<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT009767.6	1	GAATTCACAGGATTATGGTAGCCGTCTGATACAGCCTACTCAGTGTGTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122640	GAATTCACAGGATTATGGTAGCCGTCTGATACAGCCTACTCAGTGTGTCC	122689

CT009767.6	51	TCAGCAGGAGAAAGCTGCCAGCCAGCAGGACAGCAGCAGCCAAACCCCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122690	TCAGCAGGAGAAAGCTGCCAGCCAGCAGGACAGCAGCAGCCAAACCCCTT	122739

CT009767.6	101	CCTGAGAGTTGTCCTCACTGTGGACTCTGCAAAGCTCAAAAGCCACCTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122740	CCTGAGAGTTGTCCTCACTGTGGACTCTGCAAAGCTCAAAAGCCACCTCA	122789

CT009767.6	151	GAATATTCCCTTCCATGGTCCAACCAACAAAACAGAAGCTTCGCTGTCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122790	GAATATTCCCTTCCATGGTCCAACCAACAAAACAGAAGCTTCGCTGTCCT	122839

CT009767.6	201	GGAAAATTCCCCCCACAGATCCTCGAGGCCCTGAGTACACAAATCTACAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122840	GGAAAATTCCCCCCACAGATCCTCGAGGCCCTGAGTACACAAATCTACAG	122889

CT009767.6	251	AAATCCCACAAGAGGCATGGCCACAGCTTCTGAGCAGGTGTCTGTAGTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122890	AAATCCCACAAGAGGCATGGCCACAGCTTCTGAGCAGGTGTCTGTAGTTA	122939

CT009767.6	301	TCCATTCTGGATATATGCTACCCACCAAGGCTCCTTCCTACATAAGCAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122940	TCCATTCTGGATATATGCTACCCACCAAGGCTCCTTCCTACATAAGCAAC	122989

CT009767.6	351	ACTGAGAACGAGGTGATGGGTTTCCAGTCTTCAGATTGCCGAAGCAGCAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	122990	ACTGAGAACGAGGTGATGGGTTTCCAGTCTTCAGATTGCCGAAGCAGCAT	123039

CT009767.6	401	CAACTGAAAGCCAACTCTTCATTAAAAGCAGAAGGCTCCGCTCACTCACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123040	CAACTGAAAGCCAACTCTTCATTAAAAGCAGAAGGCTCCGCTCACTCACT	123089

CT009767.6	451	GTTCAGACTCTGAAGCTAATCAAACTCAGACAGCAGACCCAACCATTAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123090	GTTCAGACTCTGAAGCTAATCAAACTCAGACAGCAGACCCAACCATTAGC	123139

CT009767.6	501	CTCCAAATAGCTAGAAGCTGGGAGAGGGATGAACAGGGCCCTCACCTACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123140	CTCCAAATAGCTAGAAGCTGGGAGAGGGATGAACAGGGCCCTCACCTACT	123189

CT009767.6	551	ACACCTTTATGCCCCTGGGACATAGTAGGCAGTGACTCAAAAAAAAATCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123190	ACACCTTTATGCCCCTGGGACATAGTAGGCAGTGACTCAAAAAAAAATCT	123239

CT009767.6	601	GACTCAATGCCAGTTCCTCATATAAGCTGGCAGAGGGGGAAGCACGGTTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123240	GACTCAATGCCAGTTCCTCATATAAGCTGGCAGAGGGGGAAGCACGGTTC	123289

CT009767.6	651	TGTCTTTCTCTACTGTTCCCTATGCCCACAGCAGCCCCACAGTGAGTGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123290	TGTCTTTCTCTACTGTTCCCTATGCCCACAGCAGCCCCACAGTGAGTGTT	123339

CT009767.6	701	GCCTGTGCTTTTGTTCATAGTTTGCAGACTGACCTAGCTCTCCACAATCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123340	GCCTGTGCTTTTGTTCATAGTTTGCAGACTGACCTAGCTCTCCACAATCT	123389

CT009767.6	751	CAACACTGTCCCTGCACCCATGCTCTGCACCGCCCCCCCAATAAAATGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123390	CAACACTGTCCCTGCACCCATGCTCTGCACCGCCCCCCCAATAAAATGCA	123439

CT009767.6	801	CACACACACACAAAACTCTTCAGCAAAAACATTCAAACTAATGTCAATTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123440	CACACACACACAAAACTCTTCAGCAAAAACATTCAAACTAATGTCAATTC	123489

CT009767.6	851	TAATTTCTTTTCAGTGCAAACTCCTGGACCTATTGGTGAGTGAAAATGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123490	TAATTTCTTTTCAGTGCAAACTCCTGGACCTATTGGTGAGTGAAAATGCC	123539

CT009767.6	901	CTGGTTCATTATTAGTGACTTTCTCTGACTAAGACTTTGGCTTCCAACTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123540	CTGGTTCATTATTAGTGACTTTCTCTGACTAAGACTTTGGCTTCCAACTG	123589

CT009767.6	951	TTCACAAATTCTGCTCGTTGGCCTGGCTTTTCCTTGTATCATTACCATCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123590	TTCACAAATTCTGCTCGTTGGCCTGGCTTTTCCTTGTATCATTACCATCC	123639

CT009767.6	1001	TCCTTAAAGACTAGTCATATTTTAGAAAATGGGGATCCCACGGCCTTAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123640	TCCTTAAAGACTAGTCATATTTTAGAAAATGGGGATCCCACGGCCTTAAA	123689

CT009767.6	1051	ATTAGCATTAAGCAGCATGCAATCATATACTTACGATTGTAAGGATATGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123690	ATTAGCATTAAGCAGCATGCAATCATATACTTACGATTGTAAGGATATGT	123739

CT009767.6	1101	CAAACATTGGGAGAGTTTCCAAGGCAAACAAAATGGTGAAGCGGATGGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123740	CAAACATTGGGAGAGTTTCCAAGGCAAACAAAATGGTGAAGCGGATGGGG	123789

CT009767.6	1151	GAAAGCTTAAAGGGTAGGCACAGATATAAAAGGGGGCTGGCGAAGAGATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123790	GAAAGCTTAAAGGGTAGGCACAGATATAAAAGGGGGCTGGCGAAGAGATG	123839

CT009767.6	1201	CACATGTGCCTGATAGGATGGGGGTGGAAGAAGGCAAGGAAAGGCTACCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123840	CACATGTGCCTGATAGGATGGGGGTGGAAGAAGGCAAGGAAAGGCTACCC	123889

CT009767.6	1251	CTAAGGATCTCACCTGTAGTACCTACACAAAAAGCAAGAATGAGGAGGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123890	CTAAGGATCTCACCTGTAGTACCTACACAAAAAGCAAGAATGAGGAGGCA	123939

CT009767.6	1301	GCCCCTGCTTCTAGCTAAGTCTACAGAAAGGCTGGGTGTCATGGGGACGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123940	GCCCCTGCTTCTAGCTAAGTCTACAGAAAGGCTGGGTGTCATGGGGACGA	123989

CT009767.6	1351	TTGATGCTTACTGTTGGAGTCAGTGCCGCCTAGAAAGGCTGCTATCTGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	123990	TTGATGCTTACTGTTGGAGTCAGTGCCGCCTAGAAAGGCTGCTATCTGCA	124039

CT009767.6	1401	CACTCCTTTGGAAAACAGTTTGCCTTCTTTCTGTCTAATCACAATCATTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124040	CACTCCTTTGGAAAACAGTTTGCCTTCTTTCTGTCTAATCACAATCATTT	124089

CT009767.6	1451	GTATCTATTTACAGTACAATGTATGGATTCCAGTGGTAAGTCCCTTATGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124090	GTATCTATTTACAGTACAATGTATGGATTCCAGTGGTAAGTCCCTTATGG	124139

CT009767.6	1501	GTTGTTTTGTTGTTGTTATTGTTATTGTTGTTTGGGGTCTTGTTTTGTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124140	GTTGTTTTGTTGTTGTTATTGTTATTGTTGTTTGGGGTCTTGTTTTGTTT	124189

CT009767.6	1551	TGTTTTGTTTTGTTTTTCTCTCTGGTGTTCCTTGCCCTTGCATAATGTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124190	TGTTTTGTTTTGTTTTTCTCTCTGGTGTTCCTTGCCCTTGCATAATGTTC	124239

CT009767.6	1601	AGATGGCCTGGCCTGTTGCTCCTCTTGGTGGTTTTTGTTACCACAGTATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124240	AGATGGCCTGGCCTGTTGCTCCTCTTGGTGGTTTTTGTTACCACAGTATG	124289

CT009767.6	1651	ATGGTTTAAATGTGTTGCTGTGCTTCCCGCTTTGTGCTTGCTAAGAATTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124290	ATGGTTTAAATGTGTTGCTGTGCTTCCCGCTTTGTGCTTGCTAAGAATTC	124339

CT009767.6	1701	TCTAGAGCTATACATTAAGAGAGGGGCTGCAAAGATGGCTCAGCAGTTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124340	TCTAGAGCTATACATTAAGAGAGGGGCTGCAAAGATGGCTCAGCAGTTAA	124389

CT009767.6	1751	GAGCAATTGCTGCTTTTGCAGAGGACCCAGGTTCTGTTCCCAGCACCCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124390	GAGCAATTGCTGCTTTTGCAGAGGACCCAGGTTCTGTTCCCAGCACCCAC	124439

CT009767.6	1801	ATGGAGCTCACAACTGTAACTCCAGCCCCAGAGGATCCAGTACCACCTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124440	ATGGAGCTCACAACTGTAACTCCAGCCCCAGAGGATCCAGTACCACCTTC	124489

CT009767.6	1851	TGGTCTCTGCAGATGCCAGCTACACACATAGTAACCAGATATATTTACAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124490	TGGTCTCTGCAGATGCCAGCTACACACATAGTAACCAGATATATTTACAT	124539

CT009767.6	1901	GCAGATAAGATACTCATACACAAAAAATAACTAATGAAAGAAAAAGAGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124540	GCAGATAAGATACTCATACACAAAAAATAACTAATGAAAGAAAAAGAGCA	124589

CT009767.6	1951	AGGAAATGTTCACTTAACATCGTGATATGCTCTGAAACATATTAACACAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974457.17	124590	AGGAAATGTTCACTTAACATCGTGATATGCTCTGAAACATATTAACACAT	124639

Overview

Query
CT009767.6 - 221442 bps
Hit
CR974457.17 - 124639 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link