<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974451.9	1	GATCTGATGCCCCCTTCAGGTGGTGTACTCATATAAAAATAAATAAATAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123346	GATCTGATGCCCCCTTCAGGTGGTGTACTCATATAAAAATAAATAAATAA	123395

CR974451.9	51	ATTCTTTGTTTTGTTTTTCCAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123396	ATTCTTTGTTTTGTTTTTCCAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTG	123445

CR974451.9	101	TCATGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123446	TCATGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCAC	123495

CR974451.9	151	CTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACCACTCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123496	CTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACCACTCCC	123545

CR974451.9	201	AGCTAATTTTTTTTTTTAAAAGATGTTGCTGGAGTGGTGGCTTGATTCCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123546	AGCTAATTTTTTTTTTTAAAAGATGTTGCTGGAGTGGTGGCTTGATTCCC	123595

CR974451.9	251	AGTACCCACATGGCAGCTCACAACAGGCTGTAACACCAGGGAATCTGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123596	AGTACCCACATGGCAGCTCACAACAGGCTGTAACACCAGGGAATCTGAGA	123645

CR974451.9	301	CCTTCTCTCACCTCCCTGGGTATCATGCACACACATATATATGCAAGCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123646	CCTTCTCTCACCTCCCTGGGTATCATGCACACACATATATATGCAAGCAA	123695

CR974451.9	351	GAAGACACCCATATGTATGAAATAAAATAAATATTTTTTATGTTAAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123696	GAAGACACCCATATGTATGAAATAAAATAAATATTTTTTATGTTAAAAAA	123745

CR974451.9	401	TAAAGAGTCTGGATGTTGCTCAGTGGTAGGGCTCTGGGTATGTTCAGAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123746	TAAAGAGTCTGGATGTTGCTCAGTGGTAGGGCTCTGGGTATGTTCAGAGC	123795

CR974451.9	451	CATGAGTGGGGAGCTATAATATCTCAAAGGTGAGTCTGCTGAGGGTTGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123796	CATGAGTGGGGAGCTATAATATCTCAAAGGTGAGTCTGCTGAGGGTTGCA	123845

CR974451.9	501	CAGGCTTAATGCCACTCAAATGTATGCTTACCTCTGCTTTCCTGCATTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123846	CAGGCTTAATGCCACTCAAATGTATGCTTACCTCTGCTTTCCTGCATTAA	123895

CR974451.9	551	AACACATAGGCTGGAATGAAGCTGGCATCTGTAAGACTACCGTTTAGGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123896	AACACATAGGCTGGAATGAAGCTGGCATCTGTAAGACTACCGTTTAGGAA	123945

CR974451.9	601	GCTGAGGCAGGAGGATTGGTATGAGCTTGAGGCTAGCTTAGACTCCATAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123946	GCTGAGGCAGGAGGATTGGTATGAGCTTGAGGCTAGCTTAGACTCCATAG	123995

CR974451.9	651	CAACTCTTTGTCTCAAGAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	123996	CAACTCTTTGTCTCAAGAAATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATA	124045

CR974451.9	701	ATAATAATAATAAAAGGTAAGTAAATAAAGGCACCGATTTCTTCCTCCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124046	ATAATAATAATAAAAGGTAAGTAAATAAAGGCACCGATTTCTTCCTCCCA	124095

CR974451.9	751	CTATCACTGTGAGGACCACAAGAGATAAAAATAGAAGGGTCAGGGTGAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124096	CTATCACTGTGAGGACCACAAGAGATAAAAATAGAAGGGTCAGGGTGAGT	124145

CR974451.9	801	AAGCTGGTTCAGGAACCAGGTCTGGGGACTGTGGAGACCAGAGAGGGGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124146	AAGCTGGTTCAGGAACCAGGTCTGGGGACTGTGGAGACCAGAGAGGGGAG	124195

CR974451.9	851	AGGGCATAGTTTAGCTTTCTGCTTAATTCACGCATCTGTTGTTTAGTGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124196	AGGGCATAGTTTAGCTTTCTGCTTAATTCACGCATCTGTTGTTTAGTGTC	124245

CR974451.9	901	TTTCTAAGAGGTTAACTTTTGAAATTCCAAAAGTGAAGTTATTCGAGAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124246	TTTCTAAGAGGTTAACTTTTGAAATTCCAAAAGTGAAGTTATTCGAGAGC	124295

CR974451.9	951	CCAGCTCCGCTCTCTTGAGGATTTAGTGTCCCTAACAAAGATTTCCAGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124296	CCAGCTCCGCTCTCTTGAGGATTTAGTGTCCCTAACAAAGATTTCCAGGG	124345

CR974451.9	1001	TGAGGAGCAGGCTTCTATTCTTGGCCTATGTTTACCTTCAGTGTGTGTGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124346	TGAGGAGCAGGCTTCTATTCTTGGCCTATGTTTACCTTCAGTGTGTGTGT	124395

CR974451.9	1051	CTTTTTCCCTGGCTTTGCTTACCTTTTCTCCACCCACTCCCAATGTACTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124396	CTTTTTCCCTGGCTTTGCTTACCTTTTCTCCACCCACTCCCAATGTACTT	124445

CR974451.9	1101	GAGTCTATTAGTCATGAAAATCGACTGTGATGAAGACATTATTCCTCTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124446	GAGTCTATTAGTCATGAAAATCGACTGTGATGAAGACATTATTCCTCTCT	124495

CR974451.9	1151	GGATGAGGTTCTTGCCCTCTCACCAAGGACGGACCCCCTGAGCTCCTCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124496	GGATGAGGTTCTTGCCCTCTCACCAAGGACGGACCCCCTGAGCTCCTCTT	124545

CR974451.9	1201	GACCATTGAACCTGATTTCCCCTGTAGCAAAACCTTCCCTGGAGTAATTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124546	GACCATTGAACCTGATTTCCCCTGTAGCAAAACCTTCCCTGGAGTAATTC	124595

CR974451.9	1251	CTGTCTTTCCACATTGCCAGGTTCCTCCTCCAGGCCCTTTCAGTCGGAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124596	CTGTCTTTCCACATTGCCAGGTTCCTCCTCCAGGCCCTTTCAGTCGGAAG	124645

CR974451.9	1301	TCTGCTTCCTGGGAGCCTGAACCACAGAACTGTGGCTGAAATCCAGACAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124646	TCTGCTTCCTGGGAGCCTGAACCACAGAACTGTGGCTGAAATCCAGACAG	124695

CR974451.9	1351	CTGACGTCACCTGTCCAGATGGCGGAAACCATTGCTCAACAAAAGGAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124696	CTGACGTCACCTGTCCAGATGGCGGAAACCATTGCTCAACAAAAGGAAAT	124745

CR974451.9	1401	TGATGCCAATCTCTTACTTCTCTGTGACCCTCCCTCTCTCGCCCCCTCCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124746	TGATGCCAATCTCTTACTTCTCTGTGACCCTCCCTCTCTCGCCCCCTCCC	124795

CR974451.9	1451	CTCTCTCTGAGCCCAGAAAAGTGTTTTCCTAGACAGAAGGAAGCTGAGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124796	CTCTCTCTGAGCCCAGAAAAGTGTTTTCCTAGACAGAAGGAAGCTGAGCT	124845

CR974451.9	1501	GTCTGGGGAAATAGCTCTGGCCTTGACCTCATGCCCGCTGCCACGTGTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124846	GTCTGGGGAAATAGCTCTGGCCTTGACCTCATGCCCGCTGCCACGTGTGT	124895

CR974451.9	1551	CGTTCAAGGCTGGTTACGTCAGCTGACAAATGTTGCAAGGGTGAGCACTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124896	CGTTCAAGGCTGGTTACGTCAGCTGACAAATGTTGCAAGGGTGAGCACTG	124945

CR974451.9	1601	GATGCCGAGTCAGAAGATGTAAGTCTGAAGAGAGGTTCTTCCATCAGGAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124946	GATGCCGAGTCAGAAGATGTAAGTCTGAAGAGAGGTTCTTCCATCAGGAT	124995

CR974451.9	1651	CTGACCTTTGACAAATCACTACACTTCTTTTAATAATATCTGTTCAACTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	124996	CTGACCTTTGACAAATCACTACACTTCTTTTAATAATATCTGTTCAACTA	125045

CR974451.9	1701	TTAGTAATCATGCCCTCCTCCCAGTTGCAAGGCAGGAGTGACGAGCTGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	125046	TTAGTAATCATGCCCTCCTCCCAGTTGCAAGGCAGGAGTGACGAGCTGCA	125095

CR974451.9	1751	AGGCAGGAGTGACGTCATCTGTGTGGGTGCTTTCATAGCCTGAAGTAGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	125096	AGGCAGGAGTGACGTCATCTGTGTGGGTGCTTTCATAGCCTGAAGTAGAT	125145

CR974451.9	1801	GGCAGTGCAGAGTTCTGCCTTCCTCAGAGAAGCTGGACCTGAGGAGGCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	125146	GGCAGTGCAGAGTTCTGCCTTCCTCAGAGAAGCTGGACCTGAGGAGGCAG	125195

CR974451.9	1851	GAGAGAGGATGGCACTGTTCCAGAGTCAGGCAGCTTGCTCCACATGAAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	125196	GAGAGAGGATGGCACTGTTCCAGAGTCAGGCAGCTTGCTCCACATGAAGA	125245

CR974451.9	1901	GGGAGCCTGCCCAAGACCAGCTCAGCTATTTGATTTCCGTGCCTGGTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	125246	GGGAGCCTGCCCAAGACCAGCTCAGCTATTTGATTTCCGTGCCTGGTTTC	125295

CR974451.9	1951	CCGATGTTTATATTGAGCCAGTGTAGCAGCACACACTGACAGGCAGATCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974483.16	125296	CCGATGTTTATATTGAGCCAGTGTAGCAGCACACACTGACAGGCAGATCC	125345

Overview

Query
CR974451.9 - 188873 bps
Hit
CR974483.16 - 125345 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link