<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT485616.11	1	GAGCCAGGTCAGCTGGGGGCTCCTGGCCTGGTGCTCGGCGGTGCTGGCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169392	GAGCCAGGTCAGCTGGGGGCTCCTGGCCTGGTGCTCGGCGGTGCTGGCTC	169441

CT485616.11	51	ATGTGTTCTAGGAGGTGTTCCTTGTGCTTGAAGTAGATGCTGCACTCGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169442	ATGTGTTCTAGGAGGTGTTCCTTGTGCTTGAAGTAGATGCTGCACTCGAT	169491

CT485616.11	101	GCAAGGAAACACAGCTGGCTCCTCTTCCTCTTCTTCATTGCTGTCCACTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169492	GCAAGGAAACACAGCTGGCTCCTCTTCCTCTTCTTCATTGCTGTCCACTC	169541

CT485616.11	151	CACCAGCTACTTCCTGCAACAGTTCACACAGGTATGGTCCTGTCTGGACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169542	CACCAGCTACTTCCTGCAACAGTTCACACAGGTATGGTCCTGTCTGGACT	169591

CT485616.11	201	GGGGACAGTAGGGGCTGCAGTCGCTCCACAGATGCTTCAGAGTTCACTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169592	GGGGACAGTAGGGGCTGCAGTCGCTCCACAGATGCTTCAGAGTTCACTGT	169641

CT485616.11	251	CCAGGTCTGGGTGGCCACTTCTGAGGCTGATGTGTGAAGACCCCACTCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169642	CCAGGTCTGGGTGGCCACTTCTGAGGCTGATGTGTGAAGACCCCACTCAG	169691

CT485616.11	301	AAGGCTGGGCCACCTGCCCAAAGTCCTCTAGGTCCTCTCTGGTACCCATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169692	AAGGCTGGGCCACCTGCCCAAAGTCCTCTAGGTCCTCTCTGGTACCCATA	169741

CT485616.11	351	ACTTCCATGTCCAAGGTCTTGGGAGTGTTATCCACTGGCACAATTACCCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169742	ACTTCCATGTCCAAGGTCTTGGGAGTGTTATCCACTGGCACAATTACCCT	169791

CT485616.11	401	CCTAAAGGAAGTGACAGTCGGGGGCTGGGCAGGAAGGTCCAGGTGCAACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169792	CCTAAAGGAAGTGACAGTCGGGGGCTGGGCAGGAAGGTCCAGGTGCAACC	169841

CT485616.11	451	CTGTATCCTTCAGGGGCCCCTGTTCATCTGTATCTTGGAGCCAATCAAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169842	CTGTATCCTTCAGGGGCCCCTGTTCATCTGTATCTTGGAGCCAATCAAAC	169891

CT485616.11	501	TTGTGGTGGCTTGGAGAGTATTTCTCTAAGAACTTCACTTCACCCTGGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169892	TTGTGGTGGCTTGGAGAGTATTTCTCTAAGAACTTCACTTCACCCTGGTG	169941

CT485616.11	551	GTGCAAGAACTTTCTAGAGCCCTTGAGCTTGGCATAAGGTTTCATAGTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169942	GTGCAAGAACTTTCTAGAGCCCTTGAGCTTGGCATAAGGTTTCATAGTTC	169991

CT485616.11	601	TCACAATAACTGAGTCCTTGAACCTCTGCTCAGATGGGGTACCCTCCCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	169992	TCACAATAACTGAGTCCTTGAACCTCTGCTCAGATGGGGTACCCTCCCTG	170041

CT485616.11	651	GCCTCCTGGACCATGGGATGTTCCCAAGACCCCTGAACATCAAGGGATGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170042	GCCTCCTGGACCATGGGATGTTCCCAAGACCCCTGAACATCAAGGGATGC	170091

CT485616.11	701	AGGGAAGGGACCCAGAAGATGGGGTGGTGGGGAGCCCGGCTGAAAGTCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170092	AGGGAAGGGACCCAGAAGATGGGGTGGTGGGGAGCCCGGCTGAAAGTCCA	170141

CT485616.11	751	GGCTGTCTCCATCCCAGTAGCTGCAAGGAAGTGCCAACAGGGATAAGTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170142	GGCTGTCTCCATCCCAGTAGCTGCAAGGAAGTGCCAACAGGGATAAGTTA	170191

CT485616.11	801	GCTGTGACCCTTGGTTTCCCTCCCTAGGGTAGTAGTGACAGGGGGTCCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170192	GCTGTGACCCTTGGTTTCCCTCCCTAGGGTAGTAGTGACAGGGGGTCCTC	170241

CT485616.11	851	CCAGGCGGGATGGAATTGTTAGTTCCTTGAGACCCAGCGTAAGGGTGACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170242	CCAGGCGGGATGGAATTGTTAGTTCCTTGAGACCCAGCGTAAGGGTGACT	170291

CT485616.11	901	GTGCAGAGGTTGGGAGTAATAGGGTAAAGGTGAGGAAGTCCAAGTGGGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170292	GTGCAGAGGTTGGGAGTAATAGGGTAAAGGTGAGGAAGTCCAAGTGGGCC	170341

CT485616.11	951	TTTCCAGAGGTATTGCGTCAAGGCCAGGTTCAACTCTTAGGGTGCACCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170342	TTTCCAGAGGTATTGCGTCAAGGCCAGGTTCAACTCTTAGGGTGCACCTG	170391

CT485616.11	1001	TCCACACAGCCCCAGCCCTGCTGCATCATTGGGGAAATGAGCAGAGACCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170392	TCCACACAGCCCCAGCCCTGCTGCATCATTGGGGAAATGAGCAGAGACCA	170441

CT485616.11	1051	CAGGTTGGGGATAGAGCCTCAAAAGAGTAACCCCAAATCTGGAGGTACAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170442	CAGGTTGGGGATAGAGCCTCAAAAGAGTAACCCCAAATCTGGAGGTACAG	170491

CT485616.11	1101	TGAACTCTCACCTTTCCCCAGGGAGGATCCAAGGCTCTGACCTGGGCTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170492	TGAACTCTCACCTTTCCCCAGGGAGGATCCAAGGCTCTGACCTGGGCTCC	170541

CT485616.11	1151	AGGCTGCTTCTGTCTTGGTCCTCCCCAAACTGTGGCGACTTAGTCACATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170542	AGGCTGCTTCTGTCTTGGTCCTCCCCAAACTGTGGCGACTTAGTCACATC	170591

CT485616.11	1201	TCTCCCCCAAATTTGGTGAAGGTCAACTTTGTGGCAGGACAGCTCAAAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170592	TCTCCCCCAAATTTGGTGAAGGTCAACTTTGTGGCAGGACAGCTCAAAGG	170641

CT485616.11	1251	ATGAACCTCCTCCCCTCTTGGAGGGTAGAGTCAGGAGTGACTAATGGTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170642	ATGAACCTCCTCCCCTCTTGGAGGGTAGAGTCAGGAGTGACTAATGGTTC	170691

CT485616.11	1301	CAGTGACCCTGACCTTCCTGGGAGGGAGATAGGTAGGGCTGGGAGATCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170692	CAGTGACCCTGACCTTCCTGGGAGGGAGATAGGTAGGGCTGGGAGATCAG	170741

CT485616.11	1351	AGTAGATGAGGAAAGTTCTCTGGGCCTCAGTTTTCCAATCCTAAAAATGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170742	AGTAGATGAGGAAAGTTCTCTGGGCCTCAGTTTTCCAATCCTAAAAATGG	170791

CT485616.11	1401	AGATGATTTTCAAGAGTCAGGAATCTCGTCTTCCTTATACAATGTCTAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170792	AGATGATTTTCAAGAGTCAGGAATCTCGTCTTCCTTATACAATGTCTAAG	170841

CT485616.11	1451	GAGCTTTTTTGACAGTTATCACCAATGAAAACGATCACACAAAGCAGGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170842	GAGCTTTTTTGACAGTTATCACCAATGAAAACGATCACACAAAGCAGGTG	170891

CT485616.11	1501	CTTATTTAAAAGCTTCAGTGGGGACTATGACCCCACAACAAAATGTAGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170892	CTTATTTAAAAGCTTCAGTGGGGACTATGACCCCACAACAAAATGTAGGG	170941

CT485616.11	1551	CAGAGACAGGTAGAATTCAAATACTTAGGAATCAGGGAGCACCTTACCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170942	CAGAGACAGGTAGAATTCAAATACTTAGGAATCAGGGAGCACCTTACCTC	170991

CT485616.11	1601	ACCTGATACCTAGTAAGCCTTGGGACTGATGGCTTTTTTTCCCAGGGGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	170992	ACCTGATACCTAGTAAGCCTTGGGACTGATGGCTTTTTTTCCCAGGGGGA	171041

CT485616.11	1651	CATAAGGTTTCACTATGTATTCCCGGTTGGCCTGGAACTCATTATGTAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171042	CATAAGGTTTCACTATGTATTCCCGGTTGGCCTGGAACTCATTATGTAGA	171091

CT485616.11	1701	CTAGAATGGACTCAAACTCAGAGATCTGCCTGCCTTTGACTCCAAAGTGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171092	CTAGAATGGACTCAAACTCAGAGATCTGCCTGCCTTTGACTCCAAAGTGC	171141

CT485616.11	1751	TGGGATTAAAGGTGTGGCCACCACATCAGGCTCTAGGGTCTCTTTTTTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171142	TGGGATTAAAGGTGTGGCCACCACATCAGGCTCTAGGGTCTCTTTTTTGT	171191

CT485616.11	1801	TTTAATTTTTGTTGTTGTTGGTTTTGTTTTTTTGAAACAGGGTCTCATGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171192	TTTAATTTTTGTTGTTGTTGGTTTTGTTTTTTTGAAACAGGGTCTCATGG	171241

CT485616.11	1851	TGTAACCCTGGTTGTCCTGTAAATTACTTTGTAGATGATGCTGGCCTTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171242	TGTAACCCTGGTTGTCCTGTAAATTACTTTGTAGATGATGCTGGCCTTGA	171291

CT485616.11	1901	ACACACATACATTCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGAGATGAAAGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171292	ACACACATACATTCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGAGATGAAAGAT	171341

CT485616.11	1951	GTAGCCACCACACCAGGTTCTGGGACTTTTTAGTATAAGTATTCCTGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT033751.4	171342	GTAGCCACCACACCAGGTTCTGGGACTTTTTAGTATAAGTATTCCTGATC	171391

Overview

Query
CT485616.11 - 163243 bps
Hit
CT033751.4 - 171391 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link