<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5204 bps / non-identical: 250 bps

Full alignment

AC130799.19	128102	AAGCTTATGACTTTTATTGTAATTATGCAAGATGTCATGGTTTTGTGGTA	128151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1	AAGCTTATGACTTTTATTGTAATTATGCAAGATGTCATGGTTTTGTGGTA	50

AC130799.19	128152	AGGAAAGATGAGGTGATTAATAGGAAAAAAGATCATAGATCTAGCAGTCG	128201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	51	AGGAAAGATGAGGTGATTAATAGGAAAAAAGATCATAGATCTAGCAGTCG	100

AC130799.19	128202	AACTAATTGCCAAGCTAGGTTTCGTGTATGCTACAAGTTGAAAGCATCAA	128251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	101	AACTAATTGCCAAGCTAGGTTTCGTGTATGCTACAAGTTGAAAGCATCAA	150

AC130799.19	128252	GATGGGAAGTGAGATGTTTTGAAGAGGTTCATAACCATGAACTAACTCCT	128301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	151	GATGGGAAGTGAGATGTTTTGAAGAGGTTCATAACCATGAACTAACTCCT	200

AC130799.19	128302	TCACACTTGGTAGCTTGCTGTGGAATGAAGGATGCTGATAAAATCTCAGG	128351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	201	TCACACTTGGTAGCTTGCTGTGGAATGAAGGATGCTGATAAAATCTCAGG	250

AC130799.19	128352	CTGATAGTACGGATGATGTTATAACTGGTTATATAATGGGGCACGCTGTG	128401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	251	CTGATAGTACGGATGATGTTATAACTGGTTATATAATGGGGCACGCTGTG	300

AC130799.19	128402	GCTCAAAAGGGTGCATATGTTGGTGTTGGTTTTTCAAAGAAAAATCTATA	128451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	301	GCTCAAAAGGGTGCATATGTTGGTGTTGGTTTTTCAAAGAAAAATCTATA	350

AC130799.19	128452	CAACGGTTTTAATAGCAAAATCCGTGGTAAGGTTAAAGATGGTGATGTTG	128501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	351	CAACGGTTTTAATAGCAAAATCCGTGGTAAGGTTAAAGATGGTGATGTTG	400

AC130799.19	128502	TTGCTGCCTTAAGTTATCTTAGTGGGAAGGCGAGCAATGACCCTATGCTA	128551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	401	TTGCTGCCTTAAGTTATCTTAGTGGGAAGGCGAGCAATGACCCTATGCTA	450

AC130799.19	128552	TATGCAAAATTTACAACTACCGATGATGGTAGATTGAAGCAACTTTTTTG	128601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	451	TATGCAAAATTTACAACTACCGATGATGGTAGATTGAAGCAACTTTTTTG	500

AC130799.19	128602	GGCAGATGGATGTAGCATATCTGATTATCTATGTTTCAACGATGTTCTTG	128651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	501	GGCAGATGGATGTAGCATATCTGATTATCTATGTTTCAACGATGTTCTTG	550

AC130799.19	128652	TACTTACACCACGCACGAGAAGAACAAATACAATTGTCCATTGGTAATTT	128701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	551	TACTTACACCACGCACGAGAAGAACAAATACAATTGTCCATTGGTAATTT	600

AC130799.19	128702	TCTCCGGGTGCAATCATCATTCTCAACCAATTATATTTGGTTGTGCTTTG	128751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	601	TCTCCGGGTGCAATCATCATTCTCAACCAATTATATTTGGTTGTGCTTTG	650

AC130799.19	128752	ATGTCGGATGAAACAATTGAGACCTATAAGTGGGTCTTAAAATCTTTTTC	128801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	651	ATGTCGGATGAAACAATTGAGACCTATAAGTGGGTCTTAAAATCTTTTTC	700

AC130799.19	128802	AGAAGCAATGCGAAATAAACATCCCAAAGTTGTTGTGACAAATGGGGATG	128851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	701	AGAAGCAATGCGAAATAAACATCCCAAAGTTGTTGTGACAAATGGGGATG	750

AC130799.19	128852	AGGTCATGATGGAGGCTATAAAACATGTTTTTCCGGATTCATGTCATCAA	128901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	751	AGGTCATGATGGAGGCTATAAAACATGTTTTTCCGGATTCATGTCATCAA	800

AC130799.19	128902	CTATGTGTTTGGAACTTGCACAAGAATGCATGTAAAAATGTCGAGAGTTC	128951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	801	CTATGTGTTTGGAACTTGCACAAGAATGCATGTAAAAATGTCGAGAGTTC	850

AC130799.19	128952	TTCATTTTTGGAGGATTTCAAAAAGGCAACTTACTCAAATTTCAGCCCGA	129001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	851	TTCATTTTTGGAGGATTTCAAAAAGGCAACTTACTCAAATTTCAGCCCGA	900

AC130799.19	129002	AAGAATTTGAAGATTTTTGGATAAAGATGGTTGTGCAGCACGAAATTGCG	129051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	901	AAGAATTTGAAGATTTTTGGATAAAGATGGTTGTGCAGCACGAAATTGCG	950

AC130799.19	129052	GGGAATGAATGGGTTTCTAGAACCTATGAGAATAGGTCATTGTGGGCCAA	129101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	951	GGGAATGAATGGGTTTCTAGAACCTATGAGAATAGGTCATTGTGGGCCAA	1000

AC130799.19	129102	TGCATACCTCCGTGATAAGTTTTTTGGTTGTATATAAACTACGTGTCATT	129151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1001	TGCATACCTCCGTGATAAGTTTTTTGGTTGTATATAAACTACGTGTCATT	1050

AC130799.19	129152	GTGAAGCTATTAATTCAATCATCACGGAATATATTAGGCTTAATTGCACT	129201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1051	GTGAAGCTATTAATTCAATCATCACGGAATATATTAGGCTTAATTGCACT	1100

AC130799.19	129202	TTTGGACCTCTATCTTTTCAAAAGTTGCGGTTATGGACCCCTAACTAATT	129251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1101	TTTGGACCTCTATCTTTTCAAAAGTTGCGGTTATGGACCCCTAACTAATT	1150

AC130799.19	129252	TAAATACAAATCAGCCCCCTATGTATTGATTCTTTGGTAGTTTTGAACCC	129301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1151	TAAATACAAATCAGCCCCCTATGTATTGATTCTTTGGTAGTTTTGAACCC	1200

AC130799.19	129302	CCACTTCAGTGTTGACTCGGTCAACGCTGACGTGGCACCCTAAGTGAGGT	129351
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1201	CCATTTCAGTGTTGACTCGGTCAACGCTGACGTGGCACCCTAAGTGAGGT	1250

AC130799.19	129352	GCCATGTGTCAAATTTTTTATTTTTATTTTGCCTTGGGGGGCCAAAACTG	129401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1251	GCCATGTGTCAAATTTTTTATTTTTATTTTGCCTTGGGGGGCCAAAACTG	1300

AC130799.19	129402	CCAAATAATCAAAACATATGGGGCTGTTTTGTATTTAAATTAGTTAGGGA	129451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1301	CCAAATAATCAAAACATATGGGGCTGTTTTGTATTTAAATTAGTTAGGGA	1350

AC130799.19	129452	TCCATAACCGCAACTTTTGGAAAAATAGGGGTCCAAAAGTGCAATTAAGC	129501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1351	TCCATAACCGCAACTTTTGGAAAAATAGGGGTCCAAAAGTGCAATTAAGC	1400

AC130799.19	129502	CAATATATTATGAAGAAAATCAGCGTTTTTGAATTTATGCTTAGTTTTGA	129551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1401	CAATATATTATGAAGAAAATCAGCGTTTTTGAATTTATGCTTAGTTTTGA	1450

AC130799.19	129552	GCAGACTTTGAGAAAATATAGAAACAATGAGCTGATGGCTGATAACAAGT	129601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1451	GCAGACTTTGAGAAAATATAGAAACAATGAGCTGATGGCTGATAACAAGT	1500

AC130799.19	129602	CTTTATATTCAGAACCTGTGTTGGCCAAGTCTCTTCAAGAGTTTGAGAAT	129651
			||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1501	CTTTATATTCAGAACCTGTGTTGACCAAGTCTCTTCAAGAGTTTGAGAAT	1550

AC130799.19	129652	GATTCTGCAAAAATTTACACAACAGAGATTTTTAAGGAAGTTAAAGAGCA	129701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1551	GATTCTGCAAAAATTTACACAACAGAGATTTTTAAGGAAGTTAAAGAGCA	1600

AC130799.19	129702	GATTGCATTGGCTGGTGCATTAAATGTTATTAAGCGAATGGTAAATGGGA	129751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1601	GATTGCATTGGCTGGTGCATTAAATGTTATTAAGCGAATGGTAAATGGGA	1650

AC130799.19	129752	AGAAGGTTATCTTCAAGCTAATCAAGTATTGCCATCCCAATATTGAAACA	129801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1651	AGAAGGTTATCTTCAAGCTAATCAAGTATTGCCATCCCAATATTGAAACA	1700

AC130799.19	129802	AAAGTTGTTTATGATACTTCTAAGTCAACATTTTATTGTGTGTGTAGACA	129851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1701	AAAGTTGTTTATGATACTTCTAAGTCAACATTTTATTGTGTGTGTAGACA	1750

AC130799.19	129852	TTTTGAGTCTCGTGGCATTCCGTGTTCGCATATTTTTCGTGCAATGATCT	129901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1751	TTTTGAGTCTCGTGGCATTCCGTGTTCGCATATTTTTCGTGCAATGATCT	1800

AC130799.19	129902	TTGAGCATGTGGATCATATTCCAAGCAATTTGGTTTTGACACGGTGGACT	129951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1801	TTGAGCATGTGGATCATATTCCAAGCAATTTGGTTTTGACACGGTGGACT	1850

AC130799.19	129952	AAGAATGCTAAGATTGCTTTACTGTCATCGAATTTGATGGATGGAATGAA	130001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1851	AAGAATGCTAAGATTGCTTTACTGTCATCGAATTTGATGGATGGAATGAA	1900

AC130799.19	130002	CTATGATGTAGAGTTCGCTCAGTTTGCAGCCTATGATGCTTTTACTAGAT	130051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1901	CTATGATGTAGAGTTCGCTCAGTTTGCAGCCTATGATGCTTTTACTAGAT	1950

AC130799.19	130052	TGTGGCAGGTAGCCGTAAAAAGTAAGGAACACTACAATGAGATCATGGAT	130101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1951	TGTGGCAGGTAGCCGTAAAAAGTAAGGAACACTACAATGAGATCATGGAT	2000

AC130799.19	130102	GACATATTGAAGCTTACTAACAAATATAAGAAGATGGAGGATCTTGTTGA	130151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2001	GACATATTGAAGCTTACTAACAAATATAAGAAGATGGAGGATCTTGTTGA	2050

AC130799.19	130152	CGCGCAAAGCTCGTCACCAAAGCACATTGGTGATCCCAACAGAGTTGAGA	130201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2051	CGCGCAAAGCTCGTCACCAAAGCACATTGGTGATCCCAACAGAGTTGAGA	2100

AC130799.19	130202	CTAAAGATACTCCCAAGAATAAAAAGTTTGGCACAAAGAGGGCAGGTCAG	130251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2101	CTAAAGATACTCCCAAGAATAAAAAGTTTGGCACAAAGAGGGCAGGTCAG	2150

AC130799.19	130252	TGTTAAAACTGTAATAGCACAAAATACAAGGTTAAACCATGTCAAATGCA	130301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2151	TGTTAAAACTGTAATAGCACAAAATACAAGGTTAAACCATGTCAAATGCA	2200

AC130799.19	130302	TGCTGGTGTAAATGATAAGAGTATGAATGATGATCAGTCATCTTGTCCGG	130351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2201	TGCTGGTGTAAATGATAAGAGTATGAATGATGATCAGTCATCTTGTCCGG	2250

AC130799.19	130352	AGCCTTCTAAATTCAGCATGACAGCTGATAGAAGTTTTTTTTTTTTTTTT	130401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2251	AGCCTTCTAAATTCAGCATGACAGCTGATAGAAGTTTTTTTTTTTTTTTT	2300

AC130799.19	130402	TTT---ATTGTGTATGAATTGAAATGTTTTTATTTTATTTTGCAGGATAA	130448
			|||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2301	TTTTTTATTGTGTATGAATTGAAATGTTTTTATTTTATTTTGCAGGATAA	2350

AC130799.19	130449	AGAAATACTGGCATCTGGTTTAAACAATGTTCTTGACACTGTATGATCTC	130498
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2351	AGAAATACTGGCATCTGGTTTAAACAATGTTCTTGACACTGTATGATCTC	2400

AC130799.19	130499	CTAACCTTGAAATTTATAGGGGCGAAGTAAATCAAGTTTTGTTTTTGTAT	130548
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2401	CTAACCTTGAAATTTATAGGGGCGAAGTAAATCAAGTTTTGTTTTTGTAT	2450

AC130799.19	130549	TTACTTTGAAGTAATAGTTTTTCCTATATTTCAGAAAGATAAACGTAGTG	130598
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2451	TTACTTTGAAGTAATAGTTTTTCCTATATTTCAGAAAGATAAACGTAGTG	2500

AC130799.19	130599	AATGTTGTAATCAGAAGCAAAAGAAAGCAAAAGAGCTGACACAAAAATCA	130648
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2501	AATGTTGTAATCAGAAGCAAAAGAAAGCAAAAGAGCTGACACAAAAATCA	2550

AC130799.19	130649	AATAATTACGGCGTAAGTACATAATTGTCCCTATCTGCAGTTTGAGTAAT	130698
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2551	AATAATTACGGCGTAAGTACATAATTGTCCCTATCTGCAGTTTGAGTAAT	2600

AC130799.19	130699	TGTTACGTACATAGTTTGACAATGTGTTATATTTTTATTTAATTGTATAA	130748
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2601	TGTTACGTACATAGTTTGACAATGTGTTATATTTTTATTTAATTGTATAA	2650

AC130799.19	130749	GCGATTGTTATTATAATTTAAATATTTGGATATTTTTTTGTTGGACAATC	130798
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2651	GCGATTGTTATTATAATTTAAATATTTGGATATTTTTTTGTTGGACAATC	2700

AC130799.19	130799	TTACAGACTGGTTGTTCTAGTGGAGGTCACCATGTTAATTCCCAAATGCA	130848
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2701	TTACAGACTGGTTGTTCTAGTGGAGGTCACCATGTTAATTCCCAAATGCA	2750

AC130799.19	130849	GTTTATATTACCTAAAATGCATTCCTCACCATATGGTTATGTCACTCCAA	130898
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2751	GTTTATATTACCTAAAATGCATTCCTCACCATATGGTTATGTCACTCCAA	2800

AC130799.19	130899	GCCATGGATGGCGGAACTTGCCCAACTTTAGTGGAGTTCCTGTTTTACCA	130948
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2801	GCCATGGATGGCGGAACTTGCCCAACTTTAGTGGAGTTCCTGTTTTACCA	2850

AC130799.19	130949	CAAGCACCCCAGGTTGCGAATTTGCTTGTGATAATTTAATTTTGATATCA	130998
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2851	CAAGCACCCCAGGTTGCGAATTTGCTTGTGATAATTTAATTTTGATATCA	2900

AC130799.19	130999	TTTTCTTTGTTTCATGTGTATCATTTGTATGTTAAGCTTTAAAATATTTT	131048
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2901	TTTTCTTTGTTTCATGTGTATCATTTGTATGTTAAGCTTTAAAATATTTT	2950

AC130799.19	131049	GTCTCAGTATTATTATGGAGTGCCAGCTGGTAATAATAATACTACGTCTC	131098
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2951	GTCTCAGTATTATTATGGAGTGCCAGCTGGTAATAATAATACTACGTCTC	3000

AC130799.19	131099	ATATGGGATCGAGTTCTATTTAGTGTAATGCTAAAGTGTATTTAAGGTGT	131148
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3001	ATATGGGATCGAGTTCTATTTAGTGTAATGCTAAAGTGTATTTAAGGTGT	3050

AC130799.19	131149	AAAGATGAGATTTTATTTTATAAGCCACTTGATATTGGTGTTAACATTGT	131198
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3051	AAAGATGAGATTTTATTTTATAAGCCACTTGATATTGGTGTTAACATTGT	3100

AC130799.19	131199	AATATTCATATTTTAGGTGGAAAGGGTATTCAACCTCAGTAGTTCCTCCC	131248
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3101	AATATTCATATTTTAGGTGGAAAGGGTATTCAACCTCAGTAGTTCCTCCC	3150

AC130799.19	131249	AAATAGAGTACAAGGTATTTGTCTCCAATGGACTGTATTTGTTGTGTGTA	131298
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3151	AAATAGAGTACAAGGTATTTGTCTCCAATGGACTGTATTTGTTGTGTGTA	3200

AC130799.19	131299	AACCTGATTTTTTATAAAATTGATAGAGTAGTTATAAGTTATTTGCTATC	131348
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3201	AACCTGATTTTTTATAAAATTGATAGAGTAGTTATAAGTTATTTGCTATC	3250

AC130799.19	131349	AATCACATACTCGGACACCGGACACGGCACTAAAAAATCGACATCAGTGA	131398
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
CT009545.5	3251	AATCACATACTCGGACACCGGACACGGCACTAAGAAATCGACATCAGTGA	3300

AC130799.19	131399	TAATTTAAAAAATTGAATTAATTGAATGTAATTACATGTGTCGGCGCCCA	131448
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
CT009545.5	3301	TAATTTAAAAAATTGAATTAATTGAATGTAATTACATGTGTCGGTGTCCA	3350

AC130799.19	131449	CACCTATATGTATCAAACATTGTACACGCTTTCCATCATAAGTGCCATTG	131498
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3351	CACCTATATGTATCAAACATTGTACACGCTTTCCATCATAAGTGCCATTG	3400

AC130799.19	131499	CTACAGAGGTCATTTGGATGAAGTTATTGCTAACAATGATTATGATTGCA	131548
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3401	CTACAGAGGTCATTTGGATGAAGTTATTGCTAACAATGATTATGATTGCA	3450

AC130799.19	131549	GCTTCTGATGGCATTCATGGAAGGGCATTTTGAATTTTGACGCATTGGTA	131598
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3451	GCTTCTGATGGCATTCATGGAAGGGCATTTTGAATTTTGACGCATTGGTA	3500

AC130799.19	131599	GAAGAGCATTCAAAGGTTTCCAGTTTCTTTCCCTCTTTTTTTGTAGTTCA	131648
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3501	GAAGAGCATTCAAAGGTTTCCAGTTTCTTTCCCTCTTTTTTTGTAGTTCA	3550

AC130799.19	131649	TGCCTTTGGGCTGTAGCCATAGTTTTTAATACATAGACCTTGTTTGAGCT	131698
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3551	TGCCTTTGGGCTGTAGCCATAGTTTTTAATACATAGACCTTGTTTGAGCT	3600

AC130799.19	131699	GTAATTTTAATACAATCCTGAAATACTATGCACAATATATATCCTGAATT	131748
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3601	GTAATTTTAATACAATCCTGAAATACTATGCACAATATATATCCTGAATT	3650

AC130799.19	131749	ATTATCATTTTGATGTTTTATTATTTATTTATAAATTTTAAGCTAGCTAT	131798
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3651	ATTATCATTTTGATGTTTTATTATTTATTTATAAATTTTAAGCTAGCTAT	3700

AC130799.19	131799	TTATGTTTGTCATCACAAGGTGGGTGGTGCGCTTGTGATAGATTTGACAA	131848
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3701	TTATGTTTGTCATCACAAGGTGGGTGGTGCGCTTGTGATAGATTTGACAA	3750

AC130799.19	131849	ATACGTCAACGAGAGAAGTGATTGTTTAGTTTAATTGTGGATAAATTAAT	131898
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3751	ATACGTCAACGAGAGAAGTGATTGTTTAGTTTAATTGTGGATAAATTAAT	3800

AC130799.19	131899	TGATCATGAGAAGAGATCCCTGGTCATTACAGTTGAAATAAGCAACATCT	131948
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3801	TGATCATGAGAAGAGATCCCTGGTCATTACAGTTGAAATAAGCAACATCT	3850

AC130799.19	131949	TGTGTTTTGATTGGACATTAATGCTTTGGTGCATTATAATTTAGAACTGA	131998
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3851	TGTGTTTTGATTGGACATTAATGCTTTGGTGCATTATAATTTAGAACTGA	3900

AC130799.19	131999	GGGAGACATAAATTGCTTGGAATGCTTGTAAAGAGAAGACTTGTTGGTGG	132048
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3901	GGGAGACATAAATTGCTTGGAATGCTTGTAAAGAGAAGACTTGTTGGTGG	3950

AC130799.19	132049	GCCAATTTTATTGTGCACAAGTGAGACAAGTCTTGCATCATGCACAAATT	132098
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	3951	GCCAATTTTATTGTGCACAAGTGAGACAAGTCTTGCATCATGCACAAATT	4000

AC130799.19	132099	AGTTTTTGACATTACATCGATAAATTCCACCATTAAATTAAATGAAATAT	132148
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4001	AGTTTTTGACATTACATCGATAAATTCCACCATTAAATTAAATGAAATAT	4050

AC130799.19	132149	ATGATTTATTGGATCAATGATGAAAAAGACACATGTACATGACGTGGGAC	132198
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4051	ATGATTTATTGGATCAATGATGAAAAAGACACATGTACATGACGTGGGAC	4100

AC130799.19	132199	CATTTTACTTGTGCATATTAGACAAAAAGCCACGTTGGTGACATTAGATG	132248
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4101	CATTTTACTTGTGCATATTAGACAAAAAGCCACGTTGGTGACATTAGATG	4150

AC130799.19	132249	TGGAAATTTGAGGTGTTAGGATGTTGGCTATGTAATTTTTTTTTGGCTTA	132298
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4151	TGGAAATTTGAGGTGTTAGGATGTTGGCTATGTAATTTTTTTTTGGCTTA	4200

AC130799.19	132299	AGTGCACTTTCAATCACCCTTTTTAAAAATCTCAACCTTTAAATAATTGA	132348
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4201	AGTGCACTTTCAATCACCCTTTTTAAAAATCTCAACCTTTAAATAATTGA	4250

AC130799.19	132349	GTAATTTTTCCAACACAAATAAGAATAAGCCAAATGACTAATGAGTAAAC	132398
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4251	GTAATTTTTCCAACACAAATAAGAATAAGCCAAATGACTAATGAGTAAAC	4300

AC130799.19	132399	TTACAAGTTCTACCCACAAACTAGTTTTTACTCCACTTGTACGTCGGATT	132448
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4301	TTACAAGTTCTACCCACAAACTAGTTTTTACTCCACTTGTACGTCGGATT	4350

AC130799.19	132449	ATCCATAATTCTTAAAAGACAACCTAAAAAAAACATTACAAAGAACATTA	132498
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4351	ATCCATAATTCTTAAAAGACAACCTAAAAAAAACATTACAAAGAACATTA	4400

AC130799.19	132499	CAAAGTGTGTTGTTAAGACATAAACTGAAATTGAACTGGATTTAGTGCAG	132548
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4401	CAAAGTGTGTTGTTAAGACATAAACTGAAATTGAACTGGATTTAGTGCAG	4450

AC130799.19	132549	TTACAGTTGAACGTTGTAATAGATCTAAGCCGTCTGATCTTCAAACAACG	132598
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4451	TTACAGTTGAACGTTGTAATAGATCTAAGCCGTCTGATCTTCAAACAACG	4500

AC130799.19	132599	GCTGAGATCGTTTTATCATGTAAAATTGAATTTAAAATTTAAACTGTTTG	132648
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4501	GCTGAGATCGTTTTATCATGTAAAATTGAATTTAAAATTTAAACTGTTTG	4550

AC130799.19	132649	ATCTCAAATCAATGATCGAGATTAGCTACAACGTGAAACAATGTGTTTTT	132698
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4551	ATCTCAAATCAATGATCGAGATTAGCTACAACGTGAAACAATGTGTTTTT	4600

AC130799.19	132699	TCTACGGCATAGGATCCGAAATACCTTCTTAAATTTTCAAAAACATTACA	132748
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4601	TCTACGGCATAGGATCCGAAATACCTTCTTAAATTTTCAAAAACATTACA	4650

AC130799.19	132749	TGATTGAATATTAAAAACATTCATATAGAACCTTACTAAAACGACCCTCA	132798
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4651	TGATTGAATATTAAAAACATTCATATAGAACCTTACTAAAACGACCCTCA	4700

AC130799.19	132799	CTTCTCCTATAAATAGAGAATCCCAATCAATCCCTTTTCATGATTGCGTT	132848
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4701	CTTCTCCTATAAATAGAGAATCCCAATCAATCCCTTTTCATGATTGCGTT	4750

AC130799.19	132849	CATTTGAGTACTCAGTACACTCTTGAGAGCTAATTAACCAAAACTAAGCT	132898
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4751	CATTTGAGTACTCAGTACACTCTTGAGAGCTAATTAACCAAAACTAAGCT	4800

AC130799.19	132899	AAAAAAAACCTCCCTTTCATGGCATCATCAAACCCCCAAACTCTTCCCAC	132948
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4801	AAAAAAAACCTCCCTTTCATGGCATCATCAAACCCCCAAACTCTTCCCAC	4850

AC130799.19	132949	CACCACTCCCACAAGACTCACCACCATACAAAAAGTAAAAAACAACTTAA	132998
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4851	CACCACTCCCACAAGACTCACCACCATACAAAAAGTAAAAAACAACTTAA	4900

AC130799.19	132999	ATTTCCATTCAACATTATCTGAACTCAATGGAGCCATGGGTGACCTTGGC	133048
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4901	ATTTCCATTCAACATTATCTGAACTCAATGGAGCCATGGGTGACCTTGGC	4950

AC130799.19	133049	ACATACATACCAATAGTACTTTCACTCACCCTTTCCAAAAACCTCAACCT	133098
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	4951	ACATACATACCAATAGTACTTTCACTCACCCTTTCCAAAAACCTCAACCT	5000

AC130799.19	133099	TGGCACCACTTTGATTTTCACCGGCTTCTATAACTTCCTCACCGGTGCCA	133148
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	5001	TGGCACCACTTTGATTTTCACCGGCTTCTATAACTTCCTCACCGGTGCCA	5050

AC130799.19	133149	TGTACGGTGTTCCTATGCCAGTTCAGCCCATGAAATCCATAGCTGCCGTT	133198
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	5051	TGTACGGTGTTCCTATGCCAGTTCAGCCCATGAAATCCATAGCTGCCGTT	5100

AC130799.19	133199	GCACTCTCCGACCCCTCTTTCGGTATCCCGGAGATCATGGCTTCCGGTAT	133248
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	5101	GCACTCTCCGACCCCTCTTTCGGTATCCCGGAGATCATGGCTTCCGGTAT	5150

AC130799.19	133249	CTTAACCGGAGCTGTTTTATTGGTTTTGGGTTTTACTGGGTTGATGAAAT	133298
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	5151	CTTAACCGGAGCTGTTTTATTGGTTTTGGGTTTTACTGGGTTGATGAAAT	5200

AC130799.19	133299	TGGCTTA	133305
			|||||||
CT009545.5	5201	TGGCTTA	5207

Compact alignment

skip 1200 bps 100% identity alignment

AC130799.19	129302	CCACTTCAGTGTTGACTCGGTCAACGCTGACGTGGCACCCTAAGTGAGGT	129351
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1201	CCATTTCAGTGTTGACTCGGTCAACGCTGACGTGGCACCCTAAGTGAGGT	1250

skip 250 bps 100% identity alignment

AC130799.19	129602	CTTTATATTCAGAACCTGTGTTGGCCAAGTCTCTTCAAGAGTTTGAGAAT	129651
			||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	1501	CTTTATATTCAGAACCTGTGTTGACCAAGTCTCTTCAAGAGTTTGAGAAT	1550

skip 750 bps 100% identity alignment

AC130799.19	130402	TTT---ATTGTGTATGAATTGAAATGTTTTTATTTTATTTTGCAGGATAA	130448
			|||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009545.5	2301	TTTTTTATTGTGTATGAATTGAAATGTTTTTATTTTATTTTGCAGGATAA	2350

skip 900 bps 100% identity alignment

AC130799.19	131349	AATCACATACTCGGACACCGGACACGGCACTAAAAAATCGACATCAGTGA	131398
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
CT009545.5	3251	AATCACATACTCGGACACCGGACACGGCACTAAGAAATCGACATCAGTGA	3300

AC130799.19	131399	TAATTTAAAAAATTGAATTAATTGAATGTAATTACATGTGTCGGCGCCCA	131448
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
CT009545.5	3301	TAATTTAAAAAATTGAATTAATTGAATGTAATTACATGTGTCGGTGTCCA	3350

skip 1857 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC130799.19 - 133305 bps
Hit
CT009545.5 - 96467 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5204 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.84500552041281021333051152071
293.4814518493602937851108612691
Short-link