<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974462.5	1	GAATTCCCCCAGGACCTTGTGAAACAGGCTCCTGTCTGCAGAAAGGATGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218164	GAATTCCCCCAGGACCTTGTGAAACAGGCTCCTGTCTGCAGAAAGGATGT	218213

CR974462.5	51	TTCCCTTGCCTCTGGAAAAAGGACACAAGGCTCAGCAGTGTGCCTGGGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218214	TTCCCTTGCCTCTGGAAAAAGGACACAAGGCTCAGCAGTGTGCCTGGGGT	218263

CR974462.5	101	GCCTCTGTGCGTGTTCCCATACTAGCATCCTCCTTCCTGAGACTCCCAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218264	GCCTCTGTGCGTGTTCCCATACTAGCATCCTCCTTCCTGAGACTCCCAGC	218313

CR974462.5	151	CCTGCTCCAGGTCAGGGCCTCCCTAACCCTAGCTCCCTCCATATACATCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218314	CCTGCTCCAGGTCAGGGCCTCCCTAACCCTAGCTCCCTCCATATACATCT	218363

CR974462.5	201	CATACGCAGCGGCTGTCTACCATTTCTCATCATGGCTGCTCACAGCTCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218364	CATACGCAGCGGCTGTCTACCATTTCTCATCATGGCTGCTCACAGCTCCA	218413

CR974462.5	251	GTCCCTGGGATCAGTCCACCCTCTTTTGATCTTCATGTCCATAAAAAGTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218414	GTCCCTGGGATCAGTCCACCCTCTTTTGATCTTCATGTCCATAAAAAGTA	218463

CR974462.5	301	CTTTGAGCATTTGTGATTATTGCAGGAACAGAATGGATCAGACAATGTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218464	CTTTGAGCATTTGTGATTATTGCAGGAACAGAATGGATCAGACAATGTAA	218513

CR974462.5	351	AAACCTATGCTTACTTTTATTCATTATATATAAGGAATTCTGGTTAATTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218514	AAACCTATGCTTACTTTTATTCATTATATATAAGGAATTCTGGTTAATTT	218563

CR974462.5	401	CACCTGCGTTTCTCTTGGATGCCCCTCTCCTAGGGAAGCTCTTACTCCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218564	CACCTGCGTTTCTCTTGGATGCCCCTCTCCTAGGGAAGCTCTTACTCCCC	218613

CR974462.5	451	CAGGCTGATTCTACTCCCTGGCTCCTCCCCCCACTGTTAAGTTTAATTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218614	CAGGCTGATTCTACTCCCTGGCTCCTCCCCCCACTGTTAAGTTTAATTGG	218663

CR974462.5	501	GATTTGCAGGAGGGGACCTAGGGGTTGGAGCTCCCTGGGTTTACCAGTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218664	GATTTGCAGGAGGGGACCTAGGGGTTGGAGCTCCCTGGGTTTACCAGTGG	218713

CR974462.5	551	CAGAAAAAGACTCTCCCAACAAGAATTGCCAATAGCTCTTTAGAGATGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218714	CAGAAAAAGACTCTCCCAACAAGAATTGCCAATAGCTCTTTAGAGATGGG	218763

CR974462.5	601	TGGGGATTCTCATGAGCCCCCTTCCTTATTTCTGATTTTTTTCTTTCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218764	TGGGGATTCTCATGAGCCCCCTTCCTTATTTCTGATTTTTTTCTTTCTTT	218813

CR974462.5	651	CTTTTTTTTTATTTTCAAGACAGGTTTCTCTGTTTAGCCCTGGCTGTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218814	CTTTTTTTTTATTTTCAAGACAGGTTTCTCTGTTTAGCCCTGGCTGTCCT	218863

CR974462.5	701	AGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTACTGGGATTAAAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218864	AGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTACTGGGATTAAAGG	218913

CR974462.5	751	CATGCGCCACCATGCCCAGCTTTCTGATGGGCTTTTTTTTTTTGTTTTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218914	CATGCGCCACCATGCCCAGCTTTCTGATGGGCTTTTTTTTTTTGTTTTTA	218963

CR974462.5	801	AAGATTTATTTTATTATTATATCTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	218964	AAGATTTATTTTATTATTATATCTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACA	219013

CR974462.5	851	CACCAGAAGAGGGCATCAGATCTATATTAAGGATGGTTGTGAACCACCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219014	CACCAGAAGAGGGCATCAGATCTATATTAAGGATGGTTGTGAACCACCAT	219063

CR974462.5	901	GTGGTTGCTAGGACTTGAACTCATGACCTTTGGAAGAGCAGTCAGTGCTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219064	GTGGTTGCTAGGACTTGAACTCATGACCTTTGGAAGAGCAGTCAGTGCTC	219113

CR974462.5	951	TTACCTGCTGAGTCATCTCTCCAGCTCCTCTGATGGTCTCTTAATAGCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219114	TTACCTGCTGAGTCATCTCTCCAGCTCCTCTGATGGTCTCTTAATAGCAG	219163

CR974462.5	1001	GTAATCTTGGCCTCTGTGAGTTGGTCAGTGCCACAAGCTGGCCTTGTCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219164	GTAATCTTGGCCTCTGTGAGTTGGTCAGTGCCACAAGCTGGCCTTGTCAC	219213

CR974462.5	1051	AGAACTCTAATCCAACTTTCACCTCCTAACTTCCATCCACACCCGCTCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219214	AGAACTCTAATCCAACTTTCACCTCCTAACTTCCATCCACACCCGCTCCC	219263

CR974462.5	1101	TTCTTCCATGGTCCCTCAGCTTGCAGTCAGTTTTTATAACGACTAACTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219264	TTCTTCCATGGTCCCTCAGCTTGCAGTCAGTTTTTATAACGACTAACTTT	219313

CR974462.5	1151	AACAATACATTTATTTTACTTTACGTGTATGGATGATTTGCCTGGATGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219314	AACAATACATTTATTTTACTTTACGTGTATGGATGATTTGCCTGGATGCT	219363

CR974462.5	1201	CGTATGTTCACCACACACAAGCCTATTGGATTTCCTGGAACTGGGATTAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219364	CGTATGTTCACCACACACAAGCCTATTGGATTTCCTGGAACTGGGATTAC	219413

CR974462.5	1251	AGTTGGTTGTGAGCAACAAGTGCTCTTAAAGGCTTTCACAGGCACTTGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219414	AGTTGGTTGTGAGCAACAAGTGCTCTTAAAGGCTTTCACAGGCACTTGCA	219463

CR974462.5	1301	CTCATGTTGTGTAGAGACTTACACTGGCACACGCGTAAAAGGGAATATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219464	CTCATGTTGTGTAGAGACTTACACTGGCACACGCGTAAAAGGGAATATAA	219513

CR974462.5	1351	ATAATTGTGAAAAGATGGGGGAACCTTTATTTCAGGGAAACCCATTTTGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219514	ATAATTGTGAAAAGATGGGGGAACCTTTATTTCAGGGAAACCCATTTTGA	219563

CR974462.5	1401	GAAACCCAAGGATAAGAAAATTAAATCATCTCTTAAGAGTCCGGTCAGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219564	GAAACCCAAGGATAAGAAAATTAAATCATCTCTTAAGAGTCCGGTCAGCC	219613

CR974462.5	1451	ATTGGAGAGCTACCCCACCCCACCCCACCCCGCTCCTATTGAAATGCTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219614	ATTGGAGAGCTACCCCACCCCACCCCACCCCGCTCCTATTGAAATGCTGT	219663

CR974462.5	1501	AAGCCCAGAAGGCCGGACACAATGAGAGGAGGTGGGTTTAAAATTGAAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219664	AAGCCCAGAAGGCCGGACACAATGAGAGGAGGTGGGTTTAAAATTGAAGT	219713

CR974462.5	1551	TCGGGTCCTCTGAGAGCAGCTGGGCTTCTTTCTTGGTCCTGCAAATTGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219714	TCGGGTCCTCTGAGAGCAGCTGGGCTTCTTTCTTGGTCCTGCAAATTGGC	219763

CR974462.5	1601	AAGATGCCCACCACCGTGGAAGGAAGGCTGCAGAGCCGAAGTCTCCGCGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219764	AAGATGCCCACCACCGTGGAAGGAAGGCTGCAGAGCCGAAGTCTCCGCGC	219813

CR974462.5	1651	AGAGTGTTGACGTTCAGGCTTCCTCATCAACACCTGCGGACCTTGCCTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219814	AGAGTGTTGACGTTCAGGCTTCCTCATCAACACCTGCGGACCTTGCCTCC	219863

CR974462.5	1701	CCACCCTGGGCCGGGCGGGCATCACAGTGGTTTCCCCCTCTTCCTTTTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219864	CCACCCTGGGCCGGGCGGGCATCACAGTGGTTTCCCCCTCTTCCTTTTCT	219913

CR974462.5	1751	CCGCGGCTCTGCGGGAGAAGAAGACACCCCGCGGGATTTCATGAGCCTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219914	CCGCGGCTCTGCGGGAGAAGAAGACACCCCGCGGGATTTCATGAGCCTCT	219963

CR974462.5	1801	TTTCCTAGAGCTCCCAGCGGCAGCTTGCACGGCTTCTCCCCAAGCCCGCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	219964	TTTCCTAGAGCTCCCAGCGGCAGCTTGCACGGCTTCTCCCCAAGCCCGCG	220013

CR974462.5	1851	CCAGGTTATCCCGCGCTCCGCCTCCCGCCCTGCAAACCCAGGCAGTGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	220014	CCAGGTTATCCCGCGCTCCGCCTCCCGCCCTGCAAACCCAGGCAGTGAAG	220063

CR974462.5	1901	CACTGCCTTCTGTACCGGTCAAGACGACTCCGGGACAAACAGGGGGCCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	220064	CACTGCCTTCTGTACCGGTCAAGACGACTCCGGGACAAACAGGGGGCCCA	220113

CR974462.5	1951	CGGTTCGCACCAGGGGGCTCGGTCATAACGACAGTGGTGCAGTCTGAGAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030732.13	220114	CGGTTCGCACCAGGGGGCTCGGTCATAACGACAGTGGTGCAGTCTGAGAT	220163

Overview

Query
CR974462.5 - 228057 bps
Hit
CT030732.13 - 220163 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link