<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974427.5	1	GATCCATCAAATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91116	GATCCATCAAATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCC	91165

CR974427.5	51	CCAGCATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCAAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91166	CCAGCATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCAAAAT	91215

CR974427.5	101	CTTGCTAGTGTAAGCAATGGTGTCAGCGTTTGGAGGCTGATTATGGGATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91216	CTTGCTAGTGTAAGCAATGGTGTCAGCGTTTGGAGGCTGATTATGGGATG	91265

CR974427.5	151	GATCCCCAGGTATGGCAGTCTCTAGATGGTCCATCCTTTCGTCTCAGCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91266	GATCCCCAGGTATGGCAGTCTCTAGATGGTCCATCCTTTCGTCTCAGCTC	91315

CR974427.5	201	CAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATCGGTGTTTTGTTCCCAATTCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91316	CAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATCGGTGTTTTGTTCCCAATTCTA	91365

CR974427.5	251	AGAAGGGGCAAAGTGTCCACACTTTGGTCTTCGTTCTTCTTGAGTTTCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91366	AGAAGGGGCAAAGTGTCCACACTTTGGTCTTCGTTCTTCTTGAGTTTCAT	91415

CR974427.5	301	GTGTTTTGTAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATTCTAAATTTTTGGGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91416	GTGTTTTGTAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATTCTAAATTTTTGGGCT	91465

CR974427.5	351	AATATCCACTTATCAGAAAGTACATATCATGTGAGTTCTTTTGTGATTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91466	AATATCCACTTATCAGAAAGTACATATCATGTGAGTTCTTTTGTGATTGG	91515

CR974427.5	401	GTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGCCTAGGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91516	GTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGCCTAGGAA	91565

CR974427.5	451	TTTTATAACTTCATTCTTTTTAATAGCTGCTTAGTACTCCATTGTGTAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91566	TTTTATAACTTCATTCTTTTTAATAGCTGCTTAGTACTCCATTGTGTAGA	91615

CR974427.5	501	TGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGACAACTGGGTTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91616	TGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGACAACTGGGTTCT	91665

CR974427.5	551	TTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91666	TTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCA	91715

CR974427.5	601	TGTGTCCTTCTTACTGGTTGGGACATCTTCTAGATATATGCCCAGGAAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91716	TGTGTCCTTCTTACTGGTTGGGACATCTTCTAGATATATGCCCAGGAAGT	91765

CR974427.5	651	GGTATTTCGGGATCCTCCGGTAATACAATGTCCAATTTTCTGAGGAACTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91766	GGTATTTCGGGATCCTCCGGTAATACAATGTCCAATTTTCTGAGGAACTG	91815

CR974427.5	701	CCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCTTTCAATCCCACCAACAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91816	CCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCTTTCAATCCCACCAACAAT	91865

CR974427.5	751	GGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTTCTCTCACCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91866	GGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTTCTCTCACCT	91915

CR974427.5	801	GAATTTTTGATCTTAGCCATTCTCAATGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91916	GAATTTTTGATCTTAGCCATTCTCAATGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGT	91965

CR974427.5	851	TGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAATGATGCTGAACATTTTTTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	91966	TGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAATGATGCTGAACATTTTTTCA	92015

CR974427.5	901	GGTGTTTCTCAACCATTCAGTATTCCTCAGGTGAGAATTCTTTGTTTAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92016	GGTGTTTCTCAACCATTCAGTATTCCTCAGGTGAGAATTCTTTGTTTAAC	92065

CR974427.5	951	TCTGAGTCCCATTTTTAATAGGATTATTTGATTTTCTGGAGTCCACCTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92066	TCTGAGTCCCATTTTTAATAGGATTATTTGATTTTCTGGAGTCCACCTTC	92115

CR974427.5	1001	TTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92116	TTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATA	92165

CR974427.5	1051	GGTAAGGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGACTTTTTGTCTTATTGACGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92166	GGTAAGGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGACTTTTTGTCTTATTGACGG	92215

CR974427.5	1101	TGTCTTTTGCCTTACAGAACCGTTGCAATTTTATAAGGTCCCATTTGTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92216	TGTCTTTTGCCTTACAGAACCGTTGCAATTTTATAAGGTCCCATTTGTCA	92265

CR974427.5	1151	ATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCGTTGCTGTTCTATTCAGGAATTTTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92266	ATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCGTTGCTGTTCTATTCAGGAATTTTTC	92315

CR974427.5	1201	CCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCACTTTCTCCTTTAAAAGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92316	CCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCACTTTCTCCTTTAAAAGTT	92365

CR974427.5	1251	TCACTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTGATCCACTTAGATTTGACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92366	TCACTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTGATCCACTTAGATTTGACT	92415

CR974427.5	1301	TTAGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTTGCATTCTTCTATATGATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92416	TTAGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTTGCATTCTTCTATATGATAA	92465

CR974427.5	1351	TCGCCAGTTGTGCAAGCACCATTTATTGAACATGCTGTCTTTTTTCCACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92466	TCGCCAGTTGTGCAAGCACCATTTATTGAACATGCTGTCTTTTTTCCACT	92515

CR974427.5	1401	CGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92516	CGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGG	92565

CR974427.5	1451	TTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGGTCTTCTTGGCTGTCGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92566	TTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGGTCTTCTTGGCTGTCGCT	92615

CR974427.5	1501	ATACCAGTACCATGCAGTTTTTTATTACACTTGCTCTGTAATATAGCTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92616	ATACCAGTACCATGCAGTTTTTTATTACACTTGCTCTGTAATATAGCTTT	92665

CR974427.5	1551	AGGTCAGGCATGGTGATTCCACTAGAGGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92666	AGGTCAGGCATGGTGATTCCACTAGAGGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGT	92715

CR974427.5	1601	TTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTCTAAATGAATTTGAAGATTGCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92716	TTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTCTAAATGAATTTGAAGATTGCCC	92765

CR974427.5	1651	TTTCTAATTCATTGAAGAATTGGGTTGGAATTTTAATGGGGATTGCATTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92766	TTTCTAATTCATTGAAGAATTGGGTTGGAATTTTAATGGGGATTGCATTG	92815

CR974427.5	1701	AACTGTAGATTGCTTTTGGGAAGATAGTCATTTTTACTATATTGATCCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92816	AACTGTAGATTGCTTTTGGGAAGATAGTCATTTTTACTATATTGATCCAG	92865

CR974427.5	1751	CCAATCCATGAGCATGGGAGATCTTTCCATCTTCTGAGATCTTCTTTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92866	CCAATCCATGAGCATGGGAGATCTTTCCATCTTCTGAGATCTTCTTTAAT	92915

CR974427.5	1801	TTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCACAAGGAGGAAAATTATGTCCTAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92916	TTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCACAAGGAGGAAAATTATGTCCTAGC	92965

CR974427.5	1851	AAAAGCAAGAAAGTAATCTTTCAACAAACCTAAAAGAAGACAGCCACAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	92966	AAAAGCAAGAAAGTAATCTTTCAACAAACCTAAAAGAAGACAGCCACAAG	93015

CR974427.5	1901	AACAGAATGCCAACTCTAACAACAAAAATAACAGGAAGCAACAATTACTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	93016	AACAGAATGCCAACTCTAACAACAAAAATAACAGGAAGCAACAATTACTT	93065

CR974427.5	1951	TTATTCAATATCTCTTAATATCAATGGACTCAATTCCCCCATGAAAAGAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033782.5	93066	TTATTCAATATCTCTTAATATCAATGGACTCAATTCCCCCATGAAAAGAC	93115

Overview

Query
CR974427.5 - 180395 bps
Hit
CT033782.5 - 93115 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link