCGCGATCTTACGCTAAATTGCCAAGGGCAAGCGCAAGGTGGGCTCTCTC	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	651	TCGCGATCTTACGCTAAATTGCCAAGGGCAAGCGCAAGGTGGGCTCTCTC	700

C  CU074402.8	1300	GTGGGCGCAGACCGGTGTGCTTAGCTATCTCCGGCCTAAGGAACGGGGGA	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	701	GTGGGCGCAGACCGGTGTGCTTAGCTATCTCCGGCCTAAGGAACGGGGGA	750

C  CU074402.8	1250	GTACCCAGCAACCTTAACCTCATCTTCCCCTCCAGGTTGTGCTAAGGCGC	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	751	GTACCCAGCAACCTTAACCTCATCTTCCCCTCCAGGTTGTGCTAAGGCGC	800

C  CU074402.8	1200	GGCTCACAACGTTTGAGAGGATGGAGAGAGGCCACACCCCCTCGATTAAC	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	801	GGCTCACAACGTTTGAGAGGATGGAGAGAGGCCACACCCCCTCGATTAAC	850

C  CU074402.8	1150	GTCACTGTTTCCAAGGCAATCGGAGGCGGGGCTGTAGACAAGCGGACTTT	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	851	GTCACTGTTTCCAAGGCAATCGGAGGCGGGGCTGTAGACAAGCGGACTTT	900

C  CU074402.8	1100	GGGGACTATGGCTTAATAGGGCTCCAGGACAGGGTGCGGCTGGGCTGGGG	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	901	GGGGACTATGGCTTAATAGGGCTCCAGGACAGGGTGCGGCTGGGCTGGGG	950

C  CU074402.8	1050	GCTCGGCGGGGTGGGACGTTTCTGTCTTTGCTTTTTTATTGACTCGCTTG	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	951	GCTCGGCGGGGTGGGACGTTTCTGTCTTTGCTTTTTTATTGACTCGCTTG	1000

C  CU074402.8	1000	ATTTTTGATTCAACAGATATTTATGCTTGGCGCCATTCTTAGGGACTGTT	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1001	ATTTTTGATTCAACAGATATTTATGCTTGGCGCCATTCTTAGGGACTGTT	1050

C  CU074402.8	950	TTTCTCTCACCAAGTCTGCGGTTCACAGGTTGTCACTAAGCCGGGTGGAG	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1051	TTTCTCTCACCAAGTCTGCGGTTCACAGGTTGTCACTAAGCCGGGTGGAG	1100

C  CU074402.8	900	TGGCCATGCACCCAGGATATGATCCTGGGATAGATGTAATGCCTTTTTAT	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1101	TGGCCATGCACCCAGGATATGATCCTGGGATAGATGTAATGCCTTTTTAT	1150

C  CU074402.8	850	TAAATTTACTGTAGGGGGCTGGGGCTCATGTGCTATAACGTGCATCTGGA	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1151	TAAATTTACTGTAGGGGGCTGGGGCTCATGTGCTATAACGTGCATCTGGA	1200

C  CU074402.8	800	GATATGAGGGCAGGCAATTTGTGGGAGTTGGTTCTCGTCTTCTACCTTGT	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1201	GATATGAGGGCAGGCAATTTGTGGGAGTTGGTTCTCGTCTTCTACCTTGT	1250

C  CU074402.8	750	GAGACCCCAACTCATGTCAGGCTTGGCGGCACCTTTATCCACTGCGCTAT	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1251	GAGACCCCAACTCATGTCAGGCTTGGCGGCACCTTTATCCACTGCGCTAT	1300

C  CU074402.8	700	GTAATTATTCAGTGTCTCCTTTCTCTTGTCAAGTACCCCAGAGCGAGCAC	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1301	GTAATTATTCAGTGTCTCCTTTCTCTTGTCAAGTACCCCAGAGCGAGCAC	1350

C  CU074402.8	650	TAATCAGTGAAGACTTGGTTCTCTAATTCATGGAAGGTCTCAGCTATTCA	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1351	TAATCAGTGAAGACTTGGTTCTCTAATTCATGGAAGGTCTCAGCTATTCA	1400

C  CU074402.8	600	GGGAAGGAGGACAAAGTGTTCCATGCTCACCACGTACCAACTCCTTCCCA	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1401	GGGAAGGAGGACAAAGTGTTCCATGCTCACCACGTACCAACTCCTTCCCA	1450

C  CU074402.8	550	GCATTTTAGGTCTTGTGATCTTTGCCCTGTTGTATTTCTGGTGCCTTTTA	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1451	GCATTTTAGGTCTTGTGATCTTTGCCCTGTTGTATTTCTGGTGCCTTTTA	1500

C  CU074402.8	500	CAGCCTAGGAACTGAGTCTGAGCTCTCAGAGGACCCTAAGCCCGATAGCT	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1501	CAGCCTAGGAACTGAGTCTGAGCTCTCAGAGGACCCTAAGCCCGATAGCT	1550

C  CU074402.8	450	AAGTGTTGGAACCAGGACCCTAAGCCAGATAGCTAAGTGTTGGAACCAGG	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1551	AAGTGTTGGAACCAGGACCCTAAGCCAGATAGCTAAGTGTTGGAACCAGG	1600

C  CU074402.8	400	TTGGGACCCAAGCCTGTGGGTATGAAGCCTGGCTTCATTTTTAGACTATA	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1601	TTGGGACCCAAGCCTGTGGGTATGAAGCCTGGCTTCATTTTTAGACTATA	1650

C  CU074402.8	350	ATTAAATGGTATCAAAGAACAATCCTGCCCCTAACCCAGTCATGAAGGAG	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1651	ATTAAATGGTATCAAAGAACAATCCTGCCCCTAACCCAGTCATGAAGGAG	1700

C  CU074402.8	300	TTTACAGCCTACAGGGAAACGGGGGTGGGGGGTGGGGGTGGGGTGAGGAT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1701	TTTACAGCCTACAGGGAAACGGGGGTGGGGGGTGGGGGTGGGGTGAGGAT	1750

C  CU074402.8	250	ACCACAGAACATAATTAAGCAATAAAACCTAGAACAGGTTGGAGGCTGTT	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1751	ACCACAGAACATAATTAAGCAATAAAACCTAGAACAGGTTGGAGGCTGTT	1800

C  CU074402.8	200	TAAAAGGATCAAAATAGAGTTGAGATTGTCAGAGCCTCTCCCGTGGAAGG	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1801	TAAAAGGATCAAAATAGAGTTGAGATTGTCAGAGCCTCTCCCGTGGAAGG	1850

C  CU074402.8	150	TGCATTCCCAGGTAGGTCAGGAGGTGGGAGGTGACTGTAGGATCACAGTA	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1851	TGCATTCCCAGGTAGGTCAGGAGGTGGGAGGTGACTGTAGGATCACAGTA	1900

C  CU074402.8	100	CCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAC	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1901	CCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAC	1950

C  CU074402.8	50	AGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACTGTTCCTGCAAAGAACACCT	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT573362.4	1951	AGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACTGTTCCTGCAAAGAACACCT	2000

Overview

Query
CU074402.8 - 27884 bps
Hit
CT573362.4 - 58249 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link