<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974450.13	1	GATCCTGTGTTGCTGTGGCTGTGGCATAGACGGGCAGGTACAGCTCTGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163093	GATCCTGTGTTGCTGTGGCTGTGGCATAGACGGGCAGGTACAGCTCTGAT	163142

CR974450.13	51	TAGACCCCTAGCCCCTGGGTGCAGCCCTTTAAAAAAAATAATAATAATCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163143	TAGACCCCTAGCCCCTGGGTGCAGCCCTTTAAAAAAAATAATAATAATCC	163192

CR974450.13	101	TGGTGCATATTATCTGAGATAATGTACATCATGTGTACACTGTGCCCAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163193	TGGTGCATATTATCTGAGATAATGTACATCATGTGTACACTGTGCCCAGC	163242

CR974450.13	151	ACTGTCTGGCCCCAAAGAGGTATTTAATTCTTGGTACCCCCAATGTAAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163243	ACTGTCTGGCCCCAAAGAGGTATTTAATTCTTGGTACCCCCAATGTAAAG	163292

CR974450.13	201	AGCAATGGCTATGGTATATGAGGAGACACCCAGTGAGTTGTCCTCAACCG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163293	AGCAATGGCTATGGTATATGAGGAGACACCCAGTGAGTTGTCCTCAACCG	163342

CR974450.13	251	GAAACCTAAGAGGAACCAGACTGGAAAAGACGGCTTGAGGGAGGCCTGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163343	GAAACCTAAGAGGAACCAGACTGGAAAAGACGGCTTGAGGGAGGCCTGGC	163392

CR974450.13	301	TTGAGATGCTGGGAGGACAGGAGATGAGATGGCACTGGGCAGTAAGGCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163393	TTGAGATGCTGGGAGGACAGGAGATGAGATGGCACTGGGCAGTAAGGCCA	163442

CR974450.13	351	TAATAGCCATAACATCAGTGCCTTGGTAGTCACCGCTCCTCCGGCTGGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163443	TAATAGCCATAACATCAGTGCCTTGGTAGTCACCGCTCCTCCGGCTGGTG	163492

CR974450.13	401	GCCTTGGTTTCCTCCTTAACTCGGTGGTGGTCATAGCACCAGGTGGTTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163493	GCCTTGGTTTCCTCCTTAACTCGGTGGTGGTCATAGCACCAGGTGGTTGA	163542

CR974450.13	451	ATTCTGAGGGGAAGTTGAGGAGGAAAAGTCCCCACGAGTTGCTTTTGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163543	ATTCTGAGGGGAAGTTGAGGAGGAAAAGTCCCCACGAGTTGCTTTTGTGT	163592

CR974450.13	501	GCCAAGCAACATATAAAAGAAGACCCTTGCATATGGCACAGGTGATGAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163593	GCCAAGCAACATATAAAAGAAGACCCTTGCATATGGCACAGGTGATGAGT	163642

CR974450.13	551	GGGGGATGCTCGGCATGGAATTTTTTACAATCCTAGAGTCTCTAGAAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163643	GGGGGATGCTCGGCATGGAATTTTTTACAATCCTAGAGTCTCTAGAAGCT	163692

CR974450.13	601	AATCGTGGTCTGGACCCCCTCTTCGATAGTCTGTGACTGAAACTAATAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163693	AATCGTGGTCTGGACCCCCTCTTCGATAGTCTGTGACTGAAACTAATAGG	163742

CR974450.13	651	AGCAGCCTGTTGCCTTAGAATGAAATACAACATTTCATGAGCCAAGCCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163743	AGCAGCCTGTTGCCTTAGAATGAAATACAACATTTCATGAGCCAAGCCAA	163792

CR974450.13	701	ACAGAAAGAACAGACCAAGAACTAGAAAAAGGGGAGGCAGGAAAACATCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163793	ACAGAAAGAACAGACCAAGAACTAGAAAAAGGGGAGGCAGGAAAACATCC	163842

CR974450.13	751	CTTGAAACCCGAGCCAGGGAGGGTTCGTTCAGCAAGGACAGGAGATTTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163843	CTTGAAACCCGAGCCAGGGAGGGTTCGTTCAGCAAGGACAGGAGATTTGA	163892

CR974450.13	801	GCCCCAGAGAATCCAGGTGTTACGTCATGAACCGATGTGTAACACAGGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163893	GCCCCAGAGAATCCAGGTGTTACGTCATGAACCGATGTGTAACACAGGCA	163942

CR974450.13	851	ATGGGCCCGCGGACTTGGCGAGGGACCCCCATGAATAATGGAAGCATGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163943	ATGGGCCCGCGGACTTGGCGAGGGACCCCCATGAATAATGGAAGCATGTG	163992

CR974450.13	901	TTGGAAACCAAAGCACCTTTCCTCCAGCCCATTCCTGGGGGATCTGCGTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	163993	TTGGAAACCAAAGCACCTTTCCTCCAGCCCATTCCTGGGGGATCTGCGTC	164042

CR974450.13	951	TGGGACCAGCTCTCAGGACATATCCCCTGGTGGGGGGGGGGGCACCCCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164043	TGGGACCAGCTCTCAGGACATATCCCCTGGTGGGGGGGGGGGCACCCCTC	164092

CR974450.13	1001	CAGGCATGGCAGCGGGACCCTAACCATGCACCCCGTTGAGTTCGAACATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164093	CAGGCATGGCAGCGGGACCCTAACCATGCACCCCGTTGAGTTCGAACATC	164142

CR974450.13	1051	TTGTTGGTTGTACCCCACCTCCAAGTGCTTCTTGTACAACCTGCTGATCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164143	TTGTTGGTTGTACCCCACCTCCAAGTGCTTCTTGTACAACCTGCTGATCA	164192

CR974450.13	1101	GGAGCTCTGCTGCCTCATAATGAAAGACACGGACCTGGCGGGGGTGGGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164193	GGAGCTCTGCTGCCTCATAATGAAAGACACGGACCTGGCGGGGGTGGGGG	164242

CR974450.13	1151	GCAGCACGGGGAAACCAAACATGTAGAAAAATACCCTCTTCTCAACTCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164243	GCAGCACGGGGAAACCAAACATGTAGAAAAATACCCTCTTCTCAACTCAG	164292

CR974450.13	1201	GTAGACTGGGAGTCCCTGAGTACCAGCTGCAGAGGAGTAATCAGAGAGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164293	GTAGACTGGGAGTCCCTGAGTACCAGCTGCAGAGGAGTAATCAGAGAGAG	164342

CR974450.13	1251	CCCAGGAGTGAAGAAGGAAGAGGAAAAGCCAGGCAGGGCGAATTAGAAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164343	CCCAGGAGTGAAGAAGGAAGAGGAAAAGCCAGGCAGGGCGAATTAGAAGC	164392

CR974450.13	1301	CCCACCCCTGGTTCCTTGTGGGAGGCTCAGTGAACAGAGATACATTCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164393	CCCACCCCTGGTTCCTTGTGGGAGGCTCAGTGAACAGAGATACATTCTCC	164442

CR974450.13	1351	ATCAGGGGCTTTGCATGGCTCTGCCCGGCTAGACTTGCTCACGAGTCCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164443	ATCAGGGGCTTTGCATGGCTCTGCCCGGCTAGACTTGCTCACGAGTCCCT	164492

CR974450.13	1401	TCACAGCCTTGAGGCTGTAGCTTCTATGTTAATAAAATGGTGCCCGTGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164493	TCACAGCCTTGAGGCTGTAGCTTCTATGTTAATAAAATGGTGCCCGTGGT	164542

CR974450.13	1451	AGCCCCAGATGGGTTCCGGTTCCTGTCTAGTGCCCTAAGTATCCCTTATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164543	AGCCCCAGATGGGTTCCGGTTCCTGTCTAGTGCCCTAAGTATCCCTTATT	164592

CR974450.13	1501	TTACCAAGGCCAGTGCTAGGGCTGGCTTCTGAGGAGTGCAGGGAGGGTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164593	TTACCAAGGCCAGTGCTAGGGCTGGCTTCTGAGGAGTGCAGGGAGGGTTG	164642

CR974450.13	1551	GGGTGCAAATCAGCCAGTTGGCCAATATGGTTGATGGTAGCATCACGACC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164643	GGGTGCAAATCAGCCAGTTGGCCAATATGGTTGATGGTAGCATCACGACC	164692

CR974450.13	1601	TCCATCACCCAATGCTTGTCATTCGCTTGTTAGGTCCAATGGAGAATAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164693	TCCATCACCCAATGCTTGTCATTCGCTTGTTAGGTCCAATGGAGAATAGC	164742

CR974450.13	1651	TCTAGTCTGGAACAGATGGTACATGGCTTCACATTCTGTTGGCCACACCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164743	TCTAGTCTGGAACAGATGGTACATGGCTTCACATTCTGTTGGCCACACCT	164792

CR974450.13	1701	GATGGCCATGGCATGTGTTGCTGAACAATCCTTGGTTTCCCACTGCATCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164793	GATGGCCATGGCATGTGTTGCTGAACAATCCTTGGTTTCCCACTGCATCT	164842

CR974450.13	1751	GGGTTGGGTGTCAGAATGCCTAATGGCATCTCAAGGCAGCATGAAGATGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164843	GGGTTGGGTGTCAGAATGCCTAATGGCATCTCAAGGCAGCATGAAGATGA	164892

CR974450.13	1801	GCACTCTGCCTTCATCTTCTGTTCTGACCCGGCAGAGGGGACCTTGAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164893	GCACTCTGCCTTCATCTTCTGTTCTGACCCGGCAGAGGGGACCTTGAGAA	164942

CR974450.13	1851	GAGTTTAGCTTGAGAAGGACCTCTGATCTTCAGAGATGCCCAAAGATGAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164943	GAGTTTAGCTTGAGAAGGACCTCTGATCTTCAGAGATGCCCAAAGATGAC	164992

CR974450.13	1901	TTTCCACACCTGCTGGAACATATCTCTGTGTCTTTCGCATGGGACGCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	164993	TTTCCACACCTGCTGGAACATATCTCTGTGTCTTTCGCATGGGACGCTGA	165042

CR974450.13	1951	CCCACTCATCAACCAACTCCTGGCTCATGGGGCCAGTCAATCCTGTTACG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974587.14	165043	CCCACTCATCAACCAACTCCTGGCTCATGGGGCCAGTCAATCCTGTTACG	165092

Overview

Query
CR974450.13 - 182537 bps
Hit
CR974587.14 - 165092 bps
Total alignments
24
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199720001200011630931650921
288.96177275111928112202-1914394231
391.111952701468041470731914894171
491.79199267146810147076-116091163581
590.27184267176719176985116091163571
691.77197267111932112198116092163581
788.57178277146799147075121865221441
889.81184265146812147076135077353411
990.78200281146795147075-154424547051
1091.21198274111932112205154424546961
1188.88179278176720176997154424547021
1291.17197271146807147077160523607941
1392.64208274111931112204162687629581
1493.36214272146804147075-162688629581
1592.03202277176720176996162688629631
1692.84224291146787147077194613949051
1791.39202279176719176997-194626949041
1893.44215274111932112205-194630949031
1989.93189276146800147075197095973721
2091.1207291176705176995-197727980181
2193.4216274111932112205-197731980031
2292.34209274146803147076197731980041
2391.97207274146802147075-11159081161811
2490.8419627411193211220511159081161801
Short-link