<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT573099.7	1	CTGGGGAGCAGGCGGCCGGGCGGGCGCGGCCTCCGGGTACCGCGGTGCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	88723	CTGGGGAGCAGGCGGCCGGGCGGGCGCGGCCTCCGGGTACCGCGGTGCTG	88772

CT573099.7	51	CCACCTGCGCAGCCACCGCGTCGCCATTGGCTCACGGAGAAGCCGCTCTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	88773	CCACCTGCGCAGCCACCGCGTCGCCATTGGCTCACGGAGAAGCCGCTCTA	88822

CT573099.7	101	ATCCGCGCCGCCTCCGCCCCCGCGCGGCGCTGCGCTCGGCGGAGTCTCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	88823	ATCCGCGCCGCCTCCGCCCCCGCGCGGCGCTGCGCTCGGCGGAGTCTCTG	88872

CT573099.7	151	ACCTTCCTCCTTCCCGCAGCCCCAGAGAGACGCGCGGCGGTCGCGCCAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	88873	ACCTTCCTCCTTCCCGCAGCCCCAGAGAGACGCGCGGCGGTCGCGCCAGC	88922

CT573099.7	201	CTTCTCCTCCTCCTTTTCCTCCTCCTCCCCCGGGAAGCCGGCCGGGCTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	88923	CTTCTCCTCCTCCTTTTCCTCCTCCTCCCCCGGGAAGCCGGCCGGGCTTG	88972

CT573099.7	251	AGGCTGGGCCGCCGCCGCCGCCCGCTTTGCCACCCGCCCCGCTGATGGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	88973	AGGCTGGGCCGCCGCCGCCGCCCGCTTTGCCACCCGCCCCGCTGATGGTG	89022

CT573099.7	301	TCCGGTGCTCCGGCGCCCAGGTAGGGGCTCTAGAGCGTGGAGAGAGCGCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89023	TCCGGTGCTCCGGCGCCCAGGTAGGGGCTCTAGAGCGTGGAGAGAGCGCG	89072

CT573099.7	351	GGTTTGGGGGTGGGGGTGGGGTAGTGTTGGGGGTTCGGGGAGTCCAGGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89073	GGTTTGGGGGTGGGGGTGGGGTAGTGTTGGGGGTTCGGGGAGTCCAGGGC	89122

CT573099.7	401	TTCAGTGCGTGATGCAGATGCTCAGTATATGATGGCGTTGAATACAGCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89123	TTCAGTGCGTGATGCAGATGCTCAGTATATGATGGCGTTGAATACAGCCG	89172

CT573099.7	451	AGGGCAGGTATCTGGGGAGAGGTAGGCGCGCGCCCCCGGATGCTCTTGGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89173	AGGGCAGGTATCTGGGGAGAGGTAGGCGCGCGCCCCCGGATGCTCTTGGC	89222

CT573099.7	501	TTGACCCAGCCAGTGCCAGAATGACCCCTTGAGGATGCTAAGGGGGAGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89223	TTGACCCAGCCAGTGCCAGAATGACCCCTTGAGGATGCTAAGGGGGAGGC	89272

CT573099.7	551	CTTTACCCTGGGGAAAGGGGAAGAAGCATGATCGTTGGGAAGCTGGGGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89273	CTTTACCCTGGGGAAAGGGGAAGAAGCATGATCGTTGGGAAGCTGGGGCT	89322

CT573099.7	601	GCCCCCCCCCCCCGGTGTTGTATGTTTTTCTGGGGCCAGCTGGGATGGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89323	GCCCCCCCCCCCCGGTGTTGTATGTTTTTCTGGGGCCAGCTGGGATGGGT	89372

CT573099.7	651	GGGCCGATGCCAGCTTGGTGCGTATGTTATTTCTGGATCAGAGTGGGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89373	GGGCCGATGCCAGCTTGGTGCGTATGTTATTTCTGGATCAGAGTGGGCTG	89422

CT573099.7	701	GGGAGAAGCACAGGCGGCGATGTCTGGTTTAGATTACAGGTACTTCCTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89423	GGGAGAAGCACAGGCGGCGATGTCTGGTTTAGATTACAGGTACTTCCTTC	89472

CT573099.7	751	TTTGCTTCCGACCCCTCCCCCCACCAGCTGGGGGTGGGAGGTGGAAGGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89473	TTTGCTTCCGACCCCTCCCCCCACCAGCTGGGGGTGGGAGGTGGAAGGAA	89522

CT573099.7	801	AGAGGAGGTGGCGATGCTGAGGGCCCCCGCAGATGCTGCAGAATCCTCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89523	AGAGGAGGTGGCGATGCTGAGGGCCCCCGCAGATGCTGCAGAATCCTCTC	89572

CT573099.7	851	TGCGCCAGCCACACCGCCTTCTCCCTCCACCAACCTCAGCCCATTTGGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89573	TGCGCCAGCCACACCGCCTTCTCCCTCCACCAACCTCAGCCCATTTGGTC	89622

CT573099.7	901	ACGGTTGGGGCGCTCTCCCGGTTGTGTTCACCTTTGAGGAGGCTGTGGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89623	ACGGTTGGGGCGCTCTCCCGGTTGTGTTCACCTTTGAGGAGGCTGTGGAA	89672

CT573099.7	951	AGGTTAAAGGGTCATTAATGTGTCTGCGACACAGTGGCAAACCCCAGAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89673	AGGTTAAAGGGTCATTAATGTGTCTGCGACACAGTGGCAAACCCCAGAGC	89722

CT573099.7	1001	TTGGCTAGACTCAGCTTCAAACCCCCGATTTTTAAGTTCCAGCCTTGCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89723	TTGGCTAGACTCAGCTTCAAACCCCCGATTTTTAAGTTCCAGCCTTGCCC	89772

CT573099.7	1051	CCACCCCCACCTCCCCCAAGCACAGCTCTGCAGCCTGGGGGAACTTAAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89773	CCACCCCCACCTCCCCCAAGCACAGCTCTGCAGCCTGGGGGAACTTAAAC	89822

CT573099.7	1101	ATGAGGCACCTTCTTTTTCTAGGCACAACCAGAAATAGCCCATTGTCAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89823	ATGAGGCACCTTCTTTTTCTAGGCACAACCAGAAATAGCCCATTGTCAGG	89872

CT573099.7	1151	GGCCCCAGCACAGCTGGGGTGCAGATTGCCAGTGGTCTGGGAAGCTCTGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89873	GGCCCCAGCACAGCTGGGGTGCAGATTGCCAGTGGTCTGGGAAGCTCTGC	89922

CT573099.7	1201	CCGCAGCCTGGTTTTCTTATCAGATGTTTGCCCGTTACTCAGATCACTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89923	CCGCAGCCTGGTTTTCTTATCAGATGTTTGCCCGTTACTCAGATCACTCT	89972

CT573099.7	1251	TTCTAAGCAGCTTCCTGACTCCCCAGGGGAGAGGTCACCTCTGGCCCCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	89973	TTCTAAGCAGCTTCCTGACTCCCCAGGGGAGAGGTCACCTCTGGCCCCAT	90022

CT573099.7	1301	GTTCTTGAACCCTGTCAACCCGGAGGTTACTTATGTCTGGCCTGTCCCCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90023	GTTCTTGAACCCTGTCAACCCGGAGGTTACTTATGTCTGGCCTGTCCCCC	90072

CT573099.7	1351	TCTAGACCAAAGGGCCTTCAGGCTAAGAATCTGACTTGTCTCTGACATTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90073	TCTAGACCAAAGGGCCTTCAGGCTAAGAATCTGACTTGTCTCTGACATTG	90122

CT573099.7	1401	TCAGTGTCTGAGAAGGGCTCCTCACTGAAGAAATGTTTTCACTATGAACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90123	TCAGTGTCTGAGAAGGGCTCCTCACTGAAGAAATGTTTTCACTATGAACA	90172

CT573099.7	1451	AACGAACAAATGAACGAATGAATGAATGAATGAATGAATATGTAAACTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90173	AACGAACAAATGAACGAATGAATGAATGAATGAATGAATATGTAAACTTT	90222

CT573099.7	1501	GGGCAATAGCTACCAAGCTGGAAAATGGAGGGGAACCCCTTTGGTCTTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90223	GGGCAATAGCTACCAAGCTGGAAAATGGAGGGGAACCCCTTTGGTCTTTC	90272

CT573099.7	1551	TATTCCCCCGGACCAAAGAGCCACCAAGAAACTCCTTTAAGCCTGGGGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90273	TATTCCCCCGGACCAAAGAGCCACCAAGAAACTCCTTTAAGCCTGGGGTT	90322

CT573099.7	1601	GAATGTCAGCTGTGACTATTGGTGGGGCTTCTGTCCTGTTGGTTCCTGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90323	GAATGTCAGCTGTGACTATTGGTGGGGCTTCTGTCCTGTTGGTTCCTGAC	90372

CT573099.7	1651	TGACTCGTTGGCCGCCCTGTGTCCCCGGGGAGCCTGGCCCTTTGCTTAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90373	TGACTCGTTGGCCGCCCTGTGTCCCCGGGGAGCCTGGCCCTTTGCTTAAG	90422

CT573099.7	1701	GTCTTCCTTTCCTCAAGCGTCTGCGGTGGTGATTTCTCCTCCAGTGCTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90423	GTCTTCCTTTCCTCAAGCGTCTGCGGTGGTGATTTCTCCTCCAGTGCTCC	90472

CT573099.7	1751	ATCTCAACTGTCACAAGACAATCTGGGTCAGCTTCCAGGGCTGGGACGGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90473	ATCTCAACTGTCACAAGACAATCTGGGTCAGCTTCCAGGGCTGGGACGGC	90522

CT573099.7	1801	CCCAGCCGGGCTCTTCTAGGTCTTTGGGGTCTTATGAGTAAACTGTGTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90523	CCCAGCCGGGCTCTTCTAGGTCTTTGGGGTCTTATGAGTAAACTGTGTGT	90572

CT573099.7	1851	GTAAAAGGTGACATGGGCCCTGGCAGAGAGCCCTTTTGGCTTGCCTTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90573	GTAAAAGGTGACATGGGCCCTGGCAGAGAGCCCTTTTGGCTTGCCTTGTT	90622

CT573099.7	1901	CCTTTGACAGGTGCACAGCTCTCCCTGAGTAGGGCTGTACCACCCTGCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90623	CCTTTGACAGGTGCACAGCTCTCCCTGAGTAGGGCTGTACCACCCTGCCA	90672

CT573099.7	1951	GTCAGCTGACTCCTCTTCCTCCCTCTCTTGCTTTCCATCGCTCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT027568.16	90673	GTCAGCTGACTCCTCTTCCTCCCTCTCTTGCTTTCCATCGCTCTGAATTC	90722

Overview

Query
CT573099.7 - 82473 bps
Hit
CT027568.16 - 90722 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link