<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT033751.4	1	GATCTGATTCTATACTGGTGACTGAGAGAGTTCTGGGAAAGGAGAGCCAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89440	GATCTGATTCTATACTGGTGACTGAGAGAGTTCTGGGAAAGGAGAGCCAC	89489

CT033751.4	51	AGTGTCTTACACCCTGACTTTCCCCGCCCAAGTTTGAAGACTTCCTAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89490	AGTGTCTTACACCCTGACTTTCCCCGCCCAAGTTTGAAGACTTCCTAAAG	89539

CT033751.4	101	TTGAAGGGAGTTACACCTGGGCCTTATTCTGTTTATTCTAACATGGAACC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89540	TTGAAGGGAGTTACACCTGGGCCTTATTCTGTTTATTCTAACATGGAACC	89589

CT033751.4	151	AGTAAGCAGTTCCAGACTCAAGCTAGAGTCAAAGCTCAATGAAAAACAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89590	AGTAAGCAGTTCCAGACTCAAGCTAGAGTCAAAGCTCAATGAAAAACAGA	89639

CT033751.4	201	ACAGCCCAACTACAAATAACTGGGTTCAAGACAAATGTCACGAAGGGCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89640	ACAGCCCAACTACAAATAACTGGGTTCAAGACAAATGTCACGAAGGGCCA	89689

CT033751.4	251	CTGGTGCAGTTGCTACACATGGAGGATCACACAGTGGCTGGAATCCAGCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89690	CTGGTGCAGTTGCTACACATGGAGGATCACACAGTGGCTGGAATCCAGCC	89739

CT033751.4	301	AGTAAAGCATCCCACCCACTCATCGTCAGTGTGGTCTAACCCTATGCATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89740	AGTAAAGCATCCCACCCACTCATCGTCAGTGTGGTCTAACCCTATGCATT	89789

CT033751.4	351	CTTGTATACCTTCTAGCCCCTACTGAATGCTTCTCTTCAGTTGCTTTAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89790	CTTGTATACCTTCTAGCCCCTACTGAATGCTTCTCTTCAGTTGCTTTAGA	89839

CT033751.4	401	TGGTCTGTATCACCGGGGCCATGGTAGTACAATTGACCCTTAGTACAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89840	TGGTCTGTATCACCGGGGCCATGGTAGTACAATTGACCCTTAGTACAAAT	89889

CT033751.4	451	AACAAAAATAGGTTCCATGAGAAATTTTAGCTTTAATTCAAGTAGAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89890	AACAAAAATAGGTTCCATGAGAAATTTTAGCTTTAATTCAAGTAGAAAAA	89939

CT033751.4	501	TAAGAACATGAAAAACATAAACTAGACCCAAAGACCAAAGTGAAACAACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89940	TAAGAACATGAAAAACATAAACTAGACCCAAAGACCAAAGTGAAACAACT	89989

CT033751.4	551	TCCGTGTCTACACCATCTCTACCTTGGCCTCCTGACATGGTAGTACTACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	89990	TCCGTGTCTACACCATCTCTACCTTGGCCTCCTGACATGGTAGTACTACT	90039

CT033751.4	601	TGTTACAGAGGCTAGCTAAGGTGGCTGGGCTTCCTGGACCCAGGAGATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90040	TGTTACAGAGGCTAGCTAAGGTGGCTGGGCTTCCTGGACCCAGGAGATCA	90089

CT033751.4	651	GCTACTAGAGTATTCACCCACCTCTGCACTCCAAATATCACAAACAGCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90090	GCTACTAGAGTATTCACCCACCTCTGCACTCCAAATATCACAAACAGCAG	90139

CT033751.4	701	TACCTGTGTGGTATGAGGAGACAGAAGATGTTTTGCTAGTATATGCATGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90140	TACCTGTGTGGTATGAGGAGACAGAAGATGTTTTGCTAGTATATGCATGT	90189

CT033751.4	751	GTCCATGGATGACCATGTCTTTTTGTGTCTTATGTGGGGTTCTAAAACAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90190	GTCCATGGATGACCATGTCTTTTTGTGTCTTATGTGGGGTTCTAAAACAA	90239

CT033751.4	801	AATCTCATGTTAACAGCTTCACAAGACAGCACTCTGTACATAGTAGGAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90240	AATCTCATGTTAACAGCTTCACAAGACAGCACTCTGTACATAGTAGGAAA	90289

CT033751.4	851	TAAAAACTAGTGGTCTGAACGAAGACAAGTGGAGGCCAGCCAAAAATGGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90290	TAAAAACTAGTGGTCTGAACGAAGACAAGTGGAGGCCAGCCAAAAATGGG	90339

CT033751.4	901	AAGGATATCATCTGGAATGAAGGAGAGGCTCAGCCCAGGAGCCAAAATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90340	AAGGATATCATCTGGAATGAAGGAGAGGCTCAGCCCAGGAGCCAAAATGG	90389

CT033751.4	951	TCAGGGTCCATAGCCAAGGCCTAAAAGTCTGCGATCAGCAGCTCCATGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90390	TCAGGGTCCATAGCCAAGGCCTAAAAGTCTGCGATCAGCAGCTCCATGAC	90439

CT033751.4	1001	TTTAAATCCCACCCTCCTTCCCGCCAGGACAGCCGTTCCCAGGGCTCTCG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90440	TTTAAATCCCACCCTCCTTCCCGCCAGGACAGCCGTTCCCAGGGCTCTCG	90489

CT033751.4	1051	GGTTACTTGTTGCACAAGCTTTCTACTTAAGTGAGGAGGCGGGTTAGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90490	GGTTACTTGTTGCACAAGCTTTCTACTTAAGTGAGGAGGCGGGTTAGGGG	90539

CT033751.4	1101	AAAAAAGTCTTCTTTCTGTAACAGTAGCAAAAAGCTGCTGGAAATGCCAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90540	AAAAAAGTCTTCTTTCTGTAACAGTAGCAAAAAGCTGCTGGAAATGCCAT	90589

CT033751.4	1151	CATGACAGCCATCAAGGAAAGACAGATGGAGGGCACTCATGTGGGACCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90590	CATGACAGCCATCAAGGAAAGACAGATGGAGGGCACTCATGTGGGACCAT	90639

CT033751.4	1201	AGGAGGACTACCACTCAAAGAAGAGGGATATGGGGGCAGTGGCTCAAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90640	AGGAGGACTACCACTCAAAGAAGAGGGATATGGGGGCAGTGGCTCAAAAA	90689

CT033751.4	1251	TACTTGTGTGTGGGGTCAGGGTCCTCTAAGATCCTAAAGGTAAGCCAAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90690	TACTTGTGTGTGGGGTCAGGGTCCTCTAAGATCCTAAAGGTAAGCCAAGA	90739

CT033751.4	1301	TGTTTAGCATCAGGTTAGGGTCAGTCTCTGGGATTGTCATTTGAACACTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90740	TGTTTAGCATCAGGTTAGGGTCAGTCTCTGGGATTGTCATTTGAACACTT	90789

CT033751.4	1351	GGATTCTTAGAAAAGAAGGCTGCAAAATCTTAGGAGGGACAATCTAGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90790	GGATTCTTAGAAAAGAAGGCTGCAAAATCTTAGGAGGGACAATCTAGAAA	90839

CT033751.4	1401	ATACCCCCCCACACACACCTCCCCAAAAAAGAAAGAGAGAAAACAGAGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90840	ATACCCCCCCACACACACCTCCCCAAAAAAGAAAGAGAGAAAACAGAGGA	90889

CT033751.4	1451	AAGGCAAATGTAAAGCTTGACTGGCAATAAAAGTGAAAAGTCAGTGGCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90890	AAGGCAAATGTAAAGCTTGACTGGCAATAAAAGTGAAAAGTCAGTGGCCA	90939

CT033751.4	1501	CCAAGAATGCTAATGGAGCCCTAAGAATACATCTATTCACCCCATTCACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90940	CCAAGAATGCTAATGGAGCCCTAAGAATACATCTATTCACCCCATTCACC	90989

CT033751.4	1551	CTGCTCAAGGCGGTGGCCCCCGTTCAAGGAATGGCTCAGGGCCAGCCCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	90990	CTGCTCAAGGCGGTGGCCCCCGTTCAAGGAATGGCTCAGGGCCAGCCCTG	91039

CT033751.4	1601	ACCAGCAGGCCTAGGATGCAGCTCCCCCTGCTGGTTCATGGGAATGTGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91040	ACCAGCAGGCCTAGGATGCAGCTCCCCCTGCTGGTTCATGGGAATGTGAG	91089

CT033751.4	1651	GCAAGGTACTTTAGAATGAACAGGGAAAATAATAAATAGGGGAGGTTGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91090	GCAAGGTACTTTAGAATGAACAGGGAAAATAATAAATAGGGGAGGTTGTG	91139

CT033751.4	1701	AGACCATCTAATTTCCACATGCTGCGGAACAAATGCAGAACAAACCATTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91140	AGACCATCTAATTTCCACATGCTGCGGAACAAATGCAGAACAAACCATTT	91189

CT033751.4	1751	AGTGGATTACATTTTCTTTGTAAATACATTCCTCATCAAATACAAGGCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91190	AGTGGATTACATTTTCTTTGTAAATACATTCCTCATCAAATACAAGGCAG	91239

CT033751.4	1801	AACAGAGAACTGTCCAGGGAAGGCCCAAGCCTACTCCATGGCCCACAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91240	AACAGAGAACTGTCCAGGGAAGGCCCAAGCCTACTCCATGGCCCACAAAA	91289

CT033751.4	1851	ATGTTTCCTCCCTCTAACTCCCAGTTTCTGTGTACAGTCTGAGACAACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91290	ATGTTTCCTCCCTCTAACTCCCAGTTTCTGTGTACAGTCTGAGACAACAA	91339

CT033751.4	1901	AGCTCATCCTTGCTGTTTTAAGGGAGCCTTGACTTTCCTTGACATGATCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91340	AGCTCATCCTTGCTGTTTTAAGGGAGCCTTGACTTTCCTTGACATGATCC	91389

CT033751.4	1951	ACAAGTCAAAGATCCATGGAAGACTGCCAGGAGCCTTTTCCTCCACAGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033755.6	91390	ACAAGTCAAAGATCCATGGAAGACTGCCAGGAGCCTTTTCCTCCACAGGC	91439

Overview

Query
CT033751.4 - 171391 bps
Hit
CT033755.6 - 91439 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link