<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CT033756.22	2000	GAATTCCATGATCATCTCATAGAATTAAAATAGTTTTGACAAAGGTCATT	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1	GAATTCCATGATCATCTCATAGAATTAAAATAGTTTTGACAAAGGTCATT	50

C  CT033756.22	1950	GTCCCTGAGGCTGGAGAAATGATGTCTCAGTGGTTAAGAATACTCACTGC	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	51	GTCCCTGAGGCTGGAGAAATGATGTCTCAGTGGTTAAGAATACTCACTGC	100

C  CT033756.22	1900	TATATCAGAAGACTAGAGTTCTGATCCCAGAACCCATGTCAGGCAGCTCA	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	101	TATATCAGAAGACTAGAGTTCTGATCCCAGAACCCATGTCAGGCAGCTCA	150

C  CT033756.22	1850	TAAATGCCTGTAACTCCAGCTCCAGTGGATTTGATATCCTGCTTCTGACT	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	151	TAAATGCCTGTAACTCCAGCTCCAGTGGATTTGATATCCTGCTTCTGACT	200

C  CT033756.22	1800	TCTGTTGGCAGAGCACACACACATATGCACACACACACACACACACACAC	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	201	TCTGTTGGCAGAGCACACACACATATGCACACACACACACACACACACAC	250

C  CT033756.22	1750	ACACACACACACACACACGCACACTCAGAGAGAGAGAGGGGGGCTAAAAT	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	251	ACACACACACACACACACGCACACTCAGAGAGAGAGAGGGGGGCTAAAAT	300

C  CT033756.22	1700	ATCTTAAATTTTAAAGTCAACATCTCTTTACAATAAAATCTCTGAAGAAT	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	301	ATCTTAAATTTTAAAGTCAACATCTCTTTACAATAAAATCTCTGAAGAAT	350

C  CT033756.22	1650	AGGGGACTAAAAGCAAGACAACAGAATACAAAACGAGTATATATAACAAA	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	351	AGGGGACTAAAAGCAAGACAACAGAATACAAAACGAGTATATATAACAAA	400

C  CT033756.22	1600	ACTAATGGCAATGTTATACTAAATGGGGAAAAACTGAAGGCATTCCCTCT	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	401	ACTAATGGCAATGTTATACTAAATGGGGAAAAACTGAAGGCATTCCCTCT	450

C  CT033756.22	1550	AAAACCAAGATCAAGATAACTGTATTGATTCTCTTTACTCTTCAAAACAG	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	451	AAAACCAAGATCAAGATAACTGTATTGATTCTCTTTACTCTTCAAAACAG	500

C  CT033756.22	1500	AGCTCAAATTTCAGCTAGTGAAATAATAAGAAAAAAATAAAAAGGCATAC	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	501	AGCTCAAATTTCAGCTAGTGAAATAATAAGAAAAAAATAAAAAGGCATAC	550

C  CT033756.22	1450	TACTAGGAGGAGAGGACTAATATCTCTGTTTGCAGACATACGTGTAGCCT	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	551	TACTAGGAGGAGAGGACTAATATCTCTGTTTGCAGACATACGTGTAGCCT	600

C  CT033756.22	1400	GTAGCCTATTCACTAAAAGAAATCAAAAGATTCCATGAGAAAGCTCTTGA	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	601	GTAGCCTATTCACTAAAAGAAATCAAAAGATTCCATGAGAAAGCTCTTGA	650

C  CT033756.22	1350	ATCTAATTTTCTAAAAACAAAGTTCTACAGGTACCAAGACGAAAAAGTAA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	651	ATCTAATTTTCTAAAAACAAAGTTCTACAGGTACCAAGACGAAAAAGTAA	700

C  CT033756.22	1300	CCATAGAAAAATCAGTATCATTTCTACATAGCAATAATAAATTTGTTAAG	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	701	CCATAGAAAAATCAGTATCATTTCTACATAGCAATAATAAATTTGTTAAG	750

C  CT033756.22	1250	AAAGCAACAAGAAGGAAGTTCTAGTATTTTTAAAATACTGACATAACTAG	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	751	AAAGCAACAAGAAGGAAGTTCTAGTATTTTTAAAATACTGACATAACTAG	800

C  CT033756.22	1200	GGATGTAAAATACTTCTACAGTGAAAAGTTCAAGACACTGAGAAGAGAAA	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	801	GGATGTAAAATACTTCTACAGTGAAAAGTTCAAGACACTGAGAAGAGAAA	850

C  CT033756.22	1150	GTGAAGAAGACAGCAGCACAGGACGAGCTCCTATGATCATGGATTCGTAG	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	851	GTGAAGAAGACAGCAGCACAGGACGAGCTCCTATGATCATGGATTCGTAG	900

C  CT033756.22	1100	AAGGAATACTGTCATATTGTGCCCATTACTGAAAGTGAACTCGGATTAAG	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	901	AAGGAATACTGTCATATTGTGCCCATTACTGAAAGTGAACTCGGATTAAG	950

C  CT033756.22	1050	TGCAAACAACCCTCTTGCCAGAGACAGAGAGCTAGGGAAGAGTGCTTGTG	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	951	TGCAAACAACCCTCTTGCCAGAGACAGAGAGCTAGGGAAGAGTGCTTGTG	1000

C  CT033756.22	1000	TCTGCTCCCTGCCCCCTTGGGGGAGGGCAATACTTAACTGTCACCTGGCT	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1001	TCTGCTCCCTGCCCCCTTGGGGGAGGGCAATACTTAACTGTCACCTGGCT	1050

C  CT033756.22	950	TAACTCGTAGTTGAGGTTTGTGGTCTTCTGCCTAACCCAAGAAACCAAGG	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1051	TAACTCGTAGTTGAGGTTTGTGGTCTTCTGCCTAACCCAAGAAACCAAGG	1100

C  CT033756.22	900	TTGCAGCCATTGGGGGTGTTCTGTTTTTCTGTTCGTTACCTTTCTGCTTC	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1101	TTGCAGCCATTGGGGGTGTTCTGTTTTTCTGTTCGTTACCTTTCTGCTTC	1150

C  CT033756.22	850	TAAGTAATTTTTAGCTGCCTTGTGACTGCTTTCCTGATTCCGTTCTCCTT	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1151	TAAGTAATTTTTAGCTGCCTTGTGACTGCTTTCCTGATTCCGTTCTCCTT	1200

C  CT033756.22	800	ACAGTATGATGTGTCCTTTCTTACCTTGACTCTTCTCATTCACCCAGTTT	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1201	ACAGTATGATGTGTCCTTTCTTACCTTGACTCTTCTCATTCACCCAGTTT	1250

C  CT033756.22	750	CATGGGCTAAAGCTTCCAATCCACCATCTTAACATGGAACTACTGAACTC	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1251	CATGGGCTAAAGCTTCCAATCCACCATCTTAACATGGAACTACTGAACTC	1300

C  CT033756.22	700	TTTAAATATATAGTATCTCATTAATTCTTTGCACATTTCAGACGGTATAT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1301	TTTAAATATATAGTATCTCATTAATTCTTTGCACATTTCAGACGGTATAT	1350

C  CT033756.22	650	TTTGATCATATTTACTTTCCACTACTTCCCTCAAGTCCTCCCTGTTGCAA	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1351	TTTGATCATATTTACTTTCCACTACTTCCCTCAAGTCCTCCCTGTTGCAA	1400

C  CT033756.22	600	GCCCATCTGCTCATTTTGTTAATAACCCACTGAGTCCAATTTGCACTGTC	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1401	GCCCATCTGCTCATTTTGTTAATAACCCACTGAGTCCAATTTGCACTGTC	1450

C  CT033756.22	550	CATATACTCAGTCTGAGGTGCCAGGGAGGTGAAATGGTTCAGAGCAGAAC	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1451	CATATACTCAGTCTGAGGTGCCAGGGAGGTGAAATGGTTCAGAGCAGAAC	1500

C  CT033756.22	500	TCGTCCAGCTGTCAAGCCTGATAACTTTAGTTGGATCCCCACAACCTGCA	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1501	TCGTCCAGCTGTCAAGCCTGATAACTTTAGTTGGATCCCCACAACCTGCA	1550

C  CT033756.22	450	TGCTGAAGTGAACTAAATCCTGCAAGCGATCCTCTGACCTTCACATGTAT	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1551	TGCTGAAGTGAACTAAATCCTGCAAGCGATCCTCTGACCTTCACATGTAT	1600

C  CT033756.22	400	GCTGTGGCATAAATACATGTAGACACAGAGATAACAAAGAAATAAAAAGG	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1601	GCTGTGGCATAAATACATGTAGACACAGAGATAACAAAGAAATAAAAAGG	1650

C  CT033756.22	350	TAATACAAATTTGATTTCTTTTCCCAAAATCTGAGTGCCTACCATGTACC	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1651	TAATACAAATTTGATTTCTTTTCCCAAAATCTGAGTGCCTACCATGTACC	1700

C  CT033756.22	300	TGGCAGAATTCCAGGCTAGATTATTGATTCCCTTGAATAGTGCTTTCAGT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1701	TGGCAGAATTCCAGGCTAGATTATTGATTCCCTTGAATAGTGCTTTCAGT	1750

C  CT033756.22	250	CAACAGTTTAAAAAAAAAAAAAAACCTACCTATTAGCTCTTACAAAAAGG	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1751	CAACAGTTTAAAAAAAAAAAAAAACCTACCTATTAGCTCTTACAAAAAGG	1800

C  CT033756.22	200	GAGGACTCCTGGTGATATCCTTGCAAGAATTTCCTTCCTCGAATATGTGC	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1801	GAGGACTCCTGGTGATATCCTTGCAAGAATTTCCTTCCTCGAATATGTGC	1850

C  CT033756.22	150	AGTGGGCTTCCCTGGTTCTCAACCTAATTCTGCTGAGCACAGGCTGAGGC	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1851	AGTGGGCTTCCCTGGTTCTCAACCTAATTCTGCTGAGCACAGGCTGAGGC	1900

C  CT033756.22	100	TGTTGTAGGATGCACCTCAGTAAAGGTCTGAGTGCTCTGCTGCAAAGTCT	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1901	TGTTGTAGGATGCACCTCAGTAAAGGTCTGAGTGCTCTGCTGCAAAGTCT	1950

C  CT033756.22	50	CAATGGTATTACCTTAGATCCATGCCCCAGCCTGCTGGAAACTATGCCTG	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CT033772.6	1951	CAATGGTATTACCTTAGATCCATGCCCCAGCCTGCTGGAAACTATGCCTG	2000

Overview

Query
CT033756.22 - 220186 bps
Hit
CT033772.6 - 214867 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link