<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR974457.17	1	ATGTTAACTGTATATCATATGTTGTAATTTCCATGATTGTATAGTTTTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187050	ATGTTAACTGTATATCATATGTTGTAATTTCCATGATTGTATAGTTTTGT	187099

CR974457.17	51	TCAATTTATGTGTCTGAGAGAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187100	TCAATTTATGTGTCTGAGAGAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTT	187149

CR974457.17	101	CGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCATTCTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187150	CGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCATTCTGT	187199

CR974457.17	151	AGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187200	AGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCGAG	187249

CR974457.17	201	TGCTGGGATTAAAGGCGTGCTCCACCACGCCCGGCCTGAGAGGTTTTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187250	TGCTGGGATTAAAGGCGTGCTCCACCACGCCCGGCCTGAGAGGTTTTTTG	187299

CR974457.17	251	TTTTAATTGGTCAGAAAAGGTGAGATGTAAGGGGTGGCTCTGATGTTTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187300	TTTTAATTGGTCAGAAAAGGTGAGATGTAAGGGGTGGCTCTGATGTTTTG	187349

CR974457.17	301	ATTGGGAATCTGCATGTGAACACTGAAGGTCCTGTTCCTCACTTGGTTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187350	ATTGGGAATCTGCATGTGAACACTGAAGGTCCTGTTCCTCACTTGGTTCT	187399

CR974457.17	351	TGATTGATCAATAAAGATGCTAGTGACCAATGAGCTGGATGGAAAAGGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187400	TGATTGATCAATAAAGATGCTAGTGACCAATGAGCTGGATGGAAAAGGCA	187449

CR974457.17	401	GGACTTTCAGGTTTTCCACAGGCAGGCCTGTAGATAGAAAGGAGGAGAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187450	GGACTTTCAGGTTTTCCACAGGCAGGCCTGTAGATAGAAAGGAGGAGAGA	187499

CR974457.17	451	GAGAGTATTTGCCATGTTTCAGAGGAAGAAAGAACCATCAACCCTGTGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187500	GAGAGTATTTGCCATGTTTCAGAGGAAGAAAGAACCATCAACCCTGTGAG	187549

CR974457.17	501	ATCTAGGCTGGAGTGGCCCTTGGCCGCTTCCCTAACTGGGTCTGGGGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187550	ATCTAGGCTGGAGTGGCCCTTGGCCGCTTCCCTAACTGGGTCTGGGGCAT	187599

CR974457.17	551	CAGGTCAGATATTAGAAATATAATTAAGCTGAGGGAATATTTAAGGGGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187600	CAGGTCAGATATTAGAAATATAATTAAGCTGAGGGAATATTTAAGGGGCT	187649

CR974457.17	601	AAGCTTGGAGTGAAAAGAAAAATGCAATATTGGGAAAGACTTAGAGGGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187650	AAGCTTGGAGTGAAAAGAAAAATGCAATATTGGGAAAGACTTAGAGGGCC	187699

CR974457.17	651	TGGTCACTGAGATGATGCATATCAAAAATAAGGTGATGTGTGTGTGTGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187700	TGGTCACTGAGATGATGCATATCAAAAATAAGGTGATGTGTGTGTGTGTG	187749

CR974457.17	701	TGTCTGTCTCTGATCCACAAATCTGAGGGAACCTAGGGAGGTCTGGTAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187750	TGTCTGTCTCTGATCCACAAATCTGAGGGAACCTAGGGAGGTCTGGTAGC	187799

CR974457.17	751	ATGGTCTACCTGGAGCTCACAGTAGGGTAGCAAAAACTACACAACACAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187800	ATGGTCTACCTGGAGCTCACAGTAGGGTAGCAAAAACTACACAACACAGT	187849

CR974457.17	801	GAGCCATTTATCTACTCCGACAATGGCATTTGAATCCTGCATTGACAACT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187850	GAGCCATTTATCTACTCCGACAATGGCATTTGAATCCTGCATTGACAACT	187899

CR974457.17	851	GAGAACCAACATGTCATTAAATATAACAGCATCATTTGGGGACAGTAGTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187900	GAGAACCAACATGTCATTAAATATAACAGCATCATTTGGGGACAGTAGTA	187949

CR974457.17	901	TTGTACCCTCTTTGTTCTCCAAAAGTTTTGGGTTGATAGGTTCAAGTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	187950	TTGTACCCTCTTTGTTCTCCAAAAGTTTTGGGTTGATAGGTTCAAGTTTT	187999

CR974457.17	951	GATGTCTCCCCAAGTTATCAGCTTGCTCTTCATCTTGGGACTTCTTCTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188000	GATGTCTCCCCAAGTTATCAGCTTGCTCTTCATCTTGGGACTTCTTCTCT	188049

CR974457.17	1001	TGATGTGTCATCTATCTTTAGATACTTCCCTTGCCTAGTTGTATCTGACT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188050	TGATGTGTCATCTATCTTTAGATACTTCCCTTGCCTAGTTGTATCTGACT	188099

CR974457.17	1051	GGTGAGATCTGGAGCCAAGAAACTCTTGAATCCAGACTATATTGTTTCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188100	GGTGAGATCTGGAGCCAAGAAACTCTTGAATCCAGACTATATTGTTTCCT	188149

CR974457.17	1101	GCTTTGTGTTCTTCTGTGAGGTTAGTCAGCATCTCTTGATCTTTCCACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188150	GCTTTGTGTTCTTCTGTGAGGTTAGTCAGCATCTCTTGATCTTTCCACCA	188199

CR974457.17	1151	GAAGGGGCGATGATGGAATTTGACCTACTGTGACAATGGCATTAAATTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188200	GAAGGGGCGATGATGGAATTTGACCTACTGTGACAATGGCATTAAATTAA	188249

CR974457.17	1201	GAAAATGCATTAAAATCACTGGGGACCCAGCTCAGCCTTTCCCATTGACC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188250	GAAAATGCATTAAAATCACTGGGGACCCAGCTCAGCCTTTCCCATTGACC	188299

CR974457.17	1251	CTCTCAGTCTCTCCTCCTGGCTGATGCCCATTCTTTCTCTCACTCCCAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188300	CTCTCAGTCTCTCCTCCTGGCTGATGCCCATTCTTTCTCTCACTCCCAAC	188349

CR974457.17	1301	CTGAAGAACGGTCTTAAATTTGGGAAATTTTCTTCTATGATTTTGGTGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188350	CTGAAGAACGGTCTTAAATTTGGGAAATTTTCTTCTATGATTTTGGTGAA	188399

CR974457.17	1351	AATGGTTTCTGTGACCTTGACCTGGTTCTCATCTCTTTCCTTTATCCCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188400	AATGGTTTCTGTGACCTTGACCTGGTTCTCATCTCTTTCCTTTATCCCTA	188449

CR974457.17	1401	CTATCCATAGATTTGATGTGTTCCTAATGTCTGACATTTCCTTGATGTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188450	CTATCCATAGATTTGATGTGTTCCTAATGTCTGACATTTCCTTGATGTTT	188499

CR974457.17	1451	TATGCCTAATTTTTTTTTAAGATCTGACATTTTGTAGACTGAAGTACCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188500	TATGCCTAATTTTTTTTTAAGATCTGACATTTTGTAGACTGAAGTACCTA	188549

CR974457.17	1501	TTTCTTCTACCTTGTCCTCAATGCTGAGTCTGAGGAAGTGGAAGAAGCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188550	TTTCTTCTACCTTGTCCTCAATGCTGAGTCTGAGGAAGTGGAAGAAGCAT	188599

CR974457.17	1551	ACCACCAGGAGATTTTTGGTGCATTTCTCTGTATGGAGTCTCTACAAATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188600	ACCACCAGGAGATTTTTGGTGCATTTCTCTGTATGGAGTCTCTACAAATG	188649

CR974457.17	1601	GAGCTCAATTGAGGTAGACCAATACATGCATGCCCTTCGTGAAGAATCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188650	GAGCTCAATTGAGGTAGACCAATACATGCATGCCCTTCGTGAAGAATCCT	188699

CR974457.17	1651	TTATCTCATGTCCTTTCATGCATCCTTTTACCTGTGTCTGATTTGGCTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188700	TTATCTCATGTCCTTTCATGCATCCTTTTACCTGTGTCTGATTTGGCTAA	188749

CR974457.17	1701	ACATTCTTTTATGTGTTGGCTTTAGCAAAACATACTTTCACGTGTGTCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188750	ACATTCTTTTATGTGTTGGCTTTAGCAAAACATACTTTCACGTGTGTCTG	188799

CR974457.17	1751	CTTCAGGAAAATGCTCCTTCACATAATTGCCCCAGCAAAACACCATCCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188800	CTTCAGGAAAATGCTCCTTCACATAATTGCCCCAGCAAAACACCATCCAA	188849

CR974457.17	1801	CACAGCTGATTTTACAAGGAACCAAAGTTTCCTCTTCAAATGCTGCACAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188850	CACAGCTGATTTTACAAGGAACCAAAGTTTCCTCTTCAAATGCTGCACAT	188899

CR974457.17	1851	CTTACTTGATTACCATAGTTTAAACCAGGATATCAAAAATTACAGGAAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188900	CTTACTTGATTACCATAGTTTAAACCAGGATATCAAAAATTACAGGAAGA	188949

CR974457.17	1901	ATGGAAACTCATGGAGACTGGACCATTCACTACTGAGTGAAAAATGGAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	188950	ATGGAAACTCATGGAGACTGGACCATTCACTACTGAGTGAAAAATGGAAC	188999

CR974457.17	1951	AAGACAGAAAATTATTATTATTATTATTACCATTGTACAGAAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR974422.14	189000	AAGACAGAAAATTATTATTATTATTATTACCATTGTACAGAAATGAATTC	189049

Overview

Query
CR974457.17 - 124639 bps
Hit
CR974422.14 - 189049 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link