<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974466.14	1	GAATTCCTTTAGAAATTTTGCCAGGTCTGGGAGGTGGTAGCACATGCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188042	GAATTCCTTTAGAAATTTTGCCAGGTCTGGGAGGTGGTAGCACATGCCTT	188091

CR974466.14	51	TAAACCCAGCATTCAGGAGGCAGAGGCTGGCAGCTCTTAAGTCTACAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188092	TAAACCCAGCATTCAGGAGGCAGAGGCTGGCAGCTCTTAAGTCTACAAAG	188141

CR974466.14	101	TGCAATGCAGGACGCCAGGACTACACAGAGAGGGGCTGCCTTGAAAAGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188142	TGCAATGCAGGACGCCAGGACTACACAGAGAGGGGCTGCCTTGAAAAGCA	188191

CR974466.14	151	AAAAGCCAAAGTTCTGCCAGGTGTGTTAGCAGACATCTTTAATCCCAAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188192	AAAAGCCAAAGTTCTGCCAGGTGTGTTAGCAGACATCTTTAATCCCAAGC	188241

CR974466.14	201	AGTGGGCAGAGACTGGTCGATCTCTGTGAGTACAAGTGGGGCCAGCCTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188242	AGTGGGCAGAGACTGGTCGATCTCTGTGAGTACAAGTGGGGCCAGCCTGG	188291

CR974466.14	251	TCTCGTGTTTCAGGACGACTAGGGCAAATAGAGAAACCCTGTGTCAAGCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188292	TCTCGTGTTTCAGGACGACTAGGGCAAATAGAGAAACCCTGTGTCAAGCT	188341

CR974466.14	301	TTCTGCTCTCCAGAGAATGCACATTTGAGTTCATAGCCCTGTCCATGTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188342	TTCTGCTCTCCAGAGAATGCACATTTGAGTTCATAGCCCTGTCCATGTAA	188391

CR974466.14	351	CTGGCCCCAGGGCATCAACAAACACTCCTGAAAGTGCACTTGCCAGACAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188392	CTGGCCCCAGGGCATCAACAAACACTCCTGAAAGTGCACTTGCCAGACAC	188441

CR974466.14	401	CCACAAAACCACACACACAGAAATCTTCAAAACTCCAAAAATCAGATTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188442	CCACAAAACCACACACACAGAAATCTTCAAAACTCCAAAAATCAGATTTC	188491

CR974466.14	451	TGGGGCTGGGGAAGTGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTTTTGTTCTTCCAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188492	TGGGGCTGGGGAAGTGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTTTTGTTCTTCCAGG	188541

CR974466.14	501	AGTTCCCAAGTTCATTTCTCTATGTCAGCTCCCAGTCATGTAGTTACAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188542	AGTTCCCAAGTTCATTTCTCTATGTCAGCTCCCAGTCATGTAGTTACAGT	188591

CR974466.14	551	GGCGGAAGAAGATGGTCCAATGTCCTCTGCTGGCCCTCCAGGCACCAGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188592	GGCGGAAGAAGATGGTCCAATGTCCTCTGCTGGCCCTCCAGGCACCAGGC	188641

CR974466.14	601	ACACATGCACAAGTGTGTGCAGGCAAACCCCACACACTTGAACTTAAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188642	ACACATGCACAAGTGTGTGCAGGCAAACCCCACACACTTGAACTTAAAAA	188691

CR974466.14	651	AACAAGACTGATAAGCTGGTGCATACATCATCATGCCCGTGCTCCCTCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188692	AACAAGACTGATAAGCTGGTGCATACATCATCATGCCCGTGCTCCCTCAG	188741

CR974466.14	701	GTGGTGATCTTTGTGAAGTCCGTGCAGCGCTGCATCGCCCTGGCCCAGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188742	GTGGTGATCTTTGTGAAGTCCGTGCAGCGCTGCATCGCCCTGGCCCAGCT	188791

CR974466.14	751	TCTAGTGGAACAGAACTTCCCAGCCATTGCTATCCATCGTGGAATGCCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188792	TCTAGTGGAACAGAACTTCCCAGCCATTGCTATCCATCGTGGAATGCCCC	188841

CR974466.14	801	AGGAGGAGAGGTGGGTTGGAGGCGCGTGTGTGCCTGCCCGTCCATCTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188842	AGGAGGAGAGGTGGGTTGGAGGCGCGTGTGTGCCTGCCCGTCCATCTGGG	188891

CR974466.14	851	TCCTGTCCTGTGGAGGAGGCAGTGTGGAGAGAAGAGAGTCTCAACCCTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188892	TCCTGTCCTGTGGAGGAGGCAGTGTGGAGAGAAGAGAGTCTCAACCCTCT	188941

CR974466.14	901	CATTTACTCTCACAAAGGCTCTCTCGGTATCAGCAGTTCAAGGATTTTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188942	CATTTACTCTCACAAAGGCTCTCTCGGTATCAGCAGTTCAAGGATTTTCA	188991

CR974466.14	951	GCGGAGGATTCTTGTGGCTACCAACCTGTTTGGCCGAGGCATGGATATTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	188992	GCGGAGGATTCTTGTGGCTACCAACCTGTTTGGCCGAGGCATGGATATTG	189041

CR974466.14	1001	AGCGTGTGAACATTGCTTTCAACTATGACATGCCAGAGGACTCGGACACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189042	AGCGTGTGAACATTGCTTTCAACTATGACATGCCAGAGGACTCGGACACC	189091

CR974466.14	1051	TACCTGCACAGGGTAAGCTGCCCGCCCACCCCACTTCCCGTGTGTGCTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189092	TACCTGCACAGGGTAAGCTGCCCGCCCACCCCACTTCCCGTGTGTGCTGA	189141

CR974466.14	1101	GCACCCCCCCTCTCCTTTGTCTTCCCTGGGAGGCTTGCAGTCTAACCCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189142	GCACCCCCCCTCTCCTTTGTCTTCCCTGGGAGGCTTGCAGTCTAACCCTT	189191

CR974466.14	1151	CTCCTTCCAGGTGGCCAGAGCGGGCCGGTTTGGCACCAAGGGCTTGGCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189192	CTCCTTCCAGGTGGCCAGAGCGGGCCGGTTTGGCACCAAGGGCTTGGCCA	189241

CR974466.14	1201	TCACATTTGTGTCAGATGAGAATGATGCCAAGATCCTGAATGACGTTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189242	TCACATTTGTGTCAGATGAGAATGATGCCAAGATCCTGAATGACGTTCAG	189291

CR974466.14	1251	GACCGTTTCGAGGTCAACATCAGCGAGCTGCCCGATGAGATTGACATTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189292	GACCGTTTCGAGGTCAACATCAGCGAGCTGCCCGATGAGATTGACATTTC	189341

CR974466.14	1301	CTCCTACAGTGAGTACCACCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189342	CTCCTACAGTGAGTACCACCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	189391

CR974466.14	1351	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGCCTGTGTGCGCGTTTCCCATTTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189392	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGCCTGTGTGCGCGTTTCCCATTTTG	189441

CR974466.14	1401	TATCTTACTGTGACTTTTTTCTCCAGTTGAGCAGACACGGTAGAGGACTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189442	TATCTTACTGTGACTTTTTTCTCCAGTTGAGCAGACACGGTAGAGGACTC	189491

CR974466.14	1451	GCGTGGTCAGTCTGCTGTAGAAGAGGACACGGGTCAGGAGGAGACACTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189492	GCGTGGTCAGTCTGCTGTAGAAGAGGACACGGGTCAGGAGGAGACACTGC	189541

CR974466.14	1501	CGCCCCACCCGACACCGACGCCTCTGCCCACCCTATCTATGCTTCTCTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189542	CGCCCCACCCGACACCGACGCCTCTGCCCACCCTATCTATGCTTCTCTCT	189591

CR974466.14	1551	GCGTCACCACCACTCCTAAACCTAGTCCTGATTTATCAGAGTTGTTTGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189592	GCGTCACCACCACTCCTAAACCTAGTCCTGATTTATCAGAGTTGTTTGTT	189641

CR974466.14	1601	TGTTTGTTTTTGTTTTTTAACAAAACTAAGAATGAAACAACCGTGTCTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189642	TGTTTGTTTTTGTTTTTTAACAAAACTAAGAATGAAACAACCGTGTCTGT	189691

CR974466.14	1651	GGTGTCTGTAAGTGCTCTGTTCATGGCTTGAACCAGGGTCATTCTGAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189692	GGTGTCTGTAAGTGCTCTGTTCATGGCTTGAACCAGGGTCATTCTGAGGG	189741

CR974466.14	1701	CCGTGAGCCGGGTTGTGGGGCAGCGTCATTGTCTTCTTTCTAAGGTGGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189742	CCGTGAGCCGGGTTGTGGGGCAGCGTCATTGTCTTCTTTCTAAGGTGGCT	189791

CR974466.14	1751	GTGGACAGGGAGGCTGGGACACTGCTGGGGCCCGGAGGTAAAGAGAGCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189792	GTGGACAGGGAGGCTGGGACACTGCTGGGGCCCGGAGGTAAAGAGAGCAA	189841

CR974466.14	1801	GCCCCACGTCCTGGTACCTCAGCTCCTTCAGCTGAGTTTCTTGTATCTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189842	GCCCCACGTCCTGGTACCTCAGCTCCTTCAGCTGAGTTTCTTGTATCTCC	189891

CR974466.14	1851	CAGGTATCTAAGCGGGGCCTGGTAGGCCATGCCTGAGCGTGTGTGCACAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189892	CAGGTATCTAAGCGGGGCCTGGTAGGCCATGCCTGAGCGTGTGTGCACAG	189941

CR974466.14	1901	GCATGTGTGCACAGGCGTGTGCGTGCATGCGCATTCACGCGCGCGCGCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189942	GCATGTGTGCACAGGCGTGTGCGTGCATGCGCATTCACGCGCGCGCGCAC	189991

CR974466.14	1951	ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCATACTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974444.18	189992	ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCATACTG	190041

Overview

Query
CR974466.14 - 210806 bps
Hit
CR974444.18 - 190041 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link