<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR956362.5	1	GATCTGAAAGAGGAGGAAAATGCAAGTGTCGGGGGGGGGCGGTATTACAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	156976	GATCTGAAAGAGGAGGAAAATGCAAGTGTCGGGGGGGGGCGGTATTACAT	157025

CR956362.5	51	ATACGAAGATATACACACCTTGGTGGGCAACTCTCTTCACATCCCTAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157026	ATACGAAGATATACACACCTTGGTGGGCAACTCTCTTCACATCCCTAAAA	157075

CR956362.5	101	TAACACGGGTGGCTTAATCCCAGCATCTGAGATCACGGACTTAAACACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157076	TAACACGGGTGGCTTAATCCCAGCATCTGAGATCACGGACTTAAACACTG	157125

CR956362.5	151	AAATGTAGACTCTTATACTGACGTGAATGGTGATCTGGCCACCAAAATAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157126	AAATGTAGACTCTTATACTGACGTGAATGGTGATCTGGCCACCAAAATAA	157175

CR956362.5	201	AAACAAGAGTTACCGTTTCCGGTGCACTAACTACGTGCCCGACTCCGCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157176	AAACAAGAGTTACCGTTTCCGGTGCACTAACTACGTGCCCGACTCCGCAC	157225

CR956362.5	251	ACGCGAGAGATGGTTTGTCTTCGTGGGGGTCTGTGGAGGAGGCGATGATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157226	ACGCGAGAGATGGTTTGTCTTCGTGGGGGTCTGTGGAGGAGGCGATGATT	157275

CR956362.5	301	ACCCAGCTTTATAAGATGAGGAGACAATCTCAGAGATGTCAAGTAACTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157276	ACCCAGCTTTATAAGATGAGGAGACAATCTCAGAGATGTCAAGTAACTTG	157325

CR956362.5	351	CTCAAGGTCACACAGCTCATAGGCAACCACAGTAGATTCAGACACATGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157326	CTCAAGGTCACACAGCTCATAGGCAACCACAGTAGATTCAGACACATGGG	157375

CR956362.5	401	TTTAAGCTGTGTCTAAAGAGAATCAGTGTGGATGCCGTTCCGGTCTCCCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157376	TTTAAGCTGTGTCTAAAGAGAATCAGTGTGGATGCCGTTCCGGTCTCCCT	157425

CR956362.5	451	TGCCAAGTCACACCCTCTGTTGTCACCGCGAACTTCCGTTACACAGCCGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157426	TGCCAAGTCACACCCTCTGTTGTCACCGCGAACTTCCGTTACACAGCCGT	157475

CR956362.5	501	GAAGCCCCCCAACCCCCCACTCCATATATCACCCAGAATTAGCTGCAAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157476	GAAGCCCCCCAACCCCCCACTCCATATATCACCCAGAATTAGCTGCAAAG	157525

CR956362.5	551	TGTCAGGAAACTTGGCCAGGCAGCCCCAAGCATCAGCGAGGGCTGGAAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157526	TGTCAGGAAACTTGGCCAGGCAGCCCCAAGCATCAGCGAGGGCTGGAAGC	157575

CR956362.5	601	CTTCACCGTGAAGCCCTTTATAGAAAGCCGCAGTTGGCAGCCCCTGCTCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157576	CTTCACCGTGAAGCCCTTTATAGAAAGCCGCAGTTGGCAGCCCCTGCTCC	157625

CR956362.5	651	TGCATGGGAACAAATTAACATTGGCATTCCAAACACAGGAAAGGAAGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157626	TGCATGGGAACAAATTAACATTGGCATTCCAAACACAGGAAAGGAAGGAA	157675

CR956362.5	701	ATTGGAAACACAGTTTATACTTGGCCAGCTCTTTGAAATACTGTACCATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157676	ATTGGAAACACAGTTTATACTTGGCCAGCTCTTTGAAATACTGTACCATG	157725

CR956362.5	751	CTACCGACATCAATTAATGAAAAGCAGGGTTGTGCTGAGAGGCTCTGGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157726	CTACCGACATCAATTAATGAAAAGCAGGGTTGTGCTGAGAGGCTCTGGTT	157775

CR956362.5	801	TGCAAATGCATTAACACACGTTAAACATGTTTGTACAGGAACCGGATTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157776	TGCAAATGCATTAACACACGTTAAACATGTTTGTACAGGAACCGGATTAT	157825

CR956362.5	851	AAGCACCCTGGCTCCAAAACAATAAAGCAATTACCCTAAAACTGGTGCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157826	AAGCACCCTGGCTCCAAAACAATAAAGCAATTACCCTAAAACTGGTGCTT	157875

CR956362.5	901	TCGTAGTTGTCATTAATTCAATCCACTCCACGCGGATCAGCAAAGGCTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157876	TCGTAGTTGTCATTAATTCAATCCACTCCACGCGGATCAGCAAAGGCTTT	157925

CR956362.5	951	TCTCGGCTCCCAGCAATGCCTCCCGACACGAATGTTGAAAGGACAGCATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157926	TCTCGGCTCCCAGCAATGCCTCCCGACACGAATGTTGAAAGGACAGCATC	157975

CR956362.5	1001	ACACATGCTACTCTGAGTTTCACATAAGTAAGTGTCAAGCTTCATGCACT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	157976	ACACATGCTACTCTGAGTTTCACATAAGTAAGTGTCAAGCTTCATGCACT	158025

CR956362.5	1051	GCTAATATCCCCCCAAATCATAAACACTCCACTTTGGGGTGGTGGGGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158026	GCTAATATCCCCCCAAATCATAAACACTCCACTTTGGGGTGGTGGGGGGG	158075

CR956362.5	1101	GAGCAGAGCGGCAGCCCTGGCATTCGTCGGCATTGCCATTTCACATCGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158076	GAGCAGAGCGGCAGCCCTGGCATTCGTCGGCATTGCCATTTCACATCGGG	158125

CR956362.5	1151	TTCGAGAAGTTTTTCACGGAGGAAGGTTAGCTGAGAAATATCTGTTCCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158126	TTCGAGAAGTTTTTCACGGAGGAAGGTTAGCTGAGAAATATCTGTTCCAT	158175

CR956362.5	1201	ATTAAGAAATACCAAGTCACATTTTTGTCAAATATTATTTGTCAAATGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158176	ATTAAGAAATACCAAGTCACATTTTTGTCAAATATTATTTGTCAAATGCC	158225

CR956362.5	1251	ATTTGCTGCAAAACCCAGAATTCAATTGCAGCTGAACACACAGCTAATAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158226	ATTTGCTGCAAAACCCAGAATTCAATTGCAGCTGAACACACAGCTAATAC	158275

CR956362.5	1301	CGAACGGTTCACATAATCGCTGTGGTTGTACACGGGATCATTTGCAGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158276	CGAACGGTTCACATAATCGCTGTGGTTGTACACGGGATCATTTGCAGTGA	158325

CR956362.5	1351	AAGCACCCCCCCCTTCCTCTATAAACTGTTTCAGGACTTGGAAAGAAAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158326	AAGCACCCCCCCCTTCCTCTATAAACTGTTTCAGGACTTGGAAAGAAAAG	158375

CR956362.5	1401	CATCTGAAGCTCTGGAATAAATAAAGCACTGTGCCTTGAGCTGCCCAGCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158376	CATCTGAAGCTCTGGAATAAATAAAGCACTGTGCCTTGAGCTGCCCAGCA	158425

CR956362.5	1451	CAAAGGACCCAGCGTGCCGGGAGAACAGACTCAAAACAACCAAAAAGGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158426	CAAAGGACCCAGCGTGCCGGGAGAACAGACTCAAAACAACCAAAAAGGCA	158475

CR956362.5	1501	ACTGCCGCTTCGCTTCCCAATTTTGCAGGAATGTTTCAGAAAAATGATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158476	ACTGCCGCTTCGCTTCCCAATTTTGCAGGAATGTTTCAGAAAAATGATTT	158525

CR956362.5	1551	GAGATGACGGGGGGGGGGGGGGTGAATCGCAACATACCTCGCTTGCAAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158526	GAGATGACGGGGGGGGGGGGGGTGAATCGCAACATACCTCGCTTGCAAAG	158575

CR956362.5	1601	GCAGGCTCGGCCAGTTTCCTGAAAGACCAGCATCTTCTCCCGCTGCACTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158576	GCAGGCTCGGCCAGTTTCCTGAAAGACCAGCATCTTCTCCCGCTGCACTC	158625

CR956362.5	1651	ACAGGTACAGGCACCTGCGGCCACATCCTGAGTCCAGGCAAAAAGCCCCG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158626	ACAGGTACAGGCACCTGCGGCCACATCCTGAGTCCAGGCAAAAAGCCCCG	158675

CR956362.5	1701	TGGATGTCGCCGCCCTGCTGCCTCGCCCAGGTGACGTCACCCCTCAACTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158676	TGGATGTCGCCGCCCTGCTGCCTCGCCCAGGTGACGTCACCCCTCAACTC	158725

CR956362.5	1751	CACGTTGATCTGGGATCCATCAAGTCGGAGCAATTTGGGTGTGCAAAGCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158726	CACGTTGATCTGGGATCCATCAAGTCGGAGCAATTTGGGTGTGCAAAGCT	158775

CR956362.5	1801	AAATGTGTTATCATTTTCACCACAAATTAACAGTTTCTGTGTAAATATTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158776	AAATGTGTTATCATTTTCACCACAAATTAACAGTTTCTGTGTAAATATTG	158825

CR956362.5	1851	GTATTTCCTCGCCCCATGAAGGCGCGAGGAGGCAAAATGGCACTGGCGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158826	GTATTTCCTCGCCCCATGAAGGCGCGAGGAGGCAAAATGGCACTGGCGCA	158875

CR956362.5	1901	TTTGATTTAAACTAATTAAAAGCAGAGGGTCCTGCAATTCAATATATTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158876	TTTGATTTAAACTAATTAAAAGCAGAGGGTCCTGCAATTCAATATATTGA	158925

CR956362.5	1951	TTTTACCAGTGGGACTTAAATCTTTTATAATAAGTGTACACAGCTGCAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974467.8	158926	TTTTACCAGTGGGACTTAAATCTTTTATAATAAGTGTACACAGCTGCAGC	158975

Overview

Query
CR956362.5 - 212503 bps
Hit
CR974467.8 - 158975 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199420001200011569761589751
291.882042718589986169132960332301
392.222062707660776876-132961332301
491.79200269177459177727-132961332281
592.59207269209429209697-132961332301
692.91198254210750211003-132961332141
793.72182705449154760132961332301
890.44192272177459177730-187427876981
996.03259300160163160462187429877301
1096.552292602706327322-187430876901
1190.321942787659976876-187430877081
1294.242262775449154767187430877071
1395.092352828590086181187430877141
1493.96237296206080206375-187432877291
1582.6524357620149320206811274831280411
1693.0121227416016016043311444321447031
1792.882092677661176877-11444351447011
1891.02192266209433209698-11444351447011
1993.831952432708027322-11444361446781
2092.85207267177461177727-11444361447011
2194.74223266544915475611444361447011
2292.86208266859008616511444361447011
Short-link