<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR847861.4	1	GGCCAACATAGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71137	GGCCAACATAGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	71186

CR847861.4	51	AATAGCTGGGTGTAGTGGCATATTCCTGTAACTCCAGCTACTTGGGAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71187	AATAGCTGGGTGTAGTGGCATATTCCTGTAACTCCAGCTACTTGGGAGGC	71236

CR847861.4	101	TGAGGCACGAAAATCACTTGAACCTGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCCGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71237	TGAGGCACGAAAATCACTTGAACCTGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCCGA	71286

CR847861.4	151	GAATGTGCCCCTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71287	GAATGTGCCCCTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCA	71336

CR847861.4	201	AAACAAACAAACAAACAAACAAAAATAAAAAGAATCTCATTTCTGGGTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71337	AAACAAACAAACAAACAAACAAAAATAAAAAGAATCTCATTTCTGGGTGG	71386

CR847861.4	251	TGTGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCCCCTTGTGAGGTTAGGATAGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71387	TGTGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCCCCTTGTGAGGTTAGGATAGGA	71436

CR847861.4	301	AGATCACTTGAGGCCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGGGGAATGTAGCAAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71437	AGATCACTTGAGGCCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGGGGAATGTAGCAAGA	71486

CR847861.4	351	CTCCGTCTCTACAAAAATAAAAAATAAAAAAAAAATTAGCCAGATGTAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71487	CTCCGTCTCTACAAAAATAAAAAATAAAAAAAAAATTAGCCAGATGTAGT	71536

CR847861.4	401	GGTATACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTGGCAGGAGGATCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71537	GGTATACACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTGGCAGGAGGATCA	71586

CR847861.4	451	CTTGAGCCCAGGTGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATCGCACCACTGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71587	CTTGAGCCCAGGTGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATCGCACCACTGCA	71636

CR847861.4	501	CTCTAGTGTGGGCAACAGAAGGAGATGGAGTGAGAGTGTCCCTAAAGATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71637	CTCTAGTGTGGGCAACAGAAGGAGATGGAGTGAGAGTGTCCCTAAAGATA	71686

CR847861.4	551	ATAAGAATCTCATTTCTTAATTTATTTTCCTTAACACTTACCATATTCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71687	ATAAGAATCTCATTTCTTAATTTATTTTCCTTAACACTTACCATATTCTG	71736

CR847861.4	601	AAATACTATATATTTGTTTGCTTATAATTTGTTTCCTCTCACTAGACTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71737	AAATACTATATATTTGTTTGCTTATAATTTGTTTCCTCTCACTAGACTGT	71786

CR847861.4	651	AAGCTCCTTGAAGCCAGAGATTTTTATCTGTTTTCTTTATGGTAAGTTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71787	AAGCTCCTTGAAGCCAGAGATTTTTATCTGTTTTCTTTATGGTAAGTTCC	71836

CR847861.4	701	TAGAACTGAAAACAGGGCCTGGCATGTATTTACTGAAAAAGTGATTAAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71837	TAGAACTGAAAACAGGGCCTGGCATGTATTTACTGAAAAAGTGATTAAGT	71886

CR847861.4	751	GCTCTCCAGTTGATGGCTGGAGTTCAGACCATCATGGTTTTGTTTCAGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71887	GCTCTCCAGTTGATGGCTGGAGTTCAGACCATCATGGTTTTGTTTCAGGC	71936

CR847861.4	801	TGGAGGAAGTGGGAGAGTAAAAGGCAAAGGGGGCCCATGCCAGTTGAGTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71937	TGGAGGAAGTGGGAGAGTAAAAGGCAAAGGGGGCCCATGCCAGTTGAGTC	71986

CR847861.4	851	AGTCCTAGAAAAGAACTTTTCTGAAAGTCCCCTTTACATGACTTAGGCTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	71987	AGTCCTAGAAAAGAACTTTTCTGAAAGTCCCCTTTACATGACTTAGGCTA	72036

CR847861.4	901	ACATCTCATTGGCCAGCCCTATGCCACACCACCACTCCTACCTGCATGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72037	ACATCTCATTGGCCAGCCCTATGCCACACCACCACTCCTACCTGCATGGC	72086

CR847861.4	951	AGTTTGAGGCAAAAAAAAATTTAAAGCATAGAACTTTGCTAAACAAAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72087	AGTTTGAGGCAAAAAAAAATTTAAAGCATAGAACTTTGCTAAACAAAATA	72136

CR847861.4	1001	AAATTGGGGTTCTGCTAGAAGAAGGAAGGGACAATGAACACTGGGTCTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72137	AAATTGGGGTTCTGCTAGAAGAAGGAAGGGACAATGAACACTGGGTCTCT	72186

CR847861.4	1051	GCAAGGGGGCTGTTGGCTGCACTCCAAATGCCCGCAGCATTATACACGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72187	GCAAGGGGGCTGTTGGCTGCACTCCAAATGCCCGCAGCATTATACACGAA	72236

CR847861.4	1101	TCATACATGGAGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTACTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72237	TCATACATGGAGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGAGTCTTACTCT	72286

CR847861.4	1151	GTTGCCCAAGTTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72287	GTTGCCCAAGTTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCC	72336

CR847861.4	1201	ACCTCCTGGATTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72337	ACCTCCTGGATTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG	72386

CR847861.4	1251	ACTACAGGCGCCCACCACCCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72387	ACTACAGGCGCCCACCACCCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC	72436

CR847861.4	1301	GGGGTTTCACCATGTTAGCTAGGATGGTCTCGATCTCATGACCTTGTGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72437	GGGGTTTCACCATGTTAGCTAGGATGGTCTCGATCTCATGACCTTGTGAT	72486

CR847861.4	1351	CCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACCGCAGGCGTGAGCCACCG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72487	CCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACCGCAGGCGTGAGCCACCG	72536

CR847861.4	1401	CGCCCAGCCCTACATGGAGCTCTTTACCCTGGCCTGTGCTTTCCTCTCTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72537	CGCCCAGCCCTACATGGAGCTCTTTACCCTGGCCTGTGCTTTCCTCTCTA	72586

CR847861.4	1451	TTTACTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCCTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72587	TTTACTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCCTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGC	72636

CR847861.4	1501	CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCCCTGTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72637	CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCCCTGTCTC	72686

CR847861.4	1551	CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCATGTAGCTGGGATTGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72687	CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCATGTAGCTGGGATTGC	72736

CR847861.4	1601	AGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72737	AGGTGCCTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAACA	72786

CR847861.4	1651	GGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTCTACCTCAAGTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72787	GGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTCTACCTCAAGTGA	72836

CR847861.4	1701	TCTGCTCGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGAATTACAGGCGTGAAGCCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72837	TCTGCTCGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGAATTACAGGCGTGAAGCCAC	72886

CR847861.4	1751	CACGCCCGGTTTCCTCTCTATTTACTCTTGTGAGTAACATCAGCTTCTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72887	CACGCCCGGTTTCCTCTCTATTTACTCTTGTGAGTAACATCAGCTTCTTT	72936

CR847861.4	1801	GAACTTCACCAAACTTAATTCCTTAATTCCATACTAACTGTTTATTTGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72937	GAACTTCACCAAACTTAATTCCTTAATTCCATACTAACTGTTTATTTGTT	72986

CR847861.4	1851	GAGTTTCCAAGATGCAATTGCATATAATTCCAGGAACTGTGAGTAGTAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	72987	GAGTTTCCAAGATGCAATTGCATATAATTCCAGGAACTGTGAGTAGTAAG	73036

CR847861.4	1901	AACCCCCTTATCAGCTGTCCTATTTTTAGATATCATGATTCCTACTGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	73037	AACCCCCTTATCAGCTGTCCTATTTTTAGATATCATGATTCCTACTGAAA	73086

CR847861.4	1951	CATTCAGTGGCTTAAGCTCTGCCCAGCATGTTCTTGACCCTGTGTGCCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009501.6	73087	CATTCAGTGGCTTAAGCTCTGCCCAGCATGTTCTTGACCCTGTGTGCCTG	73136

Overview

Query
CR847861.4 - 16748 bps
Hit
CT009501.6 - 73136 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link