<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU062495.5	1	ATCGTTGGGCTGCAGAAATAACAGAGTACACTCTCCTGCGTGAAAGGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	76708	ATCGTTGGGCTGCAGAAATAACAGAGTACACTCTCCTGCGTGAAAGGTTT	76757

CU062495.5	51	ATATTGTGATAGTGATACTGAGTTTTTATGCTTTGTTAGATTGGATAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	76758	ATATTGTGATAGTGATACTGAGTTTTTATGCTTTGTTAGATTGGATAATT	76807

CU062495.5	101	GTTATTAGTAAACTTATAGAAATAGGAATATTTCAAATGATCTTACATTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	76808	GTTATTAGTAAACTTATAGAAATAGGAATATTTCAAATGATCTTACATTT	76857

CU062495.5	151	TGACTGAGTTCTTTCTAATTAATACATTTGGATATGTTGAAATTGGTATT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	76858	TGACTGAGTTCTTTCTAATTAATACATTTGGATATGTTGAAATTGGTATT	76907

CU062495.5	201	TGGACTTCTATTTTCTTTTTAAGCTCCTTAATTTAACTTTTTCATATACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	76908	TGGACTTCTATTTTCTTTTTAAGCTCCTTAATTTAACTTTTTCATATACA	76957

CU062495.5	251	GCTGTAATTATGATAATAATTCTGACTTCTAAGTTCAAATTACTGTTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	76958	GCTGTAATTATGATAATAATTCTGACTTCTAAGTTCAAATTACTGTTAAA	77007

CU062495.5	301	TGAAGAAGCTTCTAAAATAAAGTTAAATGAAGGAACTTATAGGCATAATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77008	TGAAGAAGCTTCTAAAATAAAGTTAAATGAAGGAACTTATAGGCATAATT	77057

CU062495.5	351	TTAGTTGTATATTAAATAGTTAATTGAACTTAGCATAATAATCATGTGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77058	TTAGTTGTATATTAAATAGTTAATTGAACTTAGCATAATAATCATGTGAT	77107

CU062495.5	401	ATATTTTATGACGTCGTAAGTTCCATTACTGTTGCCATTGGTTGAAGTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77108	ATATTTTATGACGTCGTAAGTTCCATTACTGTTGCCATTGGTTGAAGTTA	77157

CU062495.5	451	GAATGCTAAGAAATACTAATTTGCTTCCTGCTATCACCGTTTAAATTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77158	GAATGCTAAGAAATACTAATTTGCTTCCTGCTATCACCGTTTAAATTTTT	77207

CU062495.5	501	TCTGATTGATTTGGAACTTTGCAGGTAAACGAGGGAGAGTGTCTAACGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77208	TCTGATTGATTTGGAACTTTGCAGGTAAACGAGGGAGAGTGTCTAACGAA	77257

CU062495.5	551	CATAACTTATATATTTTAATCAATAACCTTCTGAGAATAACATTCTGCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77258	CATAACTTATATATTTTAATCAATAACCTTCTGAGAATAACATTCTGCAG	77307

CU062495.5	601	AGTTGCTTACAAGAACAGCAAGAAATACAATAACTGCCAGTAAATAACAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77308	AGTTGCTTACAAGAACAGCAAGAAATACAATAACTGCCAGTAAATAACAC	77357

CU062495.5	651	AACCTCTAGGAATTGGAGAGCCTAGCCTCTCTCAACCAAAACAACATAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77358	AACCTCTAGGAATTGGAGAGCCTAGCCTCTCTCAACCAAAACAACATAAA	77407

CU062495.5	701	AACAAGTGAATCTAACACATTCCTCCCTTATTCTCTTAAAAAATACACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77408	AACAAGTGAATCTAACACATTCCTCCCTTATTCTCTTAAAAAATACACAG	77457

CU062495.5	751	TTAAATTAAATTAAATTGGGCCCTGTGCCTAACATGAACATTTCAAATAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77458	TTAAATTAAATTAAATTGGGCCCTGTGCCTAACATGAACATTTCAAATAG	77507

CU062495.5	801	GAGGCCTACTAAAATTTTCCTTAGTACTCGTGTACTTAAGCTTTCGCAAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77508	GAGGCCTACTAAAATTTTCCTTAGTACTCGTGTACTTAAGCTTTCGCAAT	77557

CU062495.5	851	TAGTCATGCTATTGAATTTAAATACAGATTAAACTGTGTTTTAAAAATGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77558	TAGTCATGCTATTGAATTTAAATACAGATTAAACTGTGTTTTAAAAATGG	77607

CU062495.5	901	ACATTTGCTCTTGCTATTGATTTTCCTTGTGATATATCTGTAGAATGGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77608	ACATTTGCTCTTGCTATTGATTTTCCTTGTGATATATCTGTAGAATGGTG	77657

CU062495.5	951	TTATATACTACAGTGGTGGATTGAAAATAGAGCTTAGTTAAAAGTATGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77658	TTATATACTACAGTGGTGGATTGAAAATAGAGCTTAGTTAAAAGTATGTA	77707

CU062495.5	1001	GAGTATGTAACCGTTTTTATAACTGTTGCTTTTGCATGTTAATTGAATTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77708	GAGTATGTAACCGTTTTTATAACTGTTGCTTTTGCATGTTAATTGAATTT	77757

CU062495.5	1051	GTTTTGATATTTCAACTAGCTTATGCAGTTAGAGCAAATCAAAATAGTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77758	GTTTTGATATTTCAACTAGCTTATGCAGTTAGAGCAAATCAAAATAGTTT	77807

CU062495.5	1101	AAGAAATTTTTCTCGGTCAAGTTCTGAATCAAATAGACGAGGCTTATAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77808	AAGAAATTTTTCTCGGTCAAGTTCTGAATCAAATAGACGAGGCTTATAAC	77857

CU062495.5	1151	TTATACCAAGCATATGCCCTAAGAAGTAAGGACAGGTTTTAGCGTAAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77858	TTATACCAAGCATATGCCCTAAGAAGTAAGGACAGGTTTTAGCGTAAGAA	77907

CU062495.5	1201	AATAGCCATGGTCACGGTCTGGTAATGTTTTGAAGTGACAGAATGGACGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77908	AATAGCCATGGTCACGGTCTGGTAATGTTTTGAAGTGACAGAATGGACGT	77957

CU062495.5	1251	GGTCTGCTGCTAGTGTGTGCATGATGCATTAATATTGGAAAAATATCTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	77958	GGTCTGCTGCTAGTGTGTGCATGATGCATTAATATTGGAAAAATATCTTT	78007

CU062495.5	1301	ACTGCATTAAGTTGTTATATTTTTATCTATTTAATAACTTTGAACTGATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78008	ACTGCATTAAGTTGTTATATTTTTATCTATTTAATAACTTTGAACTGATC	78057

CU062495.5	1351	TTAAAAAAAAAAACTTTGAACTGATAATGCTTGGGCAGGAATCTCTTGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78058	TTAAAAAAAAAAACTTTGAACTGATAATGCTTGGGCAGGAATCTCTTGCA	78107

CU062495.5	1401	AAATTTCTGACAGGGTTCATCATCAGATGTGAACTCATAAACTGGATCGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78108	AAATTTCTGACAGGGTTCATCATCAGATGTGAACTCATAAACTGGATCGA	78157

CU062495.5	1451	GATACATGAACCAAATGCCGGACTTGTATAACATTTTTACTAAAGTAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78158	GATACATGAACCAAATGCCGGACTTGTATAACATTTTTACTAAAGTAATT	78207

CU062495.5	1501	GAAGAATGCTGCAGAATTTTGATTGGGGAATGTTGCAGATTGTGATTTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78208	GAAGAATGCTGCAGAATTTTGATTGGGGAATGTTGCAGATTGTGATTTAA	78257

CU062495.5	1551	CAGGGCAAGTCAAGAGATAGATGGAACTTTGGATGCTATTGTTAGAAGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78258	CAGGGCAAGTCAAGAGATAGATGGAACTTTGGATGCTATTGTTAGAAGAG	78307

CU062495.5	1601	GTTCCATCTGTTGCGGCATAAGTATTGTATCTAGTGTATGTCTTGTGCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78308	GTTCCATCTGTTGCGGCATAAGTATTGTATCTAGTGTATGTCTTGTGCAT	78357

CU062495.5	1651	CTAGTGTGGATAAAGTGTTAGTTTGTTTTAATTCAAGTTTAGTTTTAGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78358	CTAGTGTGGATAAAGTGTTAGTTTGTTTTAATTCAAGTTTAGTTTTAGTG	78407

CU062495.5	1701	ATAATCACAATTAGTGATTAATCACATTTTGTTTTTAGTTTGTTATGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78408	ATAATCACAATTAGTGATTAATCACATTTTGTTTTTAGTTTGTTATGAAG	78457

CU062495.5	1751	TTTGTTACAAGTTTGTTAGAGGTTAGCAAATAAGATCTAGAGTTTGTAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78458	TTTGTTACAAGTTTGTTAGAGGTTAGCAAATAAGATCTAGAGTTTGTAAC	78507

CU062495.5	1801	ATTGCTTGTGCTTCAAGAAACTTAGCTAGACATTGTATATAAGCTGCCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78508	ATTGCTTGTGCTTCAAGAAACTTAGCTAGACATTGTATATAAGCTGCCTC	78557

CU062495.5	1851	CTTTGTATATTTTCATGAGAATCAATAATAACAACTATTTTCTTCATTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78558	CTTTGTATATTTTCATGAGAATCAATAATAACAACTATTTTCTTCATTCT	78607

CU062495.5	1901	CTTAATCTTTTTCTTCTCTCATTCTCTCTATAATTCATAAATCTACAGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78608	CTTAATCTTTTTCTTCTCTCATTCTCTCTATAATTCATAAATCTACAGAC	78657

CU062495.5	1951	CCTAGAAACTACAAAATTGCTTCTGGTTTCATTGCTTGTTGAACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT030211.4	78658	CCTAGAAACTACAAAATTGCTTCTGGTTTCATTGCTTGTTGAACAAGCTT	78707

Overview

Query
CU062495.5 - 21022 bps
Hit
CT030211.4 - 78707 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001890200012000176708787071
Short-link