<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762477.4	1	GGCCGGGCGGGGGCTGCCCCCCCACCTCCCTCCCTGACGGGGCGGCTGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11074	GGCCGGGCGGGGGCTGCCCCCCCACCTCCCTCCCTGACGGGGCGGCTGCC	11123

CR762477.4	51	GGGCGGAGATGCTCCTCACTTCCCAGACGGGGCGGCTGCCGGGCGGAGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11124	GGGCGGAGATGCTCCTCACTTCCCAGACGGGGCGGCTGCCGGGCGGAGGG	11173

CR762477.4	101	GCTCTTCACTTCTCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGACGCTCCTCACCTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11174	GCTCTTCACTTCTCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGACGCTCCTCACCTCC	11223

CR762477.4	151	CAGACGGGGTCGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGACGGGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11224	CAGACGGGGTCGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGACGGGGC	11273

CR762477.4	201	GGCGGGGCAGAGGCGCTCCCCACATCTCAGACGATGGGCGGCCCGGCAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11274	GGCGGGGCAGAGGCGCTCCCCACATCTCAGACGATGGGCGGCCCGGCAGA	11323

CR762477.4	251	GATGCTCCTCACTTCCTAGATGGGATGGCGGCCGGGAAGAGGCGCACCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11324	GATGCTCCTCACTTCCTAGATGGGATGGCGGCCGGGAAGAGGCGCACCTC	11373

CR762477.4	301	ACTTCCCAGACTGGGCGGCCAGGCAGAGGGGCTCCTCACATCCCAGACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11374	ACTTCCCAGACTGGGCGGCCAGGCAGAGGGGCTCCTCACATCCCAGACAA	11423

CR762477.4	351	TGGGCGGCCAGGCAGAGACGCTCCTCACTTCCCAGACGGGGTGGCAGCCG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11424	TGGGCGGCCAGGCAGAGACGCTCCTCACTTCCCAGACGGGGTGGCAGCCG	11473

CR762477.4	401	GGCAGAGGCTGCAATCTCGGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGCTGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11474	GGCAGAGGCTGCAATCTCGGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGCTGGA	11523

CR762477.4	451	AGGTGGAGGTTGTAGCCAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11524	AGGTGGAGGTTGTAGCCAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGG	11573

CR762477.4	501	CAACATTGAGCACTGAGTGATTGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11574	CAACATTGAGCACTGAGTGATTGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCTC	11623

CR762477.4	551	GGGAGGCCGAGGCTGGCAGATCACTCGCGGTTAGGAGCTGGAGACCAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11624	GGGAGGCCGAGGCTGGCAGATCACTCGCGGTTAGGAGCTGGAGACCAGCC	11673

CR762477.4	601	CGGCCAACACAGCGAAACCCCGTCTCCACCAAAAAAATACGAAAACCAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11674	CGGCCAACACAGCGAAACCCCGTCTCCACCAAAAAAATACGAAAACCAAT	11723

CR762477.4	651	CAGGCGTGGCGGCGCGCGCCTGCAATCCTAGGCACTGGGCAGGCTGAGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11724	CAGGCGTGGCGGCGCGCGCCTGCAATCCTAGGCACTGGGCAGGCTGAGAC	11773

CR762477.4	701	AGGAGAATCAGGCAGGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGTGGCAGTACAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11774	AGGAGAATCAGGCAGGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGTGGCAGTACAG	11823

CR762477.4	751	TCCAGCTTCGGCTCGGCATCAGAGGGAGACCGTGGAGAGAGAGGGAGAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11824	TCCAGCTTCGGCTCGGCATCAGAGGGAGACCGTGGAGAGAGAGGGAGAGG	11873

CR762477.4	801	GAGAGGGAGAGGGAGACAGTGGGGAAAGGGAGAGGGAGACCGTGGGGAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11874	GAGAGGGAGAGGGAGACAGTGGGGAAAGGGAGAGGGAGACCGTGGGGAGA	11923

CR762477.4	851	GGGAGGGGGAGAGGGAGACCGCGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGGGGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11924	GGGAGGGGGAGAGGGAGACCGCGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGGGGG	11973

CR762477.4	901	AGAGGGAGACCGTGGGGAGAGGGAGAGGGAGGGGGAGAGGGAGACCGTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	11974	AGAGGGAGACCGTGGGGAGAGGGAGAGGGAGGGGGAGAGGGAGACCGTGG	12023

CR762477.4	951	GGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGGGAGGGAGAGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12024	GGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGGGAGGGAGAGGG	12073

CR762477.4	1001	AGGAGAGGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12074	AGGAGAGGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAGAGGGAGGAGAGGGAG	12123

CR762477.4	1051	AGGGGGAGGGGGAGGAGAGGGAGGGGGAGGGGGAGGGAGAGGGAGAGGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12124	AGGGGGAGGGGGAGGAGAGGGAGGGGGAGGGGGAGGGAGAGGGAGAGGGA	12173

CR762477.4	1101	GGAGACTGGATGTTTCCTTTGATCATCTATCACATCTTTGCAGAGGACAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12174	GGAGACTGGATGTTTCCTTTGATCATCTATCACATCTTTGCAGAGGACAT	12223

CR762477.4	1151	ATAAGCCTGTGCATGGCTATGAGAACACAGTGGAGAGCCATGTAAATAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12224	ATAAGCCTGTGCATGGCTATGAGAACACAGTGGAGAGCCATGTAAATAGC	12273

CR762477.4	1201	TTTTGCCTTCAAGGTGCCTGGCAGAAGCGAATGAATATTGCTGTCATGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12274	TTTTGCCTTCAAGGTGCCTGGCAGAAGCGAATGAATATTGCTGTCATGTA	12323

CR762477.4	1251	CATGCAAACGTTGTGAAATGCTTCAATGTTCCACATCTTCTTTGGAGACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12324	CATGCAAACGTTGTGAAATGCTTCAATGTTCCACATCTTCTTTGGAGACC	12373

CR762477.4	1301	TTTAAGAAATTCATGGAACTTTCAGCAGTGATATTTACCACCAACAATGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12374	TTTAAGAAATTCATGGAACTTTCAGCAGTGATATTTACCACCAACAATGT	12423

CR762477.4	1351	AATCAAATGGGGCAGCAAGCAAAATGAGCTACTACTAATGCACCATGGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12424	AATCAAATGGGGCAGCAAGCAAAATGAGCTACTACTAATGCACCATGGAG	12473

CR762477.4	1401	CAGAGGAATTTTCTCTTGCGCTAACACCACAACAGACCCATTCTTTCATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12474	CAGAGGAATTTTCTCTTGCGCTAACACCACAACAGACCCATTCTTTCATT	12523

CR762477.4	1451	TGGATTAGTATTCACTACTTGTGCTTAGTTGCTTGCAGTGGATACCCAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12524	TGGATTAGTATTCACTACTTGTGCTTAGTTGCTTGCAGTGGATACCCAAT	12573

CR762477.4	1501	TTGTGAAGTGAGCTGAGGTATAATGCAGTATTGTATACTGGAACACAGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12574	TTGTGAAGTGAGCTGAGGTATAATGCAGTATTGTATACTGGAACACAGGG	12623

CR762477.4	1551	GCTGCAAAAGCAGAACTCACTAACAAAGTCAAATGCCATGAACGTCACAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12624	GCTGCAAAAGCAGAACTCACTAACAAAGTCAAATGCCATGAACGTCACAA	12673

CR762477.4	1601	TTGATGAAAACTGGCCATTTGAAAAATCTAGATATGATAAAATTGTTAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12674	TTGATGAAAACTGGCCATTTGAAAAATCTAGATATGATAAAATTGTTAAA	12723

CR762477.4	1651	TTGATGAGGATGAAGATTGGATTATAGTATATATTCAGCATGCAAAAACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12724	TTGATGAGGATGAAGATTGGATTATAGTATATATTCAGCATGCAAAAACA	12773

CR762477.4	1701	GATAATCAGGGGAAATGCAGTGACAGTCAAAGCAACTATGGAAACAATAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12774	GATAATCAGGGGAAATGCAGTGACAGTCAAAGCAACTATGGAAACAATAT	12823

CR762477.4	1751	CCATGGCAACAAATGGCCTGGTCGGAAGAGAGGCCCAAAGACTGCCTGTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12824	CCATGGCAACAAATGGCCTGGTCGGAAGAGAGGCCCAAAGACTGCCTGTG	12873

CR762477.4	1801	TCTTCCTGATGAAATGTCTGGTAGCCCCCTAGTGGCAATGACCGGGTAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12874	TCTTCCTGATGAAATGTCTGGTAGCCCCCTAGTGGCAATGACCGGGTAGT	12923

CR762477.4	1851	GGCCCTCTGCGAGATGGGCGCCTCTCTGGAGATTGAGCGCCACTTCTGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12924	GGCCCTCTGCGAGATGGGCGCCTCTCTGGAGATTGAGCGCCACTTCTGAG	12973

CR762477.4	1901	GGCCTGGAGAAGTTGACTTGTTTTGCATCCCACGGGGTCACCCCCACCTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	12974	GGCCTGGAGAAGTTGACTTGTTTTGCATCCCACGGGGTCACCCCCACCTC	13023

CR762477.4	1951	CCCCTTTCCTTGCACTCACTGACATGAGACACAACGTATGTCCACAAACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CT009481.4	13024	CCCCTTTCCTTGCACTCACTGACATGAGACACAACGTATGTCCACAAACA	13073

Overview

Query
CR762477.4 - 10270 bps
Hit
CT009481.4 - 13073 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link