<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT033782.5	1	AGACAGGACTATTTAAATTTACTAGATCTCCAGAATAAGAGATGCAGTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	186927	AGACAGGACTATTTAAATTTACTAGATCTCCAGAATAAGAGATGCAGTAA	186976

CT033782.5	51	AAGAAAACAGGGGGCTGTTGTTACTAAACCACTGGTAAAAATTCTAACAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	186977	AAGAAAACAGGGGGCTGTTGTTACTAAACCACTGGTAAAAATTCTAACAA	187026

CT033782.5	101	TTATCACATGACTGTAGTGACTGCTAATCCCCCAAGACTGGAAGGATATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187027	TTATCACATGACTGTAGTGACTGCTAATCCCCCAAGACTGGAAGGATATG	187076

CT033782.5	151	GCAAAAGAAATACTGGAACCTGTGTCACATTTTGAATGGTTCTCATGATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187077	GCAAAAGAAATACTGGAACCTGTGTCACATTTTGAATGGTTCTCATGATG	187126

CT033782.5	201	GGGAGAAGAGACAAAGGAGACAGAATGACAACACTGAACCAGGGGTAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187127	GGGAGAAGAGACAAAGGAGACAGAATGACAACACTGAACCAGGGGTAGAG	187176

CT033782.5	251	ATATTTCCAAAGACCAGCTGCTTGGTGAAAGTCATTTTGCTGAGACAGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187177	ATATTTCCAAAGACCAGCTGCTTGGTGAAAGTCATTTTGCTGAGACAGAG	187226

CT033782.5	301	GTGCAGGCTGTAGATGATGAAGAAACCTGGCATCATATCACTTGGCAGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187227	GTGCAGGCTGTAGATGATGAAGAAACCTGGCATCATATCACTTGGCAGCC	187276

CT033782.5	351	TTAATTGCCTGGGACAAAGTCACAGAATCAGGGAAAAGAACCATTTCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187277	TTAATTGCCTGGGACAAAGTCACAGAATCAGGGAAAAGAACCATTTCCTC	187326

CT033782.5	401	ATGTCATGAAAAGTCCAAAAGAAACATTCCCTGACATTTTAAGAAGGTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187327	ATGTCATGAAAAGTCCAAAAGAAACATTCCCTGACATTTTAAGAAGGTTG	187376

CT033782.5	451	ACTTCTGCTGTAGAAAGGAGTATATCAGATCATGGTACCAATCGAATCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187377	ACTTCTGCTGTAGAAAGGAGTATATCAGATCATGGTACCAATCGAATCTT	187426

CT033782.5	501	TAGAATGAAAGCTAGGAAATAATCAGACCATAGAGGGCAAAGTCAGCATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187427	TAGAATGAAAGCTAGGAAATAATCAGACCATAGAGGGCAAAGTCAGCATC	187476

CT033782.5	551	AATAGATGAGTGGATTAGATATACAGTTGATGTTAGACCTTGTTTGCCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187477	AATAGATGAGTGGATTAGATATACAGTTGATGTTAGACCTTGTTTGCCTG	187526

CT033782.5	601	ATATGATCTTAATAAAAGAAGCTGCCACTAGAAGCCTTGAGACAACCCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187527	ATATGATCTTAATAAAAGAAGCTGCCACTAGAAGCCTTGAGACAACCCAA	187576

CT033782.5	651	AATTCAAAATGTTTTAATTGTAGTGAGCAGGTTTATCTCAGAATAAATTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187577	AATTCAAAATGTTTTAATTGTAGTGAGCAGGTTTATCTCAGAATAAATTG	187626

CT033782.5	701	CAGGGAAAATAAAATTAATCCCAAAAGGGAGCCTATGCCTTCTGGAATAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187627	CAGGGAAAATAAAATTAATCCCAAAAGGGAGCCTATGCCTTCTGGAATAT	187676

CT033782.5	751	GTAAAAGATGTGGCAAAGACTGACTGATATTTGGCTAGGAAATGTAGAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187677	GTAAAAGATGTGGCAAAGACTGACTGATATTTGGCTAGGAAATGTAGAGC	187726

CT033782.5	801	AACAGTAGACAAATAGGCAACACCTTACCAAAAAACTCCCAGGGGGGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187727	AACAGTAGACAAATAGGCAACACCTTACCAAAAAACTCCCAGGGGGGCCT	187776

CT033782.5	851	CTTGCAGGCCTCAATGACAAGCAGGGAGAGTTCTCTTCCTCGGGACAATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187777	CTTGCAGGCCTCAATGACAAGCAGGGAGAGTTCTCTTCCTCGGGACAATT	187826

CT033782.5	901	AAACACCATTGCTCTAAAAACAGATGTTCTGAGATCAGACAAAAAGGCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187827	AAACACCATTGCTCTAAAAACAGATGTTCTGAGATCAGACAAAAAGGCTG	187876

CT033782.5	951	AGGCAAATTCTATAGACAACTCAAAAAACCTAAAAGGGAGCCAAAAAGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187877	AGGCAAATTCTATAGACAACTCAAAAAACCTAAAAGGGAGCCAAAAAGAA	187926

CT033782.5	1001	CATTTTGGCAAATTTCTATAGAGGATCAAAGCCCCAAGCCAAGAATACTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187927	CATTTTGGCAAATTTCTATAGAGGATCAAAGCCCCAAGCCAAGAATACTA	187976

CT033782.5	1051	GTAAACAATATTGAGATTGAAGGAATGGTCAACACTGGAGCAGATGTCAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	187977	GTAAACAATATTGAGATTGAAGGAATGGTCAACACTGGAGCAGATGTCAC	188026

CT033782.5	1101	CATTATCTCTCCAAAACCGTGGCCTGCAAGTTGTCTACTTCAAGAAGTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188027	CATTATCTCTCCAAAACCGTGGCCTGCAAGTTGTCTACTTCAAGAAGTAG	188076

CT033782.5	1151	ACATCAAATTTCAAGGAGTTGGGACTTTATCTCAAATAAAACAAAGCACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188077	ACATCAAATTTCAAGGAGTTGGGACTTTATCTCAAATAAAACAAAGCACA	188126

CT033782.5	1201	AGATGGCTTAAACATATAGGACCTGAAGGTCAGATAGGAAAATTAAGGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188127	AGATGGCTTAAACATATAGGACCTGAAGGTCAGATAGGAAAATTAAGGCC	188176

CT033782.5	1251	ATATTTGGCTGATATAGCCATTAACTTATGGGGAAGAGATATGTTACAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188177	ATATTTGGCTGATATAGCCATTAACTTATGGGGAAGAGATATGTTACAGC	188226

CT033782.5	1301	AGTGGAAAACACAAATTCATACCCCCTCCGTTTCAGAGGCGGGTAACAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188227	AGTGGAAAACACAAATTCATACCCCCTCCGTTTCAGAGGCGGGTAACAAA	188276

CT033782.5	1351	ACTGGTCAGGCTCCTAATAAAAAAATCAAATTAGCTGAGGAAAAATTTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188277	ACTGGTCAGGCTCCTAATAAAAAAATCAAATTAGCTGAGGAAAAATTTCA	188326

CT033782.5	1401	AAGGCAGTTACAGACTGTCCAGGATGTCCATAAATAAGATACAGCAGGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188327	AAGGCAGTTACAGACTGTCCAGGATGTCCATAAATAAGATACAGCAGGAG	188376

CT033782.5	1451	CTGACAATTTAGCTTTACCTCAAGGAGCCACTGATGATAAGACACCAACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188377	CTGACAATTTAGCTTTACCTCAAGGAGCCACTGATGATAAGACACCAACA	188426

CT033782.5	1501	GCTTTATCACTAAGGTGATTGACAGACTAACCCAAAACTACAGGCAATAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188427	GCTTTATCACTAAGGTGATTGACAGACTAACCCAAAACTACAGGCAATAG	188476

CT033782.5	1551	AACAACTTGTCCAGGCTCAGCATATAGAGGAGTACATCAGCTCTTGGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188477	AACAACTTGTCCAGGCTCAGCATATAGAGGAGTACATCAGCTCTTGGAAT	188526

CT033782.5	1601	TCTCCAGTATTTATCATTAAAAAAAGACTGGCAAATGGAGGATGTTGACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188527	TCTCCAGTATTTATCATTAAAAAAAGACTGGCAAATGGAGGATGTTGACA	188576

CT033782.5	1651	CATCTCAGAGCAATTAATAAGATTATTCTGCTGATGGATTCCTTGCAGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188577	CATCTCAGAGCAATTAATAAGATTATTCTGCTGATGGATTCCTTGCAGCC	188626

CT033782.5	1701	TGGAATCCCGCTGTCTTCCTCATTGCCTAAGGAATGGTCTATCATAGTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188627	TGGAATCCCGCTGTCTTCCTCATTGCCTAAGGAATGGTCTATCATAGTGA	188676

CT033782.5	1751	TCAATCTAAAAGATTGCTTTTACAATTCCTCTACATGAACATGATAAGGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188677	TCAATCTAAAAGATTGCTTTTACAATTCCTCTACATGAACATGATAAGGA	188726

CT033782.5	1801	AAGAATTGCTTTGTCAGTGCCTACCTCCAATAGAAGTTGTCCAATACAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188727	AAGAATTGCTTTGTCAGTGCCTACCTCCAATAGAAGTTGTCCAATACAAA	188776

CT033782.5	1851	GATATCATTGGAAAGTCCTGCTATAGGGAATGTTAAATAACCCTACCTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188777	GATATCATTGGAAAGTCCTGCTATAGGGAATGTTAAATAACCCTACCTTG	188826

CT033782.5	1901	TTTCTATATTTTGTACAACAGTCATTAGAGATGATTAGTAAACAATTTCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188827	TTTCTATATTTTGTACAACAGTCATTAGAGATGATTAGTAAACAATTTCC	188876

CT033782.5	1951	CCAATCCATTATTATTTATCATTATATAGATGGCATCCTACTGGCTGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974567.10	188877	CCAATCCATTATTATTTATCATTATATAGATGGCATCCTACTGGCTGATC	188926

Overview

Query
CT033782.5 - 93115 bps
Hit
CR974567.10 - 188926 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link