<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974483.16	1	TTGCCTCTCTCTTCTTTCTAACTGTCCTGGAGCACGGAGCATCAGGGAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217472	TTGCCTCTCTCTTCTTTCTAACTGTCCTGGAGCACGGAGCATCAGGGAGA	217521

CR974483.16	51	GGTAAGTGACCACAGGTCCTCAGTGGACCCCAGCACTCTATTGCTTGTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217522	GGTAAGTGACCACAGGTCCTCAGTGGACCCCAGCACTCTATTGCTTGTCC	217571

CR974483.16	101	TTGGCCTGTACCAGCAGGGAGGGGCCCCATGGGTCAGGTGTGCAGACCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217572	TTGGCCTGTACCAGCAGGGAGGGGCCCCATGGGTCAGGTGTGCAGACCAC	217621

CR974483.16	151	AGATGTGCTGGAGGCCGAGGCTTGAGGGTTTTTGCTTCAGCCCAGCTTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217622	AGATGTGCTGGAGGCCGAGGCTTGAGGGTTTTTGCTTCAGCCCAGCTTGA	217671

CR974483.16	201	ATGGCTTTATGGGGTTATCAGGGTGCAGTTTCCAGGCTAATTTCCTAGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217672	ATGGCTTTATGGGGTTATCAGGGTGCAGTTTCCAGGCTAATTTCCTAGTG	217721

CR974483.16	251	TAGTACAGTGGTTAATTTGGAGTGAATGCCTTGGTGTTCACCATAGCTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217722	TAGTACAGTGGTTAATTTGGAGTGAATGCCTTGGTGTTCACCATAGCTCT	217771

CR974483.16	301	GTGTGAGAGACAGGGAGAGAGTTAGAGAGACATCGTAGACAAGGAAAATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217772	GTGTGAGAGACAGGGAGAGAGTTAGAGAGACATCGTAGACAAGGAAAATA	217821

CR974483.16	351	GAAAGCCGTCTGCCTGAGATAGGTGCGCCTTGTTCGCAGAAGACATTTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217822	GAAAGCCGTCTGCCTGAGATAGGTGCGCCTTGTTCGCAGAAGACATTTCT	217871

CR974483.16	401	AGAAATAGCAGGAAGGTGTAGGGGCGGGGCTTCTAAACAGGCCAATAGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217872	AGAAATAGCAGGAAGGTGTAGGGGCGGGGCTTCTAAACAGGCCAATAGGT	217921

CR974483.16	451	GAACAAGGAAGACCCAGGGACCCTGTGTAATACCCAAGCCAGCTTCCTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217922	GAACAAGGAAGACCCAGGGACCCTGTGTAATACCCAAGCCAGCTTCCTGT	217971

CR974483.16	501	TAGGGACATCCTCCTTGGGGCTGTTCCTTTTCTGGTTCTACAGTTTGGTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	217972	TAGGGACATCCTCCTTGGGGCTGTTCCTTTTCTGGTTCTACAGTTTGGTC	218021

CR974483.16	551	TTTTCTCCCGGATGTTCCGTTCTCCAGGGGACACATTCAGCAGTCCTTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218022	TTTTCTCCCGGATGTTCCGTTCTCCAGGGGACACATTCAGCAGTCCTTAG	218071

CR974483.16	601	GTGACCAGCAACACCCCATTATATTTTATGGGACTTCTTGTCCACGATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218072	GTGACCAGCAACACCCCATTATATTTTATGGGACTTCTTGTCCACGATTT	218121

CR974483.16	651	GAGACTTCTATCCAAGGAAATATACTTAACTGAAAAATTGGCAGAAGGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218122	GAGACTTCTATCCAAGGAAATATACTTAACTGAAAAATTGGCAGAAGGAC	218171

CR974483.16	701	TCAGAAGTAGCGCTCTTTTGGCTCTCCAACAGCCCCTTCCGAGCAAGGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218172	TCAGAAGTAGCGCTCTTTTGGCTCTCCAACAGCCCCTTCCGAGCAAGGGG	218221

CR974483.16	751	ACACCCTGATCAAGTTTAGCTGATGGGAGCCCCAGTCAGTTCCACTCCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218222	ACACCCTGATCAAGTTTAGCTGATGGGAGCCCCAGTCAGTTCCACTCCCA	218271

CR974483.16	801	CTAGGAGTAAGGAGCTCTTGTGACCGGACTGAGGTTTCTCTCTTGAGAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218272	CTAGGAGTAAGGAGCTCTTGTGACCGGACTGAGGTTTCTCTCTTGAGAAC	218321

CR974483.16	851	CAGAGTGGAGCATTAAGCCACCAGTCCCAAGCAGAAAGAACAAACCAGAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218322	CAGAGTGGAGCATTAAGCCACCAGTCCCAAGCAGAAAGAACAAACCAGAC	218371

CR974483.16	901	AACCAAAGCACTGGGGAGGAAGGGTGGGAGAAGCAGACTCACTCACTACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218372	AACCAAAGCACTGGGGAGGAAGGGTGGGAGAAGCAGACTCACTCACTACA	218421

CR974483.16	951	CCCAAGAAAGGGCCTTGGAGCAGGTTCTTAGCTTCCTTTGTCTGGTTCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218422	CCCAAGAAAGGGCCTTGGAGCAGGTTCTTAGCTTCCTTTGTCTGGTTCTC	218471

CR974483.16	1001	TGCCCTGGAGCTATGAACTGCTGAGGGTAGGCAGCTGAAGGTGGGCTGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218472	TGCCCTGGAGCTATGAACTGCTGAGGGTAGGCAGCTGAAGGTGGGCTGTG	218521

CR974483.16	1051	TGGGGGCAGGGAAGAGTTGCTTAGCTTTATGTGCGCATGTGTGCTTCCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218522	TGGGGGCAGGGAAGAGTTGCTTAGCTTTATGTGCGCATGTGTGCTTCCAT	218571

CR974483.16	1101	TCACCTGCAGCCAGAGGCATCAGCCCTAGTTATGGCAATTGTGAGCCACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218572	TCACCTGCAGCCAGAGGCATCAGCCCTAGTTATGGCAATTGTGAGCCACC	218621

CR974483.16	1151	TGACCTGGGTGCTGGGACTGGAACTGGAACTTGGGTTCTCTGAAGAGCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218622	TGACCTGGGTGCTGGGACTGGAACTGGAACTTGGGTTCTCTGAAGAGCTG	218671

CR974483.16	1201	AGCCATCTCTTCAGCCCCTCGTTGCTGGTTCCTAAGCTACTGTAGCTTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218672	AGCCATCTCTTCAGCCCCTCGTTGCTGGTTCCTAAGCTACTGTAGCTTAG	218721

CR974483.16	1251	GAAAATCCAAAGTAGTCTCGAAGTTTTCTGATATGGAGGGAAGTGCTGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218722	GAAAATCCAAAGTAGTCTCGAAGTTTTCTGATATGGAGGGAAGTGCTGCC	218771

CR974483.16	1301	AAGCTTGCTTTGAGTTGGAGGTGGAAGGAGCCTGAAAAGTCTATTGGAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218772	AAGCTTGCTTTGAGTTGGAGGTGGAAGGAGCCTGAAAAGTCTATTGGAGG	218821

CR974483.16	1351	CTGCTAGAGGCGAGCAGGGTCAGTGGACAAATGACCTCTCCTCCCATAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218822	CTGCTAGAGGCGAGCAGGGTCAGTGGACAAATGACCTCTCCTCCCATAGC	218871

CR974483.16	1401	CCTTCCTCTAACTCAGGATCTCCAGACTCCAGGCACTCCTACCCCTACCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218872	CCTTCCTCTAACTCAGGATCTCCAGACTCCAGGCACTCCTACCCCTACCC	218921

CR974483.16	1451	TCTTGTGTGTGCGGAGTTCTCCCCTGGCTTGGCTGAGGAAGCATAAAAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218922	TCTTGTGTGTGCGGAGTTCTCCCCTGGCTTGGCTGAGGAAGCATAAAAGA	218971

CR974483.16	1501	GCATATGGGACTGTGGGTGGGGCTATGGTGGGGCTCCAGGGTTGAAGGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	218972	GCATATGGGACTGTGGGTGGGGCTATGGTGGGGCTCCAGGGTTGAAGGCT	219021

CR974483.16	1551	TGTCTAGACCTGTACAAGGCCCTGGGTTCTATCTGCAGCCTGAGTTTGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219022	TGTCTAGACCTGTACAAGGCCCTGGGTTCTATCTGCAGCCTGAGTTTGCA	219071

CR974483.16	1601	GGAGCCCTGGGTTAAGTGCTGGACAAGCTGATGCCAGTAGCTTTTAGGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219072	GGAGCCCTGGGTTAAGTGCTGGACAAGCTGATGCCAGTAGCTTTTAGGCT	219121

CR974483.16	1651	CCCTGCTTTCGGAGGGAGGGGCTGGAGTTGAGTGGTCCACTGGGTCTTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219122	CCCTGCTTTCGGAGGGAGGGGCTGGAGTTGAGTGGTCCACTGGGTCTTCA	219171

CR974483.16	1701	CAGCTCTTTCCACTCAGCATCTCCATGCCTATTTTTCTCTCTCTTTTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219172	CAGCTCTTTCCACTCAGCATCTCCATGCCTATTTTTCTCTCTCTTTTTTT	219221

CR974483.16	1751	TTTTCATCTTTGCTGTGTGGTTTCATTTCTGCCCCATTGTTTTTAGTTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219222	TTTTCATCTTTGCTGTGTGGTTTCATTTCTGCCCCATTGTTTTTAGTTGC	219271

CR974483.16	1801	CAGTTGCTATGACACAAATAAGCAGAGGAGAAAAGAGCCTTCTACATCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219272	CAGTTGCTATGACACAAATAAGCAGAGGAGAAAAGAGCCTTCTACATCCT	219321

CR974483.16	1851	CTGGATCACAGGCACCTGTGGTAAATAATTCACCCTGAGTGCTGGCTTGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219322	CTGGATCACAGGCACCTGTGGTAAATAATTCACCCTGAGTGCTGGCTTGC	219371

CR974483.16	1901	TTTCAGATTATAAATTCTAGGGGGGGGGGGGGAGTTTAAATGGAACCTCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219372	TTTCAGATTATAAATTCTAGGGGGGGGGGGGGAGTTTAAATGGAACCTCT	219421

CR974483.16	1951	ACTCCCGTTTTGGTTTTTGAGTGGTGGATTTTATATAGGCAAGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974473.23	219422	ACTCCCGTTTTGGTTTTTGAGTGGTGGATTTTATATAGGCAAGGGAATTC	219471

Overview

Query
CR974483.16 - 125345 bps
Hit
CR974473.23 - 219471 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link